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# Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, Arkansas

>ECH_0941 putative transcriptional activator, Baf family
ATGTTAATAGCAATAGATATAGGTAATACAAACATAAAATTAGCAATCTG
TGCAAACAATAAAATTATAAAAAGGATAACTATCTCTTCACAATCTAGGA
GAACAGCTGATGAATACTTCATATATTTAAATTCTACAATGAATCAATTA
AACCTTGATTACAAAAATATAAATAATATTATCATATCAAGTGTAGTTCC
AAGTATAACAAAGCCAATTATCGAATTAAGTCAAAATTATTTTAATATAG
ATCCCACAATTTTGAGTAACCATCATGCAGACATTTTTAATATTAAGATA
AGCTTACAAAACAAAGTATTAGGATCAGATAGGTTAGCAGATATAATTGC
AGCAAGCAGTTTATATCCCCATAAAGATTTACTCATAATAGGTATGGGAA
CTGCAACAGTATTTAACTTATTAAATAAAGATAAATGCATATATGGACAA
GCTATAGCACCTGGAGCACATATTTTAGCAAAAAGTATGAGACAATACAC
TGCCCTATTACCAGAAGTATTAATTTCAAAACAAGACAAAGTAATACATG
ATAATATATACCACGCAATGGAATCAGGAATATACTGGGGATATATTACC
ATGATTAACGGAATGATTGAAAAAATAATAAAGGAAGAGGAAAAAGATTT
ATATATAATAGCAACAGGAGGAAATTCTAACTTATTCTTTAATCACAAAA
CTGCTATTCACAACATCGAAGTAGACTTAACCATAAAGGGTCTCATACAA
TTACATACTGTACTATCTTGA
>ECH_1118 putative transcriptional regulator
ATGTCTACACATGCGAAAAACAAAATAAATAAAATGGAAGATACTGATGA
AATAAAAGCACATGATCCTTTAATTGCCGGTTTGATCGATAAAAACATGC
AGAAAAACAAATTTACAAATAAAGGAGTAAACGACAATCATACTTCCAAA
AATTTCACAAAAGAAGGAGTAGAATCCACAAAAGATCTAAAAAATAGCAC
AACAAAAATTAGGCCTCACCCTGTTGATGAGTGCGTTGGGAAAGAAATAA
AAAGACAACGTATCATGAGAGGTATGAGTCAAAACCAGCTTGCAAACAAA
TTAGGAATCACTTTCCAACAAGTACAAAAGTATGAAAAAGGAACAAACCG
TATAGTGATTAGCAGGCTATATCAACTTGCAAGCGTACTTAACGTTGAAG
TAAGAGATATAATGTTAAAGTTACAGGAAGATCTAAAAAATATTTCATGT
GATCACACTGTTGCATCTACATCTACTCTTAAAGATAACGAGGAAAAGTT
TATACCAGAGTTTCACGATAGCAAAATAGATAGCAAAGAAGTTTTAATGA
TGGTTAGAGCATATACTTGTATAAAAAATGAAAAAGTACGTAACATAATT
TACAATTTGGTTAAGGCATTGTCTTTAGATAACAAACAGTAA
>ECH_0628 rrf2/aminotransferase, class V family protein
ATGTCACATATTGCAAATAGCCAATCCCTCTCTGAAGGATACTTAGAGCA
AATTATTGTAAAACTAAAAAAGCAAGGATTAATAAACTCTACAAAAGGCC
CTGGTGGTGGTTATTCTTTAAATAAGAGTCCAAATTCAATTACACTTAAT
CTAATTCTTGAATCCATAGGAGAAAATATAAAAATTACAAGATGTAAAAA
TCATCTCATAGGATGCTTATCAAATAATGCTAGATGTATTACTCACAATT
TATGGGATAATATAGGCAATCATATTAAAAAATATTTAAATAGCATTTCA
TTAGAAGATATACTTAACAATAATTTTAAATCTGGCACGACTGTAAACAA
TAATGCTAATGAATATATATATGCAGATTATAATTCAACATCAACTATAT
TACCCACAGTTAAAAGTCAATTAGATAATCTATCTTCTCTAAACATATAC
AATCCGTCATCAACACATAAACTAGGGCAAAATACAAAAAGTATTATAGA
AAAAACAAGAGAAATAGCCATCAATCAATTAAATGCTAAAAATCATGACG
TAATTTTTACTTCATCTGGTACAGAAGCAAACAATTTAGTAATAAATAGT
ACTGCTGATTATAAATACTTAATTTCTTCCATAGAACATCTATCTATCAT
GAACTGTGCAATAAATGCAGAATTAATACCAGTAGATTCTAATGGAACGG
TATGCTTAGATACATTAAGCGATATTTTATACAAATGTAAAGATGAAAAA
GTTCTCGTATCAATAATGACTGCAAATAATGAAACTGGAGTAATTCAACC
TATAAAAGAAATAGTAGAAATATCACATAAATTTGGTGCAATAGTACATA
CAGATGCTATACAAGCATGCGGAAAAATTCACGTAGATATTGAAGATTTA
GGGGTAGATTTACTAACAATTTCATCACATAAACTTGGTAGTATTGCTGG
AACTGGTATATTGTTTTTTAATAGTAAAAAAATAAAAATAAAGCCTATGA
TATTAGGTGGACACCAAGAAAAAGGACTACGTGCAGGTACTGAAAATGTT
GTATCAATCTATTTATTATCTATATCTCTAAGCAATCTAAAAGATTCTAT
AAAAAAAATGTCTAGTGTTGAGAGATTACGTGATAAACTAGAAAATCAAA
TATTAAACTTGGTACCTGAAGCTCAAATTTTTGGCAAGAACACACGAAGG
TTACCAAACACTACATGCATTTCGATGCCAAATGTAAACAGTGAAATACA
AACAATAAGTTTTGATATTGATAACATTGCAGTTGGTAGTGGATCTGCCT
GTTCTTCTGGAGCATTAGAACATTCCCATGTATTAGCTGCGATGGGAATA
GATGATAACGTAGCTAAAAACTCTATCAGGATTAGTCTTAGTCCTGATGT
AACAGATGATCAAGTAAACAAAATAGTTAATTGTTGGTACAAGATATATA
AAAATAATCAATTACTCAAATTAAATTAG
>ECH_0185 ATP cone domain protein
ATGAAATGTCCTTTTTGTAATAGTACTGATACTCAAGTTAAAGATTCAAG
GTCTATAGAAAATGACATGTTGATTAGAAGAAGAAGAGTATGTCTTGTAT
GTCACTCTAGGTTTACAACAACTGAAAAATTACTTCTTAGATCGTTTATG
GTTGTAAAAAAAAATGGTGAAACTGAACTATTTAATAAACAAAAGTTACT
TTCTTCGATTTTGATAGCGACAAAAAAACGTCCTGTAAGTCATGAAGGGA
TAAATATGATGGTGAATAATATTTTTTATGAGCTTGAAGGAAAAAAAGAA
AATGCTATTCCGACTAATGTTATTGGAAAAATGGTTATGGATAATCTTTT
TAAGTTAGATAAAGTAGCATATGTTAGATTTGCTTCTGTATATATGAATT
TTAGAAATATAAATGACTTTAGTAATATAATTGCGAAAATAATTAGTGAA
AAGACTCCTTAA
>ECH_0298 cold shock protein, CSD family
ATGTCTCAACGGTTAGTGGATGATTCAACTTACACTGGATATGTGAAGTG
GTTTAGTTCAGAAAAGGGTTATGGTTTTATTTGTAAAGATCAAGGTAATA
ATAAGATAAGGAATATTGGTCAAGATATTAAGGATATTTTTGTTCATATT
ACTGCATTGCAAAGAAGCAAAATTGATGGTTTAAGAGAAGGCCAAAAGGT
AAAGTATCAGCTTGATAAAAATAATGGTAAGTTTTCAGCAGTTAATCTTG
AGTTGTTAGAAGGTTAG
>ECH_1013 DNA-binding protein
ATGATAGTTACTAGAATGAGATACCAAATGGATAAGATGGGAATAAATGC
GCGTGAATTAGCGCATAAAGCTGATGTTGGTAAGTCTTTTGTATATGATA
TATTAAGTGGTAAATCAACGAATCCTACATCTAAAAAATTAATGGCAATA
GCGAAGGTATTAAACGTTTCATTATCATATTTTATTAGTGATGATAATTA
TACTTATGGACAGAATAATGTTAATATAATGCCTGTATATGATTTAGAAT
TGGAAAATGGTAAAGTTGCATCCTCAGGTGATGTTAATTTGTATCTCTCT
TCAAACATTAATTTAACTTCTAATATGAAGAATTTACGTGTATATTACGT
AAAGGGAGATAGTATGATCCCAACATTAATGAATCAAGATGTAGTTCTAG
TGGATATAGGAGATAAAATTCCTCATCCTGCTGGATTATTTGTTATAGTT
GATTCAGTAGGTGTATCAATTAGGAGATTAGAGTATTTAAAAGATAATCA
