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COG category: Transcription
Genomic element: chromosome

Number of genes found: 28

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# Chlamydophila caviae GPIC

>CCA00772 N utilization substance protein B, putative
ATGTCTACGCTGACCCCTGAAAGCTCCTTAGGGTCTTACGTCAAGATTTC
TCGTCCCCTCCCCAAACAAAAAATGCGGGAGATTGTGCTACAGATGCTTT
ACGCTCTGGGTATGGATCCTTCATGCGAAGAGAGTCTTGTTCCTCTTTTA
ATGTCTGAGACTGCTGTGACTCAAAGACACGCTTTTACTGCTTTAAGTTT
TTCAAAAGAAATCCTTGCAAAGTCTTCCGAATTGGATTTATTAATTGCTC
AAACAGTGAAAAACACCTCCCTTGAGAAATTGACTTTGATGGAGAAAAAT
GTTTTGCGTTTAACGCTTTTTGAACATTTCCATGGTCAGCCTATAAATAC
TGCTATTTTAATTGCTGAAGCTACAAGACTGGTAAAAAAATTTAGCTATA
TTGAGGCGTGCACATTTGTTCATGCAGTTTTAAATGATATTTTTCGTTTA
GCTATGCCCGTAGCACATCAAGAAATTCCGTTATGTTGTCAGGCTTAA
>CCA00986 RNA polymerase sigma factor, sigma-54 family
ATGTTTCAACAACATCAAAAACTTTCTCAAAACTACCTTCCCTCGCTGCG
TATGCAGCAGGGATTGCAGATGTTGCAATCTCCAATTACTGAACTTGCCT
CTTATGTACTCCAACAAATCATTCACAATCCCTTCTTTGATCTCTCTTCT
TTAGAAGATGAAGAATGGTCCGTATGTTCTTCTCTTCCCTCTGTAGATGC
TGCATATTCTCGTCCGGAATCTTTATTTTCCCATCTTCTCACACAAGTGC
AGCAAACATTTGATCGTTCTGAAGACCTGCTCATTGCTCAGCACATTATA
GGGAATCTATCAGATCAAGGTCTGTTTCTCTCTTCTACTGAAGAGCTCTC
CTTACAATTAGAAATGCCTTTAGAAACTATCCATACTGTTTGGGAAACTA
TTCAGCATTTTCACCCTTTAGGGATAGCTTCTCCCTCTCTTCAAGATTAT
TGGCTATTACATTTAGAAGGCTCTGCACATGCTCTTGCTTATAAGATCAT
CAAAGAACACTACTCTCTTTTGATTAACTGTGATTTCTTACGTATAGCAA
AAAAATGTCGCTGTTCCCCTTCAGATATAAGAAAAGTTCTTAAGACAGCC
TTAGCAAAAATTCCTTGGTGTCCTGCGGAAGGTTATGCTTCTTTATCTCA
TGTACAACCTGCGCTTCCTGATGTTTACGTCACTAAAAAACATCAAATTT
GGGAAATCCAAATAAGCTCTCGAGGTTTACCTCCTATAAAACTTAACAGC
GAAGTATTTCATATTTATGAACAGCTTCCTAAAGAAGAAAAAAAAAATCT
CACACAGCAAATTCTCTCTGCTAAATGGCTTATCAAAAATCTAAGAAAAC
GAGAACAAACCTTATTTTCTATAGTAGAAACTATCCTCCCTCATCAAGAA
AGCTTCCTTCTTGGCAAGTCTTCTTCTCCCAAAGCATTATCTGTAAAAAG
CTTATCTGAAGAGCTTTCCTTTCATGAATCAACGATATTTCGTGCTATAG
AAAATAAAACATTAGCCGCGCCTATCGGGATTATTCCTCTGAAACAGCTT
TTTCCACGCGCTGCTGGTGATAACGATTCTCAATCTAAAGAAACCATACT
GCAGTGGATTCACGAATGGATAGCTTCAGAGACAACACCTTTATCTGATG
CTGATATTAGCGAACGGATCTCTCAACAGGGAATTCAATGTGCCCGTCGT
ACGGTAGCTAAATACCGCACACAGTTGAAAATTCTCCCCGCGAATAAAAG
GAAAGCCTATTTTGAAATGTAA
>CCA00965 conserved hypothetical protein
ATGAAACAAACTTTTACCAAACGCATTTTGCTGTTCCTTTTTTTGGTAAT
TCCGATTCCTCTAGTTTTGAATCTGGTAGTTCTATCGTTATTTTCTTTTT
CAGCAGCGAAAAATAACCTGATGGAAAATCTCCATACCCATGTGACAAAC
TTCAGCTTAGAATTTGAAAAAAAACTCACCATTCACAAAATCTTTCTTAA
ACGTTTAGCAAATACCTTAGCACTTAAAGCCTATGCATCATCAGCGGAAG
ATTTCTACTCTCAAGCGTATAATGAGATGTTCGCCCTATCGGATACGGAC
TTCTCCCTTTGTTTAATCCCTCTTATCGATGGGAATATAAAAACAAAAAA
TCCCCACGATCCATTTATCCACTATTTAAAAAGTCATCCGGAAATAAAAA
AGAAACTCAGCATGTCTTCAGGGAAGGCCTGCATCATTACAATCTCTTCA
GATACTTACCAAAATTATCCTAAAAATTATCTTGTGATTACCGAAGATAT
CGAAGTATGGAATGCACCAACAAGCGCGGGGTTACTTGTTAGCTTCTATC
CTATGGACTTCTTACAAAAGGATTTATTCAAATCTTTACATCTAAAAAAT
GAAGCTATCTGTCTATTAAACAAATATGGGGAAGTCCTCTTCGCTTCAGA
TCCTAAATTCTCTTCAGAAGTCTTTTCCGTAGATATCCCTGATCTTCCTA
AAATCACGGCTAGGAAACAAGCTCTTGCTGTAACAACGGCTCCTAAAATT
CTTCGAGAACACAATCTTATAAGCATAAAAATAAAAAATAAAAGCTATCT
AGGGATTGTTTTAAATAAACTTCCTATTCAAGGAACCTATACCTTATCTA
TCATTCCTCTTTCTTGGTTTATCAATAAGGCTATCCATCTGCCTTTGAAT
GTGATTTTCTTTTATTCGTTAGCCTTTCTCTTCATGGGATGGGTACTCAC
GAAAATAAACAAACGGTTAAATCAGCCTATCCAAGAACTTACAACATGTA
TGGAAGCTGCATGGCGAGGAAATCATAACATCCGTTATGAACCTCAACCT
TACGGATATGAAATTAATGAATTAGGGAATATCTTCAACTGCACTCTATT
GTTACTCCTCAATTCAAGAGAAAAAGCAGAAATCGAATATGCCTCTGGAG
ATCAATTACAGAAAGAATTAGCTATTCTTGCTTCCCTTCAACAAACACTT
CTCAGCCCTACCTTCCCCGAATTTCCTAATATCTCTTTCATTTCCAAACA
CCTTCAGGGAATTCAGCTATCAGGGCATTTTTATGGATGGAAAACTTCCT
TCCCTGAACAGACTCTCATTGGCGTTATAGGCCTCGCCGGAGATATAGGA
CTCCCATCCTATCTTTATGCTCTATCTGCACGAAGTTTATTCCTGGCTTA
TGCAAACCTCTCTTCTTCCTTAGAGAAAATAAGCTCAGATACTTTTGATG
CCTTCGGGAAAACTACAGAAGGTGATGAAGCTACCGTCTCCATGACTTTT
ATCCGCTACGATTCCATAGATTCCACATTATCTATTTTATCCGTAGGGGA
AACCCCTCCCATAGCCTTTTTAAAAAGACAGGAAACCTTTTCCCGTCTTG
CTTCACCCACTAAGCACAAGATAGAACCCGGTGATATTCTAGTATGTATC
ACAGGAAATTATGAACTTACTGAATATCTCATGCGTTTACCTATTGAAGA
ACTCATTAAAGATCCCCTAGCACCTTTAAATTCAGAAAATTTCATAGAGA
CTCTTACAGAAATGCTGAATAAAGAAACGCAGTCACAGATAGATGGAACG
TTAAGTTTCCTGTCTTTCAGTTGA
>CCA00959 pGP6-D chromosomal paralog
ATGGGAAATTTAAAAACGTTGTTAGAGAGTCGTTTCAGGAAAAATACTCA
AGATAAAATGGAAACGCTAACACGCAAGCGCATGGAAGGAGAGCTCTCAC
CTTTCTTAAGCAGATTTTCCGATATAAAATTATCACCAAAAGAAGAAGAG
AAATTCCGTCAACTTCTAGAAAACTACACTTTTGAAGATCAGATTTCCGA
AGAAGATTTGAAAAATCTCTGTACTCTCTCTGCACAAATAAAACAAATCC
ATCATCAGGCTGTGCTCTTACACGGAGAACGTATTAAAAAAGTCCGTGAT
TTATTAAAAACGTATCGCGAAGGAGCCTTCTCGGCTTGGTTACTCATCAC
CTACGGGAACCGACAAACTCCTTACAACTTTCTCGTATATTACGAATTAT
TTTCTACTCTTCCCGAACCATTGAAAATAGAAGCTGAGAAAATGCCCAGA
CAGGCTATCTACACACTAGCTTCTCGACAAGGACCTCAAGAAAAAAAAGA
AGCCATTATTCGTAATTACCGTGGAGAAAGTAAAGGCGAGCTTTTAGATA
TTATTAGAAAAGAATTTCCTTTAATTTCTACAGATCGTCGTCAAACATGT
TTAGCAAAACAAGCGCTAGCTATACTTTCCAAAGGTTCACAATTATTAAA
AAAATGCTCGGAATTATCTCCTGAGGATTATTCTTCCCTGGAAAAATTGA
TAAAAAAGCTTCAAAAAGTTAAAAATAACTTCTTTCCCAATACAAAGGTC
TAA
>CCA00630 transcriptional regulator, putative
ATGGCAAAAATTCCCTATGCTATTTTAGAGAAAGGCTCATTGTTATTGGC
TTCTCCTGATACAGATCAGGGAGTCTTTGCTCGCAGTGTAATTTTATTAT
GTGAGCATAGCCTGAACGGTTCGTTCGGGCTCATTTTAAATAAGACATTA
GGTTTAGAAATATCTGATGATATTTTTACTTTTGATAAGGTGTCTAATAA
CAATATCCGTTTTTGCATGGGAGGCCCTCTGCAGGCCAATCAAATGATGC
TTTTGCATTCCTGTTCTGAAATTTCTGAACAGACGTTAGAAATCTGTCCT
TCTGTATATTTAGGGGGAGATTTGTCTTTCCTACAAGAGATCGCTGCTAG
TGAGTCCGGGCCAACGATAAACTTATGTTTTGGTTATAGTGGTTGGCAAG
CAGGACAGCTAGAAAAAGAATTCCTAGAGGGGAATTGGTTTTTAGCTCCC
GCAAGCTATGAGTATGTATTTTCTGATAATCCCGACAATCTCTGGTCTAG
GATCCTTAAAGATTTGGGAGGGAAATACGCTTCACTATCCACAGTGCCTG
AGAATCTTTTACTGAATTAG
>CCA00677 serine/threonine-protein kinase
TTGCAGCGTTATGATATTATCAGAATGATTGGTAAAGGGGGTATGGGAGA
GGTTTATTTAGCCTATGATCCCGTATGCTCGCGTAAGGTTGCTCTTAAGA
GGATCCGTGAGGATCTTTCTGATAATGAGTTATTAAAAAAACGTTTTCTT
AGAGAAGCTAAGATCGCTGCTGATCTTGTCCATCCTGGGGTTGTCCCTGT
TTTTACGATTTGTAGTGATAGTGATCCTGTTTATTACACAATGCCTTATA
