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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_pd09 unknown
ATGAGCTCATTGATACATGTTACAATAATCACAATAATATTATATGTGCC
TAAAAATAAGCATATTACTATTTCAGATCTGAGTATATATGATGGGATAA
CACTCGTTCCTAAAAGCGGTGTATATAGCAAAATGGATGAGACTCGTGTA
TTTAATAAAGAGGCATTTGAAACCATTGAACTAGAAATCAATCCTCCCGA
CACCTCAAGCAATGCTTCGGATGATTCAGATGGTATTTCATCTACTTCGG
ATCAGCTGTCTAGCGATTCTTCAAGCGTTTTATGCAGTTCTTGCTGTAGT
TCTTTAGATATTTCAGATTTTTTATCATCTGATGATGATATGGACCTGAC
GGGTAACAATGCCGCTGATTTAGCAAATAACTAA
>RF_pd12 unknown
ATGTTTAAAATAAAAAATATTACAAAAAGCATCAAGCACATAAAGAAAAT
ACTAACACCTAGTTCTCACAAAACGACATGTTCTAGCATAGTAGCATCGA
CATTTGATATGGAGACATCTAATAAAATTACCTCTGACTTTGGTTTTAGT
AAAAAGTATGTTGTGAATAACAGTAAAGAGATAGATTGGGTAGGAATCAG
GAAAGCAATATATAACAGATTTTCTGATGAGATCGATGCCACAAATATAC
AGAGCTTGGAGCAAGTTACGCCACTTGTTGCATCGAAACAACAAGGGTTT
AGTGCTACGAATGTAAATATCAATTGGGCAGAGATTAGGGCATTAATATA
TAACAGGTTTGCGGATGAAATACATGCGTGGAGCAAGAAGCAGCATGGTG
ATATTATAAAATATAGTCCAGTGAGAGATGTGAATGAAGAACTGGAGATA
ATAAAAGAGCAGGGATATAGTTTTGCAAAACAAAAAGCTGCTTTAAAAAG
GAGTATCACAGATAAATGGGACGAGATTGAGAGAATAAAATATTTGTCTC
AGGACACATCATGGAATACCAAGAGTCAACAGAAGCTATTATCACATGAT
AATAGTATTATTGGTAGAATGAAATTCTTGTCTATTAAGGGTTACTTATC
AAATTATGCTGGAGATGATGAGTTGTCACAATCCATCGATTCAGTAATCA
AAATTAAAGATACATTGATCACAGAGTTTATGAATAGAGTCTATGATAAG
CATATGCATGCTACAGCGGCTCGGCAAAATGTAGCGGAGGCAATAACATT
TGACAGTTTAATAGATGAGCAAGAAGTGATGGTATTAGGAGAATAA
>RF_pd59 unknown
ATGGAGATTAATGGTAAAAAAGCTAAAATATATTACAGTGATAGTGCTTC
GGCAGATGGGCCAGATTATGCTATTATAGATATTTCTAGTAAGAAGGCTA
AATATAAAAAAGCTACATATGACACTTCAAACCCCTCTAGCTCACATTCT
GACGATCACGAAAGAATGGAGTTAATAAATTCAAGTGATAACTCTATACA
AGATAACATTAATGTCATATCTTATAGTATTGTTAGTGCTGCGGCAAACA
AAACAGATTATATAAATACGTCTAGTAAAAGAGACAGATAA
>RF_pd01 Transposase
ATGCCATACAAAGAAAGAGCAAAAACAGGTTTACCAAGAAATGTAGATAA
ACCAAAATATAAAGTAACCAACTGGTCGCAATATAACAAGAGTTTAAGAC
AAAGAGGGATGATCAGCCTGTATTTTCCTGAAGGCGATTTAGAGTCTTTA
TTCATTAATGTCGAACCTTACGTAGAGGGAGAATCTGGGAGGGCAACGAC
