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COG category: Transcription
Genomic element: pSOL1
Number of genes found: 21
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# Clostridium acetobutylicum ATCC 824, ATCC 824 >gid:860520 CAP0006 GntR family HTH transcriptional regulator ATGAAACTTGATTTCAGCAGCGGAGCTAAACCTCTCTGGAGTCAAATGGC AAACATAATAAAAAAAAGGATAGAGGATGGAGAATACGAAATAGGCTGTA CTCTTCCTTCTGAAATGAGCTTTGCAGATGAATTTAACGTATCTAGAATA ACTGTCAGACAAGCTCTTAATAGACTTATGACAGATGGATATATACTAAG GCAAAGGGGTAAAGGTACTATCGTAAAAAGGGACAAAACAAGCTTTTCTA CAAGAATGCAATCTTCTTTTAAGCAGCTTCAAGACGAATACGATAAGACC ACAAAAACCCTTATAAGTGTAAACAACGTTAAAGCAAGTGAGGACGTAGC AGAAGTGTTTGACATTAATCCGGGTGATAATGTTATAATGTTAGAACGTT CAGTGGAATCTAAAGGAAAAATAATAACAATATACCACAATTATATAAGC CCTAAGGTTGGTGCATCATTAAAGGACGATTTTACAGGTTCCTTTTATAA GTATTTGGAAATGAAGGGCTTTTATATAACTTCAGCTAAGGAAGTAATAT CTGCTAAAATATCTACCGCCAAGGATAAAGAAGTATTTGGTTTTAGTAAT GATAGAGCAATGCTTCTTAAAACCAAATATGGATATTCAGATGGTGTTCC TGTCGAAATAACCTATGGAACCTACATTGCAGATGATTACAATATTGTTA TAGAACTTGTGTAG >gid:860537 CAP0024 MarR family HTH transcriptional regulator ATGAATAAAGAAAAAGAACAGCAACTGAATGAGGCATTAGTGCTTTTTTC TTTTGCATATAAAACATTTACAGAAGAACCAGATTTGATTATTAAAAAGT ATGGAATACAGCGTATACATCACCGTATTTTATTTTTTGTAGCTAGATTT CCAGGACTTAGTGTAAATGAACTGTTAAAGTTGTTAGAAATAAGTAAGCA AGCGCTGCATAAACCGATGCACATACTAATTAATAAAGGCTTGATTTTTA GTAAAGAATCTGATTATGATCGCAGGATCAAAGAAATTTTTTTAACAAAT GAAGGTGAAAGGTTAGAAAAAGAAATCAGCAACATACAGCGCGAACACTT ATTATCCATTTTTTCACAATTCCATAATGGCGATGAAAAATCATGGCTTG AAATTATGCGGCAATTATCATTAAAACGTTTAGGTTATGCTGCTTGGAAC AAAAAAAAATAG >gid:860541 CAP0028 HTH transcriptional regulator TetR family GTGAAAAAACGGAATTTAACCAAAGAGAAAATCATCCAAATCGCCTTTTC GTTAGCTGACGAAATTGGTCTTGATAAGGTTACCTTTCAAAAACTTGCAG AAAAATTGGATATAAAATCTCCATCTTTATATAATCACTTTTCTAATATG AGTGATCTCAAAATAAGCATGACAACATATTTATTAAATTCATTGAATTT TAAATTAATGCAGGACCTAGTTGGAAAAAGCGGAGAAGCTGCTGTGAAAA TTTTTGCCTATACATATAAGGACTTTGCTATGGAAAATAAGACTGCTTAC AGACTATTTTTAAGTACTAAAACCACAGAAAACGAAGAAGTGAATCGTAT GGCAAAGGAAACTAATAATATCATTCTTCAAGTTTTAAGCTTTTATATAA AAAATGACGTAGACTTAATACATAAAAGCAGAGCCTTAAGAAGTTTGCTA CATGGCTATGTATCCTTAAGTTCTCTTGGATATTTTCAAAATAAAGTTGA TTCAGAAGACAGCTTTCGCATAATGATCGATGACTTTATTTTATCCCTTT CCAAAAACACTTAG >gid:860544 