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COG category: Translation, ribosomal structure and biogenesis
Genomic element: chromosome 1
Number of genes found: 10
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# Photobacterium profundum, ss9 >PBPRA2653 Putative tRNA pseudouridine synthase A ATGCGAATAGCTTTAGGTATTGAGTATGACGGTGCAAAGTACTGTGGTTG GCAACGTCAAGTCGATGTAGATAGCGTACAAGAACGCTTAGAAAAGGCGC TATCGCATATCGCAAATAAACCGATTGCCGTATTTTGTGCAGGGCGAACT GATACAGGTGTTCACGGCACGGGGCAAGTTGTTCACTTCGATGTTGATGT TGACCGTCAAATGGTTGCATGGACGATTGGGGTTAATGCGCATTTACCTC GTGATATTTCAGTTCGCTGGGCAACGCAAGTGAGTGATGATTTTCATGCT CGCTTTAGTGCTACAGCCCGTCGCTATCGTTATATCATCTATAATAGTGC ACTACGCCCCGCTATTTTTGGTGTGGGTGTTAGCCATTACCACGGGCATT TAGATGAAAAGAAAATGCACGAAGCTGCACAGTACTTAGTTGGGGAACAT GATTTTACGTCAGTACGTGCAAGTCAGTGCCAATCTCGTAGCCCATGGCG CGCGATGAAACATGTAAATGTTAGCCGTCAGGGTGATTTCGTCATCATTG ATATCAAAGCGAATGCTTTCGTCCATCATATGGTACGTAATATTGCGGGT AGTTTAATTCGCGTTGGTCGTGGTCAAGAAACACCCGAGTGGATGAAGTG GGTGCTGGAACAAAAAGATCGTCGTGTGGCGGGTGAAACGGCAAAAGCCG CTGGATTATATTTGGTTGCCGTTGATTATCCTGAAGAATTTGGTTTGCCG AGTTCGCCATTAGGGCCTATTTTCCTTCCAGATTAA >PBPRA2511 NMB2018, putative pseudouridine synthase Rlu family protein TTGGGTATATACTGCGCGCCTTTAATGTTTTCTCTTTTTTTCTGGATAAT AATTATGTTCACTCTTGTTCATCAACATCCTGATTTTTTGGTTATTAATA AACACCCAGGGGTGAGTGTCCATAAAGATGATGGCGATCAGCCTTTACTT GCTGAAGTGGCAAAGCAGACGGGTGATGAAAAACTCTATTTGATCCATCG CTTGGATAAAATGACATCAGGTTTATTGTTATTAGGTCGCAATCGTCAAG CGGCAGCAGAGTTATCAGGCAACTTTGCAAAGCGTGATGTTGAAAAATTT TACCTTGCTATTGGTACGAAAAAGCCAAAGAAAAAACAAGGTGTTGTGAT TGGCGACATGAGTCGTTCTCGTCGTAGTAGCTGGAAACTCGACTCGACCA AAGACAATCCAGCGATTACGCAATTTTTCTCTACAGCGGCAGGCAATGGA CGCCGCTGTTTTTTATGTAAACCTCATACAGGGAAAACGCATCAAATTCG AGTCGCACTTAAAAGTGTCGGTTCGGGGATCACGGGTGATGAAATCTACG GAAATGAAGAAGCAGATCGTGGGTATCTTCATGCTTATGCTTTGTCTTTC CCTTATAAAGGTGAAAATCAGCAGTTTATTTGTGTGCCCGATAATGGTGA ACTTTGGCAGGCTGAAGAGGTTAAACAAGCGTTAGCTGAATGGGCGACAC CTTGGCTGCTAGCCTGGCCTAAATTACCAGGAAAAAGCTAA >PBPRA2450 RPSA, putative ribosomal protein S1 ATGACTGAATCTTTTGCTTTACTCTTTGAAGAGTCTCTACAGGAAATCGA AACACGTCCAGGCGCTATCGTTAAAGGTACTGTTATTGCTATCGCGAACG GTTACGTTCTTGTTGATGCAGGCCTTAAGTCAGAATCTTCTATCCCAGTT GAAGAATTCAAGAACGCTGCTGGCGAACTTGAAATTGAAGTTGGTGCAGA AGTTGACGTAGCACTTGATGCTATCGAAGATGGTTTCGGTGAGACTAAAC TTTCTCGTGAAAAAGCTAAGCGTCATGAAGCTTGGATCCAGCTTGAAAAA GCTTACGAAGAAGCTGAAACAGTTGTTGGTATCATCAACGGTAAAGTTAA GGGCGGCTTCACAGTTGAACTTAACGGTATCCGTGCGTTCCTACCTGGTT CACTAGTAGACGTTCGTCCAGTTCGTGACACTGCTCACCTTGAGAACAAA GAGCTAGAGTTCAAAGTAATCAAGCTTGATCAGAAGCGTAACAACGTTGT TGTTTCTCGCCGCGCAGTTATCGAATCTGAAAACAGCGTTGAGCGTGACG AACTACTTGCTTCTCTACAAGAAGGTATGGAAGTTAAAGGTATCGTTAAG AACCTTACTGACTACGGCGCATTCGTTGATCTTGGCGGTGTTGATGGTCT TCTTCACATTACTGATATGGCTTGGAAACGCGTTAAGCACCCAAGCGAAA TCGTTAATGTTGGCGATGAAATCAACGTTAAAGTTCTTAAGTTCGACCGT GAGCGTACTCGCGTATCACTAGGTCTTAAGCAACTTGGCGAAGATCCATG GGTAGCAATCGCTAAGCGTTACCCAGAAAGTACTAAGCTTTCTGGCCGTG TTACTAACCTTACTGACTACGGTTGCTTCGTTGAAATCGAAGAAGGCGTT GAAGGTCTTGTACACGTTTCTGAAATGGATTGGACTAACAAAAACATCCA CCCATCGAAAGTTGTTAACGTTGGTGACGAAGTTGAAGTTATGGTTCTTG ATATCGACGAAGAACGTCGTCGTATCAGCCTAGGTCTTAAGCAGTGTAAA GCTAACCCATGGCAGTCATTTGCAGAAATGCAAGCTAAGGGCGATCGCGT AACTGGTAAGATCAAGTCTATTACTGACTTCGGTATCTTCATCGGTCTTG ACGGCGGTATCGACGGTCTTGTTCACCTATCTGACATTTCTTGGAATGTT ACTGGTGAAGATGCAGTTCGTGACTTCAAGAAAGGCGACGAAATTTCTGC AGTAGTTCTAGCAGTAGACGCAGAGCGTGAGCGTATCTCTCTTGGCATTA AGCAGATCGAAGAAGACCCATTCAACAGCTACGTAGCTGATAATAAGAAA GGTGTTCTTGTAAACGGTACTGTTACTGCAGTTGACGCTAAAGGCGCAAC AGTAGAACTAGCTGTAGGCGTTGAAGGTTACCTTCGCGCTTCTGAAGCAT CTGTAGATCGTGTTGAAGACGCAACTCTAGTACTTTCTGTTGGCGATTCT GTTGAAGCTAAATTCACAGGCGTTGATCGTAAGAACCGCGTAGTTAACCT ATCTGTTCGTGCTAAAGATGTTGCTGAAGAGCAAGAAGCAATGGCTACTC TGAACAAGCAAGAAGAAGCTTCGTTCGGTAACGCTATGGCTGACGCTTTC AAAGCTGCTAAAGGCGAATAA >PBPRA2472 STY4809, putative tRNA-(MS[2]IO[6]A)-hydroxylase ATGAATAAAACTCAACAGATGATTGACGAGCTACTCTCGCCAATCAAACA GTTCTTATACTGTGAAACCCCTGATGCGTGGATAAACGAAGCCATTAAAC