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COG category: Translation, ribosomal structure and biogenesis
Genomic element: chromosome 1

Number of genes found: 10

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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA2653 Putative tRNA pseudouridine synthase A
ATGCGAATAGCTTTAGGTATTGAGTATGACGGTGCAAAGTACTGTGGTTG
GCAACGTCAAGTCGATGTAGATAGCGTACAAGAACGCTTAGAAAAGGCGC
TATCGCATATCGCAAATAAACCGATTGCCGTATTTTGTGCAGGGCGAACT
GATACAGGTGTTCACGGCACGGGGCAAGTTGTTCACTTCGATGTTGATGT
TGACCGTCAAATGGTTGCATGGACGATTGGGGTTAATGCGCATTTACCTC
GTGATATTTCAGTTCGCTGGGCAACGCAAGTGAGTGATGATTTTCATGCT
CGCTTTAGTGCTACAGCCCGTCGCTATCGTTATATCATCTATAATAGTGC
ACTACGCCCCGCTATTTTTGGTGTGGGTGTTAGCCATTACCACGGGCATT
TAGATGAAAAGAAAATGCACGAAGCTGCACAGTACTTAGTTGGGGAACAT
GATTTTACGTCAGTACGTGCAAGTCAGTGCCAATCTCGTAGCCCATGGCG
CGCGATGAAACATGTAAATGTTAGCCGTCAGGGTGATTTCGTCATCATTG
ATATCAAAGCGAATGCTTTCGTCCATCATATGGTACGTAATATTGCGGGT
AGTTTAATTCGCGTTGGTCGTGGTCAAGAAACACCCGAGTGGATGAAGTG
GGTGCTGGAACAAAAAGATCGTCGTGTGGCGGGTGAAACGGCAAAAGCCG
CTGGATTATATTTGGTTGCCGTTGATTATCCTGAAGAATTTGGTTTGCCG
AGTTCGCCATTAGGGCCTATTTTCCTTCCAGATTAA
>PBPRA2511 NMB2018, putative pseudouridine synthase Rlu family protein
TTGGGTATATACTGCGCGCCTTTAATGTTTTCTCTTTTTTTCTGGATAAT
AATTATGTTCACTCTTGTTCATCAACATCCTGATTTTTTGGTTATTAATA
AACACCCAGGGGTGAGTGTCCATAAAGATGATGGCGATCAGCCTTTACTT
GCTGAAGTGGCAAAGCAGACGGGTGATGAAAAACTCTATTTGATCCATCG
CTTGGATAAAATGACATCAGGTTTATTGTTATTAGGTCGCAATCGTCAAG
CGGCAGCAGAGTTATCAGGCAACTTTGCAAAGCGTGATGTTGAAAAATTT
TACCTTGCTATTGGTACGAAAAAGCCAAAGAAAAAACAAGGTGTTGTGAT
TGGCGACATGAGTCGTTCTCGTCGTAGTAGCTGGAAACTCGACTCGACCA
AAGACAATCCAGCGATTACGCAATTTTTCTCTACAGCGGCAGGCAATGGA
CGCCGCTGTTTTTTATGTAAACCTCATACAGGGAAAACGCATCAAATTCG
AGTCGCACTTAAAAGTGTCGGTTCGGGGATCACGGGTGATGAAATCTACG
GAAATGAAGAAGCAGATCGTGGGTATCTTCATGCTTATGCTTTGTCTTTC
CCTTATAAAGGTGAAAATCAGCAGTTTATTTGTGTGCCCGATAATGGTGA
ACTTTGGCAGGCTGAAGAGGTTAAACAAGCGTTAGCTGAATGGGCGACAC
CTTGGCTGCTAGCCTGGCCTAAATTACCAGGAAAAAGCTAA
>PBPRA2450 RPSA, putative ribosomal protein S1
ATGACTGAATCTTTTGCTTTACTCTTTGAAGAGTCTCTACAGGAAATCGA
AACACGTCCAGGCGCTATCGTTAAAGGTACTGTTATTGCTATCGCGAACG
