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COG category: Unclassified
Genomic element: pRF

Number of genes found: 23

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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_p47 Conjugative transfer protein TraG
ATGGTACTTCCACTAACTTGCCTTGTAGGCGGTTTTAAGTTCTTTCAGTT
TTGGTGTAACTTTACAATATGGGTATCATCATGGCCAATATTTTACTCAC
TAGTGCATTGTTTAGGTATGTTATCATTATCAGGCAAGGTCAGCGTATTT
GGTGGTAATGGCATGAGCATCTTGTCACAAGGCTCATATTCTGAATATGC
ATTAAATACTTATGCAACATATCAGATGCTTGAATGTTTAGTGCCGCCTT
TATCTTGGGCGTTATTTAAAGCTTGCTCGCATGGTATGTCTATGCTTGCA
GGTCAGTTCTCGCCGCTTTCTGTTGCAAGTAGCGTTGCTGCAGGAATTGC
TGATAATAACCTCAGCATGGATAATGTAAGTATTGGTAATAGAACAATAT
CGCAGCAGAATCTAGCTCCATCTTTAATGATGGCAGACAGTTCATTACAG
AAAGCGTTGATACACTGA
>RF_p01 Transposase
ATGCCATACAAAGAAAGAGCAAAAACAGGTTTACCAAGAAATGTAGATAA
ACCAAAATATAAAGTAACCAACTGGTCGCAATATAACAAGAGTTTAAGAC
AAAGAGGGATGATCAGCCTGTATTTTCCTGAAGGCGATTTAGAGTCTTTA
TTCATTAATGTCGAACCTTACGTAGAGGGAGAATCTGGGAGGGCAACGAC
ATACCAAGTACCATATATACAACTAATTTATACATTATATCGTTTATTTG
GTTTCGGACAGCGTCAAATAACAGGTTACTTGTGGTTTATTTTCGCAGAC
TCTATTAGAGGTCAAACAGTTTTGCAATAA
>RF_p28 unknown
ATGCAATTTAAATATAAAAGGGTGAATATACCTGAAAATGATCAAAGTGG
TATTAATACATACCTATCTAATAAATATGTGAGGAAAGAAAATCTTACAT
TAATGCTCGCGAATTATGAAGAGCGTAGAAAATGCGAGGCAGATGAAGCA
TATAAAACTGATGAAATTCTAAGAGAAATATCAGATAATGGAAATAAAGA
TTCCACTTGGGATTTATTTTTAAATTTTGTTATAGGCGTAAAAGAGACGG
CATTTTACTTAGCAATGAGTGTAATTAATGGATATGGTATAACCCATAAT
GAATTCCTCATGTACCTCACTATGGCTATAGGAGTCAAGCTTGGTGATGA
AAAGACACTTGAGCTAGTAGGCGATGAAAAGATACCAGAGGAAACAAAGG
TATTAGCAGAAAGATGCATGGAGCGTATTAAATTTCATAAAGAAGAGGTT
TATAATAGAGACGTTATGTGGGAAGAAATTATGGCACGTGGGAAGGATTT
CGATAATCTAGTAAAATCAGAGTCAGGGCATTCATATTATGATTCAATAC
CGAATCAAGGTACAGTAATGAAAAAATGGTCTGTTTATGTAGAGCCTATT
ATAGAAGATAATGCAAATATACAGGTAGATATGACTGGACAAGAAAGCAG
CTGTTGTTGCTGCGTAATTATCTAA
>RF_p10 unknown
ATGAGTTATAATCAAGAAGGATACGAATTTAAAATAACACAAGCATTTAA