ATACCAAGTACCATATATACAACTAATTTATACATTATATCGTTTATTTG
GTTTCGGACAGCGTCAAATAACAGGTTACTTGTGGTTTATTTTCGCAGAC
TCTATTAGAGGTCAAACAGTTTTGCAATAA
>RF_pd68 unknown
ATGGCTAAAGGATGGATTAAGGAGCAAGAAGAAAGCTTAATAACACAAAT
ATTAGCGGGTAAATTTTATCACAACTTATCTAATGAGATTCCTTGTGATA
GTCTGCCAGTTTTACAATCACCGAGTAATACCCAATATTGGGGTAACGAA
AATCCTTCTGTTAGTTCAGTATTACTTGCTGATATTGTTGCTAGTTGTAA
TAAGAAGCAAGATAATCTAGCTGGAGCTGCCACTTTCTTTCCTTTTATAG
ATAGTAGCTATGCATTACCTGATAGTATTGTTCCCGCATCATATTCGTTT
GCTACTAAAAATGGTATGACACTTTTTGGTGATTATCAGTATGGTGCCCA
TCGTTATTTTAAGGAACAATTAGTGTTTGGTCCTGAGGATTGTTCTACTG
CGGTAGGTAAAGCAACTTATCTGACTACCGATCAAATTAAAGATATAAAT
ACTACCAACATGCAAGCAGCGTATGAGGCCAGTATAGAAACAGGGAGCCC
AGACCCTAAATATCACTATCAAGCGGTAACTTTTTTAAGTGGTGATATTC
AAGATAGCCAGTTGAGATTAATTCAAGAAGGTGATATTTATCTTGTAAAG
GGTCACACAGCTCTTATTGCTACCAAACCTGATAGTAGAAGTACAATTAC
TACTATACAGTTTAATAGAGATATAGACTCGGCTGAAAATAAAATATTAG
GAGGTGGTACATATGATTATAATTTATGTGATAAAGCTAAAGAAATAAAA
ACTGGTATTTATATTTTACGTCCTACTACTGTACAACCTTTACATAAATC
TTATTCTTTGGGTGAATTGTTGAATCAAATTGACTCAAAATATTTAACTC
TTTTTCCTGATGGTCCTACAAATATTTCAGGAGATTGTAGAATATTTCTT
GAGGACAATACTACAAACATAGTTGGAGACACTGGTTATAGTACTGGACA
GTTTTAG
>RF_pd50 unknown
ATGAAAAGGGTGTGTATGAGTAAATTACTTGGTGGTTGGAGTATGTCTTT
AACTCGTTACCCATTTAATGAATTTGACTATATAATGTATGGTATGGTGA
CAAATCTTGAAGAACTAACAACAGGAAGCATGGCTTCTCCGGGGTGGAGT
CCAGAAAATGAACAAAAACCAGATAATAATCCTTGTTTTACAGGTAAAAG
GCTTTGGGTTTATGGCGGGGGAGGATGTGCTCCTGAAGAAAAGCCCTCTA
GTATGAATGACGTATCCCGCATTATATCTGCGACCATTAATAATGGTTGG
GATGGTGTTGATTTTGATGACGAGTGTAATATGAACACTGCATTTGTTAT
AAAAACAATGGAAAAACTCAAAGAAAATAGTAAAGAAACCAGTTTTGGTT
TTATTGCAGGTTATTCTTATAACCATCCCAATACAGAAAAAGGGAAGAAG
ATTACCGACAAAGTTAAGGCGATTATCGCATCAGGTCAATGTGATAGATT
AGTGCATTATTGTTACGCTGCCGCAATGTGGAATCAAAATGATATTATCA
ATAATGTAAAACAAGCATTAGTACAAAGCATCTCTTATGGCATAGAACAA
GATAAAATTGTGTTAGCCTTGACTACTTTGGGTCTGACAGACTGGAATTT
AAATTACTTTCTAGATCAAATTATTGATTTGAATTTAGGGGGGTTATTTA
TATGGCGATATGATGAGTTGACTCCAAATCATTATAAGATTATCAAAAAA