CAP0031 Transcriptional activator HLYU, HTH of ArsR family ATGATTGATAATGCTAGGGAAATAGCAGAGTTACTAAAAGTTCTAGCTAA TGAAAATAGATTAATGATTGTTTGTCATCTTATTGATGCACCTATGACAG TAACTGAACTTCATGAAAAAATAAATACCTTGACACAATCAGCACTGTCT CAGCATTTAGCTTTATTGAGAGCACATGGAATACTTAGCTCAGAGAAAAG GGGACTTTCTATTACCTATTCAATAAAGGATAATAGGATAACAAATGTAA TTAAGGTTTTAAAAGAAAATTATTGTGATATAAAGTAA >gid:860559 CAP0046 TetR family HTH transcriptional regulator ATGAAGAATAGAATAGAAGATAGAAGAATAAAGTACACAAAGATGGTTAT AAAACAAAGTTTAATTACCCTCTTAAAAAATAAACCTATAAACAAGGTGA CGGTTACAGAGATATGTAATTTGGCAGATATAAATAGGAGTACCTTTTAT ACTCATTATTCCAATCCATACGATTTATTGGATTCAATAGAGGAAGAACT ATTTGAGGAAGTAAAATCCTCGCTTAGGGATTCAGAAGGAGAGACAAAAA TTGAAAACACTGTAAATGAAATTTTTAAGGCCATTGCAAAAAATAAGGAA CTTTTTAAAATTTTTTTTAGTTCCCATAGAGATTATGGTTTTTTAATAAA GTTTTTTGGAGCTGTATATAATAATTCTATTGATAATTTTAAATCAGCCT TTAAGTCTAATAACGATGCACAGTTGGAATATCTGTACAACTATATATTA ACTGGTAATGCGTCTATCAGCTATAAATGGATTAAAAATGGATTAAAGGA AAGCCCAGAAGAAATGGCTTCCCTTGTCAATAGATTAATAGTACATACCA TGTCATTTATAAAATAG >gid:860565 CAP0052 MarR family HTH transcriptional regulator ATGAATAAAATAAGTGAAGAACAATATAAAAGATTTGATGCTGTTATGCA CAGTATATATAAACGTTTAAGACAACTTCATGGAGATATAGATTCAATGT TTCCAAAAGGCATAACCAGCAGCGAACTAAGTGTACTAAAGGCAGCTAGT AAATATCCCAATTCAGCTTTAAAAGAAATTGGAGAGTATTTAGATATCCC CGGAAGTACTCTTACCAGCATAGTTGATAGACTGGAAAAAAGAAATTTAG TTAGAAGAACTATAAATAAAGAAAACAGACGCTCCTATGCACTTGAACTT ACAAAGGATGGTATCGAACTAAGTAATCAGCATGAGGAGGCTGAAAAAGA GCTGTGGGAAAAAGTTCTTATGTCATTAAATGAAGATGTCGAAAGAGAAA CACTTATTAACCTATTAGATAAAATTAGTAAAGGAATAGAATAA >gid:860574 CAP0061 Hypothetical protein ATGAAATATGAAAAAGCACAAAATATATTGCCACAGAACATTATTGAATT AATTCAGAATTATGCTGATGGTATTTATCTATATATTCCTAGAAAAAGCA ATAGCAAAAAAGCTTGGGGAGAATACAGCGGTATAAAAGACATTTTAGAA AAAAGGAATAGAGATATTTTTGATAGATATAAACAAGGAGTGTCTGTTAA AAAACTTGCTCAACAATTTTATCTCACTGAGTACAGCATTAGAAGAATAA TAAGAAAAGAAAAACAAATAATATAA >gid:860592 CAP0079 ThlR, HTH transcriptional regulator TetR/AcrR family ATGGCAAAGACAACCAAGGGAGAAGAATCAAAAATAAAACTAATAGAATG TGCTGCGAAATTATTTTTACAAAAAGGATATAATGGTACAGGTATTAATG ATATTCTATCAGGGACAGGGTTGCCAAAGGGGTCATTTTACTTTCACTTT GCAAGTAAAAAAGATTTAGCCATTAGTGTTTCAGAGTATTTTGAAAAAAA ACTTTTAGGATGGATAAAAATAAATTCAAAAGATAAGAAGTGGGATGAAT TTATAATATCCTTAGTAGGAGAAATGATTAAGGGAGCAGAAAAAGGAAAA