GAAGATAAAGTTACATGTAGTTTCTGATAATAAAAAATATTCTTCTTATG
AGTGTCATTTAGAAGATATGGAAATATTAGGGAGAATAATTTGGTATGCA
AGATCTTTATGA
>ECH_1012 DNA-binding response regulator
ATGCGTATATTATTAATAGAAGATGATATTGCATGTGCAAAGGCAGTAGA
AGCTTCTTTATCTTCAGAAGGGCATTTTTGTGAGACTATGACTTCTGCGC
AGGATTGTTATGGTAGTATCATTCCGAAGAATGATGACTATGATGTAGTG
ATATTAGATATACATTTTCCTGGAAAAATAGATGGATATGATATTTTAGT
GAAACTGCGAGAGTCTGGTATCAAAGTTCCAGTTCTTATATTATCATGTA
TTTCATCAGTATCACATAAAGTAAAAGGTTTATATTATGGTGCAGATGAT
TATGTGACTAAACCTTTTCATAAAAGTGAATTACTTGCGAGAATAAAAGC
TATTGTGCGCCGTACTAGGGGACATCCTGAATCAATAGTACGTGTTGGAA
ATATTGCAATCAATCTTGATCATAAGTGTGTTGAATGTAATGGTGAAATA
GTGCATTTAACTAAAAAGGAGTATGGGATGATAGAGTTGTTATCATCTAG
GTTAGGTACTGTTCTTACAAAAGAAATGTTTTTATCTCACCTATATAGGG
AGTTAGATGAACCTTCTGATGATAAAATTATAGATGTGTTTATGTGTAAG
CTTCGTAAGAAACTTAAAGTCGCTAATAATGGGAAAAACTACATAGAAAC
TGTTTGGGGACGTGGTTATGTATTAAAAGAGTGTGTTGACGAAGATGAAA
GTGATGATAGAGGAGGATATAGATGGGATCATGGTGGTGCCAATGTTGAC
TCAATTTATGGTCAAGAGGAAGATAAAAAGTATGTTGAGGAAGCATAA
>ECH_0163 transcriptional regulator, MerR family
ATGGGTGAAAAGAAAATATTACACGATGAATATAGTAGTAAGCTTAAAAC
AATAGGTGAGGTTGCAAAAGACCTGGATGTTGAACAATATGTACTAAGGT
TTTGGGAAGAAAAATTTCCTCAGGTTAATCCAATTAAACGTCGTGGTAGA
AGATTGTATTCACAAGTTGATGTTGATACTTTAAAGCATATTAAGCATTT
ATTGTATGATAAGGGATATAAGATTAAAGGTGTGCAGCAAGAATTAGGTA
GGAAACCTGCTAATATTAATAAACACACTAATGATACAGAACAAAGTGTT
TATAGAAAAGATTTAATTAGTTTGCTAGATGATATGTTAAGCTTAAGGGA
TAGTTTGTTAAAGAAGTTTAACGGAATGTAG
>ECH_0763 conserved domain protein
ATGTTAACTTCCATTAAAAATAAATACAATCCTTACAACAAAGTAAATCA
ACCAAACATCAATCTTTCCTTTACCATTTTACATAAAAACGATACAAAAG
GTACAATAGATCAGGAATATGGCAATAACATAACACATAATACATTCTCT
AATGGTTTAGGTACAACATCTATAAATCTATTAGATAAACCAACAATTAA
AGAAGAAATACTATCACAAGATAATAACAATTGTTATGATGTCACAACCC
AACAATATGACACCAACAATATCACACTGCATAGTGAAGAAATTAGTTAC
GAAATGGCATACAGTTTATTGCTAGATTTAGTAAATAATGACATTGAATT
GCTTGAAGAAGTTCTATTAATTGCAAAAATTTTAATCAAAGAAGGGGTCT
TGGTTGCTCCAGAATCCAAAATAAAAAAGGATATTGCTCAAATAGTTCTC
CACAACATAAGTAAGCAAACAACTCAAAATTCAGGTTATTCAAGGTAA
>ECH_0166 conserved hypothetical protein
ATGCAGGTTGATGTTGGAAGTGAACCTGATCATGGTTATCATATTTTATT
TAAAAACAATGGTCATGTTATATCAGATTTTCGTGGTGTACAAGCTGAAA
ACTTTGTATTTGATATAAAAAATCACAATTTAAGAGCTTCTTTCTTAGTT
GATCCTATGGCACCTTTTACAGAATTAGATAACAGTCAGCATCCACACTT
CGTCGTTAACATGCACACTGCAAATGAATGTGGTTCTGATTGTGTTCATC
ACAATGAACATGATCATGATGCACACGGAAGAGGTGCGGCTAGCTCTGTA
GCTGAAGGTGTAGGTTCTGCAATAAGTCAAATCTTATCTTTAAGTGACAG
TATAGTGGTTCCAGTTCTTGAAGGAAATGCTAGTGTATCTGAAGGAGATG
CAGTAGTAAATGCTGTAAGCCAAGAAGCTCCTGCAGCTAGTGTATCTGAA
GGAGATGCAGTAGTAAATGCTGTAAGCCAAGAAACTCCTGCAGCTAGTGT
ATCTGAAGGAGATGCAGTAGTAAATGCTGTAAGCCAAGAAACTCCTGCAG
CTAGTGTATCTGAAGGAGATGCAGTAGTAAATGCTGTAAGCCAAGAAACT
CCTGCAGCTAGTGTATCTGAAGGAGATGCAGTAGTAAATGCTGTAAGCCA
AGAAACTCCTGCAGCTAGTGTATCTGAAGGAGATGCAGTAGTAAATGCTG
TAAGCCAAGAAACTCCTGCAGCTAGTGTATCTGAAGGAGATGCAGTAGTA
AATGCTGTAAGCCAAGAAACTCCTGCAACTCAACCACAATCTAGAGATTC
TTTGTTAAATGAAGAAGATATGGCTGCTCAATTTGGTAATAGATACTTTT
ATTTCTAA
>ECH_0001 chromosome partitioning protein, ParB family
ATGACAAAAAGACTAGGAAAAGGCATTTTTGAGTTAATAGGGAATAGCAC
ATTAGAAATTAACAACAACATCAGTACTGATACCCACCTTACAATGCCGA
TAAATTTATTAAACCCTAGTACATCACAACCAAGAAAAACTTTTAATCAA
GAATGTCTTAAGGAACTGGCAGAATCTATTTCCAAACACGGCATAATACA
ACCAATAATCATCAGAAAAAATCCACATAAAAAAGGATATGAAATAATAG
CAGGAGAAAGAAGATGGAGAGCTAGCATACTAGCAAAATTAAAATCAGTA
CCTGTAATTGTAAAAGAAATAAGTGATAGTCAGTGTTTAGAATTATCAAT
CATAGAAAACATACAAAGACAAGATCTAACACCTATAGAGGAAGCTGAAG
CATACTCTAACCTCATCAATACTTTTTCTTATACACATGAAGATTTAGCT
TCCATTATAGGTAAAAGCCGTAGTCATATCACAAATATGATAAGAATATT
ATCTTTACCAACTTCTATAAAGTCTATGATAAACGATAAACTTATATCAT
TTGGACATGCCAGAGCTTTAATAAATATTGAAAATCCAGAAGCAATAGCA
GAAAAAATTATTTCTTTAAATTTAAACGTAAGACAAACTGAACTATTAAT
TAAAAATTTACAAAAACCACATAAGAAAAAATCCAAAGAAAACTTAACAG
AACTAGAGCAATCACTATCTGAAATATTAAATTTACAAATTAAAATAAAC
GGTTTAAAAAACAAAGGCAGTATTGTGATAAAATATAACAATACACAACA
ACTTAACTCAATACTAGAGAAGCTCAAGAAAGTAACTCAAACATAG
>ECH_0284 hypothetical protein
ATGTTACTATGCCTCATAATAATCTGTAGTCAGAACAGGAATGCTAGTTT
AGTAGATGATCAACAAGATCCTGTCTTATATGATTTTGAAGAACACTGTA
GCATATCTTCTAGTTCGTGTCATACTCAGAGCGATAGTACGCTTTCTGAA
GGTGAATCTGTAGATGAGGAACAGGAAGTCGATGATACAATGCAATACTT
GAGTGACTGTGATGACTTTGAAACGGATAGCCTTGAGATACACGATGATA
GTAGTTCAATGAATCAAGGACACTGTAGTTTAGGTGCTATACCTAAGACT
TATAATCCTACATTTATGCAAAAAAAGACTGGATGGATTGAAGAATCTAG
TAGTAGGGAATTCTCTGATGAATGTTTTTCATGTTCTGATGTTTCAGATG
ACGATATGTCTACTAAAAGTAGTATGTTGCTTGATTATGACTGTCAGAAT
AGAAAAAGTAATCCTAATCATGAACTTGTGGTATTGCGTACTGATAATTC
TGATGTAAGTACTGTAAATGTCAGTCGTGTAATGCCAAATGGGCGCATAA
GGTTAAATTCATTAGGAGGAGAAGGTGATCATCTGACATCTTATACATTT
GGTTTCCCATTACGTTCCAGTAGTAAACTTGTGTTAAGTAGTTCTAATCT
TAGTTTTTCAGAGTTGATAATAAGTCCTACTATATATGCAGAATTTGGTA
