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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA3542 putative ATP-dependent RNA helicase, DEAD boxfamily
ATGAAGACGACTCACATCACAGAGCAGAAATTTGCTGACCTAGGTTTAGA
GCCTACGGTTTTAGAAGGACTGGACGCACAAGGGTTTCATTATTGTACCC
CGATCCAAGCTTTAGCATTGCCGGTTGTGCTCACCGGCCAAGACATCGCA
GGTCAGGCTCAAACAGGTACAGGGAAAACCCTGGCTTTTTTGACCGCGAC
TTTTAATTATTTGCTTCTTAATCCCGCATCGGATGAGCGCAAAACTAACC
AGCCTCGCGCTATTATCATGGCACCAACCCGTGAACTGGCTATCCAGATT
TACAATGATGCCGCGCCACTACTTGCAAGCACTGGCCTTAAAGCCGGCCT
CGCATACGGTGGTGAAGCGTATGAAAAGCAACAGAAAGTATTTGCTGAAG
GCGTTGATATCCTTATCGGTACTTGTGGTCGTATTATCGACTTCTACAAG
CAGCGTGTTATCGACTTAGCCTCGATTCAAGTGGTTGTACTTGATGAAGC
CGATCGTATGTTCGATTTAGGCTTTATTAAAGACATTCGCTTTTTGTTCC
GTCGTATGCCTGCACCTAAAGCACGTTTGAACATGTTGTTCTCTGCAACA
TTATCTTACCGTGTAAAAGAGCTCGCATTCGAACACATGAACAGCCCTGA
AAGTGTGGTTGTTGAACCGAATCAAAAAACGGGACACCTCATTCAAGAAG
AGCTTTTTTATCCTTCTAATCAGGAAAAGATGCGTCTTCTACAGACTCTG
ATCGAAGAAGAGTGGCCAGATCGCGCCATTATCTTTGCTAATACAAAGCA
CCGCTGTGAAGATATCTGGGGTCACCTAGCTGCCGATAACCACCGTGTTG
GTCTATTGAATGGCGATGTACCGCAGAAAAAACGTGTTCGTATTCTAGAA
CAGTTCACCCAAGGTGATATCGATATTCTAGTGGCAACCGATGTGGCTGC
TCGTGGTTTACATATTCCACAAGTAACACACGTTTATAATTACGATCTAC
CTGATGATGCTGAAGATTACGTACACCGTATCGGTCGTACTGGTCGTGCA
GGCGAAAGCGGTAGTTCAATCAGTTTTGCATGTGAAGAATACGCAATTAA
CCTTCCTGCTATCGAAACTTACATTGAACACCCAATTCCATTATCAAAGT
ATAACTCTGAAGCATTGTTAGACGAGCTACCAGCACCGCTTCGCCTTCAG
CGAACGCCGCGTCAAGGTGGAAACCGTCGTCCTAATGGAAACCGTCAGGG
TCAAGGACAGTCACGTCCTCGTAATAATAACCGACGTCATCCACAATCAC
AGAAGCAACAATAA
>PBPRA3432 putative DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGGTTTACTCTTATACCGAGAAAAAGCGTATCCGTAAGGATTTTGGTAA
GCGTCCGCGCGTTTTGGATGCTCCATACTTGCTGTCGATCCAGCTTGATT
CTTTTAAAAAGTTCATCGAGCAGGATCCAGAAGGGCATTACGGTCTAGAA
GCTGCCTTTCGTTCTGTTTTTCCAATTCAGAGCTATAATGGCAATTCCGA
GCTGCAATACGTTAGCTATCGTCTCGGTGAGCCGGTCTTCGATGTTAAAG
AATGTCAAATTCGTGGCGTTACTTACTCCGCACCGTTACGTGTGAAGCTA
CGTCTTGTCATGTATGACAAAGACGCACCTGCAGGCACCGTAAAAGACAT
TAAAGAACAAGAAGTATACATGGGCGAAATTCCGCTCATGACAGATAACG
GTACTTTCGTTATTAACGGTACCGAGAGGGTTATCGTATCCCAGCTGCAC
CGTAGCCCGGGTGTCTTCTTCGACAGCGATAAGGGTAAGACCCACTCCTC
AGGTAAAGTGCTTTATAATGCACGCGTAATCCCATACCGTGGTTCATGGT
TGGATTTCGAATTTGATCCTAAGGATAACGTATTCGTACGTATCGACCGT
CGTCGTAAGCTAGCAGCATCTGTAATTTTACGCGCACTTGATTACACCAC
AGAACAAATCCTTGATATGTTCTTCGATAAAGTTTCTTTCGAAGTTCAAG
GTAAGTCACTAGTCATGGAATTAGTGCCTGAACGTCTACGTGGTGAAACT
GCAAGCTTTGATATTGAAGCTAACGGTAAAGTGTACGTTGAACAAGGTCG
TCGTATCACTGCTCGTCATATTCGCCAACTAGGCAAAGACGGCGTTGATC
AGATCGAAGTACCTGTTGAATACATCGTGGGTAAGATCTCTTCACGTGAT