GTTACGTTCTTGTTGATGCAGGCCTTAAGTCAGAATCTTCTATCCCAGTT
GAAGAATTCAAGAACGCTGCTGGCGAACTTGAAATTGAAGTTGGTGCAGA
AGTTGACGTAGCACTTGATGCTATCGAAGATGGTTTCGGTGAGACTAAAC
TTTCTCGTGAAAAAGCTAAGCGTCATGAAGCTTGGATCCAGCTTGAAAAA
GCTTACGAAGAAGCTGAAACAGTTGTTGGTATCATCAACGGTAAAGTTAA
GGGCGGCTTCACAGTTGAACTTAACGGTATCCGTGCGTTCCTACCTGGTT
CACTAGTAGACGTTCGTCCAGTTCGTGACACTGCTCACCTTGAGAACAAA
GAGCTAGAGTTCAAAGTAATCAAGCTTGATCAGAAGCGTAACAACGTTGT
TGTTTCTCGCCGCGCAGTTATCGAATCTGAAAACAGCGTTGAGCGTGACG
AACTACTTGCTTCTCTACAAGAAGGTATGGAAGTTAAAGGTATCGTTAAG
AACCTTACTGACTACGGCGCATTCGTTGATCTTGGCGGTGTTGATGGTCT
TCTTCACATTACTGATATGGCTTGGAAACGCGTTAAGCACCCAAGCGAAA
TCGTTAATGTTGGCGATGAAATCAACGTTAAAGTTCTTAAGTTCGACCGT
GAGCGTACTCGCGTATCACTAGGTCTTAAGCAACTTGGCGAAGATCCATG
GGTAGCAATCGCTAAGCGTTACCCAGAAAGTACTAAGCTTTCTGGCCGTG
TTACTAACCTTACTGACTACGGTTGCTTCGTTGAAATCGAAGAAGGCGTT
GAAGGTCTTGTACACGTTTCTGAAATGGATTGGACTAACAAAAACATCCA
CCCATCGAAAGTTGTTAACGTTGGTGACGAAGTTGAAGTTATGGTTCTTG
ATATCGACGAAGAACGTCGTCGTATCAGCCTAGGTCTTAAGCAGTGTAAA
GCTAACCCATGGCAGTCATTTGCAGAAATGCAAGCTAAGGGCGATCGCGT
AACTGGTAAGATCAAGTCTATTACTGACTTCGGTATCTTCATCGGTCTTG
ACGGCGGTATCGACGGTCTTGTTCACCTATCTGACATTTCTTGGAATGTT
ACTGGTGAAGATGCAGTTCGTGACTTCAAGAAAGGCGACGAAATTTCTGC
AGTAGTTCTAGCAGTAGACGCAGAGCGTGAGCGTATCTCTCTTGGCATTA
AGCAGATCGAAGAAGACCCATTCAACAGCTACGTAGCTGATAATAAGAAA
GGTGTTCTTGTAAACGGTACTGTTACTGCAGTTGACGCTAAAGGCGCAAC
AGTAGAACTAGCTGTAGGCGTTGAAGGTTACCTTCGCGCTTCTGAAGCAT
CTGTAGATCGTGTTGAAGACGCAACTCTAGTACTTTCTGTTGGCGATTCT
GTTGAAGCTAAATTCACAGGCGTTGATCGTAAGAACCGCGTAGTTAACCT
ATCTGTTCGTGCTAAAGATGTTGCTGAAGAGCAAGAAGCAATGGCTACTC
TGAACAAGCAAGAAGAAGCTTCGTTCGGTAACGCTATGGCTGACGCTTTC
AAAGCTGCTAAAGGCGAATAA
>PBPRA2472 STY4809, putative tRNA-(MS[2]IO[6]A)-hydroxylase
ATGAATAAAACTCAACAGATGATTGACGAGCTACTCTCGCCAATCAAACA
GTTCTTATACTGTGAAACCCCTGATGCGTGGATAAACGAAGCCATTAAAC
CTGAAAACTTAACAGGATTACTGGTCGATCACTGTAACTGCGAGCTAAAA
GCAAGCCAAACGGCCATGTGGCTGATCCGCAAATACGCGGTAGATGCAGA
TAGTGGCAAAGCATTACTCGAATGGGCAAAACCTTATGAAGATTTTGTCT
ATGGCAGAGTGCGAAATACAGACGCCTTTCATGGCAAAAAAAATGGGTTG
TCAGCGCCTTTAGTTGCCAAAGAAGGCTTTGCACATGGTCCTGAACTTAT
CGACAAAATGGTTCGCTTAATCAAAGAAGAGTTCCACCACTTTGAACAAG
TATTAGATATCATGGTAAGCCGTAACATCCCTTACAGTAATTTAAGTGCG