AGATAGATCCCTTCTGTTTTAGTTATTTTGAAAAAGATATGTTAGGTAGA
ATGGGTGGAGTACCTAGTTCTGGAGTTTATGGTATAGAAAGTCATGCTTG
TGCTAACAGTTTAATATCACAGGATGCCATTTTGGGTTTACGAACTTGTG
GGAAATTAAGGAAGGATACAGTTTTTGTTGTTAATCAAGGAGATTTAATA
GATATGAAAGATCATATTTCTAATGTTTTACCCAGTGATGTTAAACCTGG
AATTTCTAGTTCTAGAGAGATTGTAGGTTTAACAAGTGGATCTGAATGTA
CTGAAGAGAATTCACAAAGGATTGTTCAAGGAACAGGTGTTAGTGTAGTG
GAGGATGCAGTTCCTTCTGGATCTAGAATGGTGTTTGCTAGTCAAGATGT
GGATGCTATGTTTGCAAGTAGTGTTCAGATTATTCAAGATAGTATGGATT
TGTTATCTGATTTTTGTTTGGATGAGATGACTGATGATGAAGTTGAACAG
ATAACGCGTAATATGGAACAAAGTAGTACGTCTTGTGCAACAGTTTCAGC
TATGGCACAGATGGTAGGGGCTAGTAATGTTTCTGATGGAGCTAATACAG
ATGTTAATTATCTATGTCAAGAAGGAAAGGACAGTGCGGGATTGTTGCTA
GGAGAAGGTGTATCTAAGGATAAGAAGATGACATCTGCTGCATCAAGAAA
TGTAGTAGTTGTACAAGCAGAAGTGCATGAGCCGAGTACTAGTAGTTCTG
TTGTTCGCAAATCTAGAATTCCAATTAAGGTTGGTGAGTCAAGTAGAGTA
GTTACGAAGAAAAGATTGGATGTTAAGCAAAGTAGTTTAAGTGTCACGTC
CAAAAGTCAAGGTTTAGGTGTGAGAAAGTTACAAGCAGTAGCAGCAGATG
ATCGACCTAATCTGGTTGGATATAAGTTTAAAAGTGGTGATTATATGCTA
TGTCAGTCTCCTAAGTCTAATCGTGCTGATGTAACTAAACGTAGAGTATC
TCAGAGCGGTGGTTCTGTATCAGTCAAACCTTATGAACCTGGGCATACTA
GGGTGGCAGCGCATAAAGAGTCTCAAAGTAGTGATCATGTCTCAGTTAAA
CCTTGTGAGCCTAGACGTATAGTTCCGCAAGTAACGGTAGCACTAAGAAA
AAAACGAGTGGTTTTTCAAGATACAGGGAAAGGTGAAGCTGTGCTCGGAA
GGCATGGTAGTACACAAGAATGTGTAGAGCCTAGCAGCGTAACAAGAAGT
TCTCTGGAGAATGTTCCTAATGTTGTGAAACATAAGTACGAAGATGTTTG
TCACAAGGATTCACGTCATGATATAGCATTAAGGAGAAGTGTATCTTCTG
TCCATCAGCAAAGTTCTAAATCTGCTAGAAGTATGGCTACTCTAGGAAAG
AGATCTGCAGCTGCTAAAACTGGGGTAAGCGTTAGGAGGACTAAAAGTGA
TGCTATAGATACTGAAAAAGGGCGAGATAAGCGCTGGTTAGAAAATGAAA
TTGCTATTCCACTAGAAAACACTGTAAGCCAAGTAGTGATTTGTGGGACT
AATGAAACATTACATGATACATTAAGTAAACATTTTAGAGTACTACATGA
TTCATTGTCACAATACAGTAAGAATTCAGATGCTGTTGTTCGATGCAAAG
AGGTATATTATATAGCACATTCACGCATTAAACATGCAGATAGTATTATA
CAGGAGGCTGTTGATAAATGGGCGTTAACGCAGAGAGCTACACTGTGGGA
TAAACATGGGAAAAAAGTAGTTACTGCGTGTATGAAGGATTTGGAGAAAG
TTTTTAAGAAGATTTATATAGATCAAGGTAAAACTTCTCTTGATTGTCAG
GCAAAACTTCAGGATATACGTAGTGAAGTGGAGAACAATGTCAAAAACCA
AATTGCTTGTTTAGTGAGAGATACATTCTTAAAAAATGCATGTGATGAGA
TTTTTACTGAGGTATCATCTACTATACTTCATAAAGTGTCTGTTGCACAT
GAGTCAATTGTTAAAGGAATGAGAAAATGTTCGAGAGAAGAGCTGGAAGG
TCAAGTAGTAAAGAGTTGTTCTATATTCCATAAGAGTAAGTTGCAATCTA
AAATATTAACTCATATAAATGATTTAGGTACATTTTTTAAGAAACAACTG
CAAGTAAAATCTAAGGAAATAGTAAAAGAACAATTGAAAAAATGTAAAGT
TGATATTGTTCCTGGTGATATTAGGCATTGTTGTATAGATACAGTAATTA
ATGCTCCTGTTCCTAATACTGCTGCTAGATATGCAATTCATGTATTGAAT
AGTAGACCAAATGTTAGTGGGCTTGATGCAGGACAACTGAGTTTTAGTTA
A
>ECH_0784 putative N utilization substance protein B
ATGAAAGATAATATATGCCACACACATTTGTGGCATTCAAAAAAAACAAC
AACTAGGTTCCTCGCTATACAAGGAACCTATTCTATGATATTTAATAACT
ATACTATAAATGACATCGATAACTTAATTGATTATCTATATGAAATGAAG
GAAGTATTAGATTTAATACAGATTGACAATCAGCTACTACTTAAAATTAT
GAACACAATGCTGTTAACCTTCAATACAATCAATTCAACAATTGCAACAT
TTTTAAATGAGAAATGGTCAATAGACCGCATAAACTTAATTAGCCTTTCT
ATTATTAAAACCGCAGTTTGTGAATTAATATGTTCCGATACAGATGCAGT
AATCATTATAAACGAATACGTTAATATAGCGAGTCATATATTAGAAAGAA
CAGACGTTAATTTTATTAATGCAATATTAAATCAAGTAAAATTTACAGCA
CGTCCTGTCCTAAATAAAGGTATAAATTTTCATATCGAACAAACTGAATC
CTCTGCTATTTTTAATAGTACATAA
>ECH_0133 greA, transcription elongation factor GreA
ATGAATGCGAGATTTCCTATTACAAAAAATGGGTTTGCAAAACTTGAGTT
AGAGCTAGAGTCATTGAAACATGAAAGGCCTAAAATTATAAAATCTATTT
CTGAGGCGCGAGAGTTGGGGGATTTATCTGAAAATGCAGAGTATCATGCT
GCTCGTGAAAGACAAGGGTTAGTAGAAAGTAAAATAATGGAGTTAGAATC
GAAAAAATCTAGAGCAGAAGTTATAGATGTTTCAAATTTATCTGGGGACA
CTGTTATGTTTGGGGCAACTGTAACTATGTCTATATATGATGAACAGACT
GGTAATACTGATGAAGTAGTGTACCAGATTGTTGGTGAGTATGAAGCTGA
TATTTCTAAACAAATGATTTCAATAAAATCTCCTTTAGTTGTATCATTAT
TAGGGAAAAAAGAAGGTGATGTTGTAGAAGTTAAAACTCCAAAGGGTGAT
TATAGAATATATAAAATTATAAAAATTGAATTTATATAA
>ECH_0250 mfd, transcription-repair coupling factor
ATGAATAATATTAATAAAATCTTCAATATTCCACAAACGCTAGAACCACT
TGTCATAATAAAAATGTATATAAAAAAACTAATTCATTCTGCAATATATA
TAGTCAATCAAGAAACACAACTACATAATCTAGCATCAATATTTAAGTTT
TATGTTCCAAATCTTGAAATAATCATATTTCCTGCATGGAATTCAATACC
ATATAAAAAAAATTCTCCACATAATTCAGTTATGGCAGAAAGAATTAAAA
CTCTATATTCCCTAATCACTAGACATAATGATAATCCCTATATTATTATT
TCAACAATTAATGCAATTACTCAAAAAGTATTACACCAAAATATCATATT
ACAATCAGTATTAAAAATTACATCTCTACAGAATATTACAAAAAACCATA
TAGAAGATTACTTAACCAATCACGGATACAGTCAATACTCAATAGTACAA
GATATAGGTGAATTTGCCACTTACAACAACATCATTGACATTTTTCCTAC
AACTTATAAAAATCCCATAAGGATTCATTTAAATAATAATCTTATACAAT
CAATTCACTATTTCAATCGCCAAACACAATTAATAGATAATAACTCTTCT
TTAAATGAGGTTGTTATTTATCCCACTTCTGAAATAATAAAACAAAAAAA
AAATATAGATATTTTTTCTAAAACCTATAAAACAAAACCAAACCAAGATC
AAAACCTATTAAACACAATAATCTCTGGAAAGAAACACATAGGAGAAGAA
AATTTCTTGCCTTTATTTTATAAAGAAGAATTACAAAATATTTTTAACTA
CATATCACAAAACACAACATTAATATTTAACGATAAGCTTATAAATGAAA
TAAAAGAATATAATAATCAGATATACCTAAATTACAGATCTCAACTATCC
TACCAAGTGCCTCCACCTCAACTTTACGTTGATTCTGAAGAATTTAAAAT