CGGTTAAATAAATTGTACTAG
>RF_pd44 Putative conjugative transfer protein TraD_F
ATGAACATACAAGAGCAAGGTAGATTCACGCGAGGTGCACAAATCTTCGC
ACATCAGATTAGGATGCTTACGCAAGGCATCACTAATGCACTCACAGTGA
GTCTTACTGCGTCGTGTATGTGGTTAATATTCAGAATCCTTCAAAAAATC
AATATCTTAAGCCTATATTACTATTGCATAGAATGCTACGTGCAGCTAAA
GCTTGCGGTAGGTCAGTATTTCTATGACATCTCACAGATCGGTATAACAT
TCTATGATGTAAAAAGACAGGAATGGATATACCGCTCTGCTGAGGACTTC
ATTCACAAGTTTTGGTATGTAACAAAGCATGGTACTCAGATTACAAGCTT
CGGTTCTTGGCTTGCCGGCTCCGCTGCATTTGAAGTACTTGGTGTTTTTG
CTTTAACTATGCCTGGTATTACTATCTTTTTTTGGTATAGAGGCATCAAA
ACAATAGGCAGTCAGAAATTAAGAGGCATGGATTATGTACAAGCTTCTGA
GCTTACCAAAATCCTATCCAAAGAAAAAGTAGCATCTAATATTAAGTTTG
CAGGACTTCCTATTGTTAAGGATAGTGAAAGACAGCATATACTAATTACT
GGTACTACCGGCACTGGTAAAACCAATATGCTTAATGAGTTATTGCCTCA
AATACGAAGCAATAATGAAAAAGCTATCATTGTTGATATGACAGGATCAT
ATGTTAATAAATTCTATGATCCAAGTAATGGCGATATCATCCTGAATCCT
TTTGATTCACGCACCTCTAATTGGCTACCTTGGAATGATATAGTAGATAC
AGAGGATTTTGATGATCTTGCAAGTCACTTTTCAAGTAATAATGGTATGG
GACGAGCTAGCTTCTTTGATAGAACTGCTGAATTAGTACTTGCAGAAGCT
TTAAAGAAATACGCAGTAAGTAGAGATTAA
>RF_pd45 unknown
ATGTTATTTCAAATACTTCCAATATTTTGGATTATCGCTATTTGCGCTAA
AATACCGATGACAAAAAAACTTATTATGAAATTCCCAATTATTTCTAAAA
TATGGTTAATGCTACTAAAATTTATAAAGGACTTAGATATCAAGGGCATG
TATTCAAGCCCTAATAATTTAACTGGTTTTAGTTCAGATATGGGTAATCA
TAGAAGAGATGATGAACGATCTACCAGTCCGTCATATTTTTATTTGCCAT
ATAACATATACTATGAATCTGATAAATAG
>RF_pd47 Conjugative transfer protein TraG
ATGGTACTTCCACTAACTTGCCTTGTAGGCGGTTTTAAGTTCTTTCAGTT
TTGGTGTAACTTTACAATATGGGTATCATCATGGCCAATATTTTACTCAC
TAGTGCATTGTTTAGGTATGTTATCATTATCAGGCAAGGTCAGCGTATTT
GGTGGTAATGGCATGAGCATCTTGTCACAAGGCTCATATTCTGAATATGC
ATTAAATACTTATGCAACATATCAGATGCTTGAATGTTTAGTGCCGCCTT
TATCTTGGGCGTTATTTAAAGCTTGCTCGCATGGTATGTCTATGCTTGCA
GGTCAGTTCTCGCCGCTTTCTGTTGCAAGTAGCGTTGCTGCAGGAATTGC
TGATAATAACCTCAGCATGGATAATGTAAGTATTGGTAATAGAACAATAT
CGCAGCAGAATCTAGCTCCATCTTTAATGATGGCAGACAGTTCATTACAG
AAAGCGTTGATACACTGA
>RF_pd05 unknown
ATGCAATTATTTTATCCACTTGGGTTACCAAGTGAAAATATAGGTATACA