TAGAGGGATATACTCTTAAAAGCCTGCTAAAAAGTGTATGGCAATGTGAT
TCCCTTCCTAAGGATCTTGCAGAGCAAACATCGGTAGCGACTTTTCTTTC
TATATTTCATAAGATTTGTTCCACTGTAGAATATGTACATTCTCGGGGAA
TTCTTCATCGAGATCTTAAGCCTGATAATATTTTGCTCGGACTTTTTAGT
GAGGTCGTTATCTTAGATTGGGGAGCAGCATTATCTAAAGAAATGGAGGA
AGATTTTCTTTCGGATATTGATGTCCGTATCCCGGGATCATTGTTTTCTA
ACATGACGATTCCTGGTAAGATCGTAGGCACTCCAGATTATATGGCTCCC
GAACGTTTACGAGGGACTCCAGCTTCAGAAAGTACTGATATTTATGCTTT
GGGAGTGATTCTCTATCAGATGCTGACATTATCTTTTCCTTATCGCAAGA
AAAAGGGTCAGAAAATCAGTCTTCGTCATCAAATTAGTTTCCCTGAAGAA
ATTGCTCCTCATAGAGAAATTCCTCCGTTTCTCTCTCAAGTGGTCATGAG
GGCTTTAGCGGCAGACCCCAGGGAACGTTATCGTTCTGTAAGTGCTTTGA
AAGCAGATATAGAACAACATTTACAGGGAAGTCCCGAATGGACTCCTAAG
ATTGTTTTACATACTCAAGATAGAGAATGTTGGAAGTTCCATGAACCTAT
TTTATTATCTAAGTATTTCCCAATGCTGGAAGTGTCACCAGCTTTATGGT
ACAGCCTAGCCATTTCTAAGATAGAAAGTTTTTCAGAAGTGCGTTTGGAA
TATACGCTATTGCGTAAGGGACTAGAAGAAGGCTTTGGAATTTTGCTTCC
TCCTTCCGAAGGCGTAGATCATGGGGATTTTTACCATGGTTATGGTTTTT
GGCTGCACATTAAGGAAAATATCCTATCGGTATCTTTAGTAAAAAATGGC
TTAGAGATACAAAAGACTTCCCGGCACATCGATGGAAATAAGGAGAAGTT
TTTCATAGCTTTTGAAAAGCAAAATCACCGTTTATCTTTGATTATCGATA
ATATTGTCTGGACGATTCATATGGATTATCTCCCTGCTCGGGGAGGACGT
ATTGGGGTGATCATTCAGGATGTTGCTGATGTTTGCGGAAACATTGTTGT
TTTAGAAAGTAGTGGATCTTTACAAGTCAGTTGTTTAGCGGTTCCCGATG
CCTTTCTTAATGAAAAGTTATACGAGCGTGCCATTACGTTTTATCGTAGG
ATTGTTGAGTCTTTTCCTGGACGTAAGGAGGGATATGAAGCACAATTTCG
TATAGGCATTGCTTTATTAGAAAAAGCTTCTGAGAATAGTGACTCTGAAG
GATTTATCCAAGCTCTTGAGGAGTTTTCTACTTTACATAATAGTGTTGCG
GCTCCTTTGGAGTATCTCGGGAAAGCTTTGGTATATCAAAGATTAGGAGA
GTATAACGAAGAGGTCAAAAGCTTATTACTAGCTTTAAAGCGCTATTGTC
AACGTCCTGAAATCTCTCGTGTTCGTGATCATGTTGTTTATCGTTTGCAT
GAAGCTTTATATAGCAATCACCGCATTTCTTTAGTCTTTATGCTTCTTGC
TCTTCATGTTGCTCCCGAATCTATAAATGCTTCTGAAGAAGAGCATTTCC
TTCAGAATTTACATGGAAAAATTCAAGATACTTTATTTTGCAATCTAGAT
ATTTCCCCTGTGGATTTTCGTTCTTCTAAAATGGAATTGCTGTTGAGCTA
TTGGTCAGGATTTACACCGTTTCTTCTCGGGTTGTTTCAAAGATCTTGGG
ATTTAAAGGATTATCGTGCTCTTGCGGATATTTTTTACACTGCTGCAGAT
TTAGGAAATAAGGAGTTTATTGAAGAATACTCAGGAATTTTACGTGAGAA
CATCCGAACAACAACGTTTTCTAAGGAAATCGTAGAAATTCTTCCTGATC
AGCTTCTTTGTTTCCTTTCAGGATTGGAAGCGTTAACGCTCCAGGAGTCT
ATAGAAAAGGTCTTTGACGGTATTGAAAATTTAGATCCTGTATTGATTTT
ATATTTGTTTGATTTATTTGCTAAAGACGCTTTGATTCACGGTAGAGGTG
AAGAGATTCTGAAGGCCATTGCTCTAGTAGAAAAGTATATTTCTCCTCAG
CAGCGTTATAGGTATCTTTTGCCCTATGAGGTGCTCTCTTATTTATGGAT
GAAAGATGCGAATAAAGTTTACGATCTTTTGTCTAGTTATGACGAATCTT
CGTGGATAGACGATAGCAGTCACGCCTTCGTTCTTTATGGTTATTGGCTA
GCACTTGCTGAAGATAGCTCCTTAGCTTATCTACATCTTTCAGGATGTCG
AGAAGATTCTGTATTTCCACGAGCATTGATAGGAGTATTTTGTAGTCCTT
TAGGTATTTGTGAAGAGCAGTTGAGTTATCAAGAACGGCGGCAGTTATTG
TTGCAGAAATTTATCTTTTTCCATTGTTTAGGAAATAGTGAAGAACGCGA
TAAGTGCCGCACGGCTTACGATTCTAAAGAGCGTTCTTTATAA
>CCA00429 RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family
GTGAAAACACAAAACACGCAAAACATTTCTGAGATTTGGGAATTATATTG
GGAAACCCAAGAGATTGAGTATCGAGATACTTTGATCGATTTTTACCTAC
ATCTAGTCAAATGTGTAGTTCACCGTTTGATTTCAGGTATGCCTTCCCAT
GTAAAGACCGAAGACCTGTATGCTTCCGGAGTAGAGGGATTAGTGCGCGC
CGTAGAGCGCTTTGATCCAGAGAAAAGTCGTCGTTTCGAAGGTTACGCCC
TGTTTTTAATTAAGGCTGCTATTATCGATGATTTAAGGAAGCAGGATTGG
GTTCCTAGAAGCGTTCATCAAAAGGCAAATAAGCTTTCAGAGGCTATGGA
TACCTTAAGGCAGTCTCTAGGAAGGGAGCCTACAGATGGAGATCTTTGCG
AGTATTTTCAAATTTCCCAACAAGAGCTTTCCGGATGGTTTATTTCAGCG
CGTCCGGCTTTGATCATTTCCTTAAATGAGGAAAGACCTTCACTATCCGA
CGGAGAGTCGGGTGTAGCTTTAGAAGAGCGCATTCCTGACGAACGGGCGG
AAACAGGGTACGATATCGTCGATAAAAAAGAATTCTCCTCATTTTTAGCC
AACGCTATAGAGGGCTTAGAGGAGAAAGAACGAAAGGTGATGGCTCTATA
TTATTATGAAGAGCTAGTTCTTAAGGAAATTGGCAAAATTCTTGGAGTTA
GCGAATCTCGCGTCTCTCAGATTCATTCCAAAGCTTTGATTAAACTTCGA
GCAGCTTTATCCGCCTTTATTTAA
>CCA00931 helicase, Snf2/Rad54 family
ATGGTTTTAAACGCTTTAGCTGGCTTTCGTCAAACAGCGATAGATTATCT
CGCTACGAATCGCCAAGACATCGCTTTAGATTTTTCTGGAGATTGTTACA
ATATCCGCATCCCTGATGAAGATTCTCCTGATGGGAATTGGCTCAGCACA
CTGAGATTTAGTGATATTGACAATCTAACTTTTGCCTCTTGTAGTTGCCC
TGATGGGGATTGTTGCGTTCATTTAATGACCGCTTTTTTCTCTGCCTATG
ATGCTCACGGGTGGCTACCTCTACATCATAAATTTGACATATCTTTTTGG
CATGCATTGTTCTTGAAGTTATTTCTAGAAGAGGCGCAGTTGCATGCTGA
TGGTGACCGACAGTATTCTATAACATCTCCCCACATAACATTAGAGATTT
CTGCGTTATCTTCGGAGGCTTTTACAGAATGGTTGCCTATCATTCATCAA
ACTCCAGAACCTAAAACTTATACAAAGAAAACTTTCCCTCAGTCTGTTTT
ATATCGCGTAGCAAAACAGTTTTTCTTCTTTTCTGAAGCAGGAGCACGTT
TAGATCTTATTGAAAATAGTCAGGGTTTCCCTACGCAATTTGCAATGCAA
TGGGAAGGCATCTCTTTAAAAGGAGAGATTTTAGATTTCTCTACTTTGGA
AAATCTATTCCCAAAGATTAATTTCTCTCAAACATCTCTCCCCGGAAATT
ACAGTGATTTTTCTATAACGAAAGTACGCGTAGCTCCTGAAGAATCCAAA
ATATACTTCACCGTTGAACCTATCGCGCACGATCATGCAAATCAACCTAT
AACCGAAATAGGCTCTATTGGCTATATAGCAGGGTCTCAACAGGTTATTC
TTCCCTCAAAAGAAACCTTCGTTTCTATTTATCTGATCTCCCTCCTTCCT
GAAACGCTGAAAAAACAAATATTAGCACTGCTACATTACGATTCTGAAGA
ACGTCCTATTCGTTATTCTATTCATTTCTTAAGAGACTCTTCTATTTCCT
TTTCGGCATATTTAGACACTCCTGGAGATCTAGAGAATGGGAAATTAATC
TATCCTGATTTTTGTTATGTTCCTGAAAAAGGGTTATTCACAGTTGTAGG
TTTACTCTCTCCCCAAATCTCATTTGTTATTAAAGCAGATCAGGTTGAAG
AGTTTTTAAATAATGAAGGTATGTTAATTCGCGAACCGGGATTTGAGGTA
TTTACCGATCGCATTCCTGAAGGCCAATTAACCTATAACATTACACAACA
GGGTGTTTTGTTATTCCATTACAACACAGGAAATCCCGCAGCTATAGACA
TTCATTATGGCCCGTGGACATACTATTCCGGACAAGGATTCTTCTTACAA
AGAAAAGCTGACTTAGAAATTCAGGATGGTTTGATTGTAGAAGCGGATCA
CATTCCTAACTTCATTATGAAGCATGAAGTTGTTTTACGAACGATCCCTA
ATTTCTTTGCTCCTACACCACCTTTGAAAAACCTTTTCTTTGAAGTGCAC
AAAGAAACAAAAGGTTCAGGGTTGTATTTAAAACCTGTATTTCAAGGTTT
GGAAGAAGAAAATTGCCGCCTATTTGGCGTTTTCCTTTATCGGGAAAATC
TCGGTTTTAACCTACTTCCTACTCCCTTACAACCCTTATGCTCACTCCCT
AGAAAAATCCCCGCTGAACAAGTTCCGGATTTTATAAATCAAAATTCCCA
GAATGATAAGCTTGTCTTCACAGATCCGCAGCTTTGTCCTCCGGTAACAT
TTGAACTGGTCATATTGTCCATAACACGACCGCATCCATCGTCACCTCTA
CATCTACATCTAGAACTCAAGACAAATATTGGTTCTATACCGCTGGGCAT
CGTGCTGCAGGCGTTAAAAAACAAAAAGGCTTTTGTTTTCACTAAGGCGG
GATTTTTAAGTTTCCAGCATTGCCTCTTTCAATTCTTAAAACAATTTATC
TCGGCGCAAAAATGTCTCATCCCTGAAAATACTGTAATCGCAACGGTTAC
AGATATCTTCAAATTAGATGCTTTAGCACCTCTATCTACTCATGAACACA
TTAGCGCGAGCGCATCTGATTTAGCATTTTTCTCTCAGCTTAAAGCAGCA
TGTCTACCGCCTATTCCACAAAGTCTATTCTCTACAGATCACAAACTCCG
CCCTTATCAAAATAGCGGCTTATTGTGGTTATGGTTCTTATATAACCACC
