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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA0409 putative RNA polymerase-associated protein HepA
ATGCCATTTACTTTGGGCCAACGTTGGATCAGTGATACTGAAAGTGATTT
AGGTTTAGGTACCGTTGTTGCTGAAGATAAGCGAACAGTTTCCATAATGT
TCTCCGCCTGTGAAGAGAGCCGCCTGTATGCACGAAGTGATGCTCCAGTT
ACCCGTGTAATGTTTAATGTTGGTGATGTAGTTGAAAGCCATGAAGGCTG
GTCACTAGAGGTAAAAATCGTTGAAGAAAATGGCGGTATTTTTACTTATA
TTGGAACACGTACGGACACTGAAGAAGAAAACGTAAAGTTACGTGAAATC
TTCCTAAGTCACCAAATCCGCTTTAACAAACCACAAGATAAATTATTTGC
GGGTCAAATCGATCGTATGGATCGTTTTGCCTTACGCTACCGCGCCCTTA
CCAATCAATATGAACAACATAAGAGCCCATTACGTGGTCTGTGTGGTATG
CGTGCAGGTTTGATTCCTCACCAGTTATTCATCGCGCATGAAGTGGGTCG
ACGTTACGCACCCCGTGTATTACTCGCTGATGAAGTGGGGTTGGGTAAAA
CGATTGAAGCCGGTATGATCATCCACCAACAAGTGCTTGCGGGGCGTGCT
GAACGTATTCTGATTGTTGTGCCTGAAACGCTTCAACATCAATGGCTTGT
CGAAATGATGCGTCGTTTCAACTTACACTTCTCTATTTTTGATGAAGAAC
GTTGTGTCGAATCACTTGCAGATGCAACTAACCCATTTGAGACTGCTCAA
TACGTATTATGTTCGTTAGATTTCTTGCGTAAAAGTCGCCGTCGTTTCGA
ACAAGCACAAGATGCCGATTGGGATTTATTGGTTGTCGATGAAGCACACC
ACTTAGAGTGGAGTGAAGATAAGCCAAGTCGCCAGTACCAAGTGGTTGAA
GCCTTAGCGGAAGCAACACCCGGCGTCTTACTGCTAACGGCAACACCTGA
ACAACTCGGTCGTGAAAGTCACTTTGCTCGTCTACGTTTGCTCGATCCTG
ACCGTTTTTATGATTACGACACCTTTGTGGAAGAAGAGCGCCAGTACGCC
CCAGTGGCAGAAGCCGTTACTCGCTTGCTTTCTGGTGAGAAAATCGATGA
TAACGCCAGAAAAACGTTGGTCGATTTGCTGTCAGAACAGGATATTGAAC
CCAAGCTTCGCCTTATCGAATCTAGCGACGCTGATGATGAACACGCGCAA
ACCGTGCGCCATGAATTAATTGATAGTTTGATGGATCGTCATGGTACGGG
TCGCGTATTATTCCGAAATACACGTGCTGCAATTAAAGGGTTCCCTGAAC
GCCATCTCAACATGTACCCGCTAGAACTGCCTTCGCAATATAAAACAGCG
ATGCGTGTTTCTAGCATGATGTCTGGCTCTATATCGGCTGAACAAAAAGC
CATTAAACTGCTTTACCCTGAAGATATTTATCAAGAATTCGAAGGTGAGT
CAGCAACATGGTGGAATTTTGACCCGCGGGTAAACTGGTTGCTGGAGATG
CTAAAAGCAAACCGTAACGAGAAAGTATTGGTTATTTGTTCTCGCGCACA
AACAGCCTTAACCCTAGAGCAAGCATTACGTGAGCGTGAAGGTATTCGTG
CGACTGTGTTCCATGAAGGCATGTCGATTATCGATCGTGATAAAGCAGCG
GCTTACTTCGCACAAGAAGATGACGGTGCTCAGGTATTGTTATGTTCAGA
GATCGGCTCTGAAGGACGTAACTTCCAATTCTCAAATCAGTTAGTGATGT
TCGATTTACCGAATAACCCTGACTTACTTGAGCAGCGTATTGGCCGCCTT
GATCGTATTGGTCAGCAGCGTGATATTGAAATTCATGTACCGCACCTAGA
AGGTACGTCTCAAGCCTTGCTAGCGCACTGGTACAACGAAGGCTTGAACT
CTTTTGAAGAAACTTGTCCTACTGGCCGTGCTGTCTATGAAGCCGTTAGT
GACGATCTAATAGCGCTATTAGCATGTGAAAAACATGAGCCGGAAGCCCT
AGAAAACTTGATTGAAAAAAGTGCAGCAATGCACCACGAGTTGAAAGCGA
AATTGGATCAAGGCCGTGACCGTCTGTTAGAAATCCACTCAAACGGTGGT
AATGCAGCCAATGATCTCGTTACTCAGATTTCATCAAAGGATGGCGATAC
CAATCTTATCGCTTTCTCTCTGGGCTTATTTGATACCATTGGTTTGAATC
AAGATGATAAAGGTGAAAACGCCATTGTCGTGACCCCTTCCGAGCACATG
ATGGTGGCAAGCTACCCTGGCTTACCTTACGACGGTTGTACTATCACCTT
TGATCGTGAAACAGCACTATCACGTGAAGACTTGCACTTTATTAGCTGGG
