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COG category: Transcription
Genomic element: megaplasmid

Number of genes found: 10

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# Shewanella oneidensis MR-1, MR-1

>gid:864762  SOA0002  type II restriction-modification system activator, putative
ATGCGTAAACCTAGTAAAAAACTTCTAGATAACCTTGCTAATAATGTTAG
AACATTTCGTCTCAAAAATGGAATTTCACAAGAACAGCTCGCTGAAATAT
GTGGGTTCCATCGAACATATATAGGTTCGATCGAACGCGGTGAAAGAAAC
ACGACATTGAGCACTCTAGAGGTACTTGCTAAAACTCTTAACGTATCAAT
TGCCCAGCTACTTAACGATGATGAGTAA
>gid:864788  SOA0031  partition protein, ParB family, putative
ATGACAAACTCAATTCAAGCGCAAGCAACTCACACTAAAGCCACCACTTT
ACCTGCCAGCCCAAAGACTCAAGCAGGCTCTCACAAGCCCGATATTGCTC
AAAAATCGGCAACAGCGGCTAACGCTGTGGTGGCATTGGCTTCAACAGCA
AAGCCAGTGTTACTGCAATTGCAGATTAACCAGTTGGTGTTGTCTGAGAA
GAACGTGCGTAAAGAAAATGCGTCCAAGGCTGACGATGAACAGTTGTATG
CCTCCATTTTGGCGCATGACATTTTACAAAATCTGATCGTCGAGCCCATG
AACGCGCAAGGCTTATACCCTGTGTTGGGCGGTGGCCGTAGACTGAGACA
GCTCATTAAAGCCGTCAAAAATAATAAGCTGAAACCGAAAACGCTTGTGC
CTGTTAAGTTGCTGACAGCCGAAGATGTGGCCAACTATGCCACCGAGCTA
TCTATGACTGAAAACTTCACGCGCGCCAAGATGCACCCAGTCGATGAATT
TCACGCTTTTGCTGACATGGTGAATAAGGGCGCTAGCATTGCTGATGTTG
CGGCGCGGTTTGGCGTGACTGCGAAATTCGTGCAGCAGCGCATGAAATTA
AGCATGGTCGCCCCTGTTGTGCTCGATGCGTACAAAGCGGGGAACGTGTC
GCTTGATGTCGTGATGATATTCACGATTGCCAGTGTCGAAAAACAAGTCG
AAGTGTGGGAGCTGGCAGGCGATAGACGTTACAACGAAAACCAGTTCCGC
AATATGCTTAAAGACGCCGCTGTGAATGCTGATCACTATTTGGCTCAGTT
TGTTGGCCAAGAAGAATACGAAAAAGCGGGCGGGGTTGTGACCTCAGACT
TGTTCAGTGATGAAGTCTATCTTGATGATAAAGCGTTACTCGAATCATTA
GCGATTGCAAAATTGGAGTTAGAAGGGGCAAAACTGGTTATGCAAGGCTG
GAAATGGGCAGATTATAAGCTCGTATCTGAATACGATGAACTTGCAGGGT
TTGGACGTCTTACCTTAAAAGAAGGGGAGTATGATCCCGCTGAAATGGCG
CTAGCGGGGTGTTTGCTCGTGTTAAAAAGTTATGGTGAGCCTGTCAGTAT
CTATATGGGCTTGGTGCATAAGGACGATAAAAAGGCACTGGCACAATTAC
AAGCCAGCGTGCAATCAGACCCACTCAACGTGGGTGACGTGAAAAAAATT
GAAGAAAAGGATACTAGCGGTTATTCCGCTGCGCTCAATGACGATTTACG
GGCGCAGCGCCTGATTATCGCTAAACATGCGTTAATGAGTGCGCCAAGCG
TTGCGCTTGATACGCTGCATTTCTCTGTCTGTGTAAGCGCGTTCACTGAC
TCACGTTATGGCAGCCGTCCACTGCATATCAGCGTTAACGACACCACTTG
TCATCCTAAAACGGGATCGCTCACGGATAACAAAGCGGTGCAGTTAATCG
AGGGTGTAAAAGCCAGCCTAAATTTAGCGTGGGTTGGTCTGCCAACGGTC
GCTGAACGCTTTAACGCTTTTTGCGCCCTCGATGTAAAAGAGAAAGAAAA
GCAGGTGGCTTACGCCACGGCTTCCATGTTCGAGGCGTCAATTGATAATA
GTCATCAAGCGGTTGAGGCCGTGATATCTACGCTCGATGTGAAATGGTCT
AACTACTGGCGACCGACTGCGGAAACCTTCTTTAAGCGCGTGAGCTTGTC
TTGTCTAATTGATATGGCTCAGCCTGTCATGGGTGAGCAGTGGGCATTAC
AAGCCGCCGCACTCAAGAAAAAGGACTTAGCAAATCAGGTTGATAGCTTA