TTGTTTAAATGACGCAATAGCTTTAACATATTCATCAGTAAATCATTTCT
TAGATATACCTAAGGTAATTAATAAATATGGAGTACTTGCTACTGTAGCT
TTATCAAAAACAAAACAATTAAATCTTACTGATACAAAGTTAGAGAGTAT
AGTAAAAAATGGTTTTATTATATATGAGGTAGTAGAAACAATAATCAAGG
CAAGTAATGCCATCACTAAAGATCAGCAACTGTTCAGTAAAGCTATAGAT
GATGGTTTAAATGCTGTAAATAAATTACAGGAGGCAGCGATTCATTTATC
AGGTGCTTATGAGCCTCTTGCTGAATATGTAACATCATTCTTTGGTAGTA
ATGATCAACATGAACCTTTATTATTTGATACATATACGCCTAACTCAACA
AGTGCTGTAAACGAAGGCTACCATCTGATAGGTAATAATGCTCAATTAAT
AGCGGTAGAAGTCTAA
>RF_p05 unknown
ATGCAATTATTTTATCCACTTGGGTTACCAAGTGAAAATATAGGTATACA
TGGGTTCCATGATACCACAAAGAATCAACCACAATCATACATCCCAATAA
CTGGATGTGTCTTATCTCACATATTATCATGCTCTAGGTTATCTTCCCTT
GAGAAGATGTATTTTATCTTAGCTGATTCTCTTATCTGTATTAACTCATC
TAAAGGACGTAATAGATCTATAGCTCTTCCTGCTACAAGCTGGGCTGAGA
GACTTTCTTGTTCTAAATCTAAAGTGTTTATATTACAGAAATCCCTAGAA
GATAAAGGATATTTCATTATATATAGAGATAAGAACGATCAGGGACAGAA
TAATCGTAATACTATTACTACTACTATTCCTGATCATGTTTTTAGTGATC
TTAAATATGAACCTGATAGATTTAATTTAAATTCTGATAGTGATATAGAG
ACTCAGAGTACTAATCATTCTCAGTCAGATAATCTAGATTCTATAGATAA
AACATTCATACCTACATTAGAAGGTAAGAGACAACATCTTGCAAAAACTA
AGATGTTTATTAGAGTACCTTATAAGTTCTTAAAAGAATTAAATTCTAAT
TGTAACATTTCTGCAACATCTAAAGTTGTATTATTACATCTTTTCACAAA
GATGTATAAATCTTCGGTTTGTAAGTACGATTATAACTGTTTTGGTAGTA
GATATGATTATGGCAACGCTGTTGATTATTTAACACAAAATTCAAATTCT
ATTGTTACATCATATCAAGAACTTCAACAAGAACTTAAATTACACAGAAA
TAGCCTTACTAAGGCATTACAGACTCTAGAAACAGCTAATCTTATTAAGA
GGGGTCAGATAGTTATTAAAAATGATAATTATTATAACAGCAGAGCTGAT
AAATCATTATGGAGAATATCTCTTGTAAATGCACTTCGTATAACTAATGA
TAGTACTCTTCATGAACAAAAAGGACAAATTGGATATGATGAGCAGGAAG
AACGATTTGATAAGACTCAGTTATTAATCAGTACCTCAAATACAACAATA
CGCACTAATGATCAGAAAAATGATACAGGCAAAAATAGGGTCCGAGAATC
CTTTTCGGAAAAGGGATGCACTAAACATGACCCTCCTTGCACTGATTCTG
GTCAATTATATATTAAATACTTTATAGTAAATAATAATATTAATAAAAAT
ATAGATTATATAGATGTAAAATCTGAAGAAGAGTTTTTGGAAAACGAGCT
TTGCTCGTTTCCATCTGAATCTTATAACAATTCTTTTAAAAGTTCTATTA
AGGCTAAACCATCTTGTTCTAATACTACCTCTGAATCCGCTGCAAGAACC
ATCAAAAATACATCTGAATATAAGGAACTAAGGAATTTCTATCCACTTTC