GGACGTTATGCGAAAGGGCTAATGAAAGCGGTTCGTACACACGAACCTGC
AACGTTAATTGATAAGTTGATTGCTGGCGCATATATCGAGGCACGATCTT
GTGAGCGCTTTGCTAAATTAGCCCCATTTTTAGACGACGAATTACAGAAA
TTCTATATTTCATTATTACGCTCAGAAGCGCGTCACTATCAAGATTATTT
ACAACTCGCAGAACAAATTGCAGGGCACAACATTTCAGACCGTATTCGTA
TCATCGGTGAAAAAGAAGCTGCGTTAATTAACTCAGAAGACAATATGTTC
CGATTTCATAGCGGCATACCTGCTGCGTGTTCAGCGGTCTAA
>PBPRA2661 TTE0716, hypothetical protein
ATGGCAGTGGAGATCTTACATCACGGTGCTAAGGTGGGTGTTACTGGCTC
ATGTCATGAAATTAAACTGGGACAGCATGGATTACTCATCGATTGCGGTA
TGTTTCAAGGTGACGAATCTAAAGATGCGTTAGATATCGATTTTCCTATC
GAACATATTCACGCATTGCTTTTAACCCATAGCCACATCGATCATGTTGG
GCGTATTCCTTGGTTATTGGCGGCGGGTTTTAAAGGGAAAATCTATGCAT
CTGAAGCAACTGCGGCTTTATTGCCTTTAATGCTTGCTGATGGGCTAAAA
ATTCAACTTGGTTTTAATCAGCAGCAATGCGATCAATTTACGCTATTAGT
AAAATCACGTTTAAAAGCGATCCCTTATGATTGTTGGGCTCAAATTATTT
TACCATCTGGCGAATTGGTTAAAATTCGATTTCGACCTGCAGGTCATATT
CTAGGTTCAGCGTATATTGAAATAATGCTTTCAACTGGCGAAATAGTGGT
GTTTTCGGGGGATCTTGGGCCGTGTAATACACCATTGTTAGTTGATCCTA
TTTCGCCTGAAATCGTTGATACATTAATCATTGAAAGTACCTATGGTGAT
CAGGTACATCATGGAATTGAAAGGCGAGAAGCTCAGCTTAAGGAAATTAT
CGAGCGTTCGTTAATTGATGGTGGGGTAATACTGATACCTGCTTTTAGTG
TTGGTCGTACACAAGAGCTATTGTTTGATATTGAAAATATTATTGCGGCG
TCTAACGTCAAAAATGAGGCTGTGAATTGGCAAGAAATTCCGGTCATACT
CGATTCGCCTTTAGCCGGGGAAATTACAGCGCAATACCGAAATTTTAAAA
TGCTATGGACAAAAGAAGCGAAAGAACGAAAACAACAAGGGCGTCACCCG
TTGTCTTTTTCTCAATGTATTACGATTGAGCTGCATAGTGATCATCAGGC
GTTAGTAAACAGGCTTAAAATTTCGGGTGAAGCTGCGATAGTGGTGGCAG
CCAGTGGTATGTGTGCTGGTGGGCGGATTGTTAATTATCTTGAAGCGTTA
CTGCCAGATAAAAGAACTGATGTCATTATGATCGGTTATCAGGCAAGGGG
CACATTAGGGCGAGATTTATATAGTGGCAAGTGTGTGATTACAATTAATA
AAACGGTTATAAACGTGAAAGCCAAAATACATACGATGTCTGGTTACTCT
GCTCATGCTGATCAGGCTGACTTATTAAAATTTGTGGGTGGAATTAAACA
AGGCCCCCAAACAATTCATGTTGTGCATGGTGATAAACAGGCTCAGTTAG
CCTTCGCAGAATTACTTCAGCAAATAAAACCACAAGCTAAAATAGTGACT
GGGTTTTCTTAA
>PBPRA2482 VV1227, putative pseudouridine synthase family 1 protein
TTGTCTATAATGAGTGAAAAGTTACAGAAGGTGCTAGCGCGTGCTGGCCA
AGGGTCTCGTCGTGAGATCGAATTAATGATTCAAAGCGGTCGTGTGAGCA
TTGACGGCGTAGTCGCGAAATTGGGTGATCGTCTAGACGATTTTTCTGTT
CTCGTGCGTATCGATGGTCACAAGATTGATCTGGTTTCGCCTTCTGAGGA
AGTGTGTCGTGTTCTTGCTTATAACAAACCTGAAGGTGAGTTATGTACGC