AACACCCAATGATTCAAGGTGGTATTGATTTACTATTATCTGAAGGCGTT
GGTGCTACAGCCGTTTCATTATTGAAAAACAAAGCATTGCCTGCTGGTAC
ACTACTGCTCGAAATGGTTTACGTGGTTGATGCACAAGCACCGAAATCAT
CCGGTATTGGTCGATTCTTGCCGAAAACACCGATCCGAATTTTGCTGGAT
GCGAAAGGTAACAACCTATCAAACAAAGTCGCCTTTGAAGGTTTCAACCG
CCAGCTAAGCCCGGTAAATCGACACCTAGCAAGCAAACTGGTTAACTCGG
TACAAAAAGAGATTCACGTTTTAATTGCTCAAGCAGAACAAGAAGTCGCC
AAAGAATTAGTGACAGTTCGCGAATCTGCACAGACTGAAATGGAAAACAG
CCTACAAGCTGAATTAACCCGTCTTCAGGCACTAAAAGCAGTGAATCCCA
ATATTCGTGATGATGAATTAGAGCTAATTGAAAGCCAAATTCAAGATCTC
ACGGGTTACATTGGTAAAGCACAAATACAACTGGATTCATTACGTCTCAT
TGTTGTTAGCCATAACTAA
>PBPRA0460 conserved hypothetical protein
TTGCTCGACAGCATGATTTATTTTGATAGGCAAGTGCTTAAAGGTATAAA
AGCAAAGCTCGATGAAGCCAATGTGAATGTCAGTTTGCACTTAGAGTCAG
GCACGTTGCTAGAAGAGCTCACTCGTGAACACTGGGACTACGTGATAGCA
GATTATGATAAGCCACACTTTCAACAAATCGTACAAACTTGTGGTGCTAA
ATCGGTGGTTTATTCGAATCATCAACGAGATGATTTTAGTGAAAAAATGT
CTTCTGTTGTGATGGACAATACCTGTTTAGCCAGTGCAGCATTACGGCGT
TTTCTCGATGCTAAATATACACACGTTGGTTTTTATACCAATGAGCAAGA
TGCGTTGCAGCCGTGGGGGCAAGAGAGAGAAGAAGCGTTTCAGTTGTTAA
CAATGCAAGCAGGTATACATTTTGTTCATGATGTTCATCAAGCAATGGCT
GCCCGTCAGTTTCCATTTGGTGTGTATTGTTCTTCTGATCGTTCGGCGAG
AAAACTGGCGCAATACTGCCAATGTAATGCGATTGCGGTTCCAAAGGATG
TCGCGATCATTGGCACAGATAGTGATGACACCGAAAGAATGTTGTCACCG
CTCCCACTGAGTTCGTTAGATGTTAATCCTTATGAGCTTGGACGTTTTTG
TGTTGAAACATTAATTAAAACAATACGATTCAAACGTACACTTCGACTGC
GTTATGCTCCAGAGACACTCTACGAAGCGGCGACGACAACACACTGCAAC
CATGTTGATGATATTGTCAGTCGAGCCACCTTGTTTATTCGTAACAACTT
TCACCTTAATATCAACATTAAACAAGTGACGGATTATTGCCGTACTTCGC
GGAAAACCTTAGACACCCGTTTTCTTGCAGCACAAGGTATAACGGCGCAT
CAGTATCTGACAGAGGTACGTGTGGCTCGCGCCAAATACCTGCTTGCACA
TTCGCAAAACAAACTCGATAGTATCGCATTGCAGTGTGGTTATCCCAATC
AATCCTACCTAACTCAAGTGTTCGGGAAACAGCTGGGTGTATCGCCCAGT
CAGTACCGACAAGCCAGCATCATGCATTTTCTTTCCAAAATGGATAAGCA
GTAA
>PBPRA0471 ARGR, hypothetical arginine repressor
GTGAATGGATACGATATACACGGCGCGATAGATTTAACAGCTGCTGACGA
AAGTATTACCAGTGCATGTAAACGCTTGTTACAACAGCAAAGCTTCACAA
CGCAAGATGACATTCGACACCAATTGATCAAGCTAGGTTACAATGATGTC
AGCCAGTCAACGGTTTCACGTTTATTGTCTCGCCTAAGCGTCGCAAAAGT
ACCTAATGCTTATGGTAAGAAAGTTTATTGCCTCACACTTGAGAATGAAC
CGGTTCAAGTCGGTTCATCAATATCGTCACAAATTGAATTCATTACTCAC
AATCAATTGGTTGTTGTAGTAAAAACACACCCTGGAGGCGCGCAATTAGT
GGCGCGCTTAATCGATATTCAGCCTCATGCTGAAATATTAGGCACAGTGG
GTGGTAACGATACCGTGATGGTGGCACCTAGAGATATCATGCGTATTGAA
GAGTGCGAAAAGGTTGTCAAAATCCGACTGGGTATACCCGCTTAA
>PBPRA0586 ATU2278, putative Transcription activator HlyU
ATGGATCTGCAACAGATGGAGCAAAATGCGCCCAAAGCTGTAGTGTTGCT
GAAAGCCATGGCCAATGAGCGACGTTTATTTATTCTTTGTTATTTACTAG
AAGAAGAAATGTCGGTAGGGATGATGAGTGAGAAACTTGGCTTGAGCCAG
