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Gene list

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COG category: Signal transduction mechanisms
Gene type: CDS
Genomic element: chromosome 1

Number of genes found: 16

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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA3384 hypothetical Methyl-accepting chemotaxis protein
ATGAACCTTAAAACAAAATTATCAGCATGCTTTGCTGTTCTCTCACTCAT
AATCATTTTGGTGCTATCTACCTTTTCCTACCAAGCTTTACAAAGCAGAA
CACTTAACAGCCTGAATACGGAACTAACAACAGCAGCCAATGCCACCCAA
AAAATTATCGGTGATGAACGCCATGATCACCAAAACAAAGCCAACAACGA
TTACGACAAAATTTCCCAGAATTTGACCAGCTTCACCCAAGCCTCAGAGC
TGGATTGGGTCTATTCCACCGTGATGAGAAACGGTCGGATATATTACACC
TATATCAATCAAACAAAAGAAGAAGCACGTTCTGGGCACTATAAAAACTG
GTACCAAGAAGAATACAAAATCGTTCCGAAAATGCTTCGCAAAGCATTCC
TGACTCAACAAATCCAATTTGAAGAGTACCAAGGTGAATACGGCCGATAC
CGCTCAATTTTCGTCCCGTTTCGTAACCATCAAGGAGAAACCTATGTGAT
AGGGGTCGATATCTCGCTGAGCGAAGTTGATGCCATGATAAACCGCGAAC
TCAAGAAAGTGTGTATCACCGCAATGATCGTTTTGGCACTAGCACTAGTG
GCTGCCCGCCTGATCGCCAATCAGCTTGTTGCACCAATCAATACGCTAAA
TGCCGTACTGCTCAACATTGCTAATGGCGACTGGAACCTCACACAACAAG
TGCCAGTGAGCAGTAAGGATGAAATCGGGGCAATGTCGCACTCGTTCAAT
ACCTTTATGGCAGCATTACGCCAGCGCCTAATGGAGGTTAGCCAAAGCAC
CGAAAGCGTTGCGGCGATCACCACCCAGCTTGAACACCTCATTCAGGCCG
TCACAAAGCGCTCAATCGAACAGGCAGAAAACGTTGGCAACAGTGCTGCG
GCGATCGAAGAGTTGGCGACCAGTTCACAAAGCATTTCGGAAGTGGTCAA
CGGTGCCAACCAAAAAATGACCCACTTTGAACAGCATACCCAAGACACGG
TCGGTGCGATCAATCATGCCGTCACCGGTATGCAAAATGTCCAACAGGAA
ACCAACACTGTTGCCGAAAGACTCCATCAGCTTGACAGCCGCGCCAATGA
TATCAACTCCATTGTTGAGGTGATCAAAGATATTGCCGACCAGACTAATC
TACTGGCGCTCAATGCCGCTATCGAAGCGGCACGAGCCGGAGAGCAAGGC
CGTGGGTTTGCAGTAGTGGCCGACGAAGTTCGCCAACTGTCAGAACGAAC
CGCCAAGGCAACGATCGAAATAGGGTCGATGATCAATACCATTCAAAACG
ATACGAGTGGCGCGACTGATACGATGCAACTAGCAGTCGGTCAAGTTGAT
AGTTGCGTTCAATACGCCGATGAAGCAAATCAATCACTAAATGGCTTTAG
AACTGAAATTACCTCAGTAACCGAAGGCATGGAAGAAATTGCCGAGTCAG
TAAAAGAGCAAGCTTTTGCCGCTGAACACTTATCATCCAATGTTGCCACA
CTCAGCAGCAGCGCCAATGAAAACCGCTTATCAACACAAGATGCACAACA
AGGGGTAGAAGAGCTCAAGCGCAGAGCCACTGCGCTTCGTGATGTTGTGC
GTTTATTCACGCTGTAA
>PBPRA3257 C3964, putative nitrogen regulatory IIA protein PtsN
TTGAGCCTGGACTGCACAAAAAGTGCAGTTCACTGCTCCAGCAAAAAACG
CGCCCTAGAAATTATCAGCGAGATTGCCGCTGAGCACCTTGACCAAAATC
CACAGCCTCTTTTTGAATGTATTTTAAATCGTGAAAAAATGGGCAGTACA
GGAATTGGTAACGGTATCGCTATCCCACACGGTCGAATTCAAAACAGTGA
TAAAGCTATCGCTATTCTAATTCAGTGTCAGGATCCCATTCAATTTGATG
CCATCGATAACCAACCTGTCGATCTTCTTTTTGCTTTACTCGTGCCTGAT
GCACAATGTAAAGAGCACTTAAAGACCCTTTCAAGCATGGCAGAAAAGCT
CAGTAATAAGCAGGTTTGTAAACAATTACGAACGGCTAAAAGTGATGAAG
AGCTTTATCAAATCATGACAAATGAATCATAA
>PBPRA3065 CSRA, putative carbon storage regulator