TGAACAAGATGTAGATACGCTTAACTTTAGAGCTGGTAGAGAATTTAGCA
ATAATTTTATGAATCAGTTATTACTGAAGCTCTACATCAAATATCCTGAG
AAGAGATTTAAGAACAAATTTTCGTTCTTAAGCTACATGGAGAAGATTCT
AAAGAATGAGAAGCATCAAGGACCTTTAGTAAATCATACAACATTTAGAT
TTAGCTGTAATATAGGAGCAATAGAGAAAAACTTACTCGAATATGAGAAA
TACTTAAACCAAATAGAAAGCTCATTTGATACCAGTAAAGATATGCAGAT
AAGGAAGAAGATAGCCGGAAGATTTAGTACTAATGTGGCATATGAAATAC
TAAAGGAGGTAGAGTTTAAAACAAACAATGATAATAGCTTTATACTTGCG
TTAGTTCCAAACCAACTTGCTTTAAGCGAGCGACAAATAGCAACATTAAG
TGAGCAACTAGAAGCAGTATATGGAATTAACGGTTATTACGTTACGGTGT
TGGAAGGAGATGTAAATCCTGAAGATGTAGAATATGCTGAAAGGAGTAGA
GGGAAAAAAGAGATAGCAATAGGAGTAAACAATGAAATGATTTATCCTAA
AACTGCAGTATTTGATAATGTAGAAAATGATACCCCTATTGATATTCCAG
CTAGTAACAGCGTTGTGAATACAACTAACGAAAACACCGTCTGGAATCAA
ATACGGAAAGGCTTAAGAGAAGAGCTAGGGGAAGCTGTAGATGAGACTTG
GTTTTCTAAAGCAGAGGCTAAAGAATGCAAGGAAACAAAAACCCTGACCC
TAACAATGCCAACAAGGTTTATGTCTGATTGGGTTAGAAATAATTACTCG
CATGTTATAAGAGGGCTTAGCGAAGGATATAAAATTAATTACAAATTTAA
GGAAGTGTTTAAATGCCATTATTAA
>RF_p09 unknown
ATGAGCTCATTGATACATGTTACAATAATCACAATAATATTATATGTGCC
TAAAAATAAGCATATTACTATTTCAGATCTGAGTATATATGATGGGATAA
CACTCGTTCCTAAAAGCGGTGTATATAGCAAAATGGATGAGACTCGTGTA
TTTAATAAAGAGGCATTTGAAACCATTGAACTAGAAATCAATCCTCCCGA
CACCTCAAGCAATGCTTCGGATGATTCAGATGGTATTTCATCTACTTCGG
ATCAGCTGTCTAGCGATTCTTCAAGCGTTTTATGCAGTTCTTGCTGTAGT
TCTTTAGATATTTCAGATTTTTTATCATCTGATGATGATATGGACCTGAC
GGGTAACAATGCCGCTGATTTAGCAAATAACTAA
>RF_p04 unknown
ATGCATAAATCTAAAATAAATCCGTTAGTAGAAAGTAAGCTTTCAAAAAC
TGTTGCAAAAATAATTTCAGAAAAACCTATAGAAAAAAGTGGATTTATTA
CCTCATCCAATAATAAAACAACTCATTATAAAACAAAAACCTTTCGTTTA
AGACAGCTAGATGCAGAAAACCTTATAAAAATTATTAAAGCTGTGAATCA
TTATAATCATAGAAAAACATATTCAGATTCCGAAGTTATTAGGGGTTTGA
TTAATTTCATATCAGATAATTTAGATACTAATATAAAAAAATTAACTAGT
TATATTAATTCTTCCTCATAA
>RF_p12 unknown
ATGTTTAAAATAAAAAATATTACAAAAAGCATCAAGCACATAAAGAAAAT
ACTAACACCTAGTTCTCACAAAACGACATGTTCTAGCATAGTAGCATCGA
CATTTGATATGGAGACATCTAATAAAATTACCTCTGACTTTGGTTTTAGT
AAAAAGTATGTTGTGAATAACAGTAAAGAGATAGATTGGGTAGGAATCAG