TCTGCATTATCTCAACATTTGGCATGGTTAAGGCGCGATGGGTTAGTTGA
TACCCGTAAAGAAGCGCAAACGGTGTACTATCGTTTAAAAAGTGACGAAG
TTAGAGCGATGATAAAGCTTTTACATGGTATGTATTGTGGCTAA
>PBPRA0572 CPSR, putative sigma-54 dependent transcriptional regulator
GTGGCATATATCATCAATCGATATAACTGCATGTTATTGTCGCTCGTGCT
TACTATTTTGGCAGTTATATCACATGGTTATTGTTTATTATCTAAAGGCT
TAATGATGAAAAGAGGGGTTAATATGGGAGTAATGCCAGGAGCGCTAGTG
GTCTTTGGTGGTAATTCTCAATCATGGTTGCCCTCTTTAGAGCAAGCTGG
CTGGGTATGTCATCGCTGTTATGACCTAAGAGCCGCTGAGTCTTTATTAT
TGGATATAGGTCCTTGTATTGGTGTTGTCGACCTCAGTAAAGATGACTTC
AGCATCAATGGTATAGCGACGCTGGTTAACCGTAATAAACAAGTGCGCTG
GTTAGCTGTTGTGCGAGAAGAGCAGCTTACTTCAGACGCCATTTGCCAAT
TTATTGCTAGCTTCTGTATTGATTACTTCACTTCACCGACGCCTGCTGCT
CAGTTACAAGAAACCATTGGTCATCAACTGGGAATGTTACAGTTAGAGCG
CAAAGTATGGCCTGATTTAGGGCGATTTGGCCAACAAGGTTTGCAAGGAA
CTACTGAAGTCATGAAGAGGCTTCGCCATCAAGTACAACGTATTGCAGCA
AATGATGTGTCTGTCTTTATTGAAGGTGAAATGGGCACAGGAAAAGAGTT
GGTTGCTCGGGCAGTTCATCAAGCATCAACCCGTGCCAATAATGCATTTG
TTCGGGTTAGCTGTGAAACGGTTACAGCAGACTGGTTCAGTGATAGTAAC
GATGAACAGCATTGTGATATGAATTTTTCCCCTTGTTGCTTTGCTTTAGC
TGATAAAGGCATCTTATATCTCGATGAAATCTCAGCGTTGTCAGATCAGA
GACAACAAGAGCTGTTACAGTTTATTCAAGATGACACATTCACGACAGCT
GCTGGTGAAAAGGTAACGTCAGATATTAGGGTTATTGTTTCAACCAGCTA
CCCTGTAGAGCAGCTCGTCGCTGAGGGTAAATTAAGGCAAGACCTTCTAT
ATCGTTTAAATGTTGTTACGCTTGTCGTGCCTGCATTGCGGGAGCGAGGC
TGTGATATCAGCTTACTTGCAGAGTTTTTATTGCTGAAATTTGCCAGACA
ATATAACAGCGTTGCAAAGCACTTTTCTGATGAAGCCCAAAAAATGTTAA
TCACATACCCTTGGCCGGGGAATGTGCGAGAATTAATTAGCCAAGTAAAA
CGTGCTGTACTGTTGGCTGAAGATAAAAGTATTGAAGCGGATCATCTTGA
TATACCGCGGCTAAATGACGATAAGCAAAGCTTAAAAACGATCAGAGAAG
AATCGGAGCGTGGGGCACTGCTAACTGTATTAGAGAATAATAAAGGTCAA
ATTTCAGCTGCAGCCCGTGAACTAGGGGTTTCTCGTGCAACTATGTATAG
ATTGTTGAATAAACATGATTTAGTGCCTGCTCCACGGAATTTTCGTGATA
ACCCGTAA
>PBPRA0390 EBIG1361, putative arginine repressor
ATGCGAAATTCAGATAAACAAGAACGCTTAATTAAAGCATTCAAATCTAT
TCTAAAAGATGAAAAGTTCAGCTCCCAAGGTGAAATTGTTGATGCCTTGA
AAGCTCAGGGGTTCGACAACATCAACCAATCCAAGGTCTCCCGCATGCTG
ACCAAGTTCGGTGCTGTCCGTACTCGTAATGCAAAAATGGAGATGGTCTA
TTGTTTACCCATTGAACTAGGTGTGCCGACTACTACAAGTCCTTTAAAAG
AACTCGTAATGGAAGTGGGTCATAACAGCGCCCTAGTTGTCATTCATACT
GGCCCTGGTGCCGCACAAGTTATTGCTCGCTTACTGGATTCACTAGGTAA
AGCAGAAGGCATCCTTGGTGTTGTTGCAGGTGATGATACAATTTTCATTA
CCCCAACCAACACAACAACAACAGAAGAGCTCTTTAATTCTGTGTGTGAT
CTTTTCGATTACAGCATCTAA
>PBPRA0585 ECS0018, putative transcriptional activator protein NhaR
ATGTCTCATCTCAATTATAACCATCTGTATTACTTCTGGATGGTATGCAA
ACAGGGCTCTGTTACCAAAGCAGCAGATGCCTTATTTCTTGCCCCTCAAA
CTGTGACAGGGCAGATAAGAGCGTTAGAAGAACGCTTAAAAGGCAAACTA
ACCAAGCGTGTTGGCCGTAATATTGAACCGACAGAATTGGGGCAACTTGT
TTTTAAATATGCCGATAAAATGTTTGATTTGAGCTACGAAATGCTCGATA