TATAACTAAACAGTTTCATAAAACTATATTCTCACAATCTGACAACACTA
GTAATAATTCAGCCTATACCGATAGAAATATACATACTTCTTCCTTCAAC
ATTACAGAAAAGATACAAAACGTCCCAAATTTTAAAACATTAGTACAAAA
CAAACAAATCGACATATTTGAAATATTGACACAATATATCAAAACTACAT
GTCACACAAAAAAATTAATAATAGCTTGTTACTCTACTGGCTCTTTAGAA
TATATCCAAAATAGACTTAGAACATTAAATATCAAACTATGCAAAATAGA
AAACTATCAGGAAATATGCTCTTCATATAATATTGCTATATTACCAATAT
ATCACAGCTTTATCTCAAAATATACTATTGTCATAGCAGAACACGATCTA
TTATATAAACAAGAAACAACTAATAAAAGTAACATTTCAAATATTATTAG
CAATGATACTAACCTAGATATTGGAGATATAGTAATACACAAAGACTATG
GTATTGGGAAAATAGTAGCACTTGAAACTACTAAAGTATTTGATAGTTAT
CATGATTTCATCAAAATAGAGTACTATAACAACGACAAACTATTCTTACC
TGTAGAAAATATTAATCTTATATCCAAGTATGGACAACAAAATGTCAATG
TTACCCTTGATAAACTAGGCAGTACATCATGGCAACAACGTAAAACTAAA
ATAAAAAACCATATCAAAAAAATTGCAAAAGAATTATTAACTATAGAAGC
AGCAAGAAGACTCTCTACTGGCAAATCATTTTTCCCTGATGAAAATTATA
AACACTTCTGTAATGAATTTTCTTATACTGAAACAGAAGATCAATTACAA
GCCATAAAAGACATGGAACATGATCTATCAAGTGGTAAAATAATGAATAG
ATTAATTTGCGGAGACGTTGGCTTTGGAAAAACGGAAATAGCTTTACGAG
CAGCATTCTTAGTAGCAAGTCAAAACTACCAAGTAGCAATTATAGTACCA
ACAACTCTACTGTGCAGGCAACATTTTATTGTTTTTACTGAAAGATTCAA
AAAATTTCCTAATATAAAAATCAAACAATTATCTAAAATTGTTGCGAGAT
CCGAAATAAAAAAAACTAAAGAAAGTTTATCATGTGGACAAGTACATATA
ATAATAGGAACACATGCCATATTAGCACAGGACGTTACGTTTGCTAACTT
AAGCCTATTAATTATAGATGAAGAACAACAATTTGGAGTAAAGCAAAAAG
AATTACTAAAAAAAATCAAAACAAACGTTCATGTAATTTCACTATCTGCA
ACTCCAATACCACGGACACTGTACATGTCACTATGTGGAATAAAAGATTT
GAGTTTAATAAAAACACCACCAAAAAATAGATTAGCAGTTACAACTTATA
CAACATATTATGAAGAAACTATAATAAAAGATGCTATAATACGAGAGCAT
AATAGAGGCGGTAGAGTATTTTATGTTTGTCCACAAATTAGTAATATAAA
AAGCATCAGCGACAAGATAAGAAAATTAGTACCAGAAATAAAAATGAACA
CTGCCCATGGACAACTTTCCCCTACCCAACTTGACACAATAATGAACGAT
TTTTTTGATGGCAAATTCACAATATTACTTACTACATCAATTATAGAATG
TGGATTAGATATCCCTTTTGCCAATACAATCATAATACACAATGCCGATA
TGTTTGGATTAGCTCAACTCTACCAATTAAAAGGAAGAGTAGGACGTAGC
AGTACCAAGGGTTTTGCATATTTTATATTATCTGAAAAAGCAACCAATAA
ATCTGCTATAAAACTGGAGATAATACAATCAATAGATTCTATAAATTCAG
GATTTAATTTATCATTACATGACATGGATATCAGAGGATTTGGTAATTTA
GTGGGAGAAGAACAATCAGGTAACATAAAAGATATAGGCATTGAACTATA
CCAACAAATGTTAGAAGAAGAACTTAACATTTATAGTGAATATCCTAAAG
ATCTTGACCATATAAATATCAATATCAATGTTAATATAAGAATTCCTGAG
CATTACATTCAAGATATAGGATTAAGAATGCGAGTATACAAAAAAATTGG
CAGTCTTAAAACAAAAGAAGACATAGATAATTACTATATAGAGTTAACCA
ATAAGTTTGGTAAATTGCCAAACGAAGTAGAAAACTTATTGAACACCATA
TATATAAAACAACTGTGTGCAAATATTGGCATTTATGAAGTCGAACAAAT
AAAAAACAGCATCCTTTTAAAAATAGATAGCAATACAACTCTTAAACAAA
AAATTCTTAATTATTTTATCAATAACCCTCTAACTTTTAAGATACAAAAC
AATAGTATACTTATGCTAATTAACAACAGTTCCAATTGCATTATAAGTTT
TATTATACACCACATTAGCAAAATAAACCTATTAAACAAGAAAGCAATAT
TATAA
>ECH_0562 nusA, N utilization substance protein A
ATGGTTAATCTACAAAATTTTGATAACTTAGAGTTAATAAGGGTGGCTAA
GGATATTGCTGATCAGAAAGGCTTGAATTTGGATGTTATAATAAGAGCTA
TAGAGGAAGCTATCCAACTAACTAGTCGTAGTAGATATGGGAATTGTAAG
ATTAAAGTTACAGTGGATAAAAAAACTGGTGTAGTAGCTACTTATAGGCA
AGTATTAGTTATCAATAATAATGGTGATATTAGTGTTCCTGAAGGCAAAG
AAAATGAGATAGATTTTTCTGATGTAAGCAAATATAAATTGATTACTTTA
GCAGAAGCTAAACAAATTGATAAAAATGTTGAAGTTGGTGATATAATGCT
TGAGCCTCTCCCTGTTATTGATCTTGATTATAGTTCTGCTAAGATTGCAA
AGCAAAAGATTGCTCAAGTTATTATTTCAGAAGAGCGTAAGAAACAGTAT
GAAGATTTTAAGGATCGTGTAGGTGATATTGTTTATGGTACTGCTAAGCG
TATAGAATATAATAATGTTATTGTAGATCTAAATGGAAATGAAGGTTATT
TATCAGCTTCAAATTTGATAAAAGGAGAGGTATTTCGTGTGGGTGATAGA
GTAAAAGCTCACATAGAAGATGTAAGAAAGGAAAATTCAGGACCTCAGAT
ATTTCTTTCAAGAATCAATAAAGGATTCATGGAGCAATTATTCAAGCAGG
AAATCCCAGAAATATATGATGGAATAGTTACAATTAAGGCAATAGCTAGG
GATCCAGGTTCAAGGTCGAAGGTTGCGGTTTTTTCTTCTGATAAAAATAT
TGATCCAGTAGGTGCATGTGTTGGTGCAAGAGGTGTAAGAATTCAGGGTA
TTATTTCTGAATTACATGGAGAGAAGATTGATGTGATTTTATATTCTCCA
GAACTTGCTAAATTTATAGTTAATGCTATAGCTCCTGCAGAAGTTTTAAA
AGTCATTATTGATGAAGATAAGGAAAAAGTAGAGTTAATTATTCCTGAAA
ATCAACTAAGTTTAGCAATTGGTAGGTATGGGCAGAATATCAGATTAGCA
TCTGAGTTGGTTGGTTGGAAAATAAATGTAATAGGAGATGAAACTGAATC
AAGTAGAAAAGCGAAAGAATTGAGTGCAGGTTCAAAAATATTTGTTGAAG
GATTGGATGTTGAAGAAATAATAGGGCAATTGTTATTTACTGAGGGGTTT
GTTAGTATTGAAGATATAGATCAAGCATCTGTTAGTGATATTTCTGCAAT
AGATGGGTTCAATGAGGAAATTGCAGAGGAATTAAAAAGTAGAGCAGCTG
ATTATTTAGTGCGTAAAGATGCTGAAATGAAACAGATTTTAGATAATTTA
TCTGTTGATAAGGATGTTACTATGTTACCATTTTTAAGGCCGAGTGATAT
TATAGCGTTGTCGAAAAATGGTATCAACAGTCTTGAAGATATTGCTGGAT
TGTGTACAGATGAGTTTTTTGATATTATTCCTGATATTGCATTGACTAAG
GATCAAGTAGACTCTGTTATATTAGAGTCTCGTAAGAAAATAGGATGGTT
ATAA
>ECH_0957 nusG, transcription antitermination protein NusG
ATGAAATATGAATGGTACATTATTCAGGTATCATCTGGTAGCGAAGAGAA
AGTTTGTCAAACTATTTTGGAAAATTCTCGGGTATTAGGCTTGGAAGAGA
GTTTCCGTGAAGTGTTTATCCCATATGAAGAAATTACTCGGGTAAAACAT
AATAAAAAGGTATTGGTAAAAAGGAAGTTGTCGCCAGGGTATGTGTTTTT
GTATATGAGTTTACATGAAAATTCAATGAATTTTATTAGGAGTATACCTA
GGGTATTGAATTTTTTAAATAACGATTTTGGTGTTCCTAAAGTTATTTCA
GAAAATGAAATGGAGTCTATGCGTAAGAAAATGTGTCAAAGTGTAGTAGA