GTCTATCTGGATTACTTTGTGATGAAATGGGATTAGGGAAAACTCACCAA
GCCACAGCATTATTGGATATTGTCTTCCAATCGGCAGAGCCTACAGAACG
ACCAAAATTTCTTATTGTCTGTCCAACAAGCGTGCTGCCTCATTGGGAAC
ACACGTTAGCAACACACTTACCTACAGTAAGTATTTTTGCTTTTCATGGT
CCTAATAAACCTGAAAATCTTCCTCCTACTGATGTCATTATTACTTCATA
CGGCACTCTAAGGCAAAATTACGCCAAATTTTATAAGGTTTCATTTACGG
TAACCGTGTTTGATGAAATCCACATGGCAAAAAATAAAAATAGCCAAATT
CATAAGATTCTCTGTCGCTTAGATTCTCAAATGAAATTAGGCTTAACAGG
AACCCCTATAGAAAATAACCTTCTTGAGTTCAAAGGTCTCTTGGATATCA
TTCTCCCCAACTACCTCCCGTCGGATGCTTTATTTAAGAAGCTATTTACA
AAGAAAACACCTGCAGAAATAGATGATGAGATTATCCCTTCACAAGATCT
ATTACTCAAATTAACTCGGCCTTTCATTTTAAGAAGAACGAAAAAGCTTG
TCCTTCCTGAGCTTCCTGAAAAAGTAGAATCGATAATTCCTTGTACGTTA
TCTCCAGAGCAAAAAAAGCTCTACCAGTCTACATTGAAGAGAGAAAAAGC
GCAGATTCAACAGCTGGAATCTCCAGAAGAACAAACTGTCAACTACCTCC
ACGTATTCGCCTTATTGAATCACTTAAAACAAATCTGCAATCATCCAGCA
ATCTTCTTCAAAAATCCCGATAAATACCGAGAACACGAATCCGGAAAATG
GAATGCTTTTGTACGCCTTCTCCATGAGTCCTTATCCTCGGGATATAAAG
TTGTTGTATTCTCACAATACATCCATATGATTCGTATTATCATGCTGTAT
CTTGAAGAGATCGGCGTGAAATATGCCTCTATTCAAGGAAAATCCTTAAA
TAGAAAAGAAGAGATCGAATACTTCACCACAGATCCTGAATGTCGCGTAT
TCGTAGGTTCCCTACTCGCCGCAGGAACAGGCATTAACCTTACCGCCGGT
AACGTCGTCATTATGTACGATCGCTGGTGGAATCCTGCTAAAGAAAACCA
AGCTTTAGATCGTGTTCATAGAATAGGACAGAAAAATACAGTATTTATCT
ACAAGCTCATGACTGAGGATACGTTAGAAGAACGTATTCACTACCTCATT
GAAAAGAAAATTCGCCTATTGGATAAGGTTATCTCTACCCAAAACTCTAA
TATCCTCCATATGTTAAATAGAGAAGATCTCATTACGATTCTATCTTATA
AAGATGAACGCAATGGAGTCGATGATACAGCGAATATTCCTAACGATGAA
GAAAACTCTATCTTTTAA
>CCA00618 protein kinase, putative
ATGGAAGGTGAGCAAGATATAGGAGTTGAGTTTTTAGGTGACTATAAGAT
CCTCTGTTATTTGCGAAAGGGTTTGTGGTGCCAAGATATTCTTGCCGAGC
ATCGTTTTATAAAAAAACGGTATATTTTAAAATTACTCTGTTCTGAGCTT
TCTTCATCCGAAGCCTTTATGACTGCTTTTCATGAAGCTATTATCAAATT
GGCAACAATAAGACATCCCGGGATTATCTCTATAGAAAATGTTTCACAAG
CAGAAGGGCAGTATTTTTTAGTAACCGAAGAAAAAGAAGTCCCCACGCTC
TCTTTAGCTCAATATCTTTCCAGTTGTTCTCAAGGATTATCAGAATTAGA
AGCTAAAGATCTTATCTGTCAGCTTGCTGAGATTTTAGACTATGCCCACG
CGAATAGATTAATTCACGGTGGTTTAAGTTTGGATTCTGTACATATCGAT
CTTACCGGACAATCCCCAAAAGTATTTCTTCCAGAGTTGGGGTTTTCTTT
TTTACTTAAGGATCAATATACCCAGAGCCTTTTAAGAGATTCTTCTGAGA
AATCTTCTTTTGATAAGTTAAAGCAGATACTTTTATTCCAAGCTCCAGAA
ACTGCTTTAGGAACAGTTGCTGAAGATGTCTATGCATTTGGAGTGATTGT
ATATTTTCTTTTATTTAGACAGTTGCCTCAGGGTGCGTTTCCTTTACCCT
CAGAAGCTTTCCCTGAGTATGTTTATGATTGGGATCGATTAATTCAATCC
TGTTTAAGTTATGCCGTAGAGAAAAGGCCTAAGAAGTTGGCTCCTTTACT
TGTGAAAAAAACCTTAGGAGAGCAGTTCCTCGCAGCTAAAATACAATGCA
GCGAAGAAGATTTAAGAGAGATAGAGGAAGAACCTCAAGTTCCTAGTGTA
GCGAATATTCTTCAGAAAGTTGAGGACAAAATAATAGAGGAAACCTCGGA
TCATTTAGAATTTGTCCTCGTGGAAGCCAAATCTATAGACGAAGCGATGA
ATACCTCTGTAGATTCTAAGGAAGAAGTTGTTGCTGAAGATGAAAGTTAC
TCTAACGCTTTACAATCATTATTAATACGAGAGCCGGTTGTTAGCCGTTA
TGTAGAAGAAGAAAAAGAAGAGGTGAAGCCACAGCCCTTATTCACCGAAA
TGGTATTTATTGAAGGGGGAAAGTTTCTCCGAGGAAGTCGGGAGGGACAA
CGTGATGAACATCCTGTACATGAGATTTTTTTACATAGCTTTTTCTTAGA
TATTCATCCCGTGACGAATGAGCAGTTTGTTCGTTATTTAGAATGTTCGG
GAAGTGAACAAGATAAGTATTATAATGAGCTTATTCGTCTTAAGGATTCA
CGAATACAACGCCGTTCTGGCAAGCTTGTTATTGAACCTGGTTATGCTAA
GCATCCTGTTGTTGGTGTTACGTGGTACGGAGCTTCTGGCTATGCCTCTT
GGGTGGGGAAACGGCTCCCCACGGAAGCTGAATGGGAAATTGCTTCTTGT
GGAGGCGTGACTCAGCTGCGGTATCCTTGCGGTGAAGAAATAGATAAAAG
CCAGGCAAACTTCTTTAGCTCAGATACAACGCCAGTAATGAGCTATCCCG
CCAATCCTTATGGATTGTATGATATGGCAGGGAATGTATACGAGTGGTGT
GAAGATTGGTATGGCTATGATTTCTATGAAATCTCGGCTCAAGAATCCCA
TGCGCCTCAAGGTCCTGCTCAAGGTGTTTATCGTGTGCTAAGAGGAGGGT
GTTGGAAGAGCTTAAAAGATGATCTTCGTTGTGCTCACCGTCATCGTAAT
AATCCTGGTGCGGTAAATAGTACCTACGGCTTCCGCTGCGCAAAAGGAGT
TAAGTAA
>CCA00212 ATP cone domain protein
ATGCAGTGTCCTTTTTGCAATCATGGGGAATTAAAGGTTATAGATTCGAG
AAATGCGCCAGAGGCAAATGCGATTAAACGCCGACGAGAGTGCTTAAATT
GTGGACAAAGGTTTACCACTTTTGAAACCGTTGAGCTCACTCTGCAGGTA
CTAAAACGCGATGGTCGTTACGAGAATTTCCAAGAATCTAAACTAATTAA
CGGATTAAATGCCGCCTCTAGTCATACACGTATAGGTCAGGATCAAGTGC
ATGCGATAGCCTCTAACGTGAAGTCTGAGCTCTTGGGCAAACAAAATAGG
GAAATCTCTACCAAAGAAATTGGCGAACTAGTAATGAAATATCTAAAAAA
GGCAGACATGATTGCCTACATTAGATTTGCCTGCGTCTATAGAAGATTTA
AAGATGTTGGCGAATTAATGGAGGTTTTGCTATCTGCAACTCCGGATATG
GAAAAATAG
>CCA00240 exoribonuclease, VacB/Rnb family
TTGGTGAAAAAAATAAGAAAAAGAAAACCCCAAGGCTTTAGAAGAAGCTC
TAAGCAAATCTTAATTTCCGGCGTCTTATTTGTTCACGCTAAGAAAGGCT
TTGGATTTGTCACACCTGACCATCCTGAGGAGTACCCCTTTGATATTTTT
ATTCCCGCAAGAGACCTTAAAGGTGCTCTAGATGGAGATCATGTTATCGT
CTCTCTTTTCCCAAATTCTAAAGAAGGAGAAAAAAGAAAAGGCATGATCC
ACCAAGTTGTTTCAAGAGGGAAGACAGTTCTTGTAGGAACTATAACCTCA
ATAATTGATGGAACAACCGCTCTCGTTTGTGTTAATGCCTTAGGCCCAGA
TATTCCTGTAAAAGCAAAACTTCTCCCTAAACGTTCTTATAAACTTGGGG
ATCGTTTATTACTTAGCACCCCCGCATGGAAGGAAAAACCCGAATCTAAA
GAACCTCCTCCATTGGAAATGCTCGAATTTATCGGCAATATCTCCAATGC
TAAAGCGGACTTCCCCTGCATAAAAGCTGAATACGCTATTGAAGAGGAAT
TTCCGGAAGCTGTTATCGAAGAAACTAGCCATTTCTCACAAAAACATATC
AACCAAGCTCTACGATCACGAAAAGACCTTCGCGATCTCCTTTGCTTTAC
TATCGATTCGATAACTGCAAAAGATTTCGATGATGCCGTATCGCTAACTT
ATGACAATAATGACAACTATATTCTTGGCGTCCATATTGCAGACGTCTCT
CACTACGTAACGCCACATTCTGCTCTAGATCAAGAAGCAAGTAAAAGATG
CAACTCTATCTACTTTCCTGGGAAAGTAATCCCCATGTTGCCTTCAGCTC
TTTCTGATAACCTTTGCAGCTTAAAACCCAACGTAGATAGGCTTGCTGTT
TCTGTATTCATGACTTTCACTAAGGAAGGCCATTTATCCGATTACGAGGT
ATTTCGTAGCGTAATTCGCAGTAAATACCGGATGACCTATGATGAAGTAG
ATGAGATTGTAGAAAATAAACAACCCCATCCTATATCAAAAACTCTCCTT
GCTATGGCAGAGTTAAGCGAAAAATTCGCAGATATTAGAGAAAAACGTGG
GTGCATACGCCTTGTCCTACCCTCATTTACTATGGCTCTCGACAACCTAC
AAGAGCCTGTAGCTCTTATAGAAACACGACAAACGCTATCGCATAAACTT
ATTGAAGAGTTTATGCTTAAAGCTAACGAAGTCATCGCCTACCATATTTC
CCACCAGGGAGTCACTCTACCATTTAGAATTCACGAATCTCCAAACGATG
AAAGCCTACTTTCCTTCCAGGAAATGGCAAAAGGTATGGGGTTTGATATT
ATTATGACCCCAGCTCAAGAACCCGATTACCAATATCTACTACAAGAAAG
CTCTGCAGGGCACCCTCTAGAAGCCATTCTACATTCACAGTTTGTCCGCA
GCATGAAAACTGCCTCATATTCAACAGAAAATAAAGGCCATTACGGATTA
AAACTCGACTTTTATACACACTTTACAAGCCCAATCCGTCGTTATATCGA
TCTTGTTGTGCATAGACTGCTATTTCACCCCATGTCGATAGAAGAAACTC
GCCTAGAACACATCGTACGAGCCTGTTCAACACAAGAACGCATAGCCGCA
AAAGCTGAATTTGCTTTCGAAAATCTTAAAAAGACCCGCTTCTTAGATAA
GTTCTTAAAAGAACAACCTGAAACAATTTATAAAGGCTTCATTATCACAA
CAACTCCTGAAGGGATTTCCTTCACAGTTCCAGAGTTTTGCCAAGAAGGT