GTGAACGGGGAGCGAAAAGGGCTAGATGATGCACAAAAAGCCTACTTTGA
TGCCTTGATGCCCGCTGGATTTTAA
>gid:864817  SOA0060  acetyltransferase, GNAT family
ATGAGTACCAACTATATTGACTGTCAGCTACTAAACAAGATGGAACGACA
ACCGAGCTTTTCAAGTTTCGATTGTGGTGATCCGTTTCTTGATAGTTTTG
CGCCTAAGAAATTGGCGAATGCTGATGCAAACAATGATTCTCGGGTCTAT
GTTGCTGTAGACGGGGATATAGGTGTTGGCTATGCCACGATGAAAGTTTT
TATGCTCAGTAATGACGAGTATAAAATTTTATCAGGTAAATACCCTCGCC
AGGTTCCTGTTGTGATGTTAGACCAAATCGCAGTTGATAAAGCATATCAA
GGCAAAGGAATTGGTAAGCGCCTTATGCGAAAAGTGCTTGAAGCAACTGT
GTTAGTGAATGAACTTGCGGCCGCTAAAGGTTTAGCGTTATGGGCTCACC
CTAGAGCAAAAGACTTTTATGAGTCATTAGGGTTTGAAGCCATTCCTGAT
GCAACGAAACAAGTACAAGACGTTGAGTTAACACTGATGTTTATTCACGT
AGAAACCATTTTGGATGCATTGAAGTAA
>gid:864824  SOA0068  conserved hypothetical protein
ATGAGTATATTTAACGAACTTCAAGCCTCCCTTGAAGAAGCGGTAGAAAT
TCATCATGGTCTCAAAAAGCCCGCTCGAGTAACTCGTTATGAAGTTGCTG
ATGTTAAGTCAATCCGTGAAGATCTGCTTAAAGTGACGCAGGCCGAATTT
GCTGCCACGATGGGTGTCAGTGTCGACACTGTTAAAAGTTGGGAAGGTAA
ACGCCGCAATCCTGCAGGATTAGCAGCTAAAGTGCTTGCGACGATTCAGC
AAGATCCTAAAATCTACGCAGCTCTTGCCGCTCACTAA
>gid:864833  SOA0078  conserved hypothetical protein
ATGTCACGGACTACCAGTGTTACTATCGGATCACAGTTAGATGAATTTGT
CGGTCAGCTTATTTCGTCAGGTCGCTACGGCTCGACAAGCGAAGTTGTGC
GTTCTGCCTTACGACTATTAGAAAGACAAGAAAACCAGACCATAGCTTTG
AAAATGGCGATTGAAGCTGGTGAGCAAAGTGGTGAATGTGCATTATCACT
TCATGACATCGCTGCAATGGTGAAACAAAAGCACAATGTATAA
>gid:864845  SOA0096  partitioning protein B
ATGGCTAAAAAACGTGGCGCAATGAGCCCTCTAGGCAACGCTGTTGGTGC
CGAAGAAGCACAAAAAAATGCAGCGAAAGCTAATATTGAGTCTTTAAAAC
GGCAAATAACAACTGAAATTCAGAAAGTAAGTGACGATGTAACGTTATCT
CTTAAAAATCTATTTGGTCTTGAATCTGTAGGTAATAGCTTCCTATGGCA
ATTAGCTTCGGGTGCTACCGCTACATTTACCGAAGCAACATTATCATATG
AACAAGTTCGCGATAGTACCTATGTAACGTTTGATGTTAACGGGCGTGAC
CAGGCATTATTAAATGCTGATTCTCTACAAGATCTTGATTCATTAGCCTT
CCAGCAATTTTACCCTGCTGTCGCTAGAGAAGTGAATGGTAAACTCGATG
TGCTAGATGGTTCTCGACGCCGAGCTTGGTTTTTATTGCAAAATGGTAAA
GTTGATATCTTTCGCATATTGGTAACTAAAGATGATATTTCACTTTCAGA
CGCTAAAGCATTAGCTAAGCAGCTCCAAACCGCAAAAGAACATAACTTAC
GTGAAATAGGCCAACAATGCTTATCGTTGGAAAAAGCGAATCCTAAGATT
ACACAGGCTGAAGTAGCCGCTCAACTTGGAATGAGTCAGGCTGGTGTGAG
TAAAGCTTTAAAAGCCGCTAAGGTGGATGAACGTTTGGTGAAGCTTTTTC
CTGTGGCTAGTGACTTGTCACATACTGACTACGCCTTGCTGAATAAAGTT
ATGGAAGTATATGAATTTGAAGATGAATTAATAGAGTTTATCAATGATTT
GACTCAGAAAATTGTCATTATTCAGGTTGAATATTCAAGGGCAGAGCGTA
AATCAGCTATCATCAAAGCGATGAAATCAGAACTTCAGATCGCTAAGGAT
ATGAAGAGTAAAGCACTGGTTAGTGTTACCAATCTTGCGACATTTGATAG
CTCAGGCATTTACGCAAGAAAGCGTATTAAAGGGCGCAACTTCGCTTATG
AATTTGGTCGATTGTCTCTAGATATTCAAAAACAATTAGATATTGCAATT