ATGCTAATTTTGACTCGTCGCGTTGGTGAAACGCTAATGATTGGTGATGA
AGTAACAGTTACTGTACTTGGTGTTAAGGGTAACCAAGTTCGCATTGGTG
TTAACGCACCTAAAGAAGTGTCTGTTCACCGTGAAGAAATCTACATGCGA
ATTCAAGCAGAAAAAGAAAACGGAACTCAAGGTACTGGTAACTTCTAA
>PBPRA3045 S2901, putative autoinducer-2 production protein LuxS
ATGGATGTTATGCCGTTATTAGATAGTTTTACTGTTGATCATACGCGAAT
GAATGCCCCTGCGGTACGTGTGGCAAAAACCATGCAAACGCCAAAAGGTG
ACACAATCACAGTATTTGATCTTCGTTTCTGTCGTCCTAATATGGATATT
TTAAGTGAGCGTGGAATTCATACACTTGAGCACCTATACGCAGGCTTTAT
GCGTAACCACTTGAATTCAGAACGTGTAGAAATTATTGATATCTCGCCAA
TGGGGTGTCGTACGGGTTTTTACATGAGTTTAATTGGCACACCTAGCGAG
CAAGATGTTGCAGCTGGTTGGACAGCAGCCATGGAAGATGTACTAAACGT
CGAGTCGCAAGATCAAATCCCAGAATTGAATGAATACCAGTGTGGTACAT
ACAGTATGCATTCATTAGAAGAAGCAAAAGACATTGCTAAAACAATTCTT
GCTGAAGGGATTAATGTTAATAAGAACGACGAATTAGCCTTGCCTGAAAG
CATGTTGAAAGAGCTTGATGTAAAGTAA
>PBPRA3094 SF2634, putative sigma-E factor negative regulatory protein RseA
ATGGCTGATAAAGAAAAGATTTCGGCGCTAGTTGATGGCGAAGAGCTCGA
TCAGAGTATTATTAATGCGCTGACCGTAGACAAAGAAAGCGAACAATCTT
GGCATGACTTCAACCTTATTGGTGATGTTATCCGAGGTGACGCCCCGCAA
TGCAAAGAATGGAATATTGCTGGATGCGTAGCGTTAGCATTGGATAATGA
ACCTGCTCATGTAGGGTTAACCAATTTTAGTGCAGAATCTGATGTAATTG
CTCCTGTTGTTGATACCCCTGTTATTGATATCAGAACTGCACAACATACT
GAATCTCAGCCTACACCACGTCAGGCTAAGCGTACTTTACCTGCTTGGTT
GACTCAGCTTGGTCAAGTGGCGATTGCAGCGTCAGTATCATTAGCTGTTA
TTGTTGGTGTTCAACAATACAATGGCGGTGATGATGCATTGGTTGCAGAT
GCAACGAATTCACAATTACCAGTACTTCAAACCATTCCGTTTGGAGGAAA
AGCTGAACCTGTCAGCTTAACGCGTGATTCTGTCCGTACTGGTGCGCACA
ATAGTGCACCAAGTGAAGCGCAATTAATGGAGCAACGTCGTCGTATTAAC
GCGATGCTGCAAGATTATGAATTGCAACTTCGCTTTAATGCAGAAGATGG
CAGTATTGATAGAACATTATTAGAAGCAAATTCATCTGTGGCGGATTAA
>PBPRA3171 SO0874, putative DnaK suppressor protein
ATGCCAGAGATCAAGCTTAAAAAATCACTTGGCATCCTGGCTATTGCTGG
GTTAGAGCCATACCAAGAAAAAGTCGGCGAAGAATACATGGGAGAGGAGC
AACTTGCGCACTTTCATAAAATTCTCGACGCATGGCGTAACCAGCTTCGT
GAAGAAGTTGATCGTACTGTAAACCACATGCAGGACGAAGCAGCCAACTT
CCCGGATCCAGTAGACCGCGCAGCTCAAGAAGAAGAGTTCAGCCTGGAAC
TACGTAATCGTGATCGTGAACGTAAGCTGATTAAAAAAATTGCAAAGACA
CTTCAACGTATTGAAGATGATGATTTCGGTTTCTGTGATTCCTGCGGCGT
TGAAATCGGTATCCGCCGTCTTGAAGCTCGCCCAACTGCCGATCTATGTA
TTGACTGTAAAACACTTGCAGAAATTAAAGAAAAGCAGATGGCAGGCTAA
>PBPRA3314 SO1586, putative cAMP-binding proteins
ATGAAAGAAGCACTGGACCACTTTTTACAGCAGCTAGGTGCCACCAGCGA
ACAAGCGCACCACATATCAGAACAGGCGAAGTTATTAGAACTTCCTACTC
GTCATATATTACTCAATCAAGGTGAGTATTCAGAGCATTGCTTCTTTTTA
CTCGATGGGATTTGTCATGCATGTTATTTAACAGAAGACGGCAATCAGTT
CAGCAAAGAGTTTTATTGGGATCAAGACGTTTTATTAGGGTTTGAAAGCC
TTATAACCCATCAAGCATCACCTTTTTTATTGGAAACATTGTCTGCCTGC
CAGCTGCTTTCTTTACCAATCCAATTATTGCAGGAATGGCGAGAGCAAAA
TAACCCTCTCTACATTAAGCTCGTTGAACGCCAGTTAATCTACAAAGAAC
AGAAAGAGCGTTTTATGTTAATGCATACACCTGAAGAGCGCTTCAAACTC