TGGGTTCCATGATACCACAAAGAATCAACCACAATCATACATCCCAATAA
CTGGATGTGTCTTATCTCACATATTATCATGCTCTAGGTTATCTTCCCTT
GAGAAGATGTATTTTATCTTAGCTGATTCTCTTATCTGTATTAACTCATC
TAAAGGACGTAATAGATCTATAGCTCTTCCTGCTACAAGCTGGGCTGAGA
GACTTTCTTGTTCTAAATCTAAAGTGTTTATATTACAGAAATCCCTAGAA
GATAAAGGATATTTCATTATATATAGAGATAAGAACGATCAGGGACAGAA
TAATCGTAATACTATTACTACTACTATTCCTGATCATGTTTTTAGTGATC
TTAAATATGAACCTGATAGATTTAATTTAAATTCTGATAGTGATATAGAG
ACTCAGAGTACTAATCATTCTCAGTCAGATAATCTAGATTCTATAGATAA
AACATTCATACCTACATTAGAAGGTAAGAGACAACATCTTGCAAAAACTA
AGATGTTTATTAGAGTACCTTATAAGTTCTTAAAAGAATTAAATTCTAAT
TGTAACATTTCTGCAACATCTAAAGTTGTATTATTACATCTTTTCACAAA
GATGTATAAATCTTCGGTTTGTAAGTACGATTATAACTGTTTTGGTAGTA
GATATGATTATGGCAACGCTGTTGATTATTTAACACAAAATTCAAATTCT
ATTGTTACATCATATCAAGAACTTCAACAAGAACTTAAATTACACAGAAA
TAGCCTTACTAAGGCATTACAGACTCTAGAAACAGCTAATCTTATTAAGA
GGGGTCAGATAGTTATTAAAAATGATAATTATTATAACAGCAGAGCTGAT
AAATCATTATGGAGAATATCTCTTGTAAATGCACTTCGTATAACTAATGA
TAGTACTCTTCATGAACAAAAAGGACAAATTGGATATGATGAGCAGGAAG
AACGATTTGATAAGACTCAGTTATTAATCAGTACCTCAAATACAACAATA
CGCACTAATGATCAGAAAAATGATACAGGCAAAAATAGGGTCCGAGAATC
CTTTTCGGAAAAGGGATGCACTAAACATGACCCTCCTTGCACTGATTCTG
GTCAATTATATATTAAATACTTTATAGTAAATAATAATATTAATAAAAAT
ATAGATTATATAGATGTAAAATCTGAAGAAGAGTTTTTGGAAAACGAGCT
TTGCTCGTTTCCATCTGAATCTTATAACAATTCTTTTAAAAGTTCTATTA
AGGCTAAACCATCTTGTTCTAATACTACCTCTGAATCCGCTGCAAGAACC
ATCAAAAATACATCTGAATATAAGGAACTAAGGAATTTCTATCCACTTTC
TGAACAAGATGTAGATACGCTTAACTTTAGAGCTGGTAGAGAATTTAGCA
ATAATTTTATGAATCAGTTATTACTGAAGCTCTACATCAAATATCCTGAG
AAGAGATTTAAGAACAAATTTTCGTTCTTAAGCTACATGGAGAAGATTCT
AAAGAATGAGAAGCATCAAGGACCTTTAGTAAATCATACAACATTTAGAT
TTAGCTGTAATATAGGAGCAATAGAGAAAAACTTACTCGAATATGAGAAA
TACTTAAACCAAATAGAAAGCTCATTTGATACCAGTAAAGATATGCAGAT
AAGGAAGAAGATAGCCGGAAGATTTAGTACTAATGTGGCATATGAAATAC
TAAAGGAGGTAGAGTTTAAAACAAACAATGATAATAGCTTTATACTTGCG
TTAGTTCCAAACCAACTTGCTTTAAGCGAGCGACAAATAGCAACATTAAG
TGAGCAACTAGAAGCAGTATATGGAATTAACGGTTATTACGTTACGGTGT
TGGAAGGAGATGTAAATCCTGAAGATGTAGAATATGCTGAAAGGAGTAGA