CTGAAAACTTAACAGGATTACTGGTCGATCACTGTAACTGCGAGCTAAAA GCAAGCCAAACGGCCATGTGGCTGATCCGCAAATACGCGGTAGATGCAGA TAGTGGCAAAGCATTACTCGAATGGGCAAAACCTTATGAAGATTTTGTCT ATGGCAGAGTGCGAAATACAGACGCCTTTCATGGCAAAAAAAATGGGTTG TCAGCGCCTTTAGTTGCCAAAGAAGGCTTTGCACATGGTCCTGAACTTAT 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CTAGGTTCAGCGTATATTGAAATAATGCTTTCAACTGGCGAAATAGTGGT GTTTTCGGGGGATCTTGGGCCGTGTAATACACCATTGTTAGTTGATCCTA TTTCGCCTGAAATCGTTGATACATTAATCATTGAAAGTACCTATGGTGAT CAGGTACATCATGGAATTGAAAGGCGAGAAGCTCAGCTTAAGGAAATTAT CGAGCGTTCGTTAATTGATGGTGGGGTAATACTGATACCTGCTTTTAGTG TTGGTCGTACACAAGAGCTATTGTTTGATATTGAAAATATTATTGCGGCG TCTAACGTCAAAAATGAGGCTGTGAATTGGCAAGAAATTCCGGTCATACT CGATTCGCCTTTAGCCGGGGAAATTACAGCGCAATACCGAAATTTTAAAA TGCTATGGACAAAAGAAGCGAAAGAACGAAAACAACAAGGGCGTCACCCG TTGTCTTTTTCTCAATGTATTACGATTGAGCTGCATAGTGATCATCAGGC GTTAGTAAACAGGCTTAAAATTTCGGGTGAAGCTGCGATAGTGGTGGCAG CCAGTGGTATGTGTGCTGGTGGGCGGATTGTTAATTATCTTGAAGCGTTA CTGCCAGATAAAAGAACTGATGTCATTATGATCGGTTATCAGGCAAGGGG CACATTAGGGCGAGATTTATATAGTGGCAAGTGTGTGATTACAATTAATA AAACGGTTATAAACGTGAAAGCCAAAATACATACGATGTCTGGTTACTCT GCTCATGCTGATCAGGCTGACTTATTAAAATTTGTGGGTGGAATTAAACA AGGCCCCCAAACAATTCATGTTGTGCATGGTGATAAACAGGCTCAGTTAG CCTTCGCAGAATTACTTCAGCAAATAAAACCACAAGCTAAAATAGTGACT GGGTTTTCTTAA >PBPRA2482 VV1227, putative pseudouridine synthase family 1 protein TTGTCTATAATGAGTGAAAAGTTACAGAAGGTGCTAGCGCGTGCTGGCCA AGGGTCTCGTCGTGAGATCGAATTAATGATTCAAAGCGGTCGTGTGAGCA TTGACGGCGTAGTCGCGAAATTGGGTGATCGTCTAGACGATTTTTCTGTT CTCGTGCGTATCGATGGTCACAAGATTGATCTGGTTTCGCCTTCTGAGGA AGTGTGTCGTGTTCTTGCTTATAACAAACCTGAAGGTGAGTTATGTACGC GTCACGATCCTGAAGGTCGCCGGACTGTATTTGATCGTTTACCCCGTCTA TCAAGTGGTCGTTGGGTTTCGGTTGGTCGATTGGATGCAAATACCTCAGG TCTATTGTTATTTACCACTGATGGTGAATTAGCTAACCGCCTGATGCACC CAAGCCGAAGTGTTGAACGTGAATACATGGTTCGCGTTTTCGGTGAGATT AACGAAAATATGGTTAAGAACCTAGTTCAAGGTGTTGAACTAGAAGATGG TATGGCACGTTTCGAAGACGTTGTGTATTCTGGCGGCGAAGGTATGAACC ATACTTTCTACGTTGTGATCACAGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGT TTGTGGGATTCACAAGGCGTAACAGTAAGTCGTCTAAAGCGTGTACGTTA TGGTGATATCTATCTAACGAAAGATATGCCTCGTGGCGGTTGGATGGAGC TCGAGCTGAAAGAAGTTAACTATCTTCGTGAAGTGGTAGAGCTTGAAGCT GAAGAAAACACAATGTTGACGGTCGAAGGCCTGAAGCGTAAACGTGGTGT TCGTCAGATTCGTCGTGCCGTACGTCGTCACGAAGAACGTGTTACTGAAA CACCTCGTGGTCGTCGTGGTCGCACGAATACCCCTGATGAACGTCGTTCT TCAACGCGTAACAGTGAAGCTGAAGGGCAAAATGTACCAGTTGGGAAGCG TAAGCCGTCAGGTAAGCCTTCAACGGCTAAGCCGACACGCGGCAAGCCAT CTGCTGGTAAGCCAGCGCAAGGCAATCGTCGTAAAACAGACGATTGCAAT GAGCCAGCAGGTAAGCGTAAACCGTCAGGTAATGGTGCTCAACGTCGTAA CCCATTAGCGGTTAAGCCACGTACGCGTCAATAA >PBPRA2613 VV2126, putative regulator protein ATGCGAGAGATGCTAACAAACATCAATGATTACGATCTTTGCGTCACAGA GTTCGTTCGGATTATTGATAGCTTATTACCCAGTAGTGTTTTTTATCGCC TGTGTCCAGAGCTTCACCATGGTGGAAAAACAACATCAGGTACACCTGTG CGTGTTCAACTGTTAGGTCAAGAGCCTGTATGGATGGCTGAAAATGCATA CCGCGCAAGTAATCTTGGCTCGGCGGGTATCGATATTAATTTTGGTTGCC CAGCGAAGTCGGTAAATAAGAATCGCGGTGGTGCAGTTCTGCTTAAAGAA CCCGAAAAGATTTACCAAATAGTCAAAGAAGTGCGTAGTGCTGTTTGCCC AACGAAACCTGTAACAGCAAAAGTCCGTTTAGGGTGGGATGACCCAACGC ACTGCTTTGAAATTGTCGATGCCGTGGCACAGGCTGGCGGTGATGAAATT GCCATTCATGCCCGTACAAAAGTCGATGGCTATAAAGCCGAAACAATAAA GTGGGACTACATCCATCAAGTAAAAGAAAAAAGTTCTATTCCCATTATTG CTAATGGTGAAGTCTGGAACTACCAAGACGGACAAGCATGCTTAAACGTT ACTCAAACAGATGCATTGATGATTTGCCGTGGTGCACTCAATTTACCCAA CCTGTGTAATGTCATAAAACGCAATGAAGCACATATGCCATGGCACCATG TTATTCAGCTATTGCTTAAGTTTTCTGAATTTGAAATCAAAGGTGATAAA GGGCTCTACTACCCTAACCGCGTTAAACAATGGTTTGCCTACCTGCGTCA TGAGTATCCTGAGGCTAAAGACTTATTTGTCGACATTCGCAGTTTGAATA AAGCAGCGCCCATTGTTGAAATTCTGCAACGGGCTCAGGCATTAGCACAT GCTTAA >PBPRA2483 Y2053, putative translation factor ATGAGCCAGTTTTTTTATGTTCACCCTGAAACCCCGCAAGCCCGTTTAAT GACGCAGGCGGTTGCGATTATTCGCAATGGTGGCGTTGTCGTGTATCCAA CCGATTCAGGGTATGCATTGGGTTGTCAACTTGAGAATAAACAAGCACTT GAACGCATTTGCCAGATCCGTCGACTAAACGATAAGCACAATTTTACATT GTTGTGTCGTGATTTGTCTGAAATTGCCAACTATGCACGTGTTGATAATG CGGCATTCCGTTTGTTACGTAGCAATACACCAGGCGCGTACACGTTTATT TTCAAAGGTACGAAAGAAGTGCCCCGTCGTTTAATGAGTCCTAAACGTAA