TCGTTAACTACACTCAGCGAGAGAATCTATTACTCGAAGTTGGGGTTGCC
GATGCATTATCAAAACGGTTAGTCAGTAAAATATTACTGGAAGGCGTACC
GGATGATGAACGAATCCAATTACGTTGTTTTGAATCCACCCATGAAATGC
TCCTAGAACAGTTGTCACAGCACAAACTGGATATGATCCTATCTGACTGC
CCTGTAGATTCAGGAAAGAGCCCAGGGCTTTACAGTAAGAAATTAGGGGA
GTCGAGCATGAGCTTCTTCTGTTCTGTTCCGGCTAAACCTGTCGATTTCC
CTGCCTGTATTGAAGATTACAAACTTTTGGTGCCTGGTCGACGCACTGCC
ATGGGAAGAAAATTACATCAATGGTTTGATCAGCAAGGTATCACACCTAA
CATATTGGGTGAGTTTGATGATGCCGCGTTGATGAAAGCTTTTGGCTCAT
ATCACCGTTCTATGTTTGTGGCGCCATCGATCTATGCTGAAGAAATTGAA
GAGTCGAATACCATTCGCGAATTGAAGCGAGTGAAAGATATAAAAGAAGA
ATATTACGTAATTTTTGCTGAACGAATGATTATGCATCCAGCAGTAAAAA
AAATATGCGAAGCAGATTTTAGTAAATTGTTTAAATAA
>PBPRA0423 ECS0080, putative transcriptional regulator, LysR family
ATGACGCGTAGAAGCTCTTCTATTCACCCTACTGATAATTACACGATGGA
ATCAAATTTAAGAAGTGTTGACCTTAATTTGTTGACTGTTTTTGATGCTG
TTATGCAAGAGCAGAATATAACTAGAGCAGCTCATAATCTAGGTATGTCT
CAACCTGCGGTCAGTAATGCGGTTGCGCGTCTTAAAGTCATGTTTAACGA
TGAACTCTTTATTCGCCATGGACGTGGTATTCAGCCAACACAACGTGCAA
AGCAATTATTTGGTCCTATTCGTCAAGCATTGCAATTGGTAAAAAACGAA
TTACCGTCGTCAATTTTTTCGCCAGAAACATCAACGCGTACGTTTAAGCT
GGCGCTATGTAGCCCATCAGATATGCGTTTTGCGCCTCGTATTTTCCGTG
ACATAACAGAACAAGCGCCGAGTATTCGTATGCAGCTTGAAGCGGAATTA
GACGCAGAATTAACACAGAAAATGCGTTATCAAGAAATCGATTTTGTTAT
TGATTATGTGCGCTTTGATGAACCAGGTTTCTGTAGTACAGAATTATTCA
GTGATGAACTTGTTGTGATTGCTGCTGGTAACCATCCACGTATTGGTGAC
AGTATTTCTGAAGCAGAATTTACATCAGAAATGCATGCGGTATTAAAGTC
GATGCCAGGTGTAAAGATGTTTGCAGATCATATCTATAATAAGCAGGTTT
CTTGTCAGCAAGCTTACCAAGGCGCTAGCCTAAGCAACATTATGTATGTG
GTTGGTCAGTCTGAATTAGTTGCTGTAGCCCCTCGTTGGTTAGCTGAATC
AGTTGCAGAAAACCTACAACTTAAAGTGTTGCCTCTACCCTTTGAGTCTG
CAACAGTAAGTGGTTACTTAAGCTGGCATGAGTCTTCACAAAAAGATAAA
GGACATATCTGGATGCGTGATCAGTTATTAAGTATTTGTGGCGATACGAC
TGCTTAA
>PBPRA0430 ECS3950, putative DNA-directed RNA polymerase, sigmasubunit
ATGGAGCAAAATCCGCAGTCTCAGCTAAAGTTACTTGTCGCAAAAGGCAA
AGAGCAAGGCTATCTGACCTACGCCGAAGTAAATGATCACCTACCGGAAG
ATATCGTAGACTCCGATCAGGTTGAAGACATTATCCAAATGATCAATGAC
ATGGGCATCAAGGTTGTAGAAACTGCACCTGATGCCGATGAAATCATGAT
GACAGAAGATAATACAGATGACGACGCTATTGAAGCGGCGGCTCAGGCAT
TATCTAGCGTAGAAAGCGAGATCGGTCGTACTACTGATCCAGTTCGTATG
TACATGCGTGAAATGGGTACAGTAGAACTACTGACTCGTGAAGGCGAAAT
TGATATCGCCAAACGCATTGAAGATGGCATCAACCAAGTTCAGTGTTCTG
TAGCAGAATACCCTTCAGCCATCTCTTACTTACTTGAACAGTTTGATAAA
GTTGAAGCCGATGAGCTTCGTCTTACCGACATCATCTCTGGCTTTATTGA
TCCAAATGAAGAGCAAACTGCTGCACCAACAGCAACTCACATCGGTTCAG
AGCTAAGTGAAACAGATCTTGCAGACGAAGACAAAAATCTAGAAACAGAT
GACGATGACGAGGAAGAGGAAGACACTGGTATTGATCCAGAACTTGCTCG
TGAAAAGTTCCTTGAGCTACGCCACTCGTACGAAAAAATGGCATTAGCCA
TCAATACGCATGGTCGTCACAATGCAACGACTGAAGTCGCTGTAGGTGAG