TGATACTAGTGTTGTTAATTTTGAAATTGGTGATGAAGTTGTAATTAATG
ATGGATTATTTCAAGATTTCAATGGTAAAGTTGAATATATTAATGATGAT
AAGAAAATAGCGGGAGTCAGTGTGATGATATTTGGTAGACTGACTAAGAT
AGAATTTAAGTTAGAGCATATACAAAAAGTGGAGGGATAA
>ECH_0062 recG, ATP-dependent DNA helicase RecG
ATGCACAACTTAAGCATATTTTCTAGCATGTATATGTTGCCAGGAGTTAA
TAATGTAGTAGGGAGTTTATTAAAAAAGTTATGTGGTGGTGATAAAATTA
TAGATTTGTTATTTCATATACCACAAAGTTATGTGGATAGAAGAACTGCG
TTATCTGAAGATTCTGTAGGTAAAATTGTAACTTTTATTGGTACTGTGAA
GTGTCATGGTTTTATTGGTAGGAAAAGAAAATCCCAGTATAAAATTGTGC
TTGATACATGTATTGGTGAAGTATCATTAATTTTTTTTAATTACTCGTTG
AAATATCTGAGAAGTGTTTTAAAGGTAGGTTCAACATGTGTAGTAAGTGG
TACTCTGATAAGATTTTTGGGATGTTTGCAAATTACACATCCGGATTATA
TTGTAACAGATATTAAAAAGTTCCAGGATATTAGTATCATAGAACCTATT
TATCCACTAATTAGAGGATTAACTTCTAAGAGAATTTCAAAGTTAGTAAA
GTTAAGTGTAAGGTTGTTACCTGATTTTCCTGAATGGATAGATGAAAAAT
TGTTAAGAGATAATAGATGGAATAGTTGGAAGGAAAGTTTAATAAAAATA
CATCACCCAGATACACTTGAAGCTGTGCATTTACATAGGGCAAGGTTAGC
GTATGATGAATTATTAAGTCATCAAATCTCTGTAAAAATGGTCAGGAAAT
TTGATTACCAACAAGGTGTCTCTATTGTAAGTAAGCAGCTATACTATAAT
GATATTTTAAATAAACTGCCTTTTAAGTTAACAGAAGGACAGAAAGAAGT
AATATCTCAGATTACAAAGAGTCAAGCATCAGAAAATAGGATGGTAAAAC
TATTAATAGGAGATGTAGGTAGTGGGAAAACAGTGGTAGCTTTGTTTGCT
ATTTTAAATGTTATAGAGAATGGAGGTCAAGTAGCTTTTATGGCTCCTAC
TGAGATATTAGCAGAACAACATTATCGTTGGATACGGGCGATACTATCTG
ATATTTCAGTTGATGTTGAGTTGTTAACAAGTAAGGTAAGGAAGAAACAG
AATATTAAAAAGAAATTGCAACTTGGTGAATGTAATGTAGTTATTGGAAC
TCATGCTTTATTTCAGGATGGTGTTGATTTTAATAATCTTAATTTGATTA
TCATTGATGAACAACAAAGATTTGGAGTATTACAGAGGATGAGGCTAATT
AATAAAAGTAATATGGCTGATGTGCTTTTTATGACAGCTACGCCTATTCC
TAGAACATTAGAGCAAGTAGTATATGGGGATATAGATTGTTTAAGACTTA
AGGATAAGCCTCACAATCGATTGCCTATACAAACTAGTATTGTGAATATT
GAGCGCTTGTTTGAAGTTATAGCAAAATTACAATTGGCTTTGCAAGAAGG
TAATAAGGCATATTGGATTTGTCCTTATATTGAAGATTCGGAATTATTAG
ATATAGCAGCAGCAGAAAAACGTTTTTTTACTCTACAAGAAGTGTTTGGT
AAGGATGTAGGTTTGATACACAGTCGTTTGCCTAAGATTGAAAAAGATGA
AGTCATGATGTCTTTTTATAATGGAAATATTAAGTTACTAGTTGCAACTA
CTGTAATAGAAGTAGGAGTTGATATACCTGATGCTACTATAATTATTATA
GAAAATGCTGAACAATTTGGTCTATCACAGCTTCATCAATTACGTGGTAG
AGTTGGCCGTAGTGATAAATCTTCTTTTTGTATTTTACTTCATGGGAATA
TGTTAAGTAAGATTGCATATAAAAAGCTATGTATATTGCGTAAATTTCAA
GATGGCTTTTACATAGCTGAGCAGGATTTGTTGTTGCGTGGTAGTGGAGA
TGTTTTAGGGATAAAACAATCAGGATTATCAAATTTTAAGTTTGCAGATA
TTTATAAGGATCAAGGCCTTATTTCTATTGCTGTTGAACAGGCAGGAGCA
ATTCTGGATGCGAATAAGACAGAATTAGGTGATCATTTTAATCAATTGTT
ACACATGTTTGGTTATGATGTTTCTACTATAAATTATTAG
>ECH_0994 rho-1, transcription termination factor Rho
GTGTTAGATCTGAGTGAGCTAAAAAAGAAGACAATAGAAGATTTGTTGAA
AATAGCAGAAGACCTTGGAGTGGTTAGTAATGGTAGAATGCTGAAACAAG
AAATAATATTTCACTTAATGAAAAAAGTAGTAAGTGATGGAGGTGCAGCA
ATAGGAGGAGGGGTAGTAGAGATATTATCTGATGGTTTTGGATTCTTAAG
GTCTCCTGAAGCAAATTATGCTGCAAGTGGTGATGATGTATATATTTCTG
CAGGACAAATAAAAAAGTTTAATTTAAGAACAGGTGATATAGTAAGTGGT
GAAATAAGAGCGCCAAGTGAGAAAGAAAGGTATTTTACGTTAGTAAAAGC
ACATAGTATAAACTTTACAGATATGGCAAAGTTACAAAGATATGTACACT
TTGATGATTTAATACCTTTGTATCCAGAAGAAAGAATATTATTAGAATGT
AATGATCCTATCAGCGTGAGTAAAAAAGATATAAGCATGAGAGTAATAGA
TATAGTTGCTCCATTAGGTAAAGGACAAAGAGCGCTGATAGTTGCTCCAC
CAAGAGCAGGAAAAACAATAATATTACAACAAATAGCACATTCAATATCT
GTAAATCATCCAGATATAGAATTGATAGTTTTACTTATAGGTGAAAGACC
AGAAGAAGTGACAGATATGTGTAGATCTGTGAAAGGAGAGGTAGTAAGTT
CTACATTTGATGAACCTGGATATAGACATGTACAACTTGCAGAAATTGTA
ATAGAAAAAGCAAAAAGAATGGTAGAACATAAAAAGAATGTAGTGATATT
ACTTGATTCAATTACAAGATTAGCAAGAGCATATAATTCAGTAATACCGT
CATCAGGAAAAGTATTAACTGGTGGAGTAGATTCTAATGCTTTACAAAGA
CCAAAAAGATTTTTTGGAGCGGCAAGAAATATAGAGAATGGAGGATCATT
GACAATAATAGCAACGGCACTGATTGAAACAGGGTCAAAAATGGATGAAG
TGATATTTGAAGAATTTAAAGGTACAGGAAATTGTGAAATAATATTAGAT
AGAAAAATATCTGATAAAAGAGTATATCCAGCAATAGATATTTCAAAATC
TGGTACAAGGAAAGAAGATATGTTGATAGATAGTGTGTGTTTGAAGAAAG
TATGGTTATTAAGAAGGCTATTGTCATCGATGGGATCTGTTGAAGCAATG
GAATTTTTAAGGGATAAATTGTTGATAACCAAAGACAATAATGAATTCTT
TGATATGATGAATAGTTAA
>ECH_0200 rho-2, transcription termination factor Rho
GTGTTAGATCTGAGTGAGCTAAAAAAGAAGACAATAGAAGATTTGTTGAA
AATAGCAGAAGACCTTGGAGTGGTTAGTAATGGTAGAATGCTGAAACAAG
AAATAATATTTCACTTAATGAAAAAAGTAGTAAGTGATGGAGGTGCAGCA
ATAGGAGGAGGGGTAGTAGAGATATTATCTGATGGTTTTGGATTCTTAAG
GTCTCCTGAAGCAAATTATGCTGCAAGTGGTGATGATGTATATATTTCTG
CAGGACAAATAAAAAAGTTTAATTTAAGAACAGGTGATATAGTAAGTGGT
GAAATAAGAGCGCCAAGTGAGAAAGAAAGGTATTTTACGTTAGTAAAAGC
ACATAGTATAAACTTTACAGATATGGCAAAGTTACAAAGATATGTACACT
TTGATGATTTAATACCTTTGTATCCAGAAGAAAGAATATTATTAGAATGT
AATGATCCTATCAGCGTGAGTAAAAAAGATATAAGCATGAGAGTAATAGA
TATAGTTGCTCCATTAGGTAAAGGACAAAGAGCGCTGATAGTTGCTCCAC
CAAGAGCAGGAAAAACAATAATATTACAACAAATAGCACATTCAATATCT
GTAAATCATCCAGATATAGAATTGATAGTTTTACTTATAGGTGAAAGACC
AGAAGAAGTGACAGATATGTGTAGATCTGTGAAAGGAGAGGTAGTAAGTT
CTACATTTGATGAACCTGGATATAGACATGTACAACTTGCAGAAATTGTA
ATAGAAAAAGCAAAAAGAATGGTAGAACATAAAAAGAATGTAGTGATATT
ACTTGATTCAATTACAAGATTAGCAAGAGCATATAATTCAGTAATACCGT