GAAAGCAATATATAACAGATTTTCTGATGAGATCGATGCCACAAATATAC
AGAGCTTGGAGCAAGTTACGCCACTTGTTGCATCGAAACAACAAGGGTTT
AGTGCTACGAATGTAAATATCAATTGGGCAGAGATTAGGGCATTAATATA
TAACAGGTTTGCGGATGAAATACATGCGTGGAGCAAGAAGCAGCATGGTG
ATATTATAAAATATAGTCCAGTGAGAGATGTGAATGAAGAACTGGAGATA
ATAAAAGAGCAGGGATATAGTTTTGCAAAACAAAAAGCTGCTTTAAAAAG
GAGTATCACAGATAAATGGGACGAGATTGAGAGAATAAAATATTTGTCTC
AGGACACATCATGGAATACCAAGAGTCAACAGAAGCTATTATCACATGAT
AATAGTATTATTGGTAGAATGAAATTCTTGTCTATTAAGGGTTACTTATC
AAATTATGCTGGAGATGATGAGTTGTCACAATCCATCGATTCAGTAATCA
AAATTAAAGATACATTGATCACAGAGTTTATGAATAGAGTCTATGATAAG
CATATGCATGCTACAGCGGCTCGGCAAAATGTAGCGGAGGCAATAACATT
TGACAGTTTAATAGATGAGCAAGAAGTGATGGTATTAGGAGAATAA
>RF_p49 Integrase
ATGAACTTAAATCAAAAAATAATAAAGTCAAAATTAGGTTTACTAGAATT
AGCTAAGAGTCTTGGTAGTATATCATCAGCATGTAAAGCGATGGGATATA
GTAGAGATAGTTATTACAGATTTAAAGAACTATATGAAACTGGTGGTGAA
GAAGCGTTATATGAAATTAGTCGAAGAAAGCCAATGAGTTGA
>RF_p44 Putative conjugative transfer protein TraD_F
ATGAACATACAAGAGCAAGGTAGATTCACGCGAGGTGCACAAATCTTCGC
ACATCAGATTAGGATGCTTACGCAAGGCATCACTAATGCACTCACAGTGA
GTCTTACTGCGTCGTGTATGTGGTTAATATTCAGAATCCTTCAAAAAATC
AATATCTTAAGCCTATATTACTATTGCATAGAATGCTACGTGCAGCTAAA
GCTTGCGGTAGGTCAGTATTTCTATGACATCTCACAGATCGGTATAACAT
TCTATGATGTAAAAAGACAGGAATGGATATACCGCTCTGCTGAGGACTTC
ATTCACAAGTTTTGGTATGTAACAAAGCATGGTACTCAGATTACAAGCTT
CGGTTCTTGGCTTGCCGGCTCCGCTGCATTTGAAGTACTTGGTGTTTTTG
CTTTAACTATGCCTGGTATTACTATCTTTTTTTGGTATAGAGGCATCAAA
ACAATAGGCAGTCAGAAATTAAGAGGCATGGATTATGTACAAGCTTCTGA
GCTTACCAAAATCCTATCCAAAGAAAAAGTAGCATCTAATATTAAGTTTG
CAGGACTTCCTATTGTTAAGGATAGTGAAAGACAGCATATACTAATTACT
GGTACTACCGGCACTGGTAAAACCAATATGCTTAATGAGTTATTGCCTCA
AATACGAAGCAATAATGAAAAAGCTATCATTGTTGATATGACAGGATCAT
ATGTTAATAAATTCTATGATCCAAGTAATGGCGATATCATCCTGAATCCT
TTTGATTCACGCACCTCTAATTGGCTACCTTGGAATGATATAGTAGATAC
AGAGGATTTTGATGATCTTGCAAGTCACTTTTCAAGTAATAATGGTATGG
GACGAGCTAGCTTCTTTGATAGAACTGCTGAATTAGTACTTGCAGAAGCT
TTAAAGAAATACGCAGTAAGTAGAGATTAA
>RF_p59 unknown
