Gene list
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COG category: Transcription
Genomic element: chromosome 1
Number of genes found: 14
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# Photobacterium profundum, ss9 >PBPRA0644 hypothetical transcriptional regulator ATGACTTTTAAGAATGCCCTTTGCATTCGTATAACGGTAGCGGGAAGCTT TATAATGGGATATTTAGAAAGAATTAAACAGTTAGCTAAAATCCAAGGAA TTAGCCAAAAGCAACTTGGCGAATCTTTGGGTCTTCAGCAAGGAACAATG AGCCGTAAGTTATCGGGTAAATACGGTATTGAAGTCCGCGAACTAGAAAG AATCGCTGTGACATTAAATACGTCTATCGGTTACCTTTTAACAGGGCAAA TTGATACAAGCACTCAAGCAACGACAGCCATTACTCATGAGTCTTCACAA GGTTCAACCTGTACTTACATCCCTATTATTCACCGTAAAGATTTTGGATC TTTCATCGACGGTGAATCAGTAAATGTGGTCAGTAAACGCGTAATACCAC AACACCTTGAACGTGATGATTGCTTGGGTTTATTTGTTGATAACGAAAAT ATTTCGCAATGTGCACCTATTGGCAGCTATGCATTAGCCACCAAGCAAGC GGCTTACCGCCCTAAACAACCAGTATTTGCATCGGTACGTAACAGTGAGC CTGATTTTTATCACATGACTCAATTGGCTGATGGTGTTATCTTTTCGACA TCCCAACCCGATTTCCCTAACCTCTTTGTCAATAATGATGAATTTAAAGT TCACGGTTACATCATTCAATCAGATTGGGCTTACGATCGTTAA >PBPRA0897 FLGM OR, putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM ATGGCAAGTATTGATCATCTGCGCAACAGTCAACCGATGACAACCGCTCG GAATAATCAGAGTAAAGTAACGACAACATCATCAGGCAGTCAACCTACTT CGGCACCAAGCTTGGGGCGACAAGATGCTGTTTCGTTAAGTTCACAAGGT AAAGCTGTTGGTCAAATCCACCAACAACTAGCCACAGAACCTAGCTTTGA TAGTGCAAAAGTCGCGGCAATTAAAGAAGCTATTTCAAGTGGCGCTTATG TAGTTGATGCAGATAAACTCGCATCGAATATGATGAAGTTTGAAGATGAG CTACGCGGGCTATAA >PBPRA0714 LMO0547, putative transcriptional regulator, SorC family ATGAGTGCAAATACCAATGATAGCCCACATGTTGATAGTGACTTATTGAC CGAGATTGCTATCGCTTATTATCAAGACGGTGCGACTCAAGAAGAGATAT CGAAAAAATTTGGCATGTCACGTGCCAAAGTGGGTCGTTTGCTTCGTCGT GCTCGTGAAGAAGGAGTGGTTGACATTACGGTTAAATATCACCCTGTCTT TAGCGAAAAGCTCGAGCAACAACTTATTGAACGTTTTAATCTAAAGCGCG CATTGATTGCTCTTGATCAACCTGATGATAAAACCCAGCGACAACAAGTC GCTAGCCTTGTTTCTAGTTATTTAGCCACGATTTTAACTGATGAAATGGT AGTGACGGTTGGGCAGGGTCGAAACATAGCCTCGATTGCTAGCCATGTTG GTGTTGTTCCTCATAAGAAATGTCGCTTTGTGAGTGGTATCGGTGGTACC CATCGTTCTGGTAATGCCATTAATGCTGATCATATTTGTCGTTTATTGGC GAAGAAATACGATGGTATTAGTGAAACCTTGTATGCGCCAGCTTACGTTG AAGATATTAGAGTGAAAGAAGCCTTCATGAAAAACGGTACGATAAAAGAA ACATTAGACCGTGCTCGTCGAGCTGATGTTGCTTTGGTCGGTGTTGGTGA TATGAATGAAAATAGCCACATGGTTAAACTGGGTTGGTTTACGCCGCAAG AAATTGTAGAAGCACGTATTCGAAAGGGTGTGGTGGGCGATATTGCGGGG