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COG category: Translation, ribosomal structure and biogenesis
Genomic element: chromosome II
Number of genes found: 9
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# Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125, TAC125 >PSHAb0230 putative secreted protein similar to a protein present in D. psychrophila ATGTTTAACACAACATTAAAGCCTTTATTATTAAGTGCAGCGTTACTTGC AACGTCGCTTGCAAGCCAAGCGCAAAGCACGACTAATAACCTGCACGATA GCTGGAATGCATTGCTAAATAAGCATGTTGTAGCGATTAACCATAATCAC AGCACAGAGGTTGATTACGCAGCCATAAAACGTGAGCATGCACAGCTAAA AACGTATTTAGATTCGTTAAGTGCTGTAACACAAAACGAGTTTGACGCGT GGGAAAAGCCTAAGCAACTCGCTTTTTTAATTAATGCGTATAATGCGTGG ACTGTTGAACTTATATTGACTAAGTACCCAAACCTTAAATCAATAAAAGA CTTAGGCAGCTTTTTTAGCTCACCATGGAGCAAAGAGTTTGTGCCACTAC TTGGTAAAACTCGCAGCCTTGATGACATAGAGCACGGTTTAATTCGTGGC AGCGGTAAATATAACGACCCACGTATTCATTTTGCTGTAAATTGTGCAAG TATTGGTTGCCCTGCGCTGCGCGAGGAGGCATTCACAGCTACTGAACTAG AGAGCCAATTGCAACAGCAAACGGTGCGTTTTTTATCTGATACAACACGT AATATGGCTCAAGAAAATACGCTAAATATCTCCTCTATATTTAAGTGGTA CGGCGATGACTTTGAACAAGGCTTTAATGGAGCAAATACCTTACAGCAGT TTTTTTTGCAATATAGCGATGCACTTAAACTAGTACCCGCTCAGCAAAAA GCGCTTAAAAATAATGACATGAAAGTAAAATTTTTAGACTACAGCTGGGA TTTAAATGCACGCCAGTAA >PSHAb0038 putative protein with Class I peptide chain release factor domain and peptidyl-tRNA hydrolase domain ATGTTAACTATTTCAAATACCGTGACCATTGATGAATGGGAAGTCGAATT AACCGCAGTTCGCTCGCAAGGTGCCGGTGGACAAAACGTTAATAAAGTAG CCAGCGCTATCCATCTTCGTTTTGATATTAACCGCTCTAAATTACCCGAC TTTTATAAAGAACGTTTACTTGCACTAAACGACAGCCGCATAACCAAAGA CGGCGTATTAATAATAAAAGCGCAAAGCCACCGCACACAAGAGCTTAATC GCGAAGATGCATTTAAACGCTTAAAAGATCTAATTATTAGCGCAACTAAA GTAAATAAAGCCCGCAGAGCCACTAAACCGAGCCGTAATTCGCAGCGTAA ACGCATGGATAAAAAAACCAAACACGGCCAAACCAAAGCGTTACGCGGCA ATATTAAGCTTTAA >PSHAb0516 putative cold-shock RNA methyltransferase ATGAGCAAGCAACAGGCTGTTATTGGTTTATTAAATCCCAAAAGCCCAAC TAATGTGGGCGGTGTATTACGTGCTGCAGGTTGCTACGACGCACAGCAGG TGTTTTTTACCGGAAACCGTTATTTAAATGCACAAAAGTTTCATACCGAT ACAAAAAATGTGGTTGAGCGAATTTCACTAACTGCCACCGATAATTTAGA AAAAGTAAAGCCACAAGGTGCCACGGTTGTGGTTATTGAGCTAATTGAAG