CATCAGGAAAAGTATTAACTGGTGGAGTAGATTCTAATGCTTTACAAAGA
CCAAAAAGATTTTTTGGAGCGGCAAGAAATATAGAGAATGGAGGATCATT
GACAATAATAGCAACGGCACTGATTGAAACAGGGTCAAAAATGGATGAAG
TGATATTTGAAGAATTTAAAGGTACAGGAAATTGTGAAATAATATTAGAT
AGAAAAATATCTGATAAAAGAGTATATCCAGCAATAGATATTTCAAAATC
TGGTACAAGGAAAGAAGATATGTTGATAGATAGTGTGTGTTTGAAGAAAG
TATGGTTATTAAGAAGGCTATTGTCATCGATGGGATCTGTTGAAGCAATG
GAATTTTTAAGGGATAAATTGTTGATAACCAAAGACAATAATGAATTCTT
TGATATGATGAATAGTTAA
>ECH_1054 rnc, ribonuclease III
ATGATAGAAAGTATATCAAAAATCATAAAATATAACTTTAAAAATCCCCA
ATTATTAAATGAGGCATTGACACATCCTAGTCTAGTATCAAAAGATACCT
TAAAATTTAACTATGAAAGACTAGAATTCCTAGGGGATGCAGTATTAAAC
ATAGTAATATCCGAAATGCTATTCAATATTTTCCCTAAAGATACAGAAGG
TAACCTCGCTAAAAAGAAGACAGCATTAGTTTGTGGCAATAAGTTAGTAG
AAGTTGCACAGTCTATAAATCTCGGACAATTTATCATGATGTCAGATGGT
GAAAGAGCGTGTGGTGGTATAAATAATTTCCGTAATTTAGAAAATGCATT
AGAAGCTTTAATAGGTGCAATATACCTTGACGGAGGATTTACAGCAGCAC
AAGACTTTATATACTTATTTTGGGAACATTCTGCAACACATATGAATGTC
CCTCCACAAGATGCAAAAACTATACTGCAAGAATTGGTACAAGGAAAAAG
GTTACCAGCTCCTGCATATCACACCATAGATAAATCTGGACCAGATCACA
ACCCTACATTTACAGTAGAAGTAAGAATTCCATCATATCAAGCAATACAA
GCAACTGGTCATAATAAAAAACTCGCTGAACAAAAAGCAGCAAGTTTAAT
GTTAAATCAAATTCATAACAAAACAAAATGA
>ECH_0432 rpoA, DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit
ATGAGTGATCATTGGAGTAAATTAACTAAGCCTTCTTCTATTAAGGTAGT
TCCTAGTGGTGCTTCTCCAAATAAGGCAGATTTAATTATTGAACCTCTTG
AGAGTGGTTTTGCTTTAACTCTAGGTAATGCTTTAAGAAGAGTTATGATG
TCTTCTTTGCGTGGTTTTGCTGTTTATGGTGTTGAAATAGAGAATGTTTT
ACACGAATTTACTTCGATTTCTGGGGTTAGAGAAGATGTAACAGATATTC
TTTTAAATATTAGCATGATGAGAGTAAAGCTTTCTGGTATGAATAGTAAA
GTTTTGTCTCTTAAAGTTAAAGGACCATGTGAAGTAAGATCTGGAATGAT
ACCTGACACTGATGATTGCATTATACTCAATAAGGATTTGTTAATTTGCA
CTTTAGATCAAGGTGTAGATTTTAATATAAAAATGTATGTAAATGCTGGT
AAAGGTTATGTTCCTGCTGTAAAGCGTAAGTCAGTTAATAAACTTGGTGA
TATACCAATAAATTTCATTGCAACTAATGCTCTTTATAGCCCTATAAAAA
AGGCGTCTTTTAAAGTAGAAAGTAGTCGTATTGGTCAATTTACAGATTAT
GATCGATTGATTATGTCTGTGGAAACAGATGGGTCTATTTTACCTGATGA
AGCAGTAGCATTAGCTGCAAGAATTTTACAAGATCAATTTCAACCATTTA
TTAATTTTGATGAAACTGATGAGCCTCATAAGAAAGTTGATGCTAAAGAT
ACATTGCCTTATGATTCTAATCTGTTACGTAAAGTTGATGAGTTAGAACT
TTCAGTAAGGTCTTATAATTGTTTGAAAAATGATAATATTACTTATATAG
GAGATTTAGTCCAAAAGACTGAATCTGATATGTTAAGAACTCCAAATTTT
GGTAGAAAGTCGCTTAATGAGATTAATGAGCTTTTAGCAAGTATGAATTT
GCATTTAGGAATGAAAATTGCGAATTGGCCTCCTGAATCCATTGAGAGTT
TAAGTAAACAATATAGTGAAGAATGA
>ECH_0952 rpoB, DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGTCTTCTTCTGTAACTTCTACTAAATATGTATTAAATTCTTTTAATTC
AGTGCCTAGATTATCTTATGCAAAGTCAATAGATATAAAAGATTCGTTAA
CTGATTTAATAAAAATACAGAGGGATTCATACAATGCATTTATTGGGATA
GATCAAAATACTGAAAGTGGAATAAAGAATATTTTCCAATCTATGTTTCC
TATACAAGACTTATTAGGTCGGGCTGTTCTTGAGTTTGTAAGTTATAGTA
TTGGTGAGCCACAGTATGATGAGTATGAATGTATAAAAAGGGGTATTACT
TTTTCTGTACCTATACGTATAGTTCTGCGTTTTATAGTATGGAAGGTTCA
GGAAGTATCTTTCAAGGAAGTAAAATATGTAGTAGATGAAGAAACATCAG
AAAAGAGTATAAAATATATAAAAGAGCAAGAGGTTTCCATAGGAGATCTT
CCTACCATGACTTCTCATGGGACGTTTATCATAAATGGAATAGAAAGAGT
GATAGTATCACAAATGCATCGTTCTCCTGGTGTATTTTTTGATAGTGATA
AAGGAAAAACTTATAGTTCTGGGAAATTAATTTATTCGGCCAGAATTATT
CCTTATAGAGGTTCATGGTTAGACTTTGAATTTGACATAAAAGATATACT
TTATTTTCGCATTGATAGGAAGAGGAAGCTACCAGTCTCTTTACTTTTAA
GAGCTTTAGGTTTATCTAATAATGATATTTTGGATACTTTCTATGATAAA
ATACGTTATGTAAAATCTGAAAAAGGATGGGTTGTTCCATTTGTTGCTGA
TAGATTTAGGGGTGTTAGATTATCTCATGATCTTATGGATTCAGATGGTA
ATGTATTGGTGAAAGCTAATACCAGAATTACTTTAAGAATGGCTAGAAAA
TTAGCTAATGATGGGCTTACGAAGTATTTAGTTCCATTTAATGAAATTCA
AGGATTATTTATTGCTAATGATTTATTAGATTCAACTGGAAATGCTTTAA
TTATATCTGCAGGAGAAAATATTACTAGCGAGCATATAAACAAACTAGAA
TTGTTTAATATAGAGGAAATCTTTGTTTTAAATATAGATTTTCTAACAGT
TGGTCCATATATTTTAAATACCTTATTTTTAGATAAAAATGTATCTTATG
AAGATGCGCTGTTTGAAATATATAAAGTTTTACGTTCTGGTGAATCACCT
AGTTTAGATACTATAAAAGCCTTTTTTGATGGGTTATTTTTTGAAAAAGA
AAGATATGACCTATCTACTGTTGGAAGAATAAAGTTAAATGATCATCTTG
GGTTAAATGTTAGTGAAGATATTACGGTACTAACTAAAGATGATATAATT
CATGTCATAAAGAAATTAGTGTTATTGCGGGATGGTGAAGGTTCTGTTGA
TGATATCGATCATCTTGGTAATCGTAGAGTAAGATCTGTTGGTGAGTTTA
TTGAGAATCAGTTTAGGATTGGTATATTGCGACTTGAAAGAATGATCATG
GATTATATGTCTTCGGTCAATTTTGATAATGCAATGCCATGTGATTTTGT
AAATCCTAAGGTTTTGGCTACTGTTTTGAAAGATTTCTTTAGCTCTTCTC
AGCTTTCCCAATTTATGGATCAGACTAATCCATTATCTGAAGTTACTCAT
AAACGTAGATTATCTGCTTTAGGTCCAGGTGGTTTAACTAGGGAAAGAGC
AGGTTTTGAGGTTAGAGACGTACATCCAACACATTATGGAAGGATTTGTC
CAATTGAAACTCCAGAAGGCCAAAATATTGGATTGATCAGTAGCTTGGCT
ATTTATGCCCGTATTAATAAGCATGGGTTTATTGAGAGTCCTTATAGAAA
AGTGGATAAAGGAGTTGTTACTGATAAAGTAGAATACCTGTTAGCTATGC
AGGAAAGTAATTATTATATAGCTGATGCTAGTGCTACTCTTGATGAGAAT
AATCAGTTTGTTGATGATATGCTTTATTGTAGGCATGATGGAAATTTTGT
AATGGTTAAGAGGGAAGAAGTTGATTATATAGATGTTTCTCCAAAGCAAA
TAGTTTCAGTTGCTGCGTCTTTAATACCTTTCTTAGAGAATAATGATGCA
AACCGTGCCTTAATGGGTTCTAATATGCAACGTCAAGCAGTACCTTTATT