TATGATTTTTTTGATAGCCAAGGTAACCAAGCCGACACAATGATGAGTGA TCGGGTGATTGGTTTGAGTATGGAAGAGCTACGACATATACCCACCGTGG TTGTATCTGCTGCTGAAAACAGTAAAGCATTAGCGTTGTTAGGCGCATTA CGATCTGGCGTTGTTGATGTTGTTGCGACCAGTGTGAGTAATGCACTGAC GATATTAAATCTTGATCAGCAAATGAAGTAG >PBPRA0801 NUSB, Putative NusB protein GTGAAACCAGCTGCACGTCGTAATGCTCGTCATTTTGCTATCCAAGCAAT TTATTCATGGCAGATCACGAAAGGTAATGTTGCGGAAATCGAGCAACAGT TCCTTTCTGATGACAAATTTGAAGAAGAAGAGCACCAGGCTGATGCACCT ATTCTTGCTGCACCACATACAGATCTGAACTACTTTCATGATCTTTTGAA TGGTGTTGTACAGAACCATCAGGAATTGGACAGCAAGATGCGTCCTTACC TTTCTCGTCCACTTCAAGATTTGGACCAGATGGAGCTTGCTCTACTTCGC TTAGCGATGTATGAGATGACTAAACGTGAAGATGTTCCTTATAAAGTTGT TATCAATGAAGCAATCGAATTAGCTAAGATATTCGGTGCTGAAGATAGCC ACAAATTTGTGAACGGTGTGCTTGATAAAGCAGCACCAACACTTCGTAAA AAGTAA >PBPRA0796 PLU3900, putative RibX ATGCATTGTCCTTTTTGTGGTGCCAATGACACCAAAGTAATCGATTCCCG TTTAGTTGCAGATGGTCATCAAGTTCGTCGTCGTCGCCAATGTTTAGCGT GCAATGAACGCTATACAACGTTTGAGACTGCCGAATTGGTGATGCCAAGA GTGATAAAAACCGATGGCAACCGCGACTCGTTCAATGAAGATAAACTTCG TGGTGGTATTCAGCGTGCGTTAGAAAAACGTCCGGTGAGCGCAGATGATA TAGAACGTGCAATTAACACGATCAAGTCCCGTTTACGCGCGACGGGTGAA CGTGAAGTACCATCAGATATGATTGGTAACTTAGTAATGGAAGCACTAAA AGAATTGGATAAAGTTGCTTATATCCGCTTTGCTTCTGTTTATCGTAGTT TTGAAGATATCCGTGAATTTGGCGAAGAAATTGCCAAGTTAGAAAAATAA >PBPRA0849 PM1810, putative nitrate/nitrite response regulator protein ATGACGTGTTGGAAAATAATGATAGTGGACGATCATCCACTTATGCGACG TGGTATTGGTCAATTATTAAGCTTTGAACCAGATTTTGAAATGATTGGCG AAGCAAGCAACGGAACAGATGCTGTTGCTATGGCACATGAAAAAAACCCC GATCTTATTTTGCTTGATTTGAATATGAAAGGCATGTCTGGTCTTGATAC GTTAAATGTAATGCGTGCTGAAGGTATTCTTGCCAGCATCGTAGTACTAA CCGTTTCAGATAGTCGCTCTGATGTGAAAGCGCTAGTCGCTGCAGGTGCT GATGGGTACTTATTGAAAGATACTGAACCCGATGAATTAATTAGCCTGCT GAAGCAAGCGTTATGCGGTGGTAAAGCTTACAGCGATATTGTTCGAGAAC ACTTAGAAAGTAATACAGAGCAAGATTGCCTATTAAGCTTGCTTACTGAT AGAGAAACTCAAATATTACAAGAAGTTGCTAAAGGCTACCGTAATAAACA AATTGCAGATGCGCTGTTTATTTCAGAAGCGACCGTTAAAGTACATATGA AAAGTTTACTGAAAAAACTGCAAGTAAAATCACGTACAGCAGCCACTGTT TTGTATTTAGAAGCACAAGGGCAGTAA >PBPRA0939 PSPTO197, Putative flagellar-specific RNA polymerase sigma factor, FliA GTGAATAAAGCGCTTGCTTATGGGCAATATAAAGAAAGCCCGCAAGCATT TATCGAGCGCTATTCGTCGCTGGTTAAACGCATTGCGTATCACCTGATGG GAAGGCTTCCGCCTAGCGTACAAGTCGAAGACTTGATTCAATCAGGTATG ATTGGTTTGCTAGAAGCACAGCAAAATTATGATCCAACCAAAGGGGCGAG