ATGGAGATTAATGGTAAAAAAGCTAAAATATATTACAGTGATAGTGCTTC
GGCAGATGGGCCAGATTATGCTATTATAGATATTTCTAGTAAGAAGGCTA
AATATAAAAAAGCTACATATGACACTTCAAACCCCTCTAGCTCACATTCT
GACGATCACGAAAGAATGGAGTTAATAAATTCAAGTGATAACTCTATACA
AGATAACATTAATGTCATATCTTATAGTATTGTTAGTGCTGCGGCAAACA
AAACAGATTATATAAATACGTCTAGTAAAAGAGACAGATAA
>RF_p36 unknown
GTGGTACTATTATATATGAAAAGAAGACAAAAACAAACACTTTTCTATTT
CTATGACTCAAACAACTTAAAAAAAGAGGCTGGCATGTACTTAAATATTA
ATCAAAATATAAGTAATTTAACGAATATAGAAAAAGAGTTCATTGCTGAT
AAATACGATGCAATTTTGTTTAACAATGGTAATTTAATGTTTAAAGCTAC
TCATGGATGTTTACCACAGTTTCAAGAAGAAATAATTAAATTACTAGATA
TAAAATTATTTCGTGAAGTTATAATCGAACATATATTTTTATATGAAATT
AAGTTTTGTGAGGAAGAACTCAGAAATATGAGATTGAACAAAACACAGGA
AAAGCAAATCCAAGAGAAGATCGATGAAATTAACCTATTAAAAACACAAT
ATAAAACATGTATATCAATAAGTGCACCCAATAATTTAAACGATAAAGCA
AAAATCAAGACTTTGCTAAATGATTATTATAGTGCTGTTTTAAACAGTGT
ACAATGCAGCTCTTATTTAGATTCATTGTACAATTTTGCCTCCTCTTCTT
GCGATAGCTATCATTACGATTCATACGATGGAGCTTTCTATATACCAAAG
GAAGAGTTAAAAGAATGGGAAGAAATGCAAAAGGATAACGACAAAGAAAT
AAAGATTTGCAGCACCCAGTATAAAGAATTACGTACACAGTACGTTAATT
TACAAGAACAATTAAGCCAATTAGTCAATAATCTACAATGA
>RF_p20 unknown
ATGTTTATTAGAGTACCTTATCAGTTCTTAAAGCAATTAAATTCTAATTG
TAGCATTTCTGCAACATCTAGAGTAATAATGTTGTATCTTTTTACTAAGA
TTTATAAATCTTCTGCTAATAAGTACAATTATGATGATTCTGATAGTTCT
TTAACTCGTCATTCATACTCTATTGTTACTTCTTATAGGAAATTACAAAA
AGAACTTAAATTACACAGAAATTCTATTTCTAAAGCATTGAAGACTTTAG
AAGATAATAATTTTATCTCTAAACAGAGATTTTTCATAAAAGATACAGAA
GATTATAACAATAGCAGAGCTGATAAATCATTGTGGCAGATATCAGTGCT
TAATGTTCCATTTATCACCAATCATAATAATCGCCATACACAAGAAGCAG
TAATTAGCAATCAAACTAAGGTGGAATATAATAACAACGAAGCCTTGGAA
TCCTCTAAGGAATGGGAATGCACTAAATATGACCCTGCTTGCACTGATTA
TGGTCAATTATATAATAAAGACTTTTGTATTAAAGGATAG
>RF_p50 unknown
ATGAAAAGGGTGTGTATGAGTAAATTACTTGGTGGTTGGAGTATGTCTTT
AACTCGTTACCCATTTAATGAATTTGACTATATAATGTATGGTATGGTGA
CAAATCTTGAAGAACTAACAACAGGAAGCATGGCTTCTCCGGGGTGGAGT
CCAGAAAATGAACAAAAACCAGATAATAATCCTTGTTTTACAGGTAAAAG
GCTTTGGGTTTATGGCGGGGGAGGATGTGCTCCTGAAGAAAAGCCCTCTA