GGGAAAAAAGAGATAGCAATAGGAGTAAACAATGAAATGATTTATCCTAA
AACTGCAGTATTTGATAATGTAGAAAATGATACCCCTATTGATATTCCAG
CTAGTAACAGCGTTGTGAATACAACTAACGAAAACACCGTCTGGAATCAA
ATACGGAAAGGCTTAAGAGAAGAGCTAGGGGAAGCTGTAGATGAGACTTG
GTTTTCTAAAGCAGAGGCTAAAGAATGCAAGGAAACAAAAACCCTGACCC
TAACAATGCCAACAAGGTTTATGTCTGATTGGGTTAGAAATAATTACTCG
CATGTTATAAGAGGGCTTAGCGAAGGATATAAAATTAATTACAAATTTAA
GGAAGTGTTTAAATGCCATTATTAA
>RF_pd49 Integrase
ATGAACTTAAATCAAAAAATAATAAAGTCAAAATTAGGTTTACTAGAATT
AGCTAAGAGTCTTGGTAGTATATCATCAGCATGTAAAGCGATGGGATATA
GTAGAGATAGTTATTACAGATTTAAAGAACTATATGAAACTGGTGGTGAA
GAAGCGTTATATGAAATTAGTCGAAGAAAGCCAATGAGTTGA
>RF_pd10 unknown
ATGAGTTATAATCAAGAAGGATACGAATTTAAAATAACACAAGCATTTAA
TTGTTTAAATGACGCAATAGCTTTAACATATTCATCAGTAAATCATTTCT
TAGATATACCTAAGGTAATTAATAAATATGGAGTACTTGCTACTGTAGCT
TTATCAAAAACAAAACAATTAAATCTTACTGATACAAAGTTAGAGAGTAT
AGTAAAAAATGGTTTTATTATATATGAGGTAGTAGAAACAATAATCAAGG
CAAGTAATGCCATCACTAAAGATCAGCAACTGTTCAGTAAAGCTATAGAT
GATGGTTTAAATGCTGTAAATAAATTACAGGAGGCAGCGATTCATTTATC
AGGTGCTTATGAGCCTCTTGCTGAATATGTAACATCATTCTTTGGTAGTA
ATGATCAACATGAACCTTTATTATTTGATACATATACGCCTAACTCAACA
AGTGCTGTAAACGAAGGCTACCATCTGATAGGTAATAATGCTCAATTAAT
AGCGGTAGAAGTCTAA
>RF_pd04 unknown
ATGCATAAATCTAAAATAAATCCGTTAGTAGAAAGTAAGCTTTCAAAAAC
TGTTGCAAAAATAATTTCAGAAAAACCTATAGAAAAAAGTGGATTTATTA
CCTCATCCAATAATAAAACAACTCATTATAAAACAAAAACCTTTCGTTTA
AGACAGCTAGATGCAGAAAACCTTATAAAAATTATTAAAGCTGTGAATCA
TTATAATCATAGAAAAACATATTCAGATTCCGAAGTTATTAGGGGTTTGA
TTAATTTCATATCAGATAATTTAGATACTAATATAAAAAAATTAACTAGT
TATATTAATTCTTCCTCATAA
>RF_pd65 unknown
TTGCCTAATAAATTAGGTTATAGTTATAAAAAAAACTTTTCTTCATCCGA
AAAGGGATATTGGTCAAGGAATGAGTTTATATTGAAACTAAAAACTATAG
ATAAACAAGATTTATGTATATTGTGCTATGCCGTCATACTTAAGTTGCAG
CATTATAATTGGGATAGCTTATTAGCATATATTCAATGCTGTTTTTTGAA
TACAGAATCTACCATTAAAATATGGAATGTTCAAAGTAAAATTATTTCAG
TACGTTGTGTAGATATCTTAAATAATAATGAATATATGCAAATCGTACAT
TCAGGCATAATATTGTTAATATTAATGTTACTTGCTATATGCGTTATGCC
TATTATTTTACTTACAGTATGCTTGATAATGTATACTATAATTTCAGAAC
TAAAGCGATTTTAG