TTCATCCCAGCAGCGCAATTACCTAAAGAATACTCCTTAAAAAAGAAAAC
CTCTCCCGATGATCTTCCAAGTAAAATGCGCCCCGGAGCAACTATAGAGG
TCAAACTCTCGGAAGTAAATCTCCTCAATCAGGCAATTACTTGGTCGTTG
GTTACAAAAACGCCAAAGAAAAGCGAGAAAAAATCATCCAATCCAGAAAA
GAAACCCAGAACTAGAAGAAAAAGGAAAACAGAGTAA
>CCA00543 argR, arginine repressor
ATGAAAAAAAATGTAGCACTGGATAAAGCTTTAAAAGAAATTTTAAACGA
AGAAGGAGCTTCAACTCAGGAAGAAATTTGCGAAAAACTCTCTTCCTTAG
GAATTGCAACGACACAATCTTCTGTGTCTCGCTGGCTAAAAAAGGTTCAC
GCTATAAAAATCCCTGGGGACAAAGGTGCCCGCTACTCTCTTCCTCCCTC
AATAGACGACTCTAGCATCAAACATTTGGTCTTTTCTATCCGTCATAATT
CTTCTTTAATTGTCATACGCACAGCTCCTGGTTCAGCTTCCTGGATAGCT
AGCTTAATTGATAACAAGTTTGCAGAAAGCATCTTAGGGACTTTAGCCGG
TGATGACACCATTTTCATCACACCCATCACAGAATCAACAATTTCCTTAA
CAGCCAAAGATATAGAAAACTTCTTGCTAGTTTTTTCGGAATAA
>CCA00918 helZ, helicase, Snf2 family
ATGCTTAATTTTCGCAAATTACGAAGGGATTTTACAGCTAATATTTTGCA
AGATGGCAAGGAACTTTTTGACCAGGGAGCTGTGATTAATGCGAAGATCC
TGTCAATGAATGGAGAGTCGGTGTGTATAGGAGCACAGGTTCGAGGTCTA
TACGACAACGTATATGAATGTGAAATAGAAGTTGATCGTTCGAAATCTGA
TACTATAGATTCTAACTGTGATTGCTCTTATAACTATGACTGTCAGCACA
TAGTAGCGCTACTGTTTTACTTAGAGAAATATTTCAATGAAATGGTGGTG
GCCTACTCTCAGGAGGCTGATTTAGAGACGAATCAAGAAATAAATGAAGA
AGTTAAGAAAGAGCTTCAAGAAACTTTTGTAGCTGCTGCAAGTAGGGAAG
AAGAAAGAAAAGACCGTGCGCATCAAAAAGAAATCTTAAGTGAATACGTT
CATGCAGCCAATGCGTTGAGTGCAAATCCATTTTTCCTTCCTCAGGAATA
TTTGGAAAAAAATTCTGCAGAACTTGCTGTTTTATTTGTTGCTTCTAATG
ACGAGGTATTCCGTCCGAATCAGCATGTGGAATTCCAATTAGTTTTACGT
CTTCCTGGCCGTTCTAAGCCATTTTATATTTCAAATATTAAAACTTTCCT
TGAAGGAGTTTTGTATCAAGAACCGATAATCCTTAATGGTCGTCGTTTCT
TCTTCACAATGCAATCTTTCAATGTTTCCGATCGCAAACTTATAGATTTA
TTGATCCGTTATGTTCGTTATGCGAATCAAGCCCCTGAAGAAAAGTTATT
GAAATCAGCCTATCTGACGTTGACATCATTAGGTGTGATTTTGGCAAAAA
TGTATGAACATCAGATGGCAGATCGTGGTGGGGGACAAGTCGGAGAGAAA
GAAAGTTTTTCAGGTATGTTTTGTGGGAACCTTGAAGAACCTTTATATTG
GTCGGCTTCTGCCGCTAAGATGAAGTTTGATTTAGATTTTTTCGATACCC
CCTACAAGGCACTATTAATGACGCCATTAATTCTTGTGGATGATGAAACT
CTTCAGCCTGAACAGGCGATTCTTTTAGAGTCTAATGTACCTGGAATTAT
CCACAATAATGTCTACCATCATTTTGCTCCTCAGATTCGACGAGCACATT
TACGTTCTTTCTTAAGGCTGCGAGATATCACGATTCCGGAAGCTTTGTTC
GGATCTTTCCGGGAAAATGCGCTTCCTGTGTTTAAGGAATACGCTGAGGT
TTCTAATGTTGAAGTTTTAAATCCCTTTGTTACTCTTCCTTATGTTGAGG
ATATCCGTGGAGTCTGCAATATAAGTTATTTAGATGGGGAGTTAGAAGCG
AAGTTACATTTTATCTATGATTCGCTCACGATTCCTGCGGCTTCGTTTGC
TTTAAAATACCAAGATGTTCATGCGTTTATTCGTGATGATGGAATTTTAG
CTAGGAATCTTGTTGAAGAACGTAAGATTACAGAAGAGGTTTTCTCAGGC
TTTATTTATGACGAGCGCGACGGTGCTTTTCATGTAAAAAGTGAAAAGAA
GATCGTGGAGTTTATGACAGAAACGATCCCGAATAATCAGCATAGGATTA
CATTTAACTGCCCTGAGACGCTCTCGGATCAATTTATTTATGATGAAACA
GTCTTTGATCTTTCCTTTAAAGAGAGTTCAGAAGTTAATACTTATGAAGC
CGAGCTCAAAGTTAATGGCTTACTGAAGGGAATTAGCTTAGACTTACTTT
GGGATTGTATAAGTGCTAAAAAGCGTTTCCTAGAGTTGCCTAAGAAAGGC
CGTAATGTAAAAACTCCTAGAAGGGGTAGAGCTTCTAGCACTACGAAACT
TCCATGTATTTTAGTTTTAGATTTAGAAAAGATCTCTCCAGTTGTTCAGA
TTTTTAATGAAATAGGCTTTAAGGTTCTTGATAACTTTGTAGAAAAGTGT
CCTTTATGGAGTTTGACAGGCATTTCTCCTGAGATTTTCAAAGGTTTACC
AGTCAATTTTACAATGACGGATAAACTTGCTGAGATACAAAAGCAAATTC
GTGGAGAAGTCGCTTTTGATTTCCAAGCTGTTCCTGAACAAATACAGGCG
ACATTGCGTAGTTACCAAACAGAAGGAATTCACTGGTTAGAGCGTCTTAG
AAAAATGCATTTAAACGGTATTCTTGCTGATGATATGGGCCTTGGAAAGA
CCCTGCAAGCAATTATTGCCATTACACAAAGTAGATTAGAGAAGGGAAAG
GGATGTTCTCTCATCGTCTGTCCAACATCCTTAGTATATAACTGGAAAGA
AGAATTTCGCAAGTTCAATCCAGAATTTAAAACTATGATAGTGGATGGAA
TTCCTTCTCATAGACGTAGACAGTTGGCAGCTTTGTCGGAATATGATGTT
GCTATTACTTCTTATAATCTGTTGCAAAAGGACATCGACACCTATAAGGA
TTTTGTCTTTGACTATGTAGTTTTAGACGAAGCCCATCATATTAAGAACC
GCACGACGCGTAATGCGAAATCTGTAAAAATGATTCGTTCGGGACATAGG
TTAATCTTAACAGGTACTCCTATCGAAAATTCTCTCGAAGAATTATGGAG
CTTGTTCGACTTCTTGATGCCTGGTTTATTGAGTAGTTACGACCGCTTTG
TTGGTAAGTATATCCGCACAGGCAATTACATGGGGAATAAGACCGACAAT
ATGGTTGCTTTGAAGAAGAAGGTCGCGCCATTTATTCTTCGTCGCATGAA
AGAAGATGTATTGGAAGATTTACCGCCTGTTTCAGAAATTCTGTACCATT
GTCATCTTACAGATTCTCAGAAAGAGTTGTACCATTCGTATGCTGCTTCA
GCGAAGAAAGAGCTTTCTCGTTTGGTTAAACAAGAAGGATTCGATCGTAT
ACACATCCATGTTCTTGCAACGCTTACACGTTTAAAACAAATCTGCTGCC
ATCCAGCTATCTTTGCAAAAGATGTTCCTGAACCAGGCGATTCTGCAAAG
TATGATTTGCTGATGGATCTTCTTTCTTCTCTTGTTGAGACGGGGCATAA
AACGGTTCTCTTTAGTCAATACACCAAGATGTTAAGCATCATCAAAAAAG
ACCTAGAGGCTCGTGGAGTGCGCTTTGTTTATTTAGATGGTTCCACCAAG
AACAGATTGGAGTTAGTCAATCAGTTTAACGAGGATCCGGGATTACTAGT
TTTCCTGATTTCCTTAAAAGCTGGAGGAACAGGATTGAACCTTGTTGGTG
CGGATACGGTAATTCACTATGATATGTGGTGGAACCCTGCTGTAGAAAAT
CAAGCTACCGATCGGGTGCATCGTATAGGGCAGAATCGCTCAGTGTCTTC
ATATAAGCTAGTTACGTTAAATACCATTGAGGAAAAAATTCTATCTCTTC
AAAACAGGAAAAAGAGCCTTGTAAAGAAAGTGATCAACTCTGATGATGAA
GTCGTTTCCAAGTTGACTTGGGAAGAAGTGCTAGAATTGCTACAGATATG
A
>CCA00243 hrcA, heat-inducible transcription repressor HrcA
ATGTCCAGATCATGGATCTCGAAACGAGAGTCTAAGATTCTTTACATACT
CTTAACGACGACAGAGCTGTATTTAAAAACAGGTCATCCGGTCGGATCAA
AAACTTTGAAGGAATATGAAGGCTCCAATCTGAGTACAGCAACTATTCGC
AATTATTTTTCAGAGTTAGAGGCGGAAGGATTTTTAAAGAAAAATCACAT
CTCCGGAGGAAGAATCCCTACGGATTTAGCTTTTCGTTATTATGTGGACC
ATTGTGCAGATTGTTCTCAGGATGAGCTTCCTGAATCTACAATCAATCTG
TTAAACCAGCTACCTGAAGAGAGCCAAAATATTGTTAAGGATTTACAAAA
GGCATCGGAACTCTTAGGAGAAGCCCTCCAACTTCCGACATGTTTCTCTT
CACCGCGATTTGACAATGACTCTGTAACCAATATCCAGCTTTCTCTTGTA
GATGAACAACGGGCTGTTGTGATTTTATCTACAGAATTTGGTCAGATATT
TACAGATACCCTATGGCTATCCGAAGCGTCAAATCCTGCTTCTTTAAAAC
GCATTGAAATATTTCTTCAAAGTTATGTTCGTAAGCAATCTCCCATGGAG
ATTCTTTCACAAAAAGAAGAAGATATAGGAATGACCTTATACAACGAAGT
CGTGGTACGGTATCTTACCCGCTACTGTAATTTCAGTGAGGAAGATCTAT
ATCAAACAGGATTATCAAAACTCCTAAGATATGAGTCTTTCAAAGATCCC
GACATGCTAGCTTTAGGGTTATCATTTTTCGAAAACCGCCGCCATATGTG
CAAGCTTTTAGATATTGGGATGCATAGAGACCGCCCTACAGCATTTATAG
GTAATGAGCTTTCTGATATTTTTAGAACCCCAAATCCACAATGTGCTGTG
ATTACGATTCCTTATTACATGAACCGCACTCCATTAGGAGCCTTTGGCGT
GCTAGGCCCTGTAAATCTTCCTTATAAGGAGATTTTTAAAACCCTCACAA
TATTTGCAGATAAAATTAAAGCAAGCCTGACACAAAGTTTTTATAAGTTT
AAATTATCCTTCAGAAGACCTTGTCCTTCCGATCCTACACTCTCTAAAGA
ACCTACATTACTGGCAAGATACTCTTCTATAAAACTGTTACCCCCTAAGG
AGACATCATGA
>CCA00877 mfd, transcription-repair coupling factor
ATGGCAATGGATTTCGACCCAGTTAATTTAAACCTACCCATCTTATCTGA
AATAACTAACGCCTCTATTCCATTACTAATAGAAAATATCCGTCCTGGAG