TTTAGCGAAAATTTCCCTGCTTTATTAGAACGTATAACAGATTATCAATT
GGCGTCTTACCTTGGCATTAGCCCGATAAGCTTAAGCCGTATAAAAAAGC
GTATAAATGAAAAATGA
>PBPRA3166 SO1942, hypothetical HD-GYP hydrolase domain containing protein
ATGGCCAGCATCAAAATCTCAGTGGAACGACTAACCGAAGGCTTATATAT
AAAGTTGCCACTGCAATGGGCTGATCACCCGTTTCTTCGAAATCATTTCA
AAATTAAAGATCAGCAGCAAATTCGCCTGATCCAAAAACTAGGCATTCAG
TTTGTTTACCTGCTGCCAGAAAAGAGTGATAACAACCCTCTTGCCCCCGA
GACAACAGCAGATAAAATTTCTGAACAAGAAGAGAAATTTCTCGATAAAC
AAGCAGAAAAACTCTGGCAAGAAAAACAAGGGCGAATAGAACGCCTTAGA
AACTACAAACGTAAAATTCAACGTTGTGAAAAGAATTTTGATCGCTCCAT
GTCACAGCTACGTTCCATTATGGGGAAAATTAAAAGCCGCCCATTAAATG
CCATCACTGAAGCTGATTTTTTAGTTGAAAGCATGGTGGATACTTTAATG
GAATCAGACAATGTCGCATTGCATTTAATGAATGATAAAAAAGATTCCGA
AGATATCTACTTTCATTCTCTGAATGTTGCGGTGTTATCCATGCTGTTGG
GCAAGTCTCACGGTATGTCTGCGGCAGAAATTAAAGTCATTGCGTTGGGC
GCACTGTTTCATGATATGGGAAAGCTTAAAATCCCAACCGCGATCTTACG
AAAAACAACACCATTATCAGCCCCTGAAATCAACTATTTGAAACTGCACC
CTAAATACAGTTTTGATTTAGCTAGCCTTGCTGATAACTTTCCTAAAGCC
GCAATGCCTATTCTGCTTCAGCATCATGAAATGCTTGATGGTAGCGGTTA
TCCGAAACAGCTGAAAGCCGATGACATCGATTTATACGCTCAGCTAGTCT
CTGTCATTAACGCTTATGACAACCTGTGTCATCCCACGGATAAGAGCCAA
GCCCGTATTCCTTATAGTGCCCTATCTTATTTATTCAAAAATAAAAAAGC
GCAATATAACGGTGACTTTTTAGCGTTATTGGTTCGGATGATGGGGGTGT
ACCCTCCCGGTAGTGTCGTGCAACTTTCCAACCAACAATTAGGATTGGTG
GTTTCTGTCAATTCAGATCGTTTACTGTATCCGAATGTATTGATTTACGA
TCCATCGGTACCTCCCAATGAGGCCCCTATTTTAGATCTGGAAGAAAGCG
AATTAAAAATAGAGCGAGCGATACCACCTAATAAGCTCCCCGAAAAAGTG
CATATTTACCTTAATCCTCGGGTACGTATTTCATATTACTTTGACCCTAA
TGATTAA
>PBPRA3084 STM2958, putative sensor histidine kinase/response regulator
TTGAGTGCCTTCTTCACGATGAGCCGCTATCGAGATCTTGAGCACCAGCT
GATTTCTACGGGTTCTAGTATCATCGAACCTTTAGCTATTTCATCTGAAT
ATGGGATGACAGACAAGAACCGTGAAGCAGTGCGCCGTCTGATCAGCTAC
ACCCATAGAAAGAACTCTCAAATCATTCGAAGCATTGCGGTTTTTGATGC
GAATAATCAGTTATTTGTGACCTCTAATTTTCATCGTAATTTTGAAACCT
TGATGTACCCTACGGGTCAACCTATCCCATTATTACTTGAAACACGATTA
AGTGATAACTCACTGATATTACGAGCACCTATATTAGCTGAAGGGCAGTT
TGGCAGTAACAATTCGAACAGTTATCAAGGTAAAGCATTAGGCTACATAG
CACTAGAATTAGACCTTAGCGCCTTGCGCCTACAACAGTATCAAGAAGTC
TTCACCGCTTTAATGGTATTACTGTTTGGGCTAACGCTCTCTTCATTATT
TGCGTACCGCTTGATGCAAGATGTAACCCGCCCTATTTCGCATATGGTGA
GTGTAGTCGATAGAATTCGACGAGGGCACCTCGACATTCGAATTGAAGGG
CAACTGCTTGGTGAGCTGGATACGCTTAAAAATGGTATCAATGCCATGGC
TATCTCGCTGTCTGAATACCATATCGAAATGCAACAAAGCATCGATCAGG
CTACTTCTGATTTACGAGAAACGCTTGAACAGCTAGAGATTCAAAACGTT
GAACTGGATATTGCGAAAAAACGCGCTCAGGAAGCAGCACGTGTAAAATC
GGAATTTTTAGCCAATATGTCGCACGAACTGCGAACACCACTCAACGGTG
TTATTGGCTTTACCCGTCAAATGCTAAAAACGCGATTGAGTTCAAGCCAG
CACGATTATTTGCTTACCATTGAAAAATCCGCCAATAACCTCTTAACCAT
CATTAATGACATCCTCGACTTCTCTAAATTGGAAGCGGGCAAGTTGTTGC