TTTTGAAACCTTTGCGGGTATTCGTATTCGAGGAGCCATGCTAGATGATA TTCGTCGTGGTGATTGGGTTCCTCGATCTGTGTATAAGAATAACCGACGC ATTACCGAGGCCATGGCACAGCTTGAAAATAAGCTAGGTCGCGACCCAAC AGATACAGAAATTGCCGAACATCTCGAAATGACGCTTGATCAGTACCATC AAGCATTAAATGATGTTAATTGTGGGCGTCTTGTTGGCATGGATGATCTT GGTGTGTCAGAAGATGCAGTGACAACCGAGGCGTCACGAGAAGAAAATCT TCCCTTTCAGGGTGTTGTAGATGATAATTTCCGCCAATCTTTGGCTGATG CCATTAAAACGCTCCCTGAAAGAGAGGCTTTGGTTCTATCACTTTATTAT GACGAAGAACTTAATCTTAAAGAGATCGGAGTCGTTGTTGGGGTGAGTGA GTCCCGAATTTGCCAGATTCATAGTCAGGCTATGCAACGTTTGCGCTCTA AGCTAACCGCTTGGGCTGCTTAA >PBPRA0736 R00763, Putative transcriptional regulator, LysR family ATGAGTAAATTTCCCTCACTAAAACAGCTTCATTACCTTGTTACTTTGTT TGAAACTCGTCATTTTGGCAAAGCAGCAATAAAGTGTTTTGTTAGCCAAT CAACCCTGAGTTCAGGCATTCAAAATCTTGAAGAATTATTGAACTGCCAA TTAATAGAGCGTGATAACAAATCGTTAGTCTTTACCTCTACAGGGGAAGA GGTCGTGATACGTTCCCGTGAATTACTGGCACGTAGCCAAGATCTAATGG AATTATCAAGTGGCGCAGGCGATGGTATGGAAGGCCAGCTTCGGGTGGGC TGTATACCGACTATTGCACCATTCTTGCTGTGTGATTTGGTGCAAGAGGT GAATCGTATGCACCCTAACTTGAATCTTCTGCTGCGCGAAGACACCACCA CGAACCTGTTAGCAGCGTTACGTAATGGGGAAATGGATGTGCTGATCTTA GCTTTGCCTATTGATATCAATAACATGCACAGCAAGATAGTAGGGCGAGA TGCCTTTAAAATGGTGATCAGCAAAAATCAGGCTGAAAAAGTGAATGTTC CCCTTCGATATGCAGATTTACCAGATGAATCGGTTTTCTTGTTAGAGAAA GAACATTGCTTAACGGATCATGCTGTTTCTGCGTGCAAGCTGACCACCAA AGAAAAAATAAACCCCTTTACTGCCACAAGCTTACACACGTTAGTGCAGA TGGTAGCGAATGGGTTAGGCACAACCTTTATTCCTCAAATGGCTATCGAT CATGGCTTATTAGATAATCAAAACTTAGTTGTTATTGAGCCTCCAGGGCA GGCTGCTTACCGTGAAATTGGTTTAGTGTGGCGCCCGACGTCTAGCCGAA TCAAGACCTTTAACGGCCTTGCCGATATAGTAGAAGGACTTTTATAG >PBPRA0645 RS02875, putative response regulator ATGACACAATTTTCAACCGCGATAATTGCCGACGATGAACCGCTTTTACG TCATCATTTAAATCGTTCTTTAGCCGAAGTATGGCCAGAACTCGAGATAG TGGCGAGTGCTGAAAACGGAAAAGAAGCGTGGTTGAAAATCAATGAGCAT CAACCAGACGTTGTATTTCTTGATATTCGCATGCCAGAATTAGACGGTAT GTCACTGGCAAATAAACTCAAAAAAATGCCGACCCCACCCTTGATTGTTT TTATTACCGCGTATGATGAATATGCAGTAAAAGCGTTTGAACAAAGTGCG GTTGATTACTTATTAAAGCCTATTCCCGAATCACGCTTACAGACTGCCTG CACTAAATTACAACACCAACTTTCAATGCAGCAATCAGAACAAAAACACC CATCAAATGCACAATCGCAACCCGATATATCAGCATTAATCCAGCAAATT CAACAGTTATCGACACAGTCTGAGCCACAATACCTCGCTTGGATAAAAGC CAGCGCGGGTGATGACATTCATTTAATCGCGATATCCGATGTGCTCTATT TTAAAGCGGAAGACAAATATGTATCGGTGTTTAAGCGATTACCCAATAAC GCCGCTCAAGAATATATTATTCGTACATCACTGAAGGAATTGCTTGCACA