CATTATGGTTGCCCTTTTGCAGTATTGGGATTAGAAATAGCTTTCTTGGA TTCCGATATTTCAAAATGTTATTATAAATCTATAAAAGAATTAATAGATT TATTTGCTTCAATTTTTGAACACTCTGGAGTACCTAAAGATAATATATAT ATACTAGCAAATCGTGCTTTTGCAATATATGAAGGATATTTAGTGTACTA TAGAATTGGTAAGGATATAAATACTCTAAAAACCATGCAAGAAGATCTTA TAAAAATGTATGAGGATTTCAAGGAGGTGAAATAG >gid:860600 CAP0087 HTH transcriptional regulator TetR/AcrR family ATGTCTAGCAAAAAAGATGACATCATTTCTTTAGCTGTAACCTTGATTAA GAAAAAAGGATTCCTCGCATTAAGCTATGATAATATCTCTAAGGAGATGA ATATAACAAAGACGGCAATTCATTATTACTTTGAAAAGAAAGAGGATCTC GGCATTGCCGTATGTGAAAAGTTGCAAAAGGGATTAGTACAAGATTATGA AAAAAGCCTAAATCAAATTATGAATGGTCAAGATGGGCCTTGGTTTTTTG TTAGCTCCCGAATTAGCACAATAGGCGCCACTGAGATGTGCCCTATTTCG AGTTTACAGGCTGACTATGAGGAGTTACCAGATCGTATGAAGAATATGTT GGAGAAAATCAGTAGTAGCGAAATGAAATTATGGTCGTCGCTGGTAAAGC AATACGCTTCTGATGCAGACAGCGAGGCACTCGCTAAAACTTCTCTCTTA AGTGTAAAAGGAGCGTTGCAGTATCGGCGGGTACTTGGGGATTCGGCGTT TTCAAACATGATGCAGTCTATTCAGGACCAATTTTTCGAATCATTAAATC GTATGAGGAGGTGTTAG >gid:860604 CAP0091 Predicted regulator of stationary/sporulation gene expression ATGCCAATGCAGATACCAGAAGGAAAATTTATGTGTACGGTTAAAGTTGG AGAAAAGGGTCAGATTGTAATTCCAAAAGGAGCAAGGGATTTATTTGATA TAAAACCAGGGGACATGCTACTTTTACTAGCAGATAAAGATCAGGGAATT GCTATTGTACAGAGTGATGGCTATCTACAGTTTGCAAAAGAAGTTTTTGT AGCACAGGAAAAACCGGAGGAAGCAAAATAA >gid:860612 CAP0100 HTH transcriptional regulator TetR/AcrR family ATGAATAAAAAAGCAGAATATAAAAGTGCAATACGTTCAAGAAAGCTAAT AAGAGAAGCTTTCGCAGATTTAATAAAGGAAAAAGATTGGAATAAAATCA CAGTAACCGATATCGTTAAGCGTGCAGACATTAATCGCGGAACGTTTTAC GCACACTATCAAGATGTAAAGGCGGTTTCCGACCAAATTGGAAATGAAGT AATTGAAAAAATGTTGGAATCTTTAGGTGAGTTTAATTATAAATGTTTCT TTCAAAATCCACAGCCTATTCTTTTAAAAGTTTCAAATTGGCTTAAAGAA GACTTCGAATTCTATAAAACTTTAATCAATTCCAATGGAGCTGAACAATT TCTTGAGAGACTTAAAACTATATTTGTTAACTATATGGAATTTGATAGTG ATGTTCCTGAGAACATAAAAAACACACCTGCCTTTCGCATACGAGTAAAT TTCTTTGCAGGTGGAATTATTAATATGTTCCAAGTGTGGTTTCGTGGTGA TCTTGAGTATTCTATTGATGAACTTTCAAAGGAAGTGAGCAATATTATTT CCTGTGCATCTGAACTATTTTTTTAA >gid:860615 CAP0103 Transcriptional regulator HTH-type, ArsR family ATGATTATAATCGAATATATTCATATAAGGAGTGATGAAATGAATTTAAT ACAAGTGATAAAAGCATTGTCCGATGAAACTCGCATGAGAATATTAAATT TACTTGAAAAAGGTGAAATGTGTGTTTGTGAAATGGAAGAAATACTAGAC ATAAGTCAATCCAATGCTTCACGCCATTTAACAAAGCTTACAAATGCTGA AATTATTAATTACAACAAGGTAAGTAAATATGTATATTACAAAATAAATG