CTCGCGGATTCTTAGCCGCTAAGTTTTTCCGCGAGAGGGACGAGTCTGTG
GTAATGATTACCACACGCGCTCGTATTGATGATCTTTTCGAAGATCTCTC
CTCATTTTTAGGATGTGCCCCTGTTGAGTTTCCCTCATCCGAAATTGATC
TATCTCCTAAGCTTGTCAATATTGATGCTGTGGGTAAACGTGATAAAGTT
CTTTATGAATTATATGAAAAGAAAGCTCCGTTATTTTGCATAACCACGTT
AAAAGCTTTACTAGAGAAAACTCGTTCACCTAAAGATACTGGTCATCAAC
ATTTAGATCTCCAAGTTGGTGATGTGCTAGATCCTGAAATGATGATCGAT
CTATGCAAAAATTTAGGCTATCGCCATGAAACTCTTGCGAGTGATAAAGG
AGAGTTTGCTTATAGAGGGGGGATTATTGATATCTTTCCGTTATCTTCTC
AAGAACCTTTTCGCATAGAATTTTGGGGAGAAAAGATCATCTCCATACGT
CCTTTCAACCCTTCTGACCAACTCTCAACAGGAAAAGTTTCCAAAATTTC
GATTTCTCCGGCTACAAAAGATTCAGGGAAAGAAGCGTTATCACATTGCC
TATTGGATTATTTTAAAACACCCCCTGTCTTTATCTTTGACAATCTCTCG
ATGTTAGAAGATGATTTTTCTGAGATTTCGGGAACATTGTCTTCGTTGCC
TAACCGCTTTCTATCGATTACAGATCTCTGTGAACGCGCTTTGCAATCCC
CTACTATTTTCTTTGAAGAGAAAAGCTTCCCTAATGTTCGCAATCTTAAA
AACAATGAAGTAAATATCGAAGTCTTTCATCGTGATGTAAAAGCTTCTCG
CCTAGTTGTTCCTTTTGTTTATCCTAATGAGACTATCGATGATCAAGAAA
ATCCCCTTCTGGGTTTTCTACAAAAACTTCAAGAATATGTTCCTCATAAA
GGCCAACCCTTTAATGTAGCTCTCTACAATACAAAAGCAAAATCTTTAAA
AGAAGCTCGTGCTTTAGTAGAAACTCTATCGGGAAATTCTATACATATTT
ACGAAAAGCCAGGAAATCTCTCTACAAGCTTTGCTCTAGTTGAAGAAAGA
TTTGCAGCAATTTCCCTTGCAGAATTCTCTGCTACAAAAGTGTTGAGGAG
ACAAAAACAGAGAAATTATTTTTCTGTAACTACCGAAGAAGTTTTTGTTC
CTATTCCTGGCGAGACCGTTGTGCATCTTCACAATGGTATCGGCAAATTT
ATCGGAATAGAAAAGAAGCCAAATCACTTAAATATTGAAACAGACTATCT
CGTTCTTGAATATGCTGATAAAGCTAGGCTGTACGTCCCTTCTGACCAAG
CTTATTTAATTTCACGCTATGTAGGGGCCTCTGATAAAGCTCCTGATCTT
CATAATCTTAATGGCTCTAAATGGAGAAGATCTCGAGATCTCTCTGAAAA
ATCCCTTGTGCTCTATGCTGAAAAGCTTCTTCAACTAGAAGCACAGCGGT
CTACTATCCCTTCATTTATTTATCCTCCCCACGGTGAGGAGGTGATTAAA
TTCGCGGAAAACTTTCCCTATGAGGAAACTCCTGATCAATTAAAAGCTAT
CGAGCAAATTTATTCTGATATGATGTCCGATAAGCTAATGGATCGATTAA
TTTGTGGTGATGCGGGATTTGGAAAGACGGAAGTCATCATGCGCGCTGCT
GTAAAAGCTGTCTGTGATGGCCATCGACAAGTTATTGTCATGGTACCTAC
AACAATTTTAGCGAATCAGCATTATGAAACTTTCTCACAACGCATGGCAG
GATTACCAATAAATATTGCTGTTCTTTCACGATTTTCAGAAAGAAAATCT
ATGAAAAAGATCTTCGAGGACACTGCTAAAGGCGATATTGACATCCTAAT
TGGAACACACAAGCTGATAAACAAAAACCTTGAATTTAAAAATCCTGGGT
TATTGATTATTGATGAAGAACAGCGTTTCGGCGTTAAAGTTAAAGACTTC
CTTAAGGAACGTTATCCTAAAGTAGACTGCCTGACAGTATCCGCCACACC
GATTCCTAGAACATTGTATATGTCTTTATCGGGTGCTCGTGATCTCTCTT
TAATTACTATGCCTCCATTAGACAGGCTCCCCGTCTCTACTTTTGTTTTA
GAACATAATGAAGAGACTTTATCCGCAGCCTTACGTCATGAATTACTTCG
TGGTGGTCAAGCTTATGTTATTCATAACCGTATTGAAAGTATTTTTAGAT
TAGGAAATACCATACGAACATTGATCCCCGAAGCACGTATTGCTGTTGCT
CACGGACAAATGTCCCCAGATGAACTAGCTTCTATATTCCAAAAATTTAA
AGACCAAGAAATCAACATTCTTGTAGCAACAGCATTGATAGAAAACGGTA
TCGATATTCCTAATGCCAATACCATTTTAGTAGATCAAGCCGATAAGTTT
GGTATGGCAGATCTTTACCAAATGAAAGGTCGGGTAGGAAGATGGAATAG
AAAAGCTTACTGCTATTTCCTAGTGTCTCATTTAGATAGATTATCAGGTC
CCGCTGCAAAACGTTTAGAAGCTTTGAATAAACAAGAATATGGCGGGGGG
ATGAAAATCGCCCTCCATGACTTAGAAATTCGTGGAGCTGGGAATATCTT
AGGAACCGATCAATCAGGGCACATAAGTGCCATAGGGTTCAATCTCTACT
GCAAGCTATTGAAAAAGACTGTGGCAGCATTGAAAAACAATACTACTCCT
TTGCTGTTTAACGATGACGTCAAGATAGAGTTCCCTTACAAATCACGTAT
TCCCGATACCTATATCGATCTGGCATCTATACGTATAGAATTCTATCAGA
AAATAGGCGGTGCTGAAGATGCTGAACAACTCGAGCTCATAAAAGAAGAG
ATGCGTGATCGCTTTGGTCCTCTTCCAGAAGAGGTACTATGGTTATTTGC
TTTGGCTCAAGTACGCCTATTCGCTCTACACCACAACATTTCTAGTATTA
AAGGTACGGGAAATGCATTGTATATTCAACAATGTCATGGAAAAACAGAG
CAAATAAAGAAAACATTACCCTATTCTTTATCTCCAACTCCAGAATTGTT
AATATCTGAAGTTTTAGCATCTATAGAGAAAGCTTTTCCTCTAAAAACCC
CTCGTTAA
>CCA00466 nusA, N utilization substance protein A
ATGAATAAAGATCTTGTAGCTATTTTTGACTACATGGAAAAGGAAAAAGG
AATTCAACGCCCCGTTATCATAGGCGCTATTGAGTCCGCCTTAAAAATTG
CAGCAAAAAAAACACTAAGAGATGATGCTAACGTTTCTGTAAATATTAAT
CCTCGCACTGGTGATATAGAGGTCTTCTGTGAGAAAGAAATCGTAGAAGT
ATGTGAAAATCCCAGTAAAGAGATTCCTCTAGACAAGGCTAGAGAATACG
ATCCTGAATGCCAAATTGGGCAATACATGGACGTTCCCTTTGTTTCTGAG
CATTTCGGAAGAATTGCTGCGCATGCAGCCCGACAAATTATCGGCCAAAA
ACTACGTCATGCTGAAAGAGATGTTATCTATGAAGAATATCGACATAGGG
TCAATGAAATTCTTTCTGGCGTCGTCAAACGATTCGCCAAAGGATCAAAT
TTAATCATAGATTTAGGAAAAGTTGAAGGTCTTCTACCCGCACGTTGTTA
TCCTAAAACAGAGAAACACAAAGTTGGCGATAAGATTTATGCTTTATTAC
AAGAAGTTCAAGAATCCGAAAATGGTGGAGCTGAAGTCATTCTTAGCCGC
AGCCATCCCGAATTCGTTAAACAACTTTTCTTACAAGAAGTTCCAGAATT
GGAAGAAGGTTTTGTAGAAATTGTTAAAATTGCTCGTGAAGCAGGCTACA
GAACTAAATTAGCTGTAAGTTCATCTGATCCAAAAACAGATCCTGTAGGA
GCTTTTGTTGGAATGAGAGGTTCTCGAGTGAAGAATATCATTCGAGAGTT
AAACGATGAGAAAATAGATATTGTAAACTATTCTCCCGTAACCACAGAAT
TATTACAAAATTTGCTTTGCCCCATAGAAATTCAAAAGATTGCAATCTTA
GAAGATGACAAGGTTATTGCTATAGTCGTTCATGATGCTGATTACGCAAC
AGTAATCGGTAAGCGAGGAATTAACGCTCGATTAATTAGTCAAATTTTAG
ACTACGAGCTCGAAGTTCAACGCATGAGCGAATACAATAAACTATTAGAA
ATTCAACGCCTACAGTTAGCGGAATTTGATAACCCTCAGTTAGATGAGCC
GCTAGATATGGAAGGCATTAGTAAGTTGGTTGTCCAGAATCTTGTACATG
CAGGATACGACACGATCAGAAAGGTATTATTAGCCAGTGCTAATGATCTT
GCTTCTGTTCCTGGAATCAGTTTAGAACTTGCTTATAAGATCCTTGAGCA
AGTCAGCAAATATGGAGAAGGCAAAGTTGACGAAAAACCTAAAATTGAAG
ATTAA
>CCA00696 nusG, transcription antitermination protein NusG
ATGTTTAAGTGGTATGTCGTTCAAGTTTTTACGGCTCAAGAAAAAAAAGT
TAAAAAAGCTTTAGAAGATTTTAAAGAATCATCTGGAATGACCGATTTTA
TACAAGAGATTGTCTTGCCTATAGAAAACGTCATGGAAGTGAAAAAAGGC
GAACATAAAGTAGTCGAAAAATTCATTTGGCCAGGATACCTATTAATTAA
AATGCATCTAACAGATGAATCCTGGTTATATGTGAAAAATAATCCTGGCG
TTGTTGAATTTTTAGGCGGGGGAGTTCCTCTAGCTCTATCTGAAGATGAA
GTAAGAAATATTTTAAAGGATATCGAAGAGAAAAAAGCTGGCGTTGTACA
AAAACATAAATTTGATGTTGGTTCAAGAGTCAAAATTAATGACGGTGTTT
TCGTAAACTTCATCGGTGTCGTTTCTGAAGTTTTCCATGACAAAGGACGT
CTCAGCGTCATGGTGTCCATCTTTGGAAGAGAAACTCGTGTTGATGATTT
AGAGTTTTGGCAAGTGGAAGAGGTTGCTCCGGAACAAGAAAGTGAATAA
>CCA00056 parB, chromosome partioning protein, ParB family
GTGAGCGGAGTTATCAATAAAGATACGATAATAGAAGTGGCTGTTGATAG
TATTCGGGTGAGTCCCTTTCAACCTCGCCGGGTGTTTTCTGAGGCAGAGC
TTCAGGAGTTAGTGGCGTCTCTACAATCCGTAGGGTTAATACACCCTCCT
GTAGTTCGTGAAATTCGTAGTGGTGATAAAGTTTTATACTATGAATTAAT
TGCTGGGGAACGTCGTTGGAGGGCTTTACAGCTTGCAGGATATACTACGA
TCCCTGTTGTCCTTAAGCAAGTGATTGCTGATGATATTGCCGCAGAAGCA
ACGCTTATAGAGAATATCCAACGTGTAAACCTCAGCCCTATGGAAATGGC
AGAGGCTTTTAAAAAGCTCATTAATGTTTTTGGTTTAACTCAGGATAAAG
TCGCTCTGCGCGTAGGGAAAAAACGTTCTACAGTTGCAAATTACCTACGT