GCTCAATCCAGATTCATTTTGGCAAATACATCGTTCAACCGTCGTTAATG TCGCAACCATTGAAAAAGTGAAGAAAGATCTAGCAGGAAGAATGTCAGTT ATCATTGATGGGCAAAAGCTGCCTGTTAGCCGAACAGCGCAGAGTTTATT TAAAGGAATGTAA >PBPRA0770 SF2737, hypothetical protein ATGCGCGCTATCCGGGCGTTACACGATGCAGGATTACAGGTACCTCAAGA TATTTCAGTATTAGGCTTTGATAATGATCCTGCGGATGAGTTCACTATTC CGAGTTTAACCACAATCATGCTTCCGGTGGAAGAAATGGCATATACCGCA ATCAAGCAGGCATTGCAGTTAATCGATAAGCAAGAGATCAGCCCTATTGT TCTATTTTCAGGCAACTTGATCGTTCGCGAATCAGTTGATCATTTGTGA >PBPRA0721 STY0432, putative DNA-binding response regulator PhoB ATGGTAAGAAGGATTCTTGTTGTAGAAGACGAAGCACCAATCCGCGAGAT GTTGTGTTTTGTTCTAGAACAAAAAGGCTATCAACCCATTGAAGCCGAAG ATTATGATGATGCATTAGAAAAAATTTGCGAACCTTATCCTGAATTGATT CTAATGGATTGGATGTTACCGGGGGGCTCAGGCATTAACCTGATTAAGCA CCTAAAGCGTGATGAGCTAACGCGTCAGATCCCTGTAGTAATGTTAACTG CACGCGGTGAAGAAGAAGATAAAGTGCGTGGCTTAGAAGTGGGTGCTGAT GATTACATCACCAAACCATTTTCACCGAAAGAGCTAATGGCACGTCTTAA AGCGGTAATGCGCCGTGTATCACCTACGTCACTGGATGATGTTATTGATG TACAAGGTTTGAAATTAGATCCTGTGTCGCACCGTGTAACAACGAATGAT GAACCATTAGACATGGGGCCAACAGAGTTTAAGATGCTGCATTTCTTTAT GACACACCAAGAGCGTGTATATAGTCGTGAGCAGTTGTTGAACAATGTAT GGGGTACTAACGTGTATGTTGAAGATCGTACGGTTGATGTACACATTCGT CGTTTGCGTAAAGCGCTTGAAGCGGGCGGGCACGATAAAATGGTACAAAC CGTTCGTGGTGCGGGTTACCGGTTCTCGACACGTTTGTAA >PBPRA0749 STY2790, hypothetical transcriptional regulator ATGAGATTGACTTCAAAAGGAAGATATGCAGTAACTGCGATGCTTGACGT CGCTCTGCATTCTCAAGATGGTCCAGTGCCTTTAGCGGATATTTCCGAAC GACAAGGTATTTCACTGTCTTATTTAGAACAACTTTTCTCACGCCTACGT AAAGCTGGCCTTGTGGCAAGTGTTCGTGGACCAGGTGGTGGTTATCGCTT AGGTGAAGATGCTAATGATATCGCTGTAGGTATGGTTATCGCAGCTGTTG ATGAATCGGTTGATGCTACAAAATGTCATGGTAAAGCTGACTGTCAAGGT GGTGTACGCTGCTTAACACACACTTTATGGCATGACTTAAGCTCCCGTAT CAGCGGCTTTTTGAATAACATCACTCTTGGTGAGTTGATGAGAGATAATA ACGTTCAAGAGATTTCAGGTCGTCAAGATCAAGTTTTAAGCAATAGTTCG CTAAGAACGTCTTTTGGACATAAAAAAACACACGATAGCACCACTATAGG TGTCGATGTCCGCTCTTAG >PBPRA0642 TRPR, putative trp operon repressor ATGTCAACAACTCCGGAAACGGCTGATTTTACCGAGTGGCAACAGGTCGT CGATTTACTTCGTCAGGCAGCATTAGAGCAGAAAGATGACGTGATGCTGA AGCTATTACTTACCCCTGATGAAAGAGAAGCGTTATTGGCTCGCGTTAAT ATTCTTCATGAGCTAATGAATGGGCAGCGTAGCCAACGAAAAATTAGTGA ATTGTTAGGGGTTGGGGTAGCAACGATTACCCGAGGATCTAATGAATTAA AGCATCAGAGCGACGATACAAAAGAATGGCTGGCTTCTTTATTAAAGAAG CAACAGCAATAA >PBPRA0657 VPA1044, hypothetical serine/threonine protein kinase