GTATGAATGACGTATCCCGCATTATATCTGCGACCATTAATAATGGTTGG
GATGGTGTTGATTTTGATGACGAGTGTAATATGAACACTGCATTTGTTAT
AAAAACAATGGAAAAACTCAAAGAAAATAGTAAAGAAACCAGTTTTGGTT
TTATTGCAGGTTATTCTTATAACCATCCCAATACAGAAAAAGGGAAGAAG
ATTACCGACAAAGTTAAGGCGATTATCGCATCAGGTCAATGTGATAGATT
AGTGCATTATTGTTACGCTGCCGCAATGTGGAATCAAAATGATATTATCA
ATAATGTAAAACAAGCATTAGTACAAAGCATCTCTTATGGCATAGAACAA
GATAAAATTGTGTTAGCCTTGACTACTTTGGGTCTGACAGACTGGAATTT
AAATTACTTTCTAGATCAAATTATTGATTTGAATTTAGGGGGGTTATTTA
TATGGCGATATGATGAGTTGACTCCAAATCATTATAAGATTATCAAAAAA
CGGTTAAATAAATTGTACTAG
>RF_p68 unknown
ATGGCTAAAGGATGGATTAAGGAGCAAGAAGAAAGCTTAATAACACAAAT
ATTAGCGGGTAAATTTTATCACAACTTATCTAATGAGATTCCTTGTGATA
GTCTGCCAGTTTTACAATCACCGAGTAATACCCAATATTGGGGTAACGAA
AATCCTTCTGTTAGTTCAGTATTACTTGCTGATATTGTTGCTAGTTGTAA
TAAGAAGCAAGATAATCTAGCTGGAGCTGCCACTTTCTTTCCTTTTATAG
ATAGTAGCTATGCATTACCTGATAGTATTGTTCCCGCATCATATTCGTTT
GCTACTAAAAATGGTATGACACTTTTTGGTGATTATCAGTATGGTGCCCA
TCGTTATTTTAAGGAACAATTAGTGTTTGGTCCTGAGGATTGTTCTACTG
CGGTAGGTAAAGCAACTTATCTGACTACCGATCAAATTAAAGATATAAAT
ACTACCAACATGCAAGCAGCGTATGAGGCCAGTATAGAAACAGGGAGCCC
AGACCCTAAATATCACTATCAAGCGGTAACTTTTTTAAGTGGTGATATTC
AAGATAGCCAGTTGAGATTAATTCAAGAAGGTGATATTTATCTTGTAAAG
GGTCACACAGCTCTTATTGCTACCAAACCTGATAGTAGAAGTACAATTAC
TACTATACAGTTTAATAGAGATATAGACTCGGCTGAAAATAAAATATTAG
GAGGTGGTACATATGATTATAATTTATGTGATAAAGCTAAAGAAATAAAA
ACTGGTATTTATATTTTACGTCCTACTACTGTACAACCTTTACATAAATC
TTATTCTTTGGGTGAATTGTTGAATCAAATTGACTCAAAATATTTAACTC
TTTTTCCTGATGGTCCTACAAATATTTCAGGAGATTGTAGAATATTTCTT
GAGGACAATACTACAAACATAGTTGGAGACACTGGTTATAGTACTGGACA
GTTTTAG
>RF_p33 unknown
ATGGTTAAGAAATCATTATTTTTAATTTTATTATGTATTCCAATATTATC
CGGATGTAAATGCTCAAAACATCACAATGCAAAACACCAGTATAATGAGT
ATAGCAAAACTGCATGTGGCAATCCTCCTCCGCCATGCGTACATCATGAA
GCACTTGTGACTCCATATTCAGGTCCTTTAGTAAGTATTGATTGCCCAAA
AGAGTCTCTAGGTCATCATTCAAAACATTATAAAAAACACCACAAAAAGC
ATAATAAAAGCCATGATATGACAGGAGCATTACCGCCAAAATATTTACAA
GTTAAGGATTTCAAGGAATGCCTTAGCACAGAGCAAGTATCCACATATAC