CTTTCTGAAATCTTTAAGCAATTCCGTTTAATTCCAAAACAGTTTGATAA
ACTTGTTCGCTCACTACGCGATTCAATGGATAAAGTACGCACGAACGAGC
GTCTTATCATGCGTATGTGTATTGATAACAGTAAAATGCCAAAGAAGACA
TTCATTAAATTCTTCGCGGGTAATGAGTCATCTCCAGACTGGATTGATGA
AGCACTAAACTCTGGCAAGCCATACGCAGAGCGTCTGAAAAACTATGAAG
AAGATCTTCGTCGTTCATCGCTTAAATTGCGTATTCTTGAAAAAGAAACT
GGCTTATCAATTGAACGTATAAAAGACATCAGCCGTCGTATGTCTATCGG
TGAAGCAAAAGCGCGCCGAGCGAAGAAAGAGATGGTTGAAGCAAACTTAC
GTTTGGTTATTTCGATTGCGAAAAAGTACACCAACCGTGGTCTACAATTC
TTGGATCTAATCCAGGAAGGTAACATCGGTCTTATGAAAGCTGTTGATAA
ATTTGAATACCGTCGTGGTTATAAGTTCTCAACTTATGCAACATGGTGGA
TTCGTCAGGCGATCACTCGCTCGATTGCTGACCAAGCACGTACTATTCGT
ATCCCAGTGCACATGATTGAGACGATCAACAAATTGAATCGTATTTCTCG
TCAAATGCTACAGGAAATGGGTCGTGAGCCTATTCCGGAAGAGTTGGCTG
AGCGCATGCAAATGCCTGAAGACAAAATCCGAAAAGTGCTTAAGATTGCG
AAAGAGCCAATCTCAATGGAAACACCAATTGGTGATGATGAAGATTCACA
CCTAGGCGACTTCATTGAAGATAATACGTTACAGCTTCCAATGGATGCAG
CAACAGCAACTAACTTGCGTGCGGCAACTAACGATGTTCTAGCGGGTCTT
ACGCCACGTGAAGCGAAAGTACTTCGTATGCGTTTTGGTATCGATATGAA
CACTGACCACACTCTAGAAGAAGTGGGCAAGCAGTTCGACGTAACGCGTG
AGCGTATTCGTCAAATCGAAGCCAAAGCATTACGTAAGCTTCGCCACCCA
AGCCGTTCAGACGTGCTACGTAGCTTCCTTGACGAGTAA
>PBPRA0500 GALR, hypothetical protein
TTGCAGTTTTTCCATGAAAATAATGTGAGCGTTCCACAGCAAGTATCTTT
GGTTAGTTTTGACAGTATTGATCGCTGCGCCAGTTTTTATCCCACGGTTT
CGGCAGTACATTTTCCTATTAGTAAAATGGCTCGAGTTGCTGTTGAAGTG
CTGATAAACCTGATTGAAAATAAAGATATCAGTATAGACTGTCATTTTGA
GCCACAACTTGTAATTCGCCATGGTGATCGTGTGATTTAG
>PBPRA0601 HD1699, putative transcription elongation factor GreA
TTGGGGTGTACTGAGGTAGTAATATTTATGGAAAAGGTTCCAATGACTGT
GCGTGGTGAACAAACCCTACGTGAAGAACTGGAGATACTGTTAAAGCGTC
GCCCTATTATTTCAAAGGCGATTGGTGAAGCTCGTGAATTGGGGGACTTA
AAAGAGAATGCTGAGTATCACGCTGCGCGTGAGGAACAAGGTATTTGTGA
AGCACAGATTCGAGATATCGAATATAAGCTTTCTGTATCTCAGGTTATTG
ATGTCACTAAAATGGAAAATACCGGCAAAGTGATTTTTGGTACGACTGTT
AAGCTTATTGATATTAATACTGATGATGAATTGACGTATTGTATCGTTGG
TGATGACGAAGCCGATATTAAGAAAAACCTGATTTCCGTTAACTCGCCGA
TTGCTCGTGGGTTAATCGGTAAGCTTGAAGGTGATGAAGTGTCTATTCAT
ACACCGGGTGGTGTTAAAGAATTTGAAATCGAGCAAGTTCAATATCTTTG
A
>PBPRA0466 PSPTO300, putative xylose operon regulatory protein
ATGAATAAACGTTTTCGCATCACACTGCTCTTTAATGCTAATAAAGTGTA
TGATCGCCAAGTGATAGAAGGAGTGGGTGAATACCTTCAAGCATCCCAAT
GTGATTGGGATATCTATTTAGAAGAAGAATTCACCACTCACATCGAAAAC
TTTCATGCGTGGAAAGGCGATGGGGTTATTGCTGACTTCGATAACCCTGA
CATCATGGCGTTATTAGAACATTCAGACATCCCCGTTGTTGGTGTGGGCG
GTTCCTATGAAAACAGCCAAGACTATCCCGATGTCCCTTATGTCGCGACC
GATAACCAAGCCCTGATAGAGTTAGCATTTCAGCACTTACGTAACAAAGG
ATTAGAAAACTTCGCTTTTTATGGAATGCCACAAGATTCTTGGAAACGTT
GGGCTCATGAACGTGAAAAGGCTTTTAAGCATGTTGTCCAATCTGCAGGG
TACTCTTGTTCGGTCTATCGCGGCAATGATACCAGCCCGCAAACATGGCA