TTGAAAATATTCCATTCGACTTCACTGAATCACTTGATGAAGTCATGCGA
TTACTGGCACCAAGTGCACACGAAAAAGGGCTTGAGCTAACACTGAAGGT
TGATGATCGTATTCCTGCTGGCTTAATTGGCGATCCGTTGCGTATTCAGC
AGGTTGTCACGAATTTGATCGGTAATGCCGTGAAGTTTACCGAACGGGGT
AATATTGATGTTTCTGTTGAATTAAAAGCCAGCAAAGATGAAAGCATCGA
GCTGCAATTTACCGTTCGTGATACAGGTATTGGTATTTCTGAGCGCCAAC
AAGCCCAATTATTCCAAGCCTTTAGCCAAGCAGATGCCAGTATATCCCGA
CGCTATGGTGGTACAGGGTTAGGGCTGGTTATTACCCAGAAACTAGTCAC
GCAGATGGGTGGAGAGATCAGCCTAACCAGTCGCTTACATCAAGGATCAA
CATTCTGGTTCTCATTAAGCATGCTGAAAACCGATCTTCCGGTCTCTCAA
CCAATCGATACCACCGCGTTGGTAGGTCAGAAAGTATTGTTGATCGAACC
AAACATGCAGGCGGCATCTATAGTGCAGCAGCGCCTTATTAAAGCAGGCA
TGTTTGTGACTTATCGTTCCACCATGCCTGAAGAGGTAGAGCATCATCAG
TTCGCCTTAATTTGTTTGCCTCCTGGTCAGCAGCCACCTATCGCAATACT
CTTGGATCGCGTATTCAAAGCGGAGCAAGTCACTGATAAAGTGATTATCA
GCCTGCCAACCACTGAATTGGCCTTATCAGAACGTCTGATCAATGCAGGG
GTATCTGCGTGTTTAGGTAAACCTCTCTCGCATCGCAAGCTGTTTGAAGT
ACTGAATAATAAACCCGATGACATTTTTGAACCTGAGCTATTATCATTAC
CAGAAACCGCTCAAAAAATTGAGCCTCTCACCGTAATGGCTGTTGATGAT
AACCCTGCCAACTTGAAGCTCATCTCTGCCTTATTAAGTGAACGTGTCGA
AACAGTTATTACTGCAACAGGCGGTAGAAAAGCGGTTGAGTACGCGCATC
AAAAAGCATTTGATCTGATCTTTATGGATATTCAAATGCCTGAAATGGAC
GGTGTAACGGCATGTGAAGCGATTCACAAAACAGAATTAAACCATTCAAC
ACCTGTCATTGCAGTAACAGCGCATGCTATGCCTGGCGAGCGTGAGCGTT
TAATTAATGCTGGTATGGATGATTACTTAACCAAGCCTATCGAAGAGCAT
ATTCTTCAGCAAATTTTGGCGAAGTGGAATCAACCACCCGAAAATGAACA
CAACCAGAATACTATTATTGATCTTGAACCCGACGTAATTTCGACGCAGC
AACACCCGATTCAAGACAACAAAGATATCAGCTGGGATTGGGATTTAGCA
CTGAAGCAAGCAGCAGGAAAAGAAGATCTTGCCAAAGACATGCTGCAAAT
GCTGCTCGATTTCATGCCTGAGGTTGAAATGCTGGTCAATGAAGCGCTGG
ATGGGAAAGACATAGAGTTATGGCCACCGATTCACAAACTGCATGGTAGC
TGTGCATACAGTGGTGTACCTCGATTGAAGAGCTTATGTTACACCATCGA
AACACAGCTTAAAGCCAATGCAACGGTCGCAGATATCGAACCTGAGCTCT
TTGAGTTAATGGATGAGATGAACCACGTTGTAAAAGCCTCTAAGGCATTT
AGAAACAGGTAA
>PBPRA3093 T0272, putative sigma-E factor regulatory protein RseB
ATGATTAAAATTCTGGTCGGTGCCGTGACACTGGTCAGCCTATTGATGCC
AATACAAGCCTCTGCTGAAGAACCTATAGTTTCAGCAGAGGCTTTGTTGC
ATCAAATGAATGAGGCTAGTAGAGACCTCAGTTATGAGCTCTCTTACATA
CTAATTAAGAAAAATAGTATTGAACCGCTGCGTTATCGCCATGCTGTAGA
AGATGGTAAAACGTATGCACATCTTATTTACCTTAGTGGCCCACCACGTG
AGGTGATTCAGCGTGGTCGTGAAGTCAGTTATTTTGAACCGGGGTTAGAT
CCGTTCACAATCGACAGCAATAAAATGGTGGCACCGTTGCCTCCAGTCAT
GAAAACAAATATTCATGAATTGTCGGATTTCTATGATTTCATATCGATGG
GACGTGCGCGTGAAGTCGGTGTGGCTTGTGATGTTATACGCGTTGCTCCC
AAAGATGGGACGCGTTACTCCTACTTATTGTGGATAGATACACGTAGCCA
TTTAGTGATGCGTGCTGATTTGCTGGATCGTGACGGTGAACCATTAGAAC
AGTATCGTGCTGTTTCTTATGTGGTTAACCAAAAAGTCGGGGAAGTACTT
AAGAATTTGAGTACGGTTGATTTACCGGCTGTTGTACAACTACCACCACA
GCCTCAAGCTGATCTTGGTTGGTCGGTGAATTGGTTGCCTCAAGGTTTTG
AGTCTGTCTCACGTAATCGCCATCGCTTGGTGTTAACAGAAAGGCCCGTT