CTTTTCTCTTTATCGGAAACTATTCAAAAAAGTCTTTATTTAGGAGAGAT
TACCTTAGGACATGCTAAAGTTATCCTGACTCTTGAAGATCCTAAATTGC
GAGAAATTCTCGCTGAGAGGATTATCTCGAAGCGTCTTGCTGTTCGTGAA
GCAGAGCAAGAAGCAAAGAAATTATTGTCAGGGGAGTCTATATCTTTATC
TTCTAAAGAACATGTAAAAACACCCTCAACTGTATCTTATCAAGATATGC
AAGAGCGTCTTAGCCAATCTTTAGGCTATAAGGTAACAGTAAAATCACAA
GGTTCTCACCATAGCGTCTCTCTACATGTTCACGATGAAGAGCAGCTAAA
GCAGTTAGAGGAGTGGCTTTTGAAGAAAGCCTAG
>CCA00039 pkn5, serine/threonine-protein kinase
ATGGATTGTCAATCCGAAATGCTTTCTCACAATCAGGTAATTGGTGCATA
CCACATCAAGAAGCTCTTGAGTAAGAAAGAGGGAAGCACAGTATATCAGG
GTGTCCATCCCGATACTCTACAGCCTGCAGCTATTAAAGTTCTTGCAACG
CCTTTGGTTACTGATACACCACGAGTTCATAATTTCTTAAAAGAAGCACG
GATTATTGAGCAGATCTCACATCCTAATATTGTTAAGCTATATCAATATG
GACAATGTCGAGAAGGTCTATATATAGCTATGGAATATATTCAGGGAGTT
TCTCTTCGACACTACATCCTCTCTCAGCTCATTCCCTTATCACGTGCTAT
CGATATTATCCTACACATCGCACAAGCTATTGAATATTTACATAGCCGAG
GCATACTCCATAGGGATATAAAACCAGAAAATATCCTTATAACATCTCAA
GGAAACATCAAACTTATAGATTTTGGCCTTGCGATAAGTTCTATAGATAA
GGACGCTCGTCCTTTATATTTAGGAACACCATCGTATATGAGCCCTGAAC
AACGTCAGGGAGATAAGATTTCTGAACTTTCAGAAATCTATTCCTTAGGC
TTAATAGCCTATGAATTGATCTTAGGGAATTTAGCTTTAGGTAAAGTCGT
TTTGTCCTTAATTCCAGATAGAGTGAGTAAGATCTTAGCGAAGGCTTTAC
AGCCTTCTCCTACAGATCGTTACGCATCTATGAAGGAGTTCATTATTGAC
TTACATAGATACCGTCATGGCGAAGATCTGCAAAAAGATCTGCGGAATAA
AGATCATACAGCCATGGTGAATGATCAGCTATATCATCAGAGATTCTGGT
TATCTCCCTTAGAGATTGTGGTTCCTGAATACCTAGCAGTTTCTATACAT
GAACACGGTTATCCTACGCATCCCCACGTATACTACGAAGCTTATATGAG
TGGAGATACTTTTAGATTATGGTTTTGTTATAGTCTTTCGGGAAATCCAA
CTTTAGTATTAACTGTTATGAAAAGCTTCGTAAGTCAATGGGGTCATGAA
GAGAACATTCGAAGCACAATTCGTAAAATGCATAGCGAATTAATGCGTAT
CAATGTTCCTATCAATGGAAAAGGAATCTCCTTATTTTGTGTAACGATCC
CTAAAGAAAAAAAGGAACTTTCTTGGATTGCTTGTGGGAAAACTAGTTTC
CGGTTAAAAAAACAAGGAAAGGTTCCTGAGATTTTTACTACTTCGTCCGC
GGGTTTAGGGAAAATTAGTTCTTTACAAATTCAGGAAACCAAGGTTGCAT
GGGAAATAGGTGATGGAGCAGTATTACATACCTTACAGGCAGACGATTCC
ATGTCATCTTTACATAGTCCTTTATTCACAGAGTTGAAAGATAGAGGACA
AACAGCTATATTCTGCCCAATAGAGAGCGTACGGTACGGGATAGAAGAAA
ATCATGACGGAAATCTTTGTCCCTCAACACTTATCAGCTTAAAAAGAATC
CGGTGA
>CCA00130 rho, transcription termination factor Rho
ATGAAAGAAGAACGTTCTTCAGAAGTCTTGCCAAAGGTGAAAGAGAATAA
AAAACATACATGTCCAGTGTTGCAAGAGAAGTCTTTTGCAGGAGAGTGTG
CGGTAGTTACGGATACGGTTGATGAAAATCAGAACGTGACTATTACAAAA
ATTGCTAAATTGCAAAGGATGGGAATTGAAGAGCTTAATGTATTAGCTCG
TCAATACGGAGTGAAGAACATCGGGTCTCTCACCAAATCTCAAGTAGTAT
TTGAGATTGTGAAAGCAAAATCTGAGCGTTCAGACGAGCTTTTGATTGGG
GAAGGAGTTTTAGAAGTGCTTCCCGATGGATTCGGCTTTTTAAGATCTCC
TACTTATAACTACCTCCCTTCGGCTGAAGACATTTATGTTTCCCCTGCTC
AGATCCGTAGATTTGACTTAAAGAAGGGAGACACCATCATAGGTACGATA
CGTTCTCCAAAAGAGAAGGAAAAGTATTTTGCCTTATTAAAGGTAGATAA
AATCAATGGATCTACCCCAGACAAAGCTAAGGAACGGGTTTTATTTGAAA
ACCTCACCCCTCTATATCCTAATGAAAGAATTGTTATGGAGATGGGGAAA
GAGCATCTTGCTGAAAGGGTATTAGATCTTACAGCTCCCATTGGGAAAGG
TCAAAGGGGACTTATTGTTGCTCCTCCACGTTCTGGAAAGACCGTCATTT
TACAAAGCATAGCCCACGCTATTGCTGTTAATAATCCGGATATTGTTTTA
ATTGTTTTACTCATCGATGAGCGTCCTGAAGAAGTCACTGATATGATTCG
TCAAGTGCGGGGTGAAGTTGTTGCTTCTACATTTGATGAGCAGCCAGAGA
GACATATTCAGGTTGCGGAGATGGTTATAGAAAAGGCTCGACGTCTAGTT
GAACACGGAAAGGATGTTGTTATTCTTCTCGATTCTATTACACGTTTAGC
TCGAGCTTACAACACTGTTCAACCGCATTCTGGAAAAATTTTGACGGGTG
GTGTGGATGCTAGTGCTCTGCATAAACCAAAGAAATTCTTTGGCGCCGCT
AGAAATATTGAAGGCGGGGGATCATTAACCATTCTAGCTACAGCATTGAT
CGATACAGGATCTCGAATGGATGAAGTGATTTTTGAAGAGTTCAAAGGCA
CAGGAAATATGGAGCTTGTGCTTGATCGTCGTCTTTCTGATAGAAGGACC
TATCCTGCAATCGATCTCATTAAGAGTGGTACCAGGAAAGAAGAACTCCT
TTATCATCCTAGTGAGTTGGAAAAAGTTTACCTCTTCCGTCAGGCAATTG
CTGATCTTACCGCTATTGATGCGATGCATTTGCTGTTGGGTAGATTAAAG
AAAACGAATAGTAACGCAGAATTTCTTCTTTCTTTAAAAGAATAG
>CCA00342 rnc, ribonuclease III
ATGAATAATCTGATCAACATTAAAGAAGTTGAAGCTAAATTAAATTTTAC
ATTTACTCAACCGAAACTCTTAGTGACTGCTCTCACACACCCTTCTTATA
GGAATGAGACTGTGACTATTACCGAAGATAGCGAGCGTTTAGAATTCTTG
GGAGACGCCGTGTTATGTTTAATCGTAACTGAACACTTATTCCTGTTATT
TCCTTCCATGGATGAAGGGACACTGTCCACAGCACGCGCAGCTTTAATTA
ATGCAGTTTCTTGCTGCCAATATACCGACGCATTAGGATTAGGAGAACAT
CTACTTATAGGAAAGGGAGAAAGAATTCAAAATGAGCGTGGCAGAACTTC
AGCCTATGCTAATTTATTCGAAGCTGTTTTAGGAGCTGTTTATCTAGATG
GAGGTTTAGCCCCAGCACGACAAATCACCGTGCCGTTATTACCTTCAAAA
AAAGATATCCTTCCTCTTATGCTTGGAAATCCCAAAAACCGCCTTCAGCA
GCTCACACAAAAACAACTGAGGACATTACCTGTATACCAATGTACGCCAT
GGACATCACAACAAGGTGTTCCGGGCTACCATATTCGTGTAATAGTGAAC
GATGAAGTTTGGGGAGAGGGATGTGCCTTATCAAAAAAAGAAGCCGAAAA
ACTTGCAGCTCAAAAAGCTTTAGATGCCCATGACTACGAAAATAAAAACA
CAATGGACTTGTAA
>CCA00114 rpoA, DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit
TTGTCGACCAAGAAAAAGGCGCAGAGTGTAGTTTTAGGGAAGGAGAAAGG
GATGTCGGATAATTCACAAAATTTACTTTACGATAAATTTGAATTGCCAG
AATCAGTCAAAATGATGGCTGTAGAAGGTAGCGGGGGATCGGTTGATAAG
CAGGCGAGTTTTGTCGCAGAGCCTCTAGAGAGAGGTATGGGTCATACCTT
AGGTAATGCTTTGAGAAGAGCATTATTGATTGGTTTAGAAGCCCCTGCAA
TTATTTCTTTCTCTATGACTGGTGTGCTTCATGAGTACATGGCGATAGAG
GGAATCGTAGAAGATGTAACAAACATTGTCTTAAACTTGAAAGGAGCTTT
GCTCAAGAAATATCCTTTCCAAGATAGTGAAGACGGTCGTTGTACTCAAT
TATTAAAGTCTACTATTTCTGTAGATGCCTCTGATCTTGCTGCTTGTGGT
GGTCAAAAGTCCATAACATTGGCTGATTTATTGCAAGAAGGTGGGTTTGA
ATCTGTTAACCCTGATCATGTGATTTTCACTGTCACACAACCTATGCAGC
TTGAAATTGCCCTAAGAGTGGCATTTGGAAGAGGATATTCTACATCTGAG
AGAATCGTTCTTGAGGATAAAGGTGTGAATGAGATCGTCTTAGATGCGGC
CTTTTCACCTGTAGTTTTAGTTAATTACTTTGTAGAAGATACTCGTGTTG
GTCAAGATACAGATTTCGATCGCTTGATTTTGCATGTGGAAACAGATGGT
AGGGTATCTCCTAAAGAAGCTTTAGCTTTCTCTACACAAATTTTAACTAA
GCACTTCTCTATTTTTGAAAAAATGGATGAGAAGAAGATAGTCTTTGAAG
AAGCTATTTCTATCGAGAAAGAGAACAAAGACGATATTCTTCATAAGTTA
GTCTTAGGTATTAACGAGATCGAGTTATCTGTAAGATCTACAAATTGTTT
GTCTAACGCAAATATTGAAACTATTGGTGAGTTGGTGATTATGCCGGAAC
CTCGCCTGTTGCAATTCAGAAACTTTGGTAAGAAGTCTCTTTGTGAGATT
AAGAACAAGTTGAAAGAAATGAAACTTGAATTGGGAATGGATCTCAGTCA
GTTTGGTGTTGGTTTAGACAACGTAAAAGAAAAAATGAAGAGTTACGCCG
AAAAGATTCGGTCTAAAAACGTCAAGGGATAA
>CCA00691 rpoB, DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGTTCAAATGCCCGGAGCGGGTTAGCGTCAAAAAAAAGGAAGACATCTT
AGATCTTCCAAATCTTATTGAAATTCAAATTAAATCTTATAAGCAATTTC
TTCAGATTGGGAAGCTTGCGGAAGAGCGCGATAATGTCGGCTTGGAAGAA