GTGCAACGCCACTGCCTGAGTTTACCCACCCAGAAAACGCATTTTATGTG TTTGGCCCAGAGGATGGCTCAGTGTCTAAAGACGTTTTAAAGTGGGCCGA CGAAGTCGTGTATATTCCTACTATTGGCTGCATGAACCTCGCTGCCACTT GTAATGTGGTGCTATACGACCGTTTAGCAAAACTAGGCGGCGTAGAGAGC AGTGATACTACAATTATCAATTCTCGCGACACCAATAATAAAATGAAATG GGAAAAAGCATAG >PSHAb0351 putative acetyltransferase ATGCGAAGGCAATTTAATACCGAGCGATTAATTATTCGCCATGCTGTTGA AGCAGATGCTGGCGATTTATTAAAGTTAGTAAATCAAAAAAGTTTTATAA AATACATTGGGGATAAAAAAGTTTATACCCTTGAGGATGCTATAATCTAT ATTAAGCAAGCTTTTAGTGAGGCGCACCAATCGCAAGGGTTTGGCCCTTA TGTGATCACTTTAAAAAATCAGCAGTTAGTGGGGGTTGTTGGTTTTTATA GCCGTGCAATGTTGCAGCACCCCGATATAGGATTTGCGTTATTAACAGCG TTTGAAAAACAAGGGTATATTTACGAAGCTGCAAAAGCGTTAGTTGAAAA TAAAAGTATATTTGGCATTAATAAATTATGCGCCATTACCTCAATAGATA ATAGCGCATCACAAAATGTGTTAATTAAGCTTGGCTTTAAGCCACAAGGG CAAGTAATAATAGATAAAGAAAGCCGCAGCGTTGTTTCTTTATTTTTATA TCATTAA >PSHAb0137 hisS, histidine tRNA synthetase GTGGCAAAACAAATTCAAGCAGTTCGCGGTATGAACGATTGCCTACCAGG CGATACTCAAGTTTGGCAAAAAGTAGAAAATATTTTACGCGAAACCGTTG CGTCGTTCGGTTATCAAGAAATTCGTTTTCCAATTGTAGAATCAACCGAC CTATTTAAACGCTCTATTGGTGAAGTAACCGATATAGTAGAAAAAGAAAT GTACACCTTTGCCGATCGTAATGGCGACTTACTTACGCTTCGCCCAGAAG GCACCGCTGTGTGTGTACGCGCAGGAAACGAAAATGGCTTACTGTATAAC CAAGAGCAACGCCTTTGGTATATGGGCCCAATGTTTCGCCATGAACGTCC GCAAAAAGGCCGCTATCGCCAGTTTCACCAATTTGGTTTAGAAACCTTTG GTATTGCGAGTGCCGACATAGATGCAGAAGTTATTTTACTTACAGCGCAA TTATGGGAATCGTTTGGGATTAGCGAACATGTACGTTTAGAGCTTAACTC GTTAGGTTCAAACGAAGCACGTGCCAATTACCGTGATGCACTGGTTGCCT ATCTTGAACAACACCTTGATGTACTAGACGAAGATTCAAAACGTCGCATG TATTCAAACCCGCTACGTGTACTTGATAGCAAAAACCCTGACGTGCAAGC AATTTTAATTAATGCACCTAAGCTATCTGAGCATTTAGACACTGAATCAA AAGAACATTTTGCAAATTTATGTGAACGTTTAGACGCAGCCGGCGTCAAA TACACGATTAACGAAAAACTGGTACGTGGTTTAGATTATTACAACCGCAC TGTGTTTGAATGGATCACCGACAGCTTAGGCGCGCAAGGTACTGTGTGTG CCGGTGGCCGTTACGATGGCTTAGTTGAGCAACTTGGTGGAAAAGCGACC CCTGCAGTAGGTTTTGCAATGGGCCTTGAGCGCTTAGTGCTACTGCTACA AGCACTTGAGTGTGTAGGTGATATTCGTCGTAATGCTGATGTATATTTAG CATCAATGGGCGACAAAGCCAGTATTCAAGCACCTATTATTGCAGCGACG CTTCGACGCGATGTGCCAAACTTACGCGTTATGGTGCATGCTGGCGGCGG CAACTTTAAAAAACAATTAAAACGTGCTGATAAAAGCGATGCACTCGTTG