GAAAGTAAAATGTACAGTGACGGGCTATTCAGCCTTTCTATCTACGTTTC
TGATGCTGACAACTATACTGTACGTGAGCAGCTTGTAAGGCAAGGTCGTC
GTACTTTGCATAGCAATGTCGTCGGAGATAAAGAAGTGACTGTCGTTGGT
GATATTCCGCCAGCCACTGCACGACGTATTGCTGAGTCGATTACGTTCGC
TAAAGCCCCAGTTGTAATTCCGACTGCCGAGGGTACTAAGCCATGA
>PBPRA3193 VCA0176, putative methyl-accepting chemotaxis protein
ATGAATTTCAATCAGGTAAGTATTAAACAAAAACTGATCTTCGCCATGGT
CATTGCTGTTCTTTCTTCGACGACTTTAGTCGGTTTTATCAGCCAAAATC
AAGCCCGTAACGTAGTGGAAACACGCCTGTTAGAATCAGAGCTTCCCGCT
ACCTTAATGCAAATCAGAAATACTATCGATAAAGAAGTATCGGTATTACA
GTTTGCGGCACAACAACTCGCCTCTAATCGCTTCATTCTGGAGTCCTTTA
AGCAGGAATCGTCTAAACAATCAAATGCTCAACTCATTCAAGTGTTGAAT
GATATCAGAACCCAATATGATTTGTTCGATGCTTCTATTGCCGATCGCAC
GACAGGAGATTATTGGAATCAAACCGGTTTTTTACGCCGCTTAAACCAAC
AGCAAGATGGCTGGTTTTTTGGTTTTATCAATAGTGGCAACGAGAAGATG
CTTAACGTTTTCCGTGAAAACAACGGGGATGTAAAACTGTTCGTCAACTA
CCAGCAGCTAAATGGCAGCGGGATGGCAGGTTTATCAAAATCTCTGGATG
ACATGGTGGCTTTTATTAACCAATTTAAGCTAGAAGAAACAGGCTTTGTT
TACCTTGTCGATGCCAAAGGTGCAGTACGGCTACATAAAGACAGCAGCAA
GATGGGCAACGCTAGCCTGACTCAAATGTACAGTTCTGATGTTGCCCGCA
CACTACTCAACAAAAACAACGTTAACTTTTCTGAATATACAATCGCAGGT
AAAGATACGTTGCTTGCAACTAGCTATATTCCCTCAATGGATTGGTATGT
CGTTGCTGAACTACCAAAGGAAGAAGCGTTTTCAGCATTAAACCAAGCAC
GAAATGAAATAATGATCTGGACAGCTATCATTGCTGTTACTTTCATCTTT
ATTGCGATTTGGTTAGGCACTAATATCACTCGCCCTATCGAACGCCTTGC
TGCTGTATTTAAAGATCTAGGAGAAGGTGAAGGTGATTTACGTCATCGTA
TCGATGTGCAGGGAAAGGATGAAATCGCTCAGCTTTCTATCGGCTTTAAT
AGCTTTATTGCGAAAATTCATTATTCCGTGAAAGAAGTCGCTGAAACAGG
TAACTCGCTACGTGATGCTGCAGAATCTGTTGCTTCACAAGCACAAATCA
CCTTAGATAACAGCCATAGCCAGCGTGACCGTACTATTCAAGTTGTTACT
GCAATCAATGAAATGGGTGCAACAGTCAATGAAATTGCGGGTAATGCCGC
GAATGCAGCAGAAGCAGCGCACAACGCTGAAGAAGAAACGAAAAATGGTC
AGCTTGTTGTCGCTCAAGCACGCGATACCATTAATCAATTAGCGAATGAT
GTTGATCAGGTGAGCGAGGTGATTGGCTCGCTAGCCCACAATACCCAAGC
GATTGGCAGTATTCTCGATACCATTCGCGGTATTTCAGAACAAACCAACC
TGTTGGCATTAAACGCTGCTATCGAAGCTGCCCGGGCTGGGGAACAAGGG
CGTGGGTTTGCTGTGGTCGCCGATGAAGTGCGTAATTTAGCCAGCCGCAC
GTCTGATTCAACCAACGAAATCCAAACGATGATTAATCGCCTGCAAGAAG
AAGCCAGTGATGCCGTTACCGCAATGCAACAAAGTCGTCAGCTAACATCA
AATGGGGTTTCTGCTGCCGACGAGGCATCTGGTGCACTGATTTCGATTAG
CGATCGAATTGCCTTAATCTCTGATATGAATACCCAAGTCGCCACCGCCA
CAGAAGAACAGTCAACGGTAGTGAATGACATTAACTGTAATATTGAAGAG
ATTAACGAAACCACCCAACGTACTGCAGAGACGGCGTCGGAATTAGCCGA
TTCCAGTCAATCATTACGTGGTTTATCTAAACGTCTTGATGATATGGTTG
GCACCTTCAAACTGTAA
>PBPRA3375 VVA0366, putative methyl-accepting chemotaxis protein
ATGAGATATACGATCAAGTTTAAAATCCAAATAGCGATTGCGACTATTAT
TGCCGCCGTCAGCACTGTACAAGCTTGGATTTCAATAAACCAACTAAAGC
AAGAAACGACCACCGAAATCAGCCGTCAAATGACAGATATTGGTGAAGCC
ACCAGCCGCTACATCAGTAATTGGCTAGATACGCGCAGCGACATGATGCT
AGCCAATGAACCATTGATTGCGAGCGAAAATAATATCGATCGCGAACTAC
TATTAACCAAACGCGCAGGGCATTTTCTGTCTGTTTATGCCGGGTTTTCA