GTTTTTAGAGAGATCTTTCCAATTAAATCTTACAATGAAGCTACTATCTT
AGAGTATCTGTCTTATAACTTAGGTGTGCCGAAATACTCTCCCGAAGAGT
GTATCCGTAGAGGGATCACCTACAGTGTAACTCTAAAAGTTCGCTTCCGT
TTGACTGATGAAACAGGTATCAAAGAAGAAGAAGTCTATATGGGAACTAT
ACCCATTATGACAGATAAAGGTACCTTTATTATTAACGGTGCTGAAAGAG
TTATTGTTTCTCAGGTACACAGGTCTCCAGGAATTAATTTTGAGCAAGAA
AAGCACTCTAAAGGAAACATTTTGTTTTCCTTCAGAATTATTCCTTATCG
AGGTAGCTGGTTAGAAGCTATTTTTGATATCAATGACTTAATTTATATCC
ATATTGATAGAAAAAAACGTCGCCGCAAGATTTTAGCTATGACGTTTATT
CGTGCTTTAGGGTATTCATCTGACGCTGATATTATTGAAGAGTTTTTCCA
AATAGAAGAGCGCTCTTTAAAGAGTGAAAAAGACTTCACCCTTTTAGTTG
GTAAAATCTTAGCGGATAATGTTCTCGACGAATCCTCCTCCTTGGTTTAC
GGAAAAGCTGGTGAAAAACTTAGTACAGCAATGTTAAAACGTATGCTGGA
CGCGGATATTTCAACTTTAAAAATAGCGGTAGAGGCAGATGAGAATCACC
CTATCATCAAAATGTTGGCGAAAGATCCAACAGACTCTTATGAAGCTGCT
TTAAAAGATTTCTATAGAAGATTACGTCCAGGAGAGCCTGCAACATTAGC
TAATGCGCGTTCTACAATTATGCGTCTATTCTTTGATTCTAAGCGTTATA
ACTTAGGAAGAGTAGGTCGTTATAAGTTGAATAGAAAGCTCGGCTTCCCA
ATGGACGAAGAGACTCTATCACAAGTTACTCTGAGAAAAGAAGATGTCAT
CGGTGCTTTAAAGTATCTTATCCGCTTAAAAATGGGTGATGAGAGAGCCT
CGATTGATGATATTGATCACCTAGCAAACCGTCGTGTACGTTCCGTAGGG
GAATTAATTCAAAACCAATGCCGTTCTGGCTTGGCTAGAATGGAGAAAAT
CGTTCGTGAGAGAATGAATCTATTTGATTTCTCTTCCGATACATTAATTC
CTGGAAAAATTATTTCCGCGAAAGGTCTAGCAAGTGTTTTGAAAGACTTT
TTTGGTCGCTCCCAACTTTCTCAATTTATGGATCAAACCAACCCTGTAGC
GGAATTAACGCATAAGCGTCGTTTGTCAGCTTTAGGTCCTGGTGGTTTGA
ATAGAGAAAGAGCTGGGTTTGAAGTTCGTGACGTACATGCGAGCCATTAT
GGACGTATTTGTCCGATTGAAACTCCAGAAGGACCAAACATTGGTTTGAT
TACTTCGCTCTCTTCTTTTGCGAAAATCAATGAATTTGGATTTATTGAAA
CTCCCTACCGCATTGTTAGAGATGGTGTTGTCACTGATGAAATTGAATAC
ATGACAGCCGATGTTGAAGAAGAATGCGTTATTGCTCAGGCTTCAGCAGC
TCTAGATGAATATAATATGTTTGTGGATCCTGTATGCTGGGCAAGGTGTC
GTGGAGAGGCTTTTGAAGCTGATACGAGTACTGTTACACATATGGACGTT
TCTCCAAAACAATTGGTCTCGATTGTTACAGGTTTGATTCCATTTTTAGA
ACATGACGACGCTAACCGTGCTCTCATGGGATCAAACATGCAACGTCAAG
CTGTCCCTTTGTTGAAAACTGAAGCTCCTATAGTTGGAACAGGATTAGAA
GCTCGCGCTGCTAAAGATTCCGGAGCTATTGTTGTTGCTGAGGAAGATGG
AGTTGTTGACTACGTGGACGGTTATAAGGTCGTTATTGCACCTAAACATA
ACCCAACATTGAAACGTACTTACGATCTTAAAAAATTCTTAAGATCTAAT
TCAGGTACATGTATCAACCAACGACCTCTATGTAGTGTTGGAGATGTCAT
AGTTAAAGGTGATGTTATTGCCGACGGTCCTGCTACAGATCAAGGAGAGC
TTGCTTTAGGAAAAAACATCTTAGTTGCCTTCATGCCATGGTATGGGTAC
AACTTTGAGGATGCGATTATTATTTCTGAAAAGCTCATCAAGCAAGATGC
GTATACTTCAATTTATATTGAAGAATTCGAATTAACAGCTAGAGATACAA
AATTAGGAAAAGAAGAGATTACTCGTGATATTCCTAATGTTTCTGAAGAA
GTTTTAGCTAATTTAGGTGAGGACGGGATTATCCGTATTGGTGCTGAAGT
AAAGCCTGGTGATATTCTTGTTGGTAAAATTACACCAAAATCAGAAACAG
AACTCGCTCCTGAAGAACGCCTATTACGCGCTATCTTTGGTGAGAAAGCT
GCTGATGTTAAAGATGCTTCTTTGACAGTACCTCCGGGAACAGAGGGCGT
TGTCATGGATGTTAAGGTCTTTAGTAGAAAAGACAGACTATCCAAGAGTG
ATGATGAGCTTGTAGAAGAAGCTGTTCATTTAAAAGATTTGCAGAAGGGT
TATAAGAATCAGGTTTCGGTATTAAAGACTGAATACCGTGAGAAACTTGG
AGCCTTATTACTTAATGAGAAAGCTCCTGCTTCGATTATTCATCGCCGTA
CAGCAGATATTTTGGTTCAAGAAGGTACAGTATTTGATCAAGAAACTATA
GAGCTTCTTGAACAAGAGTCTTTAGTTGATTTGCTCATGCCTCCTTGTGA
AATGTATGACGTCTTAAAAGGTCTACTTTCTGACTATGAGACTTCTTTAC
AACGCTTAGAAGTCAATTATAAAACAGAAGTTGAGCATATCCGTGAAGGA
GATGCTGATCTTGACCATGGTGTCATTCGTCAGGTTAAAGTTTATGTTGC
TTCAAAAAGAAAGCTCCAAGTTGGAGATAAAATGGCTGGACGCCATGGAA
ACAAAGGTGTTGTTTCTAAGATCGTTCCTGAAGCTGACATGCCTTATCTA
GCTAATGGTGAAACTGTACAGATGATCTTAAATCCTCTTGGGGTGCCTTC
GAGGATGAACCTAGGCCAGGTATTGGAAACGCATCTTGGTTATGCTGCAA
AAACTGCCGGCATTCATGTAAAAACTCCAGTATTTGAAGGATTCCCAGAG
TCTCGTATTTGGGACATGATGATCGAACAGGGATTACCTGCAGATGGTAA
GTCTTACCTATACGATGGAAAGACTGGAGAGAGATTCGATAATACTGTAG
TTATTGGCTACATTTATATGTTGAAACTCAGCCACCTGATTGCGGATAAA
ATCCACGCTAGATCTATTGGACCTTACTCTCTAGTAACTCAGCAACCTCT
TGGAGGTAAAGCTCAGATGGGAGGTCAAAGATTTGGGGAGATGGAAGTGT
GGGCTTTAGAAGCTTATGGTGTAGCTCATATGCTTCAAGAGATTCTTACA
GTAAAATCAGACGACGTTTCTGGACGAACAAGGATTTACGAATCCATTGT
TAAAGGAGAAAACCTCCTTAAATCAGGTACGCCTGAGTCGTTTAACGTTT
TGATTAAAGAAATGCAGGGTCTAGGACTTGATGTTCGTCCTATGGTAGTA
GATGCTTAA
>CCA00690 rpoC, DNA-directed RNA polymerase, beta` subunit
ATGTTCGGAGAAGGTTCTCGAGACAATGCCACTCTATCCAAAGAGGGGCT
ATTTGATAAACTAGAAATTGGAATTGCCTCAGATATTACTATTCGCGATA
AGTGGTCTTGTGGGGAAATCAAGAAGCCTGAAACAATCAATTACCGTACG
TTTAAACCTGAAAAAGGTGGATTGTTTTGCGAAAAGATTTTCGGGCCTAC
GAAGGATTGGGAATGTTGTTGTGGTAAATATAAGAAGATTAAACACAAGG
GCATTGTCTGCGATCGCTGTGGAGTAGAGGTCACCCTTTCTAAGGTACGT
CGTGAACGTATGGCTCATATAGAGCTTGCAGTGCCTATTGTGCACATATG
GTTTTTTAAGACTACACCTTCAAGAATCGGTAACGTCTTAGGAATGACTG
CATCTGATCTTGAAAGGATTATCTACTATGAAGAATATGTAGTTATCGAT
CCAGGTAAGACAGATTTAAATAAGAAACAGCTTTTAAATGACGCTCAATA
TCGAGAAGTAGTTGAGAAGTGGGGTAAAGACGCTTTTGTTGCTAAAATGG
GCGGAGAAGCTATTTACGATTTATTAAAATCAGAAGATCTTCAAAGTTTA
TTGAAAGAGCTTAAGGATCGTTTGCGAAAAACAAAATCTCAGCAAGCTAG
AATGAAGCTCGCTAAACGATTAAAGATCATTGAAGGTTTTGTTTCCTCTT
CTAATCATCCTGAGTGGATGGTTTTAAAAAGCGTTCCTGTTGTTCCACCC
GATCTTCGTCCATTAGTTCCTTTAGATGGCGGAAGATTTGCAACTTCTGA
TTTAAATGATTTATATCGTCGTGTAATTAACCGTAACAATCGTCTAAAAG
CTATTTTAAGATTAAAAACTCCTGAAGTGATCGTTCGCAACGAAAAACGT
ATGTTACAGGAAGCTGTGGATGCGTTATTTGATAACGGTCGTCATGGACA
TCCTGTAATGGGAGCGGGTAATCGTCCTTTAAAATCTCTTTCTGAAATGT
TGAAAGGGAAAAATGGACGTTTCCGACAAAACCTTTTAGGTAAGCGTGTC
GACTATTCTGGACGTTCTGTTATTATCGTCGGCCCCGAATTGAAATTTAA
TCAATGCGGTTTACCTAAAGAAATGGCTCTTGAGTTATTCGAACCATTCA
TTATTAAAAGACTTAAAGATCAAGGAAGCGTCTACACTATTCGCTCTGCT
AAGAAAATGATTCAACGCGGGGCCCCTGAAGTTTGGGACGTTTTAGAAGA
AATTATTAAAGGTCATCCCGTATTACTTAACCGAGCTCCTACGCTTCACC
GTTTAGGGATACAGGCTTTTGAGCCCGTATTGATTGAAGGTAAAGCTATT
CGTGTTCACCCGTTAGTGTGTGCAGCGTTCAACGCCGACTTCGACGGAGA
CCAAATGGCTGTTCACGTGCCACTGTCTATTGAAGCACAGCTAGAAGCTA
AAGTTTTGATGATGGCTCCTGACAACATCTTCTTACCATCTTCCGGAAAG
CCTGTTGCAACACCTTCTAAAGATATGACGTTGGGTATTTACTATCTAAT
GGCTGATCCTACTTACTTCCCTGAAGATCACGGTGGAAAAATTAAGATCT
TTAGAGATGTTACTGAGGTATTGCGCGCATTATATACAGGTGGATTCCTT
GATGAGCGTATAAATAACCGTTGTGATGAGACTGGACGTGGTATCCACAT
CCATGAAAAAATTAAAGTGCGTATTGATGGTCAGATTATTGAGACCACTC
CTGGACGCGTTCTGTTTAATAGAATTGTTCCTAAGGAATTAGGGTTTCAA
AATTACAGCATGCCAAGTAAGCGTATCAGTGAATTGATTTTACAATGCTA
TAAGAAAGTTGGTCTTGAAGCGACTGTGCGTTTCTTAGATGACCTTAAAG
ATCTAGGGTTTATCCAAGCGACAAAAGCTGCGATCTCCATGGGATTGAAA
GACGTTAGAATTCCTGAGATTAAGAGTGAGATTCTTAAAGAAGCTTACGA