AAGACGTTATAGAAACTTTTCCATTTATAGAGGAAATCATTAAAAAGCAT GCACTTAATCTAGAACAATGTAAAAAAGATTTACGACAATTAAAAAAATA TAAAGAAAGTGGCCTTAACTGCGATGAGTTAAAGGAAACTAAATTAGGGG GAAAATAA >gid:860619 CAP0107 HTH transcriptional regulator MerR family ATGTACTATACAATTAGCGAAGTATCCAAAAAGATTAACGTATCTCCTCA CACCCTTCGTTTTTATGCTAAAGAAGGTTTAATGCCATTTGTTGAACGCA 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>gid:860622 CAP0110 NH2-acetyltransferase ATGAAAATTACTTATACAGAGGAAAAAAAATTCACGCAGAAAGAAATTCA GAATTTATTCTTATCTGTTGGCTGGGTGTCTGGCAATTATCCAAGTCGAT TGTATAAAGCCTTGATAAATTCTTCTACTGTTTTAACCGCTTGGGATGGA GATAAGCTTGTGGGTCTTGTACGAGTACTGGATGACAGTGAAATGGTAGC CTTCCTGCATTATGTTTTGGTTAACCCTAACTATCAAGGGCAGAGAATTG CTGGGACAATGATTGAGATTATTAAAGAAAAATATAAAGATTATCTGTAC CTTGAAATTATGCCTGAGGAAAGTAAAAATGCAGCCTTTTATGAAAAATT CGGATTTAAAATAATGCCAGATGGTGTAGCAATGCAGCTTTGCAATTTTA ATAATCAAAACTAA >gid:860623 CAP0111 NH2-acetyltransferase ATGAATATTAAAATAAGAAAAGTATCCATAGAGGATTTAAATAAAGTAAT AGAAGTTGAAGCAAGGTGTTTTCCAGAAGCAGAAGCTGCTAAAAAAGCAT CATTAGAACAAAGAATTAAGACATTTCCTGAAAGCTTTCTTTTAGCAGAA ATTGATGGAGAAGTAATTGGTTTTATAAATGGCTGTATAATTAATGAAAC CACTATTTATGATGAATTATTTAATAACGCTGCACTCCATATTCCAAATG GAGATTATCAAACTATCTTTGGACTTGATGTAATACCAGAATATCGTAAC CAAGGAATTGCAGCCGAGTTAATGAATCATTTTATAGAGATATCAAGATT ATCTGGCCGCAAGGGTGTTATTTTAACCTGCAAGGAAAAGCTCATTCACT ACTACTCAAAGTTTGGCTTTGAAAATAAAGGTATTTCAGAATCTAAGCAC GGTGGTTCTGAATGGTATGATATGCTTTTAGAGTTTTAA >gid:860639 CAP0127 HTH transcriptional regulator TetR family ATGCAATTTCAACGTGCACGCAGCGATAAGCAAAAGAATATCAGAATGAG TGAAATCGTAAATGCTACAATAAATTTATATGAAAGCCTTCAATATGATA AAATTACACTCGCATTAATAGCTAAACAGCTAAGCTTTAGTCGTGCTAAT TTATATAAATACGTGTCTACAAAAGAAGAAATTTTTTTATTAATAATTTC AGGAGATATAGAAAACTGGTCTAAGGAAGTAGTGAAGTTTTTCGATAAGT ATGATGCATTAAGTGCTGAGGAGTTTTGTAAGCTTTGGTCAGAGCTTTTA TATAGGCACAAAAGAATAATAGAACTTTTTTGTATTTTAAATACCATAAT TGCAAGGAACGTGTCAGCAGAAAAATTAGCAGCATTTAAAAAGCAAATAC ATAAAGATTTTACGAGAACCAAAAAAGTAGTTAAAAGGTTTTTCCCTTTT ATGAGTAAAGAGCAATTGAAGTTTTTTATAGAATATCAAATGAAATATGC AGTTGGAGTGTATCCAGCAACAATTATTAACGATGTGCAAAAAAAGGCCA GTGAATTAAGTGGAATTCCATCTAATGTTAAAGATTTCGAAAGTTCTTTT TCAAAGTTTCTTATGGTAATTTTAAATGGAATAGAGATTACAATATAG >gid:860665 CAP0153 Predicted transcriptional regulator TTGAATGATAAATCTCAATTTCTAAAAGGTACTCTAGAGGGATGTATTCT