GATGGTAGTATTGCTTACGGTGATAAATCGGAAGATTGGCCAGCAGATTA
TGACCCACGCACTCGTCCTTGGTATAAAGATGCGACCTCAGAAAGCAAGT
TAGTACTTACTGACCCATACAAAGACTTCGATGGCAGTATTGTCGTGAGT
TTTGCTAAAGCATTTCGGGGGCAAAATTCGGGGGTATTAGCCGCTGATTT
AACGGTTAATCATATTATCGACCAAGTACTCAGCTTAGAGTTGAATCACG
ACGGTTTTGCTTTTTTAATTGACGGTAATAACCGTATTGTCGCGTATCGC
GATGAAGCGCTAAGTCAGCAACCACTGACTCAGCTTGATAGTGAGCTAAC
ACCAGACCTTATCCGCAAGCTGCAAAATGACAACGCCATTCATACCTTCA
CGCTAGACAGTGAAAACAGCGATAAGATGATTTTTGTCACTCCGATCGCA
GGTACAAACTGGACACTGGGTATCATCGAAGATAAGTCCTTAGCATTCGC
CTCGATTACCGAACAGATGAAATTCCTGGTTCTGGCATCGCTAGGGCTGT
ACATCATCATTTCAATTATTGCGACACTGATCATTAATAACTTACTGCGA
CCGCTGAATAACTTAAATAAATCAGTAAGCCAATTAGCCCAAGGCAGTGG
TGATTTAACACAACGCATTGAAATTGAACGCATGGATGAAATCGGTGAAC
TTGCTGACAGCATGAATCGATTTTTATCGCAGCTACAAGCGATGATTAAA
GATGCAGTGGCGCACTCACACACCCTGAGCGAATACGCAGATACCTCATC
AAAGCAAACCATGCTGGCCTCAGAGAAAGTCGCCGAGCAGCAAAACGATG
TGAATCAAATCGCCACCGCGATTCATGAAATGTCGGCAACATCGGGCGAA
GTAGCCAGCCATGCTGAAATGACTGCCGCCGCCGCACAGGCATCGACGAA
TGCCTGTGATGAAGGTCAGCACGTTATCGGGCAAAACCGTGATGCAATTA
CAATGCTAGCCAATCAAGTGCAAGAAGCCGCAACGGTTATTCATGAACTC
GAAAGCAACGCACAAGGCATCAACCAAATTCTGTCGACCATTCAAGGTAT
CGCCGAGCAAACGAACCTGCTGGCACTTAATGCTGCAATTGAAGCTGCAC
GAGCTGGAGAGCAAGGGCGAGGCTTTGCCGTGGTCGCCGATGAAGTACGT
GTATTGAGTAAGCGTACCCATGATTCGACCGAAGAAATTCGTAGCATGAT
CGATACCTTGCAAAAGAATACCCACCAAGCTGTCAATAGCATGAAAGCAA
GTACCGATCTTGCAGATAAAAGCGTGGGCTATGCTGAAGAAGCCAACCAG
AGTCTGTGTAAAATTACCGACGCCATTACTGAAATTTCCGACATGGCGAC
CCATATTGCCAGCGCTGCAGAAGAACAACGCGCAGTGAGCGAAGATATCA
GCCGTAATACCCAGGCGATTAAAGATGTCTCTGACCATTTAGCAAATCAA
ACTCTAGAAGTAAGCCAAAGCGCACAAAAGATCAGTGATTCTGCAGGGGC
TATGCGACAAGATATGTCTCGCTTTAAGGTGTAA
>PBPRA3287 Y0203, putative MSHA biogenesis protein MshH
ATGAGAAAAGCATCAGGGATGAAGTTAACCAATCGTTTGGTTGCTTTTGT
CACGCTTATTGTTATTTGTGCTATTTTCGTTGTGTTTATTGGCGGTGCCA
TTAGCTTTCGAAAATTAGGGCAAAATTATCTGACCAACTATCTTGATGGT
GTGGTTAACGTTATCGATCAACAATTGGCAGATCCTGAGGGCGCGCAAGC
ATTCTCACGTTGGCTACCGCATTTATTAAAAGCCAGTAATGTCGTTGAAC
TTGAAATTAGCAGCTCTGCAGGCTCTATATACTCTTTTAAAGGCTTGCAT
CCACTCTCCGATCCTAATGTATTGTATATCAGCCATTACCAGCTTGAGAA
AAACACAGGCTTTAATATCGATATTAAGTCACTACCTCCTTATACCGAGT
TTACCTATTCGATAGGCGCAATGTCATCAATCAGTATTGCTATCATGATC
ATTATTATGGGCTTGGTATGGGGCATGAACTGGTTACGTAGGCAATTACA
TGGTTCAGAGCTGTTAGAAGTACGAGGACGCATGATCCTTGCTGGGCGTG
TCGATAAATACGCTGTCGGTTCTGAAGAGGAGTGGCCTGCAACAGCAAGT
TTAGCCCTTGATCAAATGATTGCTGAGTTAAAAGATGCCCGTCAAGAGCG
CAGTCGTTTTGATACGTTTATTCGTACTCACACATTTCTTGATCAATTAA
CGGGCACAGCAAACCGAGTGTTATTTGATAGCCGCCTTCAATCAATAGTG
CAAGATCAAGACACCTATGGCTCTGTTATTTTGATTCGTATTTCAGAATG
GGATCACTTACTGGCAGAAAAGGGAAAAGAGGCAGCTGATGACTTAATCC
AAGATGTGGGTATGATCTTATCTAATTTAATCCAGCGCTATTCAGATACT