GTCACGATCCTGAAGGTCGCCGGACTGTATTTGATCGTTTACCCCGTCTA
TCAAGTGGTCGTTGGGTTTCGGTTGGTCGATTGGATGCAAATACCTCAGG
TCTATTGTTATTTACCACTGATGGTGAATTAGCTAACCGCCTGATGCACC
CAAGCCGAAGTGTTGAACGTGAATACATGGTTCGCGTTTTCGGTGAGATT
AACGAAAATATGGTTAAGAACCTAGTTCAAGGTGTTGAACTAGAAGATGG
TATGGCACGTTTCGAAGACGTTGTGTATTCTGGCGGCGAAGGTATGAACC
ATACTTTCTACGTTGTGATCACAGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGT
TTGTGGGATTCACAAGGCGTAACAGTAAGTCGTCTAAAGCGTGTACGTTA
TGGTGATATCTATCTAACGAAAGATATGCCTCGTGGCGGTTGGATGGAGC
TCGAGCTGAAAGAAGTTAACTATCTTCGTGAAGTGGTAGAGCTTGAAGCT
GAAGAAAACACAATGTTGACGGTCGAAGGCCTGAAGCGTAAACGTGGTGT
TCGTCAGATTCGTCGTGCCGTACGTCGTCACGAAGAACGTGTTACTGAAA
CACCTCGTGGTCGTCGTGGTCGCACGAATACCCCTGATGAACGTCGTTCT
TCAACGCGTAACAGTGAAGCTGAAGGGCAAAATGTACCAGTTGGGAAGCG
TAAGCCGTCAGGTAAGCCTTCAACGGCTAAGCCGACACGCGGCAAGCCAT
CTGCTGGTAAGCCAGCGCAAGGCAATCGTCGTAAAACAGACGATTGCAAT
GAGCCAGCAGGTAAGCGTAAACCGTCAGGTAATGGTGCTCAACGTCGTAA
CCCATTAGCGGTTAAGCCACGTACGCGTCAATAA
>PBPRA2613 VV2126, putative regulator protein
ATGCGAGAGATGCTAACAAACATCAATGATTACGATCTTTGCGTCACAGA
GTTCGTTCGGATTATTGATAGCTTATTACCCAGTAGTGTTTTTTATCGCC
TGTGTCCAGAGCTTCACCATGGTGGAAAAACAACATCAGGTACACCTGTG
CGTGTTCAACTGTTAGGTCAAGAGCCTGTATGGATGGCTGAAAATGCATA
CCGCGCAAGTAATCTTGGCTCGGCGGGTATCGATATTAATTTTGGTTGCC
CAGCGAAGTCGGTAAATAAGAATCGCGGTGGTGCAGTTCTGCTTAAAGAA
CCCGAAAAGATTTACCAAATAGTCAAAGAAGTGCGTAGTGCTGTTTGCCC
AACGAAACCTGTAACAGCAAAAGTCCGTTTAGGGTGGGATGACCCAACGC
ACTGCTTTGAAATTGTCGATGCCGTGGCACAGGCTGGCGGTGATGAAATT
GCCATTCATGCCCGTACAAAAGTCGATGGCTATAAAGCCGAAACAATAAA
GTGGGACTACATCCATCAAGTAAAAGAAAAAAGTTCTATTCCCATTATTG
CTAATGGTGAAGTCTGGAACTACCAAGACGGACAAGCATGCTTAAACGTT
ACTCAAACAGATGCATTGATGATTTGCCGTGGTGCACTCAATTTACCCAA
CCTGTGTAATGTCATAAAACGCAATGAAGCACATATGCCATGGCACCATG
TTATTCAGCTATTGCTTAAGTTTTCTGAATTTGAAATCAAAGGTGATAAA
GGGCTCTACTACCCTAACCGCGTTAAACAATGGTTTGCCTACCTGCGTCA
TGAGTATCCTGAGGCTAAAGACTTATTTGTCGACATTCGCAGTTTGAATA
AAGCAGCGCCCATTGTTGAAATTCTGCAACGGGCTCAGGCATTAGCACAT
GCTTAA
>PBPRA2483 Y2053, putative translation factor
ATGAGCCAGTTTTTTTATGTTCACCCTGAAACCCCGCAAGCCCGTTTAAT
GACGCAGGCGGTTGCGATTATTCGCAATGGTGGCGTTGTCGTGTATCCAA
CCGATTCAGGGTATGCATTGGGTTGTCAACTTGAGAATAAACAAGCACTT