ATACGACATGAACCGTTTAGCCGATTGGCTACAACGCTTATCCACTCCCA
TCGGCATCATCGCCGTGACGGATTCAAGAGCACGCCATCTTCTACAAGTC
TGTGAACACCTTAATATCATGGTGCCTGATAAAGTATCCGTGATTGGCAT
CGATAATGAAGAGCTTGCGCGCTACCTAACCGCGAGTATCACTGAGCTCT
GTCGGGCAAGGCTGTAA
>PBPRA0465 RB1454, hypothetical protein
ATGCGAATATTAGTGCCGCCAACACAAGTATTTGAACGCCAAAGGACCGA
CTTTCAAGCAATAAAAGATACGTACGTTATTCAAGCCATGCGCTTTACTC
GCCTCAATGCGTGCAAAGGCATTAAAGTGGATCAAGTGCTCAGTTATGTC
GGTATTTCTCGTTCCAATATGGAAGCTCGATTTAAAGAAGAACGGGGGCA
CTCTATTCACCCAGAGATTCATAACTCAAAATTGAAGCGAGCGGGCTGTC
TTCTAAAAACAACTTCTTTACCCATCGTTGAAATTCACATCTGTGTGGAT
ACCCTTCCTTGCAATACATGTATACCGTTTTTAAAAAGAACTTAA
>PBPRA0481 SO0916, hypothetical transcriptional regulator, MarR family
GTGTACCGCAACTATATTTACTTGAGAGATCATGCCATGCAACCAGAAGA
ACTCCGTCAGCTCTCACGCCAGTTGGTTCGCCAACTCGGTTTACTGGATA
ACCATTGTGGGTTGTTAAAGTTAACTCCCGTGCAAGCTCATACATTGATT
GAACTTGAATATGCGCCATGCACCGTTAACCAAATGGCAGACAAACTCAA
GGTTGATAAATCGAATGCGAGTCGAACCTTGGCTGTTTTACTTAATTTAG
GTTTGGTTGAAAGCACCCCTAATCCTGACGATAAACGCAGCCAACTCTTT
CGGTTAACGTTATTAGGTCAACAGACACTGACGTCTTTACACACCCAACT
CAATCTTCATGTGCAAACGGTACTGGATCAGATGGACAGTGATGAAATCA
GCCAGCTCAAAAGCAGCCTAACACGCTACAACAAAGCAATTCATACCGCC
CATAAACAACACGGTTTTACCCTTCGTCCATTGACCCCTTTAGATAATGC
TTCCATCGCTGCCATTATTCGAAAAGTGTCAGCAGAATATGGTTTAACCG
CAGATAAAGGCTATGGAGTTGCCGATCCTACGCTTGATTCGATGAGCGAG
GTTTACCAACCGGATAACTGTCAATATTGGGTTATTGAAAAAGATCATCG
AGTACTTGGCGGTGGAGGCATTGCAGCACTCAGCAATATAGATGGATTGT
GTGAATTACAGAAAATGTACTTCCTGAACGAGCTGCGTGGTAAAGGGTTA
GCCCGAAGCTTAGCGGTAAAAGCGTTAAAATTTGCCCGAGAATACGGCTA
CAATGGATGCTACCTCGAAACAACCGAAAACCTAACAGAAGCGATTGCCT
TATATGAATCGTTGGGGTTTGTTCATATTCCGCATGCGATGGGAGATACC
GGCCACGATGCATGTGAAGTTCGCATGCTCAAAACCTTTTAA
>PBPRA0547 SO3988, putative aerobic respiration control protein FexA
ATGCAAACCCCTCACATTCTAATTGTAGAAGACGAGCACGTAACACGTAA
TACCCTTAAGAGCATTTTTGAAGCTGAGGGTTACACTGTCTTTGAAGCCA
ATGACGGCGCTGAAATGCACCAGATGCTTTCTGAGCACCCCGTTCACCTT
GTTATCATGGACATCAACCTACCAGGTAAAAATGGTTTATTACTAGCACG
TGAACTTCGCGAGCAAGGTGATATGGCTCTTATGTTCCTGACAGGTCGTG
ACAACGAAGTTGATAAGATTTTAGGTCTTGAAATTGGTGCTGATGATTAC
ATCACTAAACCATTCAACCCTCGTGAGTTAACTATTCGTGCGCGTAACTT
ACTGACACGTGCGATGAACCAAGGTCTACCAACTGAAGATAAGAAATTGG
TAGAGCGTTATGAGTTCAATGGTTGGTCTTTAGAAATCAACAGCCGTTCT
TTGGTTAGCCCAAGTGGTGACCAATTTAAGCTTCCTCGTTCTGAATTCCG
TGCTTTACTTCACTTCTGTGAAAACCCAGGCAAAATTCAAACGCGTGGCG
ATCTTCTGAAGAAGATGACTGGTCGTGAACTTAAGCCTCACGACCGTACG
GTTGACGTAACTATTCGTCGTATCCGTAAGCACTTTGAATCTGTTGCTGA
TACACCTGAAATCGTTGCAACGATTCATGGTGAAGGTTACCGTTTCTGCG
GTGATCTAAACGAAGAATAA
>PBPRA0562 STY2836, putative ATP-dependent RNA helicase SrmB