TAAAGTTGCTGTTGTTAAGAAGCAATACGATGACGGTATTATCACAGACG
GGGAGCGTCATTCTAAGACTATTAGTATTTGGACGGAAGTTTCTGAATTG
TTATCAGATGCTCTTTATGTTGAGATTAGTAAGCAAGCTAAGAGCAAACA
CAATCCTTTATTCTTAATGATTGATTCTGGAGCTCGAGGTAATAAATCTC
AGTTGAAACAGTTAGGAGCCTTGCGAGGTTTGATGGCGAAGCCAAACGGA
GCGATTATTGAATCTCCGATTACTTCAAATTTCCGCGAAGGGTTAACAGT
TCTTGAATACTCGATTTCTTCTCACGGTGCTAGAAAAGGTTTAGCCGATA
CTGCCTTAAAAACAGCGGACTCTGGATACCTAACGCGAAGACTCGTTGAC
GTAGCTCAGGATGTAATTATTACAGAGAAAGATTGCGGAACATTGAATCA
TATTGAGATTTCTGCAATTCGCCAAGGTTCTGAAGAACTTTTACCTTTGA
AGGATCGTATTTACGGTCGTACGGTGTCTGAAGACATTTATCAGCCAGGG
GATAAGAGCAAGCTTCTTGCTAAGAATGGAGATGTTGTTACATCTGCTCA
GGCAGAACTCATTGACGATGCTGGTATCGAAAGCATTAAAATTCGTTCTA
CACTTACTTGTGAAAGCCGTCGCGGTGTTTGTGCTAAGTGTTATGGATTG
AATCTTGCTAATGGTCGCCTCATTGGTTTAGGGGAAGCTGTAGGTATTAT
TGCTGCTCAGTCTATTGGGGAACCAGGAACACAGTTGACAATGAGAACGT
TCCACCTTGGAGGTATCGCTGCGACATCTTCAACTCCAGAAATCGTTACA
GATAATGACGGTATTTTGGTGTATATGGATCTTCGGGTTGTTGTAGGTCA
AGATGGCAACCATCTGGTATTGAACAAGAAGGGAGCGATTCACGTTGTTC
GTGATGAAGGCCGTAGTCTAGAAGAATACAAGAAGCTCTTAAGTACCAAA
TCTATCGAAAGTTTAGAGACTTATCCAGTAGAGCTTGGTGTAAAGATTTT
GGTTGGCGATGGGGAAAAAGTATCCTCAGGTCAAAGAATTGCTGAAGTTG
AGCTGCATAATATTCCAATTATCTGTGATAAACCTGGTTTTGTGAAATAT
GAAGACTTAGTGGAAGGTATTTCTACAGAGAAAGTTGTCAATAAAAACAC
AGGATTAGTCGAGCTTATTGTTAAACAGCATCGCGGGGAATTACATCCTC
AAATTGCTATTTACTCTGATGCCGGTTTAACAGAATTAGTTGGAACATAC
GCAATTCCTTCTGGAGCTATTATTTCTGTTGAAGAAAACCAAAAAGTTGA
TCCAGGTATGTTGTTAGCGAGATTACCTCGTGGAGCAATCAAGACTAAGG
ATATTACTGGTGGTTTACCGCGGGTTGCTGAATTGGTTGAAGCTAGAAAA
CCTGAAGATGCTGCAGACATTGCGAAGATCGATGGTGTTGTAGATTTTAA
AGGAATTCAGAAAAACAAACGTATTCTTGTTGTTCGTGATGAAATCACTG
GAATGGAAGAAGAACACTTAATTCCATTGACCAAACACTTGATTGTTCAG
CGTGGAGATAACGTGATGAAAGGGCAGCAGCTAACAGATGGTTTAGTTGT
TCCTCATGAAATCTTGGAAATCTGCGGTGTTCGCGAATTACAGAAATATT
TAGTAAATGAAGTTCAAGAAGTTTATCGTCTGCAAGGTGTGGATATTAAC
GATAAGCACATTGAAATCATTGTTCGTCAGATGTTGCAGAAAGTTCGTAT
TACCGATCCAGGTGATACCACTTTACTTTTTGGTGAAGAAGTTAATAAGA
AAGAGTTTTACGAAGAAAATAGACGTACAGAAGAAGATGGTGGTAAACCA
GCTCAAGCTGTTCCTGTGTTATTGGGAATTACTAAAGCTTCGTTGGGTAC
AGAATCATTTATTTCTGCAGCGTCCTTCCAAGATACGACTCGTGTATTGA
CTGATGCGGCTTGCAGTAGCAAAACTGACTATCTCTTAGGATTCAAAGAA
AATGTCATTATGGGACATATGATTCCAGGAGGTACAGGGTTTGATACACA
TAAGCGGATTAAGCAATACTTAGAAAAAGAACAAGAGGATCTTGTTTTCG
ACTTTGAAAGCGAATCTGAATGCGCTTGTTAA
>CCA01001 rpoD, RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family
ATGCTCATGAATACACAAAATGGCCAGGCTACGGAAGCGGCTCACGAAGA
AGAAGCTCAAAAGAAGTTAGAAGAACTTGTTTCTCTTGCTAAAGATCAGG
GCTTTATCACTTACGAGGAGATCAACGAGATCCTTCCTATGTCTTTCGAC
ACGCCTGAACAGATTGACCAGGTGTTGATTTTTCTTACAGGAATGGATAT
CCAGGTCCTGAACCAGGCAGATGTTGAAAGACAAAAAGAAAGAAAAAAAG
AGGCCAAGGAGCTAGAAGGCTTAGCCAAACGTACTGAGGGAACTCCAGAC
GACCCTGTACGTATGTATTTGAAAGAAATGGGAACAGTTCCTCTTTTAAC
TAGAGAGGAAGAGGTTGAGATTTCTAAGAGAATAGAGAAAGCTCAAGTTC
AAATAGAACGTATTATTTTGCGTTTTCGTTATTCTTCAAAAGAAGCTATT
TCCATTGCGCAGTATCTAATCAATGGGAAGGAGCGTTTTGATAAAATTAT
TTCAGAAAAAGAAGTAGAAGATAAGGCGCATTTCCTTAAGTTGCTTCCTA
AGTTGGTTACCTTGCTTAAGGAGGAGGATTTATATTTAGAGTCTCTTCTC
TTGGCGTTAAAACAGGGGAATTTATCGAAGCAAGAAATTGCGAAGTTAAA
TGATAATTTAGAAAAGTGCCGTATCCGTACGCAAGCATACCTACGTTGTT
TCCATTGTCGTCACAATGTTACAGAAGACTTCGGTGAGGTTGTCTTTAAA
GCGTACGATTCTTTCTTACAATTAGAACAACAAATCAATGATTTAAAAGT
TCGCGCAGAAAGAAATAAATTCGCAGCAGCAAAATTAGACGCTGCTAAAC
GTAGATTACACAAAAGAGAAGTCGCTGCAGGACGAACTCTGGAAGAGTTC
AAAAAAGACGTGCGTATGTTGCAGCGTTGGATGGACAAAAGCCAGGAAGC
CAAAAAAGAAATGGTCGAGTCCAATTTGCGTTTAGTGATTTCCATAGCTA
AAAAATATACAAACCGAGGCCTGTCCTTCTTAGATTTGATTCAAGAGGGC
AATATGGGCTTGATGAAGGCTGTAGAGAAGTTTGAATATCGTAGAGGATA
TAAATTTTCTACATATGCCACTTGGTGGATCCGTCAAGCCGTTACCCGCG
CTATAGCTGATCAAGCGCGAACGATTCGTATTCCTGTGCACATGATTGAA
ACGATAAACAAAGTTCTTCGTGGTGCTAAGAAATTAATGATGGAGACTGG
TAAGGAACCCACTCCGGAAGAATTGGCTGAGGAATTAGGATTAACTCCTG
ATCGGGTGCGGGAGATTTATAAAATTGCCCAGCACCCTATTTCTTTACAG
GCAGAAGTTGGTGAGGGAGGCGAAAGCTCCTTCGGTGATTTCTTAGAAGA
CACTGGCGTGGAGTCTCCTGCGGAGGCTACGGGTTATTCTATGCTTAAAG
ACAAGATGAAAGAGGTTTTAAAAACTCTTACAGATCGTGAGCGATTTGTT
TTGATTCATCGTTTTGGTCTTTTAGATGGGAAGCCTAAGACATTAGAAGA
GGTGGGTTCAGCGTTTAACGTGACTCGAGAGCGCATTCGTCAGATTGAAG
CTAAAGCTTTAAGGAAAATGCGTCACCCAATTCGTTCAAAACAGCTTCGT
GCCTTTCTTGATCTTTTGGAAGAAGAGAAAACGACCTCGGGTAAAGCAAA
AAATTTTAAGGGTAAGTAA
>CCA01007 tctD, transcriptional regulator
ATGCTTACGGATAAAATTATATTATTTGTTACCGAAGACAGTAATATATC
TTTGCAACTAAAAGAGTTTGCTCAGAATGTAGAGTATAAGATAATTGTTG
CTTCTGCACTTACAAGTACTTCTGAGGCTGATTTAATTTTCTGCGAATAC
TTGCTTCTCCCCGAAGATATGTTTTCTAATAAAATTCCATCCGAAACAGA
TTTAGTTGTATTGTTTGATGCTTTTGAAGAAGAGGCTGTTGTAAAAATTC
TGAATAACGGAGCTTCTGGCTATTTACTTCGCCCTATAACAGTTAAGGTT
ATAGATGCTGTTATTCGCGCTTTCTTACGTAATCATCGTCATTTCGAACA
CGCGATTCCTGAATCGATTTCTTTTGGTGATCGAACATTCCATCTTTTAA
GTCTTTCCATAGATTCCCCTTTGGGAACGGTTCATTTAACTCCTTCAGAA
GCAGGAATATTAAAAAAACTTCTGATGAATCGTGGTCAATTGTGTTTAAG
AAAACACTTACTGGATGAAATAAAAGGAGGCTCCAAAGAAATTATCGCTA
GAAATGTTGATGTTCATATTGCTTCTTTAAGAAAAAAATTAGGGGCTTAT
GGTTCAAAAATTTCTACAATTCGCGGAGTTGGTTATTTATTTTCAGAAAA
TGATAATTTAACTAACTCACCAAGCAGTGAGCCGACCGCAACCCATCCTT
AA
>CCA00562 trpR, trp operon repressor
ATGGCGCAGGAAAGTAATGAAAATGGTTGGGGAGACTTTTTAGAGCTGTG
CTCTAAAATTAAGACTCCTGAAGCATTTCATGATTTCTTTGCGTTATTTC
TTACTTTTGGAGAGCGAGAATCTATGGCTTCTCGTTTTTTAATTGTCCAA
GCGTTACTCGCGGAGCAGCTCACACAACGTGAAATTGCCCAAAAATATGG
CGTGAGTATCGCACAAATTACAAGAGGATCAAACGCTTTGAAAGCGATTG
ATCCTAAATTTAAAGAATTTTTAAAAAATTTAAATAGAAAATATGGAAAC
CAGTAG
>CCA00167 yhhY, acetyltransferase, GNAT family
ATGACAGAGAATAGAGATACAGGAGTCCCTGGATTAGAAATACGTTACAC
GCTGCCTAGTGATGCTGTGTATATGCAGCAATGGTTAAATGATCCTAAGA
TCCTTCGAGGGTTTCCGTTAAAGACTGAAGCAGAAATTCGTGACAGCGTA
AATTTTTGGGTAGGATTTTATCGGTACCATAGTAGTTTAACAGCTGTATA
TGAAGGGGAAGTCGCTGGAGTGGCTACTCTTATTTTAAATCCCTATATTA
AGGTGTCCCACCATTCGTTAATTTCGATTATTGTTGGTGAGCCTTACCGA
AATAAGGGGATTGGAACAGCATTATTAAATAATTTGTGCCATTTGGCTAA
AAGTCGTTTTCATTTAGAGATCCTCTATTTAGAAGTCTATGAGGAAAATC
CTGCTATAGAGTTATATAAACGTTTTGGTTTTATTGAAGTGGGAAGACAA
CGGCGTTTTTATAAAGATGAGATAGGGTATCTTGCCAAAATTACTATGGA
AAAAGATCTTTAG