GAACGCATTTGCCAGATCCGTCGACTAAACGATAAGCACAATTTTACATT
GTTGTGTCGTGATTTGTCTGAAATTGCCAACTATGCACGTGTTGATAATG
CGGCATTCCGTTTGTTACGTAGCAATACACCAGGCGCGTACACGTTTATT
TTCAAAGGTACGAAAGAAGTGCCCCGTCGTTTAATGAGTCCTAAACGTAA
AACCATTGGTATCCGTATTCCTAATAATGCGATTGCTTTAGCTCTGCTTG
AAGAGTTAGGTGAGCCATTAATGTCGACCAGTTTAATTTTGCCTAATAGC
GATGTTGCTGAATCTGACCCTGAAGATATCCGCGATAAGTTAGAGCATGC
GGTCGATTTAATCATGAATGGTGGTTATTTAGGCGAGCAACCGACTACCG
TGATTGATTTTAGTAATGATGAAATGGAAGTGTTACGAGTGGGTGCGGGT
GATCCTGCACCTTTTAGCTAA
>PBPRA2432 Y2271, Hypothetical ribosomal-protein-alanine acetyltransferase
TTGTTTAACTCAATTATAAACCGCTCTACAACATTAGTGGTTGATGAACT
TAAGATTCGTTTGATCGGTAACAAAGATTCTGCTCGAATTACAGCTTATT
ACCAAAAAAATCGAGCATATCTACAGCCTTGGGAACCGTTACGTGATGAG
AATTTTTTCTTACCTGAAGGGTGGGAGAAAAGGTTGTTACAACTTAACGA
ACTTCATAAACATAATCTTGCTTATTATTTTGTTATTACGACGAAAGATT
CAGATGACATAATAGGGGTTATTAACTTCAGTAATTTAGTGAAGCACCCA
TTTTATGCGTGTCATGTAGGTTATTCATTGGCAGAAGCTTATCAAGGTAA
AGGTATTATGCATCGTGCTCTTGATGTAGTTGTCGAGTGGATATTTGCAG
AGAAGCAGTTTCATCGCATTATGGCCGCCTATATGCCAAGAAATAAACGC
AGTGGTAAAGTGTTAGAAGATTTAGGCTTTGAAAAAGAAGGCAGAGCAAA
AGAGTATTTATTGATCAATGGTAAATGGGAAGATCATATACTTACCGCAA
AAACAAATCATAACTGGGTGCCACCTAAGTAG
>PBPRA2596 YPO2161, putative L-asparaginase I
ATGCCGGAATTTCACCGTTCGGAAATGCCAGAATTTACTATCCACGAATA
CGAGCCGCTTATTGACTCGTCTGATATGTCGCCAGAGGATTGGCAGCGTA
TCGCGGATGATATTAAAGCAAACTACGACAAGTATGACGGTTTTGTCATT
TTGCATGGTACGGACACCATGGCTTACACTGCTTCAGCTTTGTCGTTTAT
GTTTGAGAACCTAGATAAACCCGTTATTGTAACAGGATCACAAATTCCTT
TAGCGGAATTACGTTCTGATGGGCAAAGTAATCTATTGAATTCACTTCAT
ATTGCGGCTAATTACCCAATCAATGAAGTAACCTTGTTCTTCAATAACCA
GCTAATTCGTGGAAACCGAAGCACCAAAGCACATGCTGACGGCTTTGGTG
CTTTCATTTCACCTAACATGCCCCCTTTGCTTGAAGCTGGTATTAATATC
AAGTTGAACAATATTGAACTTGATAAGAAACCTGAAGGTGATTTTAAGGT
CAATGCAATAACACCACAGCCTATTGGTGTCATTACAATGTACCCTGGCA
TTTCACCTGAAGTGATTCGTAATACTTTACGCCAACCTGTTAATGCAATG
ATTTTGCTGACATTTGGTGTAGGTAACGCACCGCAAAACCCCGATTTACT
GGCTCAACTGAAAGAAGCAAGTGAACGTGGCGTGATTGTAATGAACCTTA
CGCAATGCCTTTCTGGCAAAGTGAATATGGGGGGTTACGCGACAGGCTGT
GCACTCGCTGATGCTGGTGTGTTAAGCGGTTATGATATGACCCTTGAAGC
AGCACTCGCTAAACTGCACTACTTGTTAAGTACCGATTTTCCGGTAGAAA
CGATTCGCAGTATGATGCAGCAAGATTTACGTGGTGAACTTAGCCTGTAA