GTGAAAGACTTTTCCGAGTTAGAGTTAGATAGCGCACTATTAAACGCGAT
TGAAGAAATCGGCTACACCCGCCCGACCGAAGTTCAGGCACAGGCTATCC
CTCACGCCCTGGACGGTAGAGACGTATTGGCTTCCGCTCCTACAGGTACC
GGAAAAACAGCTGCATTTCTTTTACCGATGATCCAGCACTTACTTGATTT
CCCTCGTAAGAAGCCAGGGCCAGCGCGTGTATTAATTTTAACCCCAACGC
GTGAACTTGCGATTCAAATTGCTGACCATGCGCGTGCATTAGCTAAAAAT
ACTCACCTAAAGATCTTCACGATCACTGGCGGCATTTCATACGATGACCA
CGCTGAACTTCTAGGTAAAACACAAGATATCGTTGTGGCAACACCGGGAC
GTTTAATGGAGTACGTTGAGAGTGAGCGTTTCGATTGCCGAGCAATTGAA
TGCTTAATTTTAGATGAAGCTGACCGTATGTTAGATATGGGCTTCACTAA
AATTGTTGAGCGTATTAACCACGAATGTCGCTGGCGTCGTCAAAGCCTTC
TATTCTCTGCAACCTTAGAGGGTAAAGGCGTTCGTGAGTTTTCAGAAACA
ATTCTGAAAGAACCTGTAGAAGTAAACTCTGCACCTTCACGTCGCGAACG
TAAGAAGATTCATCAGCTTTACTTACGTTGTGACGATATGGATCACAAAT
TAGCATTGCTTGAGCAAATCCTGAAACATCAGGCAGAGCGCAGCATTGTC
TTTGTGAAAACCCGTGATCGTCTGGCTATGTTGCGTGATCAGCTTGCATC
AATGAACGTGAAATGTAGCTGGATTCAAGGCGAAATGGCGCAATTATCTC
GTAATAATGCGATTTCTCGTTTCCGTGATGGTGATGTCAACATTCTGATT
GCAACCGACGTTGCGGCTCGTGGTATCGATTTACCCGACATCAGCCACGT
AATCAACTTTGATATGCCACGTACCGCTGACGTGTATTTACACCGTATTG
GTCGTACTGCACGTGCAGGCAAGAAAGGTATTGCGATTTCACTGGTTGAA
GCACACGATCAAGCGATGATCGAACGTGTAAGCCGTTATATGGAAGAAGA
AGTGCCAGAACGCTTCATCAATGGTTTACGCCCAGCAAGTAAAAAAGCCA
AAACCATTAAAAAGAAAAAAGTAAAAATCGATAAGAAACTGAAAGTTGCT
AAGCAAAAGAAAGCCGCTAAAAAGCATAAGAAAGCATCAGAAAACAAACC
TGAAGCTTAA
>PBPRA0499 STY3156, putative transcription regulator LacI family
ATGGCAAGGATTAAAGATGTAGCTCTTTTAGCTGGAGTTAACCGTTCAAC
CGTCTCTCGCATTATCAATGGCGAAGGTAAATTTAGGGCGGATACTAAAC
GCAAAGTTGAACAAGCGATGGCGGATTTGAATTATCGCCCCAGTGCGATC
GCTCGCTCTCTCGCGACAGCTTCATCAAATATGACTGGCTTGTTGGTGAC
TGATTATACTGGTGGGTTCTTCGGCGAAATGATGAATCAAGTTCAGACTG
AACTTGATTTGCACAAGAAGTTTTTGATTACTGCTCAGGGGCATCATAGT
GCCGAGGGGGAGCGTGACGCTATTTGCCGCTTCCATGCTCTTCGTTGTGA
CGGCTATGTACTCAATAGTCGCTATCTTAGTGATGATGAATTGCGATTAT
TGGCTAAAGAGCCAACACCGTTTGTTTTGCTTGACCGTAGCGTTGAAGGT
TTGGAATCTAGATGTATAACGTTTGATCATTCTTTAGCGGGGCAGATGGC
TGTCGACCATCTGATTAATCAAGGTCACAGAAAAATTGCGTGTATAACTG
GTCTACTCAATCGAACGAACAGTAGACAGCGTTATCAAGGTTACCTTAAT
GCTTTATCTACCGCGGATATCACCGTCGATCTGACTCTGTGTGCCGAGGG
TAATTATGGGCGAGAAAGTGGTTATCTAGCAGCAAAAAAATTGTATCATT
CTCATCCTGATTTGACTGCGTTATTTTTCATGTAG
>PBPRA0611 T3205, putative transcription pausing L factor
ATGAACAAAGAAATCTTGGCTGTCGTTGAAGCGGTATCCAATGAAAAAGC
TGTTCCTCGTGAGCGTATCTTTGAAGCACTAGAGATCGCACTGGCAACAG
CAACAAAGAAAAAACACGAAGCAGAAATTGATGTTCGTGTTGCTATCGAT
CGTAAGACGGGCCAAGTTGCAACATTCCGTCGTTGGCTTGCTGTTGACGA
AGTCACTCAACCGACATTAGAAATGACGATTGAAGCGGCACAGTACGATG
ATGAAACCATCGAACTTGGTGGATTTGTTGAAGACGAAATCGAATCAGTA
ACATTCGACCGCATTACAACACAAACTGCTAAGCAAGTAATCGTACAGAA
AGTACGTGAAGCTGAACGCGAGCAAATTGTTGAGCAGTTTATGGATAACG