AACCATTGGTATCCGTATTCCTAATAATGCGATTGCTTTAGCTCTGCTTG AAGAGTTAGGTGAGCCATTAATGTCGACCAGTTTAATTTTGCCTAATAGC GATGTTGCTGAATCTGACCCTGAAGATATCCGCGATAAGTTAGAGCATGC GGTCGATTTAATCATGAATGGTGGTTATTTAGGCGAGCAACCGACTACCG TGATTGATTTTAGTAATGATGAAATGGAAGTGTTACGAGTGGGTGCGGGT GATCCTGCACCTTTTAGCTAA >PBPRA2432 Y2271, Hypothetical ribosomal-protein-alanine acetyltransferase TTGTTTAACTCAATTATAAACCGCTCTACAACATTAGTGGTTGATGAACT TAAGATTCGTTTGATCGGTAACAAAGATTCTGCTCGAATTACAGCTTATT ACCAAAAAAATCGAGCATATCTACAGCCTTGGGAACCGTTACGTGATGAG AATTTTTTCTTACCTGAAGGGTGGGAGAAAAGGTTGTTACAACTTAACGA ACTTCATAAACATAATCTTGCTTATTATTTTGTTATTACGACGAAAGATT CAGATGACATAATAGGGGTTATTAACTTCAGTAATTTAGTGAAGCACCCA TTTTATGCGTGTCATGTAGGTTATTCATTGGCAGAAGCTTATCAAGGTAA AGGTATTATGCATCGTGCTCTTGATGTAGTTGTCGAGTGGATATTTGCAG AGAAGCAGTTTCATCGCATTATGGCCGCCTATATGCCAAGAAATAAACGC AGTGGTAAAGTGTTAGAAGATTTAGGCTTTGAAAAAGAAGGCAGAGCAAA AGAGTATTTATTGATCAATGGTAAATGGGAAGATCATATACTTACCGCAA AAACAAATCATAACTGGGTGCCACCTAAGTAG >PBPRA2596 YPO2161, putative L-asparaginase I ATGCCGGAATTTCACCGTTCGGAAATGCCAGAATTTACTATCCACGAATA CGAGCCGCTTATTGACTCGTCTGATATGTCGCCAGAGGATTGGCAGCGTA TCGCGGATGATATTAAAGCAAACTACGACAAGTATGACGGTTTTGTCATT TTGCATGGTACGGACACCATGGCTTACACTGCTTCAGCTTTGTCGTTTAT GTTTGAGAACCTAGATAAACCCGTTATTGTAACAGGATCACAAATTCCTT TAGCGGAATTACGTTCTGATGGGCAAAGTAATCTATTGAATTCACTTCAT ATTGCGGCTAATTACCCAATCAATGAAGTAACCTTGTTCTTCAATAACCA GCTAATTCGTGGAAACCGAAGCACCAAAGCACATGCTGACGGCTTTGGTG CTTTCATTTCACCTAACATGCCCCCTTTGCTTGAAGCTGGTATTAATATC AAGTTGAACAATATTGAACTTGATAAGAAACCTGAAGGTGATTTTAAGGT CAATGCAATAACACCACAGCCTATTGGTGTCATTACAATGTACCCTGGCA TTTCACCTGAAGTGATTCGTAATACTTTACGCCAACCTGTTAATGCAATG ATTTTGCTGACATTTGGTGTAGGTAACGCACCGCAAAACCCCGATTTACT GGCTCAACTGAAAGAAGCAAGTGAACGTGGCGTGATTGTAATGAACCTTA CGCAATGCCTTTCTGGCAAAGTGAATATGGGGGGTTACGCGACAGGCTGT GCACTCGCTGATGCTGGTGTGTTAAGCGGTTATGATATGACCCTTGAAGC AGCACTCGCTAAACTGCACTACTTGTTAAGTACCGATTTTCCGGTAGAAA CGATTCGCAGTATGATGCAGCAAGATTTACGTGGTGAACTTAGCCTGTAA