ACAATATTGTATGCCGGAACATAAACCAGAGCATTGTCCTTTTAACTCAT
GGCAGCAGCTAGTGAAATTAGATATGCCTAGATGCAAAGCTTAA
>RF_p45 unknown
ATGTTATTTCAAATACTTCCAATATTTTGGATTATCGCTATTTGCGCTAA
AATACCGATGACAAAAAAACTTATTATGAAATTCCCAATTATTTCTAAAA
TATGGTTAATGCTACTAAAATTTATAAAGGACTTAGATATCAAGGGCATG
TATTCAAGCCCTAATAATTTAACTGGTTTTAGTTCAGATATGGGTAATCA
TAGAAGAGATGATGAACGATCTACCAGTCCGTCATATTTTTATTTGCCAT
ATAACATATACTATGAATCTGATAAATAG
>RF_p65 unknown
TTGCCTAATAAATTAGGTTATAGTTATAAAAAAAACTTTTCTTCATCCGA
AAAGGGATATTGGTCAAGGAATGAGTTTATATTGAAACTAAAAACTATAG
ATAAACAAGATTTATGTATATTGTGCTATGCCGTCATACTTAAGTTGCAG
CATTATAATTGGGATAGCTTATTAGCATATATTCAATGCTGTTTTTTGAA
TACAGAATCTACCATTAAAATATGGAATGTTCAAAGTAAAATTATTTCAG
TACGTTGTGTAGATATCTTAAATAATAATGAATATATGCAAATCGTACAT
TCAGGCATAATATTGTTAATATTAATGTTACTTGCTATATGCGTTATGCC
TATTATTTTACTTACAGTATGCTTGATAATGTATACTATAATTTCAGAAC
TAAAGCGATTTTAG
>RF_p38 Conjugative transfer protein TraA_Ti
TTGCATACGCATTCGCATATACAAAGAAGCAAGGGACAAAATGCTGTTGC
TAAAGCTGCATATATTTCTGCTAGTAAATTAGTATATAAAACTACCTGTC
ATGAAACTGGTGAGGAAATAAGTATAACCTTTGATTTTACACAAAAGCAA
GGAGTGATATATAGTAAGATATTTGTGCCTGAAGGCTTTGAAGACGCTGC
ATGGCTACAAGATAGAGAACAGTTATGGAACGGAGCAGAAGCAAGAGAAA
AAGAGCGGATTCTAGGACTGCATCAGAAATAG
>RF_p24 unknown
ATGAGGTCATTTATGAATATATCACATCATCACACTGTTGGCAATAGTAG
TAAGCTATTTGCTGCTTCAAGCACAAATCAATCACAATATCTAGAGTCTG
ACTACTTTTTACCAGCTAGTTATAGCGAGAACTACTACAGTAGGAAGTAC
AGCAGATCAATAAGCAAAATTTCACGTATAGTATCTGCAAGCCTATTATC
GGCTATGATGCTCACAGCAACATTAGATGCTAAAGCACATCCTAGCGTAG
AATCAAGTATCTTAGAACCAAATCAAAGTTTTCTATTTGGTAAGGATTCT
GCAGGAATTAGCACTAACGTGCCTTTACCACCAATCATGCCCCAGTCACC
ACCATCAGCTCCTCCAATTCCGCCTGTGCTCCCAGCTATGCCTGATTTCA
TCAGCGATGCAAGTATTGGAGGGAAATCAGACAATAGGTCAGCACTACTT
GAATCAATCAGGAATTTTGGCAAAAACATATTAAAAAAGTCAAGAAAGAA
CCAAAGCCTAAAGTTGTATCTAGCGATGGCGGGGATTTAA
>RF_p22 unknown
ATGGCATTAAAAAAACGTCCATTGCAGATTTCTCAACAAAAGATTGAGAA
TTTAGCAAATGAATTAGCAGATAAACCTTATGGTTATACAAAAGAAGATG
ATACTCTTGTGCGTACTACAATTTCACTCCCTGCTTCTGTTTTATTCAAA
TTAGAAGATCTCTCGAGACATAATAAACGGACAAGGAGCTCATTAAAATC