AAAAGCAGATGCTCCTTTGATTGGTACTGGTATGGAATCAATAGTTGCTG
CAGGATCAGGAACAGTTGTTTTAGCTAAACGTGGAGGTATTGTTCATAGG
GTAGATGGACTGTATATAGTTATTCGTGCGTTTGATCAGGAAAAAAATGA
ATATTTAGGTGTTGATATTTATAACTTAAGGAAATTCCAACGTTCTAATC
ATAATACTTGTATTAATCAGCGACCTTTAGTTAAACCTGGAGATTATGTA
AAAGCAAATGATGTTATAGCTGATGGATCAGCAATTGATCAAGGTGAGCT
TGCTTTGGGTAAGAATGTGTTGGTTGCGTTTATGTCTTGGCAGGGATATA
ACTTTGAAGATTCAATAGTTATTTCAAGTGAAGTTGTAAAGAAAGATGTA
TTTACTTCAATACATATAGAAGAATTTGAATGTGTAGTTAGAGATACAAC
GCTTGGTCCGGAAAAGATTATGAGGTCTGTTCCTGATATCAATGAGGATA
GTTTATCTCATTTGGATGATGTTGGAATTGTTAATGTTGGAGCTGAAGTT
TCTGCAGGAGATATTTTGGTTGGTAAAGTGACACCTAGACCACCAGTTTC
TTTACCTCCAGAAACAAAATTGTTAGTTACTATTTTTGGTGAAAAAGTAT
TTGATTGTGTAGATTCTTCACTATATTTGCCACTTGATGTTGAAGGGACA
GTAGTTGATGTGCATGTTTTTGTGCGTCGTGGTGTTGAAGAAAATGATAG
ATCTCTTTTAATTAAACAAAATGAAATCAATGGTTTTATAAAAGAAAGGG
ATTATGAAATAGATGTAGTTAGTGAGTATTTCTATGATGAATTGAAAAGA
GTTTTGGTGAGTTCTGGTGTACAGTATAATAATCAGAATATAGATGATTA
TTTAGCATCTATTCCAAAGAAGGAATGGTGGGATATTAACTTATCTGATG
AAGCTATGTTGCTTCAAGTTAAGGACTTGAAAGAAAAATTTGATTCAATG
ATTCAAAATGCTCATAGTAAGTTTGATCAAAAGATAGATAAATTAAACTA
TGGATATGATTTACCTCAAGGTGTTTTGTGTATAGTTAAAGTTTTTGTTG
CAGTAAAACATAATTTACAGCCAGGAGATAAAATGGCTGGTAGACATGGT
AATAAGGGGGTGATTTCTCGTATTGTACCTGTTGAAGATATGCCATACTT
AGAGGATGGCACTCCTGTTGATATTATACTGAACTCTTTGGGTGTACCTT
CTCGTATGAATGTTGGGCAGATTTTAGAGACGCATTTAGGATGGGCATCT
GTTAATTTAGGGAAAAAGATAGGGCATATATTAGATAACCTTGATGAATT
GACGGTATCTCATTTAAGAAACTTTTTATATCAAGTATATGATGGGCAAG
ATTTAAAAGATAATATTCAGTCTATGAGTGATGAGGATCTTTTGGTTTTT
GCAGAAAGATTGCGTGATGGCGTGCCTATGGCTGCACCAGTATTTGAAGG
GCCAAAAGATAGTCAAATTTCTAACTTATTAAGATTAGCTGATTTAGATG
TTTCAGGGCAAGTAGATCTTTATGATGGAAGAATTGGTGAAAAATTTGAT
CGTAAGGTTACTGTAGGATACATATACATGTTAAAGTTACATCACTTAGT
GGATGATAAAATACATGCAAGATCTGTTGGTCCATATGGGTTGGTAACTC
AGCAACCATTAGGTGGAAAATCTCATTTTGGTGGTCAACGTTTTGGAGAA
ATGGAATGTTGGGCATTGCAAGCTTATGGAGCTGCTTATACCTTACAAGA
AATGCTTACAGTAAAATCTGATGATATTGTTGGAAGAGTTAAGATTTATG
AATCTATCATTAAGGGTGATAGTAATTTTGAATGTGGAATACCAGAATCC
TTTAATGTAATGGTAAAAGAGTTAAGATCATTGTGTTTAGATGTTGCTTT
AAAGCAAGATAAGGATTTCTTAAGTAATGAAGTGAAAGATTAA
>ECH_0951 rpoC, DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit
ATGAAGATGTTGGATTTGTATGGCTATACTAGTATTGCGCAATCGTTTGA
TAAGATTTGCATATCTATAGCTAGTCCTGAAAGCATTAGAGCAATGTCGT
ATGGTGAAATTAAAGATATTTCTACTACTAATTACCGTACGTTTAAAGTG
GAAAAGGGAGGTCTTTTTTGTCCTAAAATTTTTGGGCCAGTTAATGATGA
TGAATGTTTGTGCGGTAAGTATCGAAAAAAGCGTTATAGAGGCGTAGTTT
GTGAAAAGTGTGGAGTTGAAGTTACATCATCTAAGGTGCGTAGAGAAAGA
ATGGGACATATAGAACTTGTATCTCCTGTAGCACATGTTTGGTTTTTGAA
ATCTCTGCCTTCGCGTATAGGTGCATTACTTGATATGCCGCTTAAGTTGA
TAGAAAATATTTTATATAGTGGTGATTTTGTAGTTATTGATCCAATTGCA
ACTCCATTGTCTAAGGGTGAAGTTATTAGTGAAAGTGCTTACAATCAAGC
AAAAGATAATTATGGAGAAGATAGTTTTCTTGCTTTAACTGGAGCTGAAG
CTATTAGGGAGTTGTTAGTGCGGTTGGATTTGCATGCAATTAATGCAAAT
CTTAGAGTAGAGTTGGAATCTACAACTTCAGAAATGAAGAGAAAAAAAAT
AGTAAAAAGATTGCGTATTGTTGAGAATTTTATAAATTCTGGTAACAAAC
CTGAGTGGATGATATTAACAGTTATACCAATTTTGCCACCTGATTTAAGA
CCACTTGTTTCTTTAGAAAATGGAAGACCAGCAGTTTCTGATTTAAACCA
TCATTATCGGACAATTATTAACCGTAATAATAGATTGGGTAAGTTATTAA
AATTAAATCCACCTGCGATTATGATCCGTAATGAAAAGAGAATGCTACAA
GAAGCAGTAGATGCTCTTTTTGATAGTACACGTCGTAGCTATGTTTCTAA
TAAGGCAGGGAGTGTAGGGTACAAGAAATCATTAAGTGATATGTTAAAGG
GCAAGCAAGGGCGTTTTAGACAAAACTTGCTAGGAAAAAGGGTAGATTAT
TCTGGTAGATCAGTAATAGTTGTTGGTCCTAACTTAAAATTGCACCAATG
TGGATTACCTAAGAAAATGGCGTTAGAATTGTTTAAACCGTTTATTTGTT
CAAAGTTAAAAATGTATGGTATTGTGCCAACAGTAAAATTGGCAAATAAA
ATGATACAAAATGAAAAGCCAGAAGTTTGGGATATCTTAGATGAAGTAAT
ACATGAACATCCAATATTATTAAATAGAGCACCTACTTTGCATAGATTAG
GTATACAAGCATTTGATCCAGTTTTGATAGAAGGTAAAGCAATACAATTA
CATCCTTTAGTGTGTAGTGCTTTTAATGCTGATTTTGATGGTGACCAAAT
GGCAGTACATATTCCATTATCATTGGAAGCTCAACTTGAAGCTAGGATAT
TAATGATGTCTACTAATAATATCTTAAGTCCTTCTAATGGTAAGCCAATA
ATTGTTCCTTCAAAGGACATAGTGCTTGGAATATATTACTTAACTTTACA
AGATCAAGTTCAATCTGAAGATGAGATATTATTCTTTGGTGATTTTAGTC
ATGTGGAATACGCTTTACATAACAAAGATGTGCATTTATGTAGTCAAATT
AAGTATAGAATGACTTATTGTAATTATGATACATCGGATGGGAAGCCTTC
ATATTATTCTAAAATAATTGAAACAACTCCTGGTAGGTTGATATTATGGC
AGATATTTCCACAACATAAAAATTTGACTTTTGATTTAATAAATCAAGTT
TTAACTGTAAAAGAGATTACATCTATAGTTGATTTGGTATATCGTAGTTG
TGGTCAAAGTGAGACTGTTGAATTTTCAGATAAGTTGATGTCTCTTGGTT
TTAAATATGCTTCGCAGTCTGGTATTTCATTTGGATGTAAAGATATGATT
ATTCCAGATACAAAGACAATGCATGTAGATAATGCTAGTGAAAAAATCAA
AGAATTTGCTGTTCAATATCAAGATGGTTTAATTACAAGAAGTGAAAGAT
ACAATAAAGTAATAGATGAATGGTCTAAGTGTACTGACTTGATAGCTAAA
GATATGATGAAAGCTATTTCTGTATATGATGTAGAAAGTAAATTAAATTC
CATTTACATGATGGCTCATTCTGGTGCTAGAGGATCTGCATCACAGATGA
AACAATTAGCAGGAATGAGAGGATTAATGGCTAAACCATCAGGTGAAATT
ATTGAAACTCCTATAATATCTAATTTCCGTGAAGGGTTGAATGTATTTGA
ATATTTCAATTCGACTCACGGAGCAAGAAAAGGTTTAGCAGATACCGCTT
TGAAAACTGCGAATTCCGGATATTTAACTCGTAGGCTTGTTGATGTTGCT
CAGGATTGTATAGTTGTTGAGTACGATTGTAAAACACACAATGGATTTGC