AAGGTGAGTTAATCACTGGTATCGTTAAAAAAGTAAACCGTGATGCAGTA
ATTATTGATTTAGGTAATAATGCAGAAGCCGTAATCCAACGTGATGATCA
GCTTCCTCGTGAAAACTTCCGTTCAGGTGACCGTATTCGTGGTCTTTTAT
ACGCAGTGCGTCCTGAAGCGCGTGGTTTCCAATTGTTCATGACACGTTCT
AAAGCAGAAATGTTGTTAGAACTATTCCGCATTGAAGTGCCAGAAATCGG
TGAAGAGCTGATTGAACTAATGGGCGCGGCTCGCGATCCTGGTTCACGTG
CGAAAATTGCAGTGAAAACGAACGACAAACGTATTGACCCAGTTGGTGCG
TGTGTTGGTATGCGTGGCGCACGAGTACAAGCCGTTTCTAGTGAACTTGC
TGGTGAGCGTATTGATATCGTTCTTTGGGACGAAAACGCAGCACAGTATG
TTATCAACGCAATGGCGCCTGCTGAAGTTGCTTCAATCATTGTTGATGAA
GATAGCCACACAATGGACATTGCTGTTGAGAAAGATAATCTTGCTCAAGC
AATTGGTCGTAGTGGTCAGAATATCCGTTTAGCATCACAGCTTACTGGCT
GGGAACTAAATGTAATGACTGTAGAAGATCTACAGAAGAAGCACAAAGAA
GAAGCACAAGTATCGATTGATACGTTTACTAAATACCTAGACATTGATGA
AGACTTCGCGACGCTATTGGTTCAAGAAGGCTTCACAACACTAGAAGAAA
TCGCTTACGTTCCTGTTAGCGAGCTTATGGATGTTGAAGGTCTTGATGAA
GACGCAATTAATGAGCTACGTAAGTGTGCGAAAGAAGCACTGACTACGCT
TGCCCTTGCGCAAGAAGAATCATTTGAAGGTGTGGAGCCTGCAGCTGATC
TTCTTGGTCTTGACGGTTTAGAGCGTGAATTGGCGTTTAGGCTAGCTGCG
AAAGGTATTTGTACGCTGGAAGATCTTGCTGACCAAGGCACAGATGATTT
GCTCGATCTCGAAGAGATGGGCGAAGCAAAAGCGGGTGAGCTTATTATGG
CTGCGCGTAATATTTGTTGGTTTAGCGACGAAGCGTAA
>PBPRA0420 VC2489, putative transcriptional regulator
ATGGCAGGAAAGGCTGGGCGTCCGACGGGAGTATCTGATGCAAGACAGCG
CTTGATCCATCAGGCGAGGTTACTGTTTGTTGCACTGCCATACAGTAAGG
TGTCTACGCGTATGATCGCAACCCGTGCTGATGTTAATGTGGCACTCATC
CGTTATTACTTCGGTAACAAAGCGGGGTTGTTTGAAACCATGCTACGTGA
AACTGTTGAGCCTATTCAAAGTCAATTTGCAAAGGTGTTAAACAAGGGAG
ACATAGAAAGTATTGGTGAATTAATGCGAACTTATTACCGCATTATGGCA
CCAAATCCAGACCTGCCTAAGTTGAACTCTCGCGCCATGATGATGGAGCC
CGGTGCATTGCAGCGGCAAACGATTGAAAATATGTTCAGTAATATTGCAT
ATTCGGCAACTGAATTAATGTTTAAACCAATGAAGTTGAAAGGGCAATTG
CGAGAAGGCATTAACCCTGACAAAGCCAGAATGACGTTTATTAGCATGAT
GGTCTTTCCATTTGTAGCGCCTCCCGCCATGCTTGAATTACAAGGTATTA
AATTAGATGAAGCGTACTTAATGGAATTAGCAGACCATAATGTAAGAGTA
TTAACGCAAGGGATCTTAGCTGAAACAGAGGACAGTTCAGCATGA
>PBPRA0427 YGAE, putative LuxZ
GTGTCTAGCCCTACTTTGACTAATAAAATTATGGAAGTTATACGACAAGA
TATTCTGCTTGGAGAGCTTTCTCCGGGCCAAAAGCTTGTCGTTGCCGACT
TAAAAGCACGCTATAACGTCGGAGCCTCACCCATTCGCGAAGCGCTGGTT
CAATTATCATGGAAAAAATACGTCAAATTCGCCCCTCAAAAAGGCTGCTG
GGTTGCCCCCATTTCGGTAGATGAACTTGAAGATCTGTTTGAGACTAATC
TGATTTTATCTCGCGTATTATTAGAACGAGCAATCATCAATGGCGACGAG
GCATGGGAACTCAATATTCTCACTACCTATCACAAGTTAAGCAAAATAAA
CCCTGCGGCTTCAGACGTTGATTTTACGGAATGGGAAGATCGGCACAGTG
AATTCCACCTCGCTTTACTTGCGGGCAGCCAATCACCAGTAATGCTGGAA
CTATACCGTGAAGTTTATGAGCAAATTGAACGTTACCGTCACGTCTGGGT
AAGCCGCAATCGCCACTATGAAGAACGTTATCATGATAATGGTGAACATG
ACGCGATGATGAAAGCTGTGCTAGGGCGAGATACACAACGGGCACTCGAT
TTACTTAATAATCACTTTAAGCGAGCAGTCGAAATCATTAAAGCATACAT
CTAA