TTGTTTTTACATATATCAATTACATTATTCTCACTAACTCTAGGGGCGAA CACAAAATACAATAAAAACACTATTGCACAAGAATCTTTTGAATATACTA TTCTTTCCCAACTACTATTGGAGAAAACTCTCATGGAAAAACAACCTCAT AAAAATAATAACCAACCTCAACATTCAAAAAACCATGAGATATCAAACCA AGAAGATGATAATAACAAAACAATTATTAACACATCAAAAGCATCTTCGC TAAAGAGTACCAAAGGTAACGATAACGGTTCTGGTGACATAAATAGTGAT CTTTTAAATACAGTAATAAAAGGCAGGTATCGTATTGAATCACGTATTGG CCATGGTGGTATGTGTGATGTTTATCGTGCAACTGATTTATTGCTTGAGG CAGCTGGCGCATCAAGCCCTTTCGTCGCAATTAAAGCGCTACAAAATGAG TTCTTTAATCAACCGGAAGCAGCAAAGGTATTGATAAATGAAGCTCAAAC AACTCAGAAATTAAGCCACCCCAATATCATCCGTGTTTATGACTTTGGCA TTGATAAAAAAATATGCTATTTAGTCATGGAATACCTTGATGGTGAAACC TTAGATGTCGTAATTCAACGCTCTCGACCCCATGGTTTACCCTACAAACG TGCTATTCCGTTACTCGATCAAATGCTATCTGCATTAAAGTATGCTCACC AAAACGGTATTGTTCATGCTGATTTAAAACCAAGCAACATCATGCTAACT CGAGATGGTGAAATTAAAATTTTTGATTTTGGTGTTGCTAAAAAGTTAGG TGAAAATAACGATCAATACGCTGCAGTACAAGAAGAAACACTATCGGAAC TCGGTGGTTATACGCCTAATTACGCCTCAATCAATCTGTTAGAGGGCAAC GACCCTGAAATTAAGGATGATATTTTTGCGTTTAGCTGCATTAGTTATGA GCTCTGTTCAAGTAAGCATCCTTTTAATCGCAAGCCTGCTGATGTAGCCC AAAAGGAAAAAATTCAACCAATAAAACCTAAGCATTTAAATTCATCTAAA TGGCGTATTATTCAACAAGGGCTATCATTATCCGCGAAAGAGCGTATCGG TGATGCTGCTTTAATCAGCTCCCAATTACATCGCCAATACAAATCAACAG CCATAATGATCACGGCTATTTTGAGCTTAAACTCTGTGGTCGGGTATGTA TTGTATCAACAAAAAGAAGCCATTTTAGAACTAACAACCGACAATCGAAA TTTGCACCAACACATTGAAGAAAGAGCAAAACTCGCAAATCTCAGTGCAC GTGAAATCATTAAACAGCTCCCTGAATTATCAATTAATGCCCCCATTATT GCCAGCGGTCTACTAAAAAGTAAGCAACGTGACGTTATTGCATTATACGA ACACAATATTGACCTTATCTTTAATACACGAGAGAACTATTACCCAAATT ATTACGCAATAGAAGCTGAATTAGCCGAAGTGAGCAAACTCTACCCTGAC TCACATGCTATCAATGTACTGAGCACCGACATTTCAACCAGCTGGCAATC AACTATCGATATTTTATCCAATCAGCTCAATACCGCTCTAGAAAAGGCAC ATTATCAAATATCTGCCGATAGTAATATCTATGAGCTATTAACTAACCTT AAAAATTTACGTCATGATATTCAATTTAAACCGACGTCATTGGCTGAAAA GACCTATGCAACCCAGTATAAAAAAGCTGCTAACCAGCAAGATACTGAAA CATTAGCAACCTTAATTCAGGTGGGAGAAACTTTCTTCTCAACAACAGAT GAACATATCGCTCAATTACAGCATACAAAAATTCTACACAAAGCCACTCT TCAACTGGAACAGTTCAAAGCCGCTAGAGAAGGCGATAAACCCGCCCCCT TCCCATATGAATCTGCAGAACTTTTATATGCAAATAAATTTGATAAATTT AACCACCAGCTTAAACGCGTGAACAGCGAATCGAAGTTAGACAAGTTACT CAAGCAGGTAGATGAAATTGCTAAAGAGTTACCCGCTGATTTTTCATCAC TCATTACCTTGCGCTTAGCAAGTGCTAATCAGTACCTCGATTTTTCAGAA AAATGGCAAAAAAAGAGAAAGCAAAGCGCCGCACGTAATGCAATGAAAAA AGCCACACATCAATTTAACTTAGTTGAAAAAGCACATTCACGATCATAA