AATAAGGTCTGTTGTTGAAGGTGGGACTGTAGTTGAAACATTAGATAATA
TAATACTTGGAAGAGTTGCTGCTGTTGATGTTTATAATCCTATTACTGAA
GAGTTACTTGTTAAAGCTGGAGAGTTAATAGATGAAGCTAAAGTTGAAAA
AATAAAAATAGCAGGATTAGATGCTGTAAAAGTGAGATCTCCTCTTACTT
GTGAAGCGAAGAAAGGTATTTGTGCTTTGTGCTATGGTAGAGATCTTGCT
ATTGGTGATGTTGTATCAATAGGTGAAGCTGTTGGTGTAATAGCAGCTCA
GTCTGTTGGTGAACCTGGAACACAGTTGACTATGCGTACTTTCCATGTAG
GTGGTACTGCAATGAGAGGTGTTGAAACTTCAAACTTAATAGCGTTATTA
GATGCTAAGGTAAAGTTAGTAAACAGTAATATCGTTGAAGACAAGCATGG
TAATAAGATTGTCATGAGTAGATCTTGTGAAGTAGTGTTACTTGATAGTG
TAGGCAATGAAAAAATGCGTCATAATGTACCTTATGGAGCAAGACTTTAT
GTTGATGATGGTCAGTTAGTAAAAATTACAGAAAAAATTGCTGAGTGGGA
TCCATATACAATGCCTATTATTACAGAAAAAACAGGTATCATTAAGTATA
TGGATTTAATAGATGGTGTGTCTATCAATGAAGTCTTGGATGAATCTACT
GGTATTTCTAACAGAGTAGTAGTTGATTGGAAATTACATTTACAGGGTGC
TAACCTCAGACCTAGGTTAGTTCTAATTGATGATAATGATAATATAATAA
CATTATCCAATGGTTTGGAGGCAAATTATTTCATACCAATAGGGGCAGTG
TTAAATGTTCAGGATGGACAAAAAGTTCATGCTGGAGATGTAATAACAAG
AATTCCAAGAGATTCTATAAAAACTAGAGATATTACAGGGGGGTTACCAA
GAGTAATTGAATTGTTTGAAGCACGTCGTCCAAAAGAACATGCTATAGTA
AGTGATATTGATGGTTATGTTGAATTTGGAAAAGATTATTATAGATCTAA
AAGACGTATATTTATTAAGCCAGTCAGTGATACCTTATCACCTGTTGAGT
ATTTAGTACCTAAAGGTAAGCATACTATTGTAAATGAGGGAGATTTTGTA
CATAAAGGGGATTTATTAATGGATGGTGATCCTGATCCTCATGATATATT
ACGTGTTTTAGGAGTTGAAGCATTAGCAAATTATATGATTTCTGAAATTC
AGCAGGTTTATAGGTTACAGGGTGTGCGTATTGATAATAAACACATAGAA
ATAATCTTAAGACAAATGTTGCAAAAAGTTGAAATATTTGAACCAGGAGA
CACTATGTATTTGGTTGGTGAAAATATAGACATGGAAGAAGTAATAAAGA
CTAATGATAATATGGTAAAAATGGGTAAATCTCCTGCTAAATATGCTCCA
ATACTTCAAGGTATTACTAGAGCGAGTCTTGATACTAACTCATTTGTTTC
TGCAGCGTCATTCCAGGAAACAACAAAAGTATTAACAGAAGCAGCCTTTT
CTGGTAAGGAAGACTCTTTATATGGGTTAAAAGAGAATGTAATAGTAGGT
CGATTAATACCTGCAGGTACAGGGTTCTTAATGAATAAGATAAAGAAGTT
GTCTTTATTAAATAAAGAGGACTATTCTATGTATTATAATAATGAATATC
AAGATTCAGCATTACTCCAAAATGATAATAATGCTTTTAACCAGGAACTG
CATAAAGATACTGGAAATATTGTTGATTATTAA
>ECH_0760 rpoD, RNA polymerase sigma factor RpoD
ATGAAAGATCTACAAACAGATAAAGAATTACTCAGAACTCTTGTGAGTAA
GGGACTCAAACAAGGATTTGTTACATTTAACGATATCAACGATGTTTTTT
CTGACTACGTGCTGTCATCTGACAACATAGATGAAACTATATCAATGCTT
CAGGATTCAGGTATTAATGTTCTTGAACAAAGTGATGAAGACGAGGCAAA
TAGCATAATAGAAGAAAACAGAATCAAAGATGAAATGGACGAAGATGATG
TATCAGACACCAGTATAAAATCTTGGGATTTTGGACAAACAGATGACCCT
ATACGCATGTACCTATGTGAAATGAGTTCTGTTGAATTACTATCTCGTGA
AGGAGAAATTGAAATTGCCAAAAAGATCAAATCAGAAAAAGTAAATATGC
TCAGGTCACTAGTAGAATCCCCAATAGTATTACGTACATTTATGTCATGG
AGGGATGACTTAGTAAATGAACAAATAATGTTAAGAGATTTAATAGATTT
AGATGCAAATTACAGGTATGAATTTCCTGAAAAATTTTCTGACACTGATG
ATGCTAGTGTTTTAGGTTATGATAAAGATTTAATGGATGAACCTGATGAA
GATCCAGATATACCAGAAGATGAAGATGAAGAAAACATTTCAATAAATGC
TTCAATATTAGAAATGGAAAATGCATTGCTACCCAAAGTAGTAAGCATCT
TAGATTCAGTAATTGCATCAGCAGAAAAAATTTTAGAACTCAAAAAACAA
TATCAAGGTAAAATTAACCAAGATATTGAAAAACAATACAATGACTTACA
CGATAGCATATGGGAAATGATATATCAAATTAAACTTAGTAATTCCGCAG
TCCTATCAATCACACAACAAATATATAGCTTAAGTAAATCAATAGCAGCA
GAAGAGGCAAAAATTATTTCCCTTGCAGAAAGCTATGGTATACAACGCAA
AGACTTCTTAGATGCATATAATACTAATTCTGTATTGCAAAAAAAAGGCA
CTTCTCCTCAATGGGATAACATGTTACTCAATGAAGAGAGTAATATAGTA
AGTATGTACAGTAAAATTAAGCTACTGTCTGGAGAAAATAACCTTACCGA
ATTCAAAGCATTAGTCACAAAAATACAAAAGCACGAACGTGCAGCAAATC
AAGCAAAGCAAGAAATGATAAAAGCAAATCTAAGGTTAGTAGTATCGATT
GCAAAAAAATATTCAAATCGAGGTTTACAGTTTCTAGATTTAGTACAAGA
AGGGAATATTGGCTTAATGAAAGCAGTAGATAAATTTGATTACAAACGTG
GATATAAATTCTCAACTTATGCAACGTGGTGGGTGAGGCAAGCTATCACT
AGAGCAATAGCAGATCAGGCACGAACTATTAGAATTCCTGTACACATGAT
TGAAACAGTAAATAAAATCAATCGCACACTAAGACAAATGCTACACGAAA
TGGGTAGAGAACCAACATTAGAGGAATTATCAGCAAGATTAAACATTAAT
GTAGATAAGATACGTAAGGTAATGAAAATAGTTAAAGACCCCGTAAGCTT
AGAAAGCCCCATAGGAGATGATGACAGTAGTACCTTTGGTGATTGCATAG
AAGATAAACGTGCAGTAAAGCCAGAAGATGCAGCAGTACTTGCAGACTTA
CGAGAAATAACTACAAAAGTATTATCAACATTAACACCAAAAGAAGAGAG
AATCTTACGTATGCGGTTTGGAATAGGTAAAGGTGGAAAAGACCATACCT
TAGAAGAAGTAGGAAAACTATTCAATGTAACAAGAGAACGTATACGACAA
ATTGAAGCAAAAGCTTTACGTAAACTACGTCATCCAAGTCGTGCAAGAAA
GCTTAGAGGATTTTTCTAA
>ECH_0655 rpoH, RNA polymerase sigma-32 factor
ATGTTAACAAATTCTATATTTTCCCTAACTCAAGACAATTTAATGTCCTA
TATCAATGAAGTGCATGCATTTCCGATTTTGTCTCCTGAAGAAGAAGACA
GGTTAGCAAGAAATTGGTATGAAAATGGGATCGTTGCTGACGCACATAGG
TTAGTTACTAGTCATCTAAGGCTAGTAGTCAAAGTTGCATTAAGCTTTAA
AAATTATGAATTGCCTCTTATAGAGCTAATAATGGAAGGAAATATAGGGC
TGATGCAGGCTGTAAAAAAGTTCAATCCCACTCTTGGCTTTAGGTTATCC
ACTTATGCTATTTGGTGGATCAAAGCTTTTATTAAGGACTATATTCTTAA
ATCTTGGTCGTGCATTAAAATTGGTACAACACAAGCACAAAGGAAGTTAT
TCTTTAGCTTAAGGAAAATTAAGAAAAAACTTTTTAAATATAACCACAAT
ATTACAAAAGAAGATATAAAGCTAATTGCAAATAAATGTTCAACTTCTGA
ACAAGAAGTAGAACAGATGAACAGGTATTTTCTCTACAGAGATAGATCCC
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>ECH_0796 rpoZ, DNA-directed RNA polymerase, omega subunit
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