GTAGATGTTTTGAAAAAAAATAAATTTAACACTACAGTTGATTAG
>gid:864855  SOA0108  hypothetical protein
ATGAAAGTTCAAAATCAAGCTATCATTACGTTTAAAAATATATCACCATC
AAACAAGATGCAATGCAATGCTATCTGCTGCTTATCATGCGGAAAATGTG
ATAATAATATCATTCCTTATATTGAAAAGCATTCTTTATCTCCATCAGAT
GCAATAGAGCATGTTAGAAATCTTAATGAGAATGCCATGAGGGCACTTTG
TTTATTAATATGCAATAAGTATTCATCTTACGATGAGCTAATTCATCATA
TTTGGGAAGGCCGTATTGTTGGCTCTGGTAGTTTGCCAGTTGTAATACAT
GAGGTCAGATTGTTTTTAAAAAAATGTCCATCTTTAAAGGTCGTGAATGT
AAGAACAAAGGGGTACATGCTAGTCGAAACTAACTAG
>gid:864872  SOA0132  conserved hypothetical protein
ATGGCTTATATTCAGTTAAAATTTAAATTGTTAGTCATGCCGGATGGTAG
AAATATTTCCATGGAGAGTTTATCTGATAACGAAATTAAAATAATAACTT
TTTTAGCAAAAAATTATCCACTTGCATCAAATAGAGATGAGATTTTGAAA
AATTGTTGGGAAGGAAAAGTCGTTACTGAAAATTCCGTAAATGTTGCAAT
CAGCAATATACGAAGTTTTTTTCAAAAAGAAAATATTCAAGATTTCATTG
TAACCCTTAGAGGTGAAGGTTATCAACTTTCTGAAAAAATAATCATAAAA
GAATCTAATGATCCTGCGGCTTTAAACTCATTATCAAAGGGTATCAATTT
ATTTTTAACCAGCATAAAAAATCACCCGGCAACTTTCCTTCTAAACATCA
TTACATGCCTTATTTTAATGACGATCATTAAACTATACATTTGGATTATA
TTACTATGA
>gid:864901  SOA0165  transcriptional regulator, LysR family
ATGTTTAATTGGGAAGGCGTTAGCGAATTTGTAGCCGTTGCAGAGGCAGA
GAGCTTTACTAAGGCTGCAAAACAGCTTGGGATATCTACCGCGCAAGTCA
GCAGGCAGGTCAGCGCATTAGAAACCCGAATGGCTACTAAGCTGTTTCAC
CGCACCACACGTAAAGTGTCGGTGAGCGAAGTGGGCCGGATCTATTATCA
ACACTGCAGACAAGTGCTGGATGGATTAGAAGAGGCCGAGCGCGCGATTA
CTAATTTACAGAGTACACCGAGAGGGCTGTTAAAAATTACCGCCCCAGTA
ACTTATGGTGAAAAAACGCTTGTGCCGCTGGTGAACGATTTTATCGCTAA
ATACCCAGAGCTTGAAGTAAAGATAAATCTAACGAATCAGAAGGTCGACT
TAATCGATGATGGGTACGATCTCGCCATTCGACTCGGACAGCTTAAAGAC
TCGAGTATTATGGCCAAAAGACTAGGCTCAAGAACTCAATATGTCTGCGC
CTCCCCAGATTATGTTTCAACTTTTGGAATACCTCACTCACTGTCTGAGC
TGGAACAGCATAACTGTCTGTTGGGAACATTAGATTACTGGCGATTTCAG
GAAAATGGAAAGACGAGAAATGTCAGGGTTAAGGGTAATTTGACCTGTAA
CAGTGGCTATGCACTCGTTGATGCCGCGATAAAAGGCATAGGCATCATTC
AGCTACCTGAGTACTATGTATTGCCTTTTTTAGAAGATGGACAGCTTGTT
CCACTGTTGGAGCAAAACCGTCAACCTAAAGAGGGGATCTGGGCACTCTA
TCCTCACAACCGGCACTTATCACCTAAAGTGCGCATGCTACTTGATTATC
TGAGTGAAGCTCTGAGTTAA
>gid:864773  umuD  umuD protein
ATGCGTGTTATTCCTATCCCAGCTCAAGCGGGTATTACCGGCTTTGAAAG
CCCCGCAGCTGAATATACTCAGCTTGGGCTTAGCCTTGATGAATTGCTGA
TCATCCATCCTAGTGCCAGTTTTTTATGCGTGGCGCAGGGAGACTCGATG
CAAGGTGTAGGGATTTATGATGGTGATGTCTTAATCGTTGACCGCCATGA
GACCGCCCGCAATGGTGATGTGATAGTCGCTAATTTTAACGGCCTGTTTG
TCTGTAAGATCATCGACACCCAAAGGCGTTTGCTGTTGTCATGCAATGAA
CAATTTCAGCCGGTCACAGTACAAGAATTCGATGATTTTAGTATTGAAGG
CGTGGTTATCCGCTCGATTCGTTGTCACCGCCCTAGTTCGTTACTGTGTG
CTTAA