CCGTTATTATCGGTGAAGATGAATTAGAACAAGGCGTTGTGACCATTAAG TATTTACGCGAGCGTAAAGAACAAGTCACATTAGAATTAGAACAAGCTAA AGCGCTATTAGCAGAGCTTATTAATAGCTAA >PSHAb0411 rhlE, putative ATP-dependent RNA helicase with P-loop hydrolase domain; DEAD-box protein family ATGAATTTTAAATCTTTTAGTTTTGCTCCTGAACTTGTTCAGGCGTTAGA CGAACTTAACTATCACACCCTTACGCCCATTCAGCGCGCAGCAATTCCTG CTGTTCGTAAAGGTAAAGACGTTTTAGCAAGTGCACAAACGGGGACGGGT AAAACCGCCGCGTTTGCGCTACCAATTATTCAAAAATTATTTGAGTCTGA AGTAAGCACTACTAATGCTCCGCATGCTTTAGTTTTAGCGCCTACGCGCG AACTTGCAGAGCAAATAGCAAATAACTTTAAAGACTTCGCAAAACACACT TCGTTAAAAGTAGTCAGCTTATTTGGCGGTGTTAACACCGCAGGCCAAGC TAATGCACTTAAAGAAGGTGTTGATATTGTAGTAGCAACGCCAGGGCGTT TACTTGATCATATTCGCTTAGGTAACTTAAGCCTTGCCAGCGTAAAGCAT TTGGTACTTGATGAAGCAGACCGTATGCTCGATATGGGCTTTATTGAAGA GATGCAAGGCGTTATAAAAAGCTGCGCTGACGATCGTCAAATCTTGTTGT TTTCAGCTACTTTCCCAGCAGCAATTAAACAGTTTGCATCTAAAGTATTA AAACAGCCAGAAATAGTACGTGTTGATCAAACAAACAGTACTGCTAGCAC TGTAGCGCATGTGGTTTACCCAGTTGAAGAGCGCCGTAAGCAAGAGCTGC TTTCTGAGCTAATTGGTAAGAAAAACTGGCAGCAAGTGTTAGTATTTGTA AACATGAAAGAAACAGCCGATGAGCTAGTAACAGAGCTTAACCTTGATGG TATTCCGGCTGCGGTTTGTCATGGCGATAAGTCACAAGGTAATCGTCGTC GTGCGCTGCGTGAATTTAAAGAAGGTAAAGTACGTGTATTAGTGGCAACA GAAGTTGCGGCGCGTGGTATTGATATAGACGGTTTACCGCGTGTAATTAA TATTGACTTACCTTGGCTTGCAGAGGACTACGTACATCGTATTGGTCGTA CTGGCCGCGCAGGTAAAGAAGGCCAAGCAATTTCATTTGTAAGCCGTGAA GAAGAAAACATGTTGTTTGAAATTGAAACCTTAATTGGTCAAAAAATTAA ACGTGTTTACTTAGAAGGCTATGCAGTAAGTAACCGTGAAGTATTAATTG ATAAAATTGGCAAAAAGCCTGCACACTTACGTCGTACTCGTGCTAATAAG CCATCTGGTCAAGCAACTGGCGAAGCAAGAGCAGTAAATCGCTCACGTAT ATCTAAAATACGTAAAAGCTTAAAAGGCGAAAAACTGTCGCTTAAAAAGT AA >PSHAb0436 rluC, putative ribosomal RNA pseudouridine synthase ATGACAGACTTAAAACGATTAAATAAATTTATTAGCGATACTGGCTTTTG TTCGCGACGCGAGGCTGATAAATATATTGAAGACGGTCGTGTTACTGTTA ATGGTATTCGTCCGGAAATGGGCGTAAAAGTTTCATCTACTGATGTTGTA TTGGTAGATGGCAAAACACTTAAAGCAATCCCTAAACGCGTTTATATTGC CTATAACAAACCCGTTGGCATTACCTGTACTACAGAGCGAAAAATTCAAA GTAATATTGTTAAAGCAGTTAATTACCCCGATAGGATTTTTCCAATAGGG CGCTTAGATCGCCCATCTGAAGGGCTAATATTTTTAACTAACGAAGGCGA CATTGTTAATAAAATTTTGCGCGCTGGCAATAATCACGAAAAAGAATATG