GTTCTTTCTCGTTACTTTGATGCTGAATTTGCCATTATGATCCCACAGCA
ATCAGCAAAAGAAATAAAGCAATTTACCAGTCAACTATTAAAAGCATTAG
AAAGATTGACCCCAGCAGCACCACTTGAAACTGATAATTGGTGTCATATC
GGGGTGACTTTCTTTTCTAGCGGTGAGCGACGAGGCCGTATTATGGATGA
GGCTGATATGGCATTACGGAGTGCACAGCTTCATCGGGCAAACAGTTGGT
ATGCATTTAAGAAAGAGCAGCAATGGGATGATAGTCGAGGCAGTGTACGT
TGGCGTACCTTGTTAGATGCAGTATTTAATGCGGGTGGCCCGATATTGTA
TCAACAACCCGTTGTTAATGTTGATGGTGAAACATTACTTCATCGCGAAT
TGTTAGCGCGTATTAAAGATGAAAATGGTGTTTTGATTAAAGCATCTCGA
TTTCTTCCTGCTGTTGAACAGGTTGGTTTTAATATTCGCATGGATAAATT
GGTTATTGCCAAATCATTACAATTGCTAAAAACAATGCCAGTGAGCGATG
TGTTTTCTATCAATGTCAGTATCATCGCACTATTAGATAAACGTTTTGTT
CGTTGGCTAAGAGATGAGTTATTACAAACCCCGCGAACAGTGTTGAATCG
TCTATCGTTTGAAATACCAGAGGGAAGTTTAGTTAAGCATCTTGATGCTA
TGCGACCTGTCGCACGGATGATAGTCGGGCTTGGTTGTAAACTGGTGATC
GATCAGGCGGGGAGAACCATTGTAAGCACCCATTATATAAAAGATATCAA
AGTGGATTATATTAAACTCCATCGAAGCCTTATCCGTGAAATTCATCAAA
GGCAAGAAAATCAACTATTTGTTCGTAGTATGCTCGGTGCTTGTGCCGAT
TCGAATGCAAAAGTTATCGCTGTTGGCGTGGAAAATAATAAAGAATGGCA
GGTATTAAAACAGCTTGGTGTACATGGCGGACAAGGCCGGTATTTTGGGG
CTGAAATCTCGTTAATAAGTGATTCAAACATACAACAGAAGTAG
>PBPRA3082 Y0811, putative GTP pyrophosphokinase
ATGGTCGCAGTTCGCGGTGCGCATTTAAAGGAAAATGATACATTTGAGCT
TTCATCATGGGTTGATAGCCTGCAGCAAGATGCCAAAGCATCTAAACGCT
TAAAAAAGACCTATCAACGATGTATCGAAATAACGACTAAGGAAGAGTCT
ACGCCATTATTATTATGGCGTGGCCGCGAAATGGTAGAAATTCTAGTTAC
CCTGAGTATGGATGCAGATACTCTGGTCGCTGCGTTAGTAGTCCCGCTGG
TTGAAGCTGGGATCTATCAACATGAACAAGTTAAAGAAGATTACAACACC
ACTATCATGCAGTTGGTAAAAGGTGTTGAGCAAATGGCCGCGATTGGCCA
GTTGAATGCGACCACCGAAGGTGCCGAGCAATCGGCACAGGTCGATAATA
TTCGCCGCATGTTGTTATCTATGGTTGATGACTTCCGTTGTGTTGTCATT
AAGCTTGCAGAGCGTATTTGTAATCTGCGTGAAGTGAAAGATGAGCCGGA
TGAGGTACGTCGTTCTGCAGCACGTGAATGTGCCAATATTTATGCACCTC
TAGCAAACCGTTTAGGCATTGGCCAGCTTAAGTGGGAAATTGAAGATTAC
GCTTTCCGCTATCAGCACCCTGATGTGTACAAGCAAATTGCTAAGCAACT
ATCAGAACGTCGTATCGACCGTGAATATTATATTGATCACTTTGTCTCTG
ATTTAGATGAATCAATGAAAGCGTCGCACATCAAAGCCGAAGTGCATGGT
CGCCCTAAGCATATTTATAGTATCTGGCGAAAGATGCAAAAGAAAAGCTT
AGAGTTTGATGAGCTATTTGATGTACGTGCGGTACGTATTATTGCTGATC
AGCTACAAGATTGTTATGCCGCATTAGGTGTTGTGCATACTAAATACCGT
CATCTTCCAAAAGAATTTGATGACTATGTGGCGAACCCTAAACCGAATGG
TTACCAATCGATTCACACCGTTGTACTGGGGCCAGAAGGCAAAACAATTG
AAATTCAGATCCGTACTAAGCAAATGCACGAAGAGTCTGAATTAGGTGTG
GCAGCACACTGGAAATACAAAGAAGGCTCATCATCGGGTGCTGCGAAGTC
ATCTTATGATGAGAAAATTAACTGGCTTCGTAAGCTACTTGTGTGGCAAG
AAGAAATGTCTGATTCTGGCGAAATGCTGGATGAGTTACGTAGCCAAGTC
TTTGATGATCGTGTTTATGCTTTTACGCCCAAAGGTGATGTGGTTGATTT
GCCGTTAAATGCAACCCCACTCGATTTTGCTTACCATATTCACTCTGAAG
TTGGGCACCGCTGTATTGGTGCCAAAGTAGAAGGGCGTATTGTGCCATTC
ACTTATCACTTACAGATGGGTGAGCAGGTTGAAATTATCACCCAGAAAGA
AGCTAATCCGTCACGTGATTGGTTAAACCCTAATTTAGGCTTTGTGACCT