AAAAATAATTAATGATGCTGGTGAAGTTTATGGATATGAAATAGCTGAAA AATTAAAGGATTATGGCTTGAATAATGTAAGTGAAGGAACAATTTATCCA CTTCTTTTAAGGCTGGAAAAATCAGAACTTCTGAATTCAATAAAAAAAGA ATCCCCCTATGGTCCTAAGAGAAAGTATTATACCCTATCCTCTAAAGGAA AAGAAGAGCTGAAAGACTTCTATGAAAACTGGCTTAATCTTAAGGCAAGC ATAGATAAAATATTTTTAGATTATGGAGATGATAATAATGATGAATGA >gid:860669 CAP0157 Special sigma factor (sigF/sigE/sigG family) ATGCCAGAATGCAAACTTGAAGATTACAAAAGAATATACAATTACGTTCT TGATTATCAAAATGGCAGCACATATGCCGCTCAGGAATTAATAGAATGTT TTAAAAACTTTTTATTAAACTACTTAAATCTTATTATGTATGGAGCTTAC AAGCCAAAAGATTATTCAATAAACAAATTTATACGTTTGTATATAAAAGT ACAGGAACTAAAGGAAGTTAATAGGGAGGAAGTTAATTTAAAGCTTGAGA ATGTCTCAAAAAAAATAAAAAATATGTTCTCTAAATATAATGAAAGTGAA ATACAGAATGAACTTATTGCAGCTTTATTAATAATGGCAAAAAAATATAG AGACTATGATAAACCTAGTTTCCATAATTACGTGTATAAATGTTTTCATT ATGAAATTTATCGCCGCTTAAGTTCTCTTGTAAAGGATACCATTTCGAGA AGTAATAATAGTGAATACCTGGATAGTATATTAGTTTATGATAATAGTAT AAGTTTTTTTGAAGATAATGAATTACTAGATGATAATTGGATAGAGGGTA GAACAGGAAACGAAATTTTTAAATGCTTAAATTCTTTTGAGAGAAGTATA ATTAAAGAACATTATATAAATAAAAGTACGGATGCAGATATAGCTAATAA ATATGGGGTATGTAGGGCTACAATAAATCGTGCTAGGCTAAAGGTTAAAA AAAAGCTGGCAAATGAACTTAGAATTAAATAA >gid:860679 CAP0167 Specialized sigma factor (SigF/SigE family) ATGAAGCCTTTATCTAACGAAAACCTAAATATTTTGGTTCTTAAATCACG CTCTGGTGATAATGCCTCTTTAAATAAAATATTTAACTATTTTGGCCCAT TTATAAAAAGTTTCACTAAAAACATATATATAAGAAACTTCGACAAAAGC GATATATACGAGGAATGTAACTTTTCAATTCTGTTATCAATCAAAAAATG TGACATAAAAAAATATAACTTCACTGCTTACACCATAAGTTCCATTAAAA ATAACATATATTATAAAATAAGAAATCAAGCAAAATTCCAGTCTGAATTA AGCCTTAACGCAAAAGTAACTGACCAAAACTGCACTTTTCAAGATATTCT TATAGATAAAACGAATCATTTTAAGAACTTATCTATCAAAAATGCCTTAA CCAGTTTAGACAAGAAAGAACAAGATATTATAGACCATATTTACTTTTTA GGATACTCTTCTATTGAGTATTCTAAAAAATCAGGCATAAATTATAGAAC ATGTCTTAGACGAAAAAACAGTGCTTTAAAGAAACTAAAGAGAAAGTTAA ATTAA >gid:860690 CAP0178 Transcriptional regulator, MerR family TTGTACTATTCAATAGGCGAATTCTCAAAACTTACTGGTATAAGCATATA TACCTTGCGTTATTATGAAAAGGAAAATTTAATTACATCTAAGCGCAAAG AAAATGGCAGGCGATTTTACGATGAAAAAGATTTAAAATGGATAGAATTT ATAAAAAGATTAAAAAACACTAACATGCCAATAAAGGAAATTAAGAAATA TGCTGTTTTGAGATCCCTTGGAAAAACAACTCTTGAAGAACGGTTTGAAA TGCTAATTGCCCATAGAGAAAATCTTAAAAAAGAAATAAATTCGTATATT GAAAATCTTAAAGAATTAGATAATAAGATTGATTACTATAGAGAAGAAAT AAATAAAAATATTAATTTATAA