CGTGAGTGCAATAATCCGTGATTGTATTGCAAAATCTTTAAATATTTAA
>RF_p25 sca12, Cell surface antigen-like protein Sca12
GTGGGGACGATGATGATTGGAGTGGTGAGGATAGTATTTCAGATACTGAT
GGATATGACACTGTATACAAGTAGTGGTAGCGAATATTCTGAGGATAGTG
GCGACGAGGACGGGATACCAATTTCACCACCTGCGATTGAAGAGGATAGA
GCGGAACTTGACAGCATAAGAGAGTTGCAAGTATCAAGGCAATCATCAGC
TGTTGCAAGTAATGATAGCATTAATGAAGTAAGTTTTGCAGCAGACAGTA
GTGGTTTTAAAGAAGAGCAACAAGAAGAGAGTACCACGGAGAGCGATTTT
GAGATACTAGATGAGGTGGACGAAGAAGATAGTTTATCTAAAGATATATC
TACTAACTTAGGTGGTACCGTAAGCACTGAGCCACAAGAACAATCGACTG
CTAAAGATAAAGAAGAGTTGCTTAAAAAAGCGACCATTGCAGTAGCGTCA
CATAACCAAGCACGAGAGGCTAACAAAATATCCAGTAAACAGATCAGACA
CCGTATGTTTGTGAGGGATATATTAATATCTCCTGTATCTGCAGGGGAAG
ATGGCACAGACATTCTTGCTAGAATCATTGGATATCACATATGGAGTAGT
GGCACGCTTGGCAGCAACAAACAAAAATCTAAAGCAGACTTAAATGGCTA
TAGTAGCAAAATAGCTGGAGGCACTATTGGGCTAGAGCTTAACCTTGAAA
ATGACTTACTACTCGGTGCTAATTTTAGCAAATTTAGTAGCCGTGTTAAA
TATCAAGATCAAGGCGGGTCAAGTGATTTACGAAGCAGTACCGCAAGTAA
CAGAGCTAAATATGATACTCATATATTTAGTCTATACGGCTTAAGTCCAG
TAAGCCGTAATATGAGCGTTTCGGTCATAGGTTCAGCAGGACTTAGTAAA
GGCAGGAAAGCAAGATCAAAGTTATTGAGTTTTGAGCCTCATCTTAACTA
CAGAGTAGAGTTACCCAAAGCAGTAACGCTAATACCTCATATTGGGTTGA
GATACGAATATGAGAAAGCAAACGCTTACCAAGAGCAAATAGCAAGTAAC
CTGTCTATAGAGAGTGCTAAAAAGAGTTACCAAGCCTTAAGCGGTGAGAT
AGGTAGCAGAGTAATATTTGCTCCTATTAAACTAAATGGTAGTACTCCAC
GGGCAATATCAATAACACCAACGGTACATTTTTCGGTAGAGAGAAAAATA
GGTAGCAGGGGCACAAGCCATCCTTTCACTTTAACGTACTACGAGTCCAA
GCAAACTATCGGCACTGGTACCATATCAGCTAATGCTCAAAACGAAAGGA
CGAGTCTTAATGCTGGAGTCGGATTAATAGCAGCTAGTCAGAACATTAAG
CTAGAGCTATTGTACGACCAGCAAAGGCAAAGGCGATTTAAGAGTCATCA
AGGAGTTTTAAAGCTGAAGGTGAGTCTCTAG
>RF_p37 traD_Ti, Conjugative transfer protein TraD_Ti
TTGTCCCTTGCTTCTTTGTATATGCGAATGCGTATGCAATTACAAAAAGC
AGTAGCCTTTGATCGTAAATCTGACGCTAGAAAAAAGATTATGCTAGGCG
GATTATTTGTTAAAGCAGGTCTTGATTACTTACATCCTGATAATGCTCAT
ATTCTTTACGGAATGTTACTTGATTGTAAGGAGCAATTAATCATTAATCC
GAAGATTATTGATAAGTGGAAAAGTAAAGGTCAGCAGCTACTTAAAAAAA
GTATTTGA