CAGGTCGAGCAAGAGCCAAAGTGCATGCGTGGTTCCGTAGGCAAGCCCAT
GACAAAAACATGGTAGCGGGGCGTGAAATCTTAGAGCTTGAACTGAATAA
AATCGGCGCCAAGCTTAAAGATGCAGAAGTGTATGCATTAAAGCGTTTCA
ATGCTAAAAACGTAGATGAATTGTTTGTTGGTATTGGTAGTGGTGATTTG
CGTATTAACCAAGTGGTTAATCACATCAGCATGATTATTAATAAGCCAAC
GGCAGAAGAGGAAGACCAACAGTTAGTGGATAAGCTGACTGAAGCGAGTA
CCAAAATCAGTACCAGTGCGAAAAAGCCTCAGCGTGATGCTGTTGTTGTT
GAAGGCGTCGATAACTTAATGACCCATTTAGCGCGTTGTTGTCAGCCGAT
CCCTGGTGATGAAATTGTGGGTTTTGTCACCCAAGGTCGTGGTATTTCTG
TTCACCGTAATGACTGTGAGCAACTTGCAGAACTGCGTCATCATGTACCA
GAACGTATCATTCATACGGTATGGGGCGGTGGTTTCGTGGGTAATTATAA
TATTACAGTTCGAGTAACAGCCTCAGAGCGGAATGGCTTAATTAAAGAGC
TGACCAACACTTTAGCGAATGAAAAAGCAAAAGTGGCGGGAATGAAAAGT
CGCATTGACTACAAAAAACAGATGTCGATTATGGACTTTGACTTAGAACT
CACCGATTTAGACGTGCTGAGTAAAGTGCTTAAGCGTATCGAGCAAGTTA
AAGATGTCGCTGAAGCCAAGCGTTTGTATTAA
>PBPRA3092 Y1293, hypothetical protein
ATGATGCGTACGCTGGCAACGGTTATTGCCGTTGAACAAGGCAGTGTAAC
TGTCAGTTGTCAGCAACAAACCAGTTGTGGCCATTGTGCTTCACGTGATA
ATTGTGGAACAGGTATTGTGACCAAAGCAATCCCTGGGCGAGCACACCAA
GTCACGTTAGCGACGGACAAGCCACTAACGATTGGTGAAATTGTTGAAAT
TGGATTATCAGAAAAAAGTATGCTGAGTTCTGCACTGCTAGTGTACATTG
TGCCGTTACTGTTCCTAGTGTTGGGGGCGGTTGTAGGGCAGTGGTGGTTT
GTTGACTTAGCAGGCACCAGTGAACTCGGTGTCATCATTACATCTATGGT
CAGTGCAGCTATTGGGCTGCTACTTGCGCGGCAATATGCTAAGCGTTTAG
ACGGCAATTCGGACTATGAGCCGAGCCTGATTCGGGTATTGGGGCAACCA
CTATCATCAGATAAGATGATAAATGCTGCATCGAAAGATAGCGAGTAG
>PBPRA3188 Z0174, putative sugar diacid utilization regulator
ATGCAACTGAATGCCACCATTGCTCGACAAATAGTTGAGCGCACCATGAA
GATCATTAAATATTCCGTCAATGTGATGGACGAACAAGGCCGCATTATTG
GCTCTGGTGATACCTCACGCCTAAACCAGCGCCATGAAGGGGCAATTCTG
GCACTCAACGATCATCGTATTGTTGAAATAGATGATGCCACCTCAAAACA
GCTTAAAGGCGTTAAACCGGGTATTAATTTCCCCATCATCTTCCAACATA
AAGCGATTGGTGTCGTGGGAATATCTGGCGAGCCGGATTTAGTGCGCAAT
TATGGCGAGTTAGTAAAGATGACCGCTGAGTTAATCGTAGAACAAGCCGC
ATTAATGGCGCAGGTTCAGTGGAATAAGCGCCACCGTGAAGAGTTGGTTC
TGCAGTTGATTGAAGAAGGTTCTGAATTAAATGAAAACCAACTGCTTTCC
ATTGCTGAACGGTTAGGTTTAGATCTTGCTCAGCCTCGTATTGCTGCGAT
TGTAAAAGTATACCCAGTAAAAGGTAAAAGCTTATCGTTAGATCACCTGC
AACGTTTAGTCCATCTGCTTGAATACCCAGAGCGGGATAATTTAGTCGGA
ATTGCCTCGGTATCGATGAATGAAGTTGTGGTGCTCAAACCCATTACCTT
GAGCGATAACGGTTGGTCTCGCGCACTGGAGCAAAAACGCGTCAATCAAT
TAATGAAGCGGGTCACGAAAGAAGGTGACTTTACTATTCGAATCGCCTTA
GGTGATTACTTCCCTTCGTTGCAAGGCCTCTCTCAGTCTTTCATGACGGC
AAAAGCCACTATGGAAGCCAGTAATACAATAAATAGTCAGCAAGATAACG
TGCTGTTCTATCAAGATCATATCTTGCCAGTTTTACTAAACGGTTTAAAA
GATGATACTTGGCGTCAAGAACAATTGCTAATGCCGTTAGTCAAACTGCA
ACAAAATGACCCTCGTGGTGTGTTAATCAAAACATTGAAAGCATTTTTTG
TTCAAAATTGTGATTTAGCTCAAACGTGCGAAATGTTACATATTCACCGA
AATACGCTTCGTTATCGCCTAGAGAAAATAGAGCAAGAAACATCGTTAAG
TTTCAATAATATAAGCGACAAAACACGGCTTTACTTATCCCTATTAAGCC
AGCCATAA