TAGTTACTGTAGATAAACCATTAAATCGTCAGTTTGTAGCTAAAATGGGT AATGGTGTGCCCATACTCGATACCATCACTAAAAAATGTAAAGTAACCCA AACCGGTGCGCAGCAGTTTACTATTATTTTAACCCAAGGGTTAAATCGTC AAATACGTAGAATGTGTGAATATTTAGGTTATGAAGTGGTCACACTCAAA CGCGTACGTATTATGAATGTGACGCTTAAAGGTTTAAAAGTAGGGCAATG GCGTCACTTAACTGAACAAGAAATGGCGATTATAAACAACTCTATTTCTG ACTCAGGAAAAACCCAAGAGCATTCAGTATACGATGAAGCAAACGCTTTA CAGCAACAAAGCCCGCAAGCTGTAGCTAAGCCGCAAAAAACAAGTGATAA AAAACGTGATTTTCAGGGCGAAAACCCTAAACGTTTTAATCAAGGTGAGC GCACTGAAGAACGTAAAAAAGAGCGTAGTAAAACGCCTTATCAAAAGCGC TCAACCACTTATGTTGGTAAACCTAAAAGTATAAAAGCAAATAAATCATC CGACTCAAAAGGAATATTGAGCCTTAAAAAATAA >PSHAb0503 rnd, putative RNase D, processing tRNA precursors GTGCACTACCAATTAATTGAAACCCAAAATCAGCTTAATACTTTTGTTGA GCAAATTAAAAACAAGCCCGTTTTAGCCATAGACACAGAGTTTATGCGTC GCCGCACTTTGTACCCAGAAGTTGCACTTATTCAAGTTTATGATGGCGAG CATTTAGCACTTATAGATCCACTGGCAGAACTGTCATTATTCGATTTTTG GCAAATTTTAAAAGATCCTGCTGTTTTAAAAGTATTTCACTCTCCTTCAG AAGACATAGAAGTTTTTCAAAAGTACGCTGGGTTTGTTCCTACGCCGTTA TTCGATACTCAATTTGCACTGCAAATTTTAGGCGAAGGAAACTGCATGGG CTTTGCCCTTATGGTAAAAACCTTACTGGATATTGAAATAGATAAAAGTG AATCACGTACAAATTGGTTGCAACGGCCATTAACAAATAAACAATTAGAG TACGCTGCTGCCGATGCCTATCATTTATTACCCTGTTTTAATCTTATTAT TGACAGTGTAAAAGCCGCCGATTTATTTAATATTGTTATTAGCGAAAGTG AGTTAGTGGCTAATAAGCGTGAATTTCAAACCCCAGATGAACTGCTCTAT AAAGACATTAAAAATGCGTGGCAACTAAGGCCACATGAACTTGCAATATT AAGAGAGCTGGCTGTTTGGCGTCGAAATAAAGCAATTCGTAAAAATTTAG CACTTAACTTTGTATTAAAAGAACATAATATGACAGAAATTGCTAAACGA GGGCCAGCAAGTTTAAATGCATTAAGGCAAATTCCGGGCGTTGAGGCGAT AGAAGTGAACCGCTCGGGAGTCGAAATACTAAAGTGTATTGAGCAAGCAA AAGCATTGCCTGAGGAGCAACACCCAGCAATTTTAAAGCGTTTAATAGAC TTTCCTAGTTACAAAAAAGTAGCGAAAGAGATAAAACAAAAAATTAATAA AGTTGCCAAAGAACATAATATTCCAGAGGATGTAATGGCTTCTAAAAAGC AGGTTAATCAACTAATTAGTTGGAATTGGAAATTATCTGCAGCACAAAAA GAGCAGCATATTAAACCAGATTTGCTTAGTTCTTGGCGCTATTCTTTTGT AAAAGATACGCTAAAAGAATGGGATGTTTGA >PSHAb0382 rpmJ, 50S ribosomal protein L36 (Ribosomal protein B) ATGAAAGTATTAAGCTCACTTAAAAGTGCTAAGCAGCGTGCAGGGTGTCA AGTTGTAAAACGTAAAGGACGCGTGTTTGTGATTTGTAAGGAGAACCCGC GCTTTAAAGCTGTTCAGGGTATGAAAAAGAAATAG