TACGTGAATGAAGAAACCGGCGAACTAATTGCAGCTGCTAACCAGGAATT
AAACCTGGAAATATTAGCATTGCTTTCTCAGGCAGGTCACAAGTCTATTG
AAGTTCTATTTACGAACGATTTAGATTACGGACCATACATGTCTGAGACG
TTACGTGTTGATAGCACGACAGACCGTCTAAGTGCGTTAGTCGAAATCTA
CCGCATGATGCGTCCTGGTGAGCCACCTACACGTGAAGCGGCTGAACAAC
TGTTTAATAGCTTATTCTTCTCTGAAGATCGCTATGACTTATCAGCTGTT
GGCCGTATGAAGTTTAACAGCTCTCTTCTTCGTGAAGAAACAACTGGTTC
TGGCATTCTTGATCACAGCGATATTATCGAAGTGATGAAGAAGCTTATCG
AGATCCGTAACGGCCGTGGTGAAGTTGATGATATCGACCACCTTGGTAAC
CGTCGTATCCGTTCAGTTGGTGAGATGGCTGAAAACCAGTTCCGTGTTGG
TCTAGTTCGTGTTGAGCGTGCTGTTAAAGAGCGTCTAAGTTTAGGCGATC
TTGATGCAATCATGCCTCAAGACCTGATCAATGCTAAGCCAATTTCTGCT
GCAGTTAAGGAGTTCTTCGGTTCTTCTCAATTGTCTCAGTTTATGGACCA
GAACAACCCACTATCAGAAGTTACTCACAAACGTCGTATTTCGGCGCTTG
GTCCAGGTGGTCTGACTCGTGAACGTGCTGGCTTTGAAGTTCGAGATGTA
CACGCGACTCACTACGGTCGTTTATGTCCTATCGAAACGCCAGAAGGTCC
AAACATCGGTCTAATCAACTCGCTATCTGTATATGCGCGTTGTAACTCTT
ACGGTTTCTTGGAAACTCCATACCGTAAAGTAGTTGATAGTAAAGTTACC
GACCAAATCGATTACCTGTCTGCTATCGAAGAAGGCCAGTATGTTATCGC
TCAGGCGAATGCTGCGTTGGAAACTGATGGTAGCTTTAGCGATGAACTAA
TCACTGCTCGCCAGAAAGGCGATTCAGGTTTGCACCCACGCGACCACGTT
CAATACATGGACGTTGCAACCAACCAGGTTGTATCTGTGGCGGCATCCCT
AATCCCGTTCCTAGAGCATGATGATGCTAACCGTGCACTTATGGGTGCAA
ACATGCAACGTCAGGCTGTTCCAACATTACGTGCTGATAAGCCGTTAGTT
GGTACAGGTATTGAACGTTCTGTAGCGGTTGACTCCGGCGTAACAGCTGT
AGCTAAACGTGGCGGTCAAGTTCAGTCTGTAGATGCTTCTCGTATCGTTG
TTAAAGTTAACGAAGACGAGCTAGTACCAGGCGAAGCTGGTATCGATATT
TATAACCTTACTAAGTACACCCGTTCTAACCAGAATACTTGTATTAACCA
GCGTCCAACAGTGATGCCAGGTGAGCCAGTAGCTCGTGGTGACGTACTTG
CAGATGGTCCTTCGACCGATCTGGGTGAACTTGCTCTTGGCCAGAACATT
CGTATCGCGTTCATGCCTTGGAATGGTTATAACTTTGAGGATTCCATCTT
AGTTTCTGAGCGTGTTGTACAGCAAGATCGCTTGACAACAATCCACATTC
AAGAGCTTTCTTGTGTGGCGCGTGACACGAAACTAGGTTCTGAAGAAATC
ACTGCTGATATCCCGAATGTGGGTGAAGCTGCGCTTTCTAAGTTGGATGA
GTCAGGTATCGTTTACATCGGCGCTGAAGTTAAAGGTGGCGACATTCTGG
TAGGTAAAGTGACACCTAAGGGTGAAACACAACTTACTCCAGAAGAAAAA
CTGCTACGTGCAATCTTCGGTGAAAAAGCATCTGACGTTAAAGATTCGTC
TTTACGTGTACCAAACAGTGTGTCTGGTACAATCATTGATGTTCAAGTAT
TTACTCGCGATGGCGTAGAAAAAGATAAGCGTGCTCTTGAAATTGAAGAG
ATGCAGCTTAAAGAAGCGAAGAAAGATATCACAGAAGAATTCCAGATCCT
TGAGGGTGGTCTTCTTGCTCGTGTTCGTACGCTTCTTCTTTCTATCGGTT
ACAGTGAAGAGAAAATTGCTTCAATGGACCGCGAGCGTCTATTTGCACTT
ACGCTTGATGATGAGTCACTACAGAATCAACTAGAACAACTAGCTGAACA
GTATGACGAATTAAAAGCTGAGTTCGATAAGAAGTTTGAAACTAAGCGTC
GTAAAATTACTCAGGGTGATGATTTAGCTCCTGGTGTCCTTAAGATTGTT
AAGGTTTACCTAGCTGTTAAACGTCGCATTCAACCTGGTGATAAGATGGC
GGGTCGTCATGGTAACAAGGGTGTAATCTCTAAGATTTGTCCTGTTGAAG
ACATGCCATACGATGAAAAAGGTCAGACCGTTGAAATCGTACTGAACCCA
TTGGGTGTACCATCTCGTATGAACATCGGCCAGATTCTGGAGACTCACAT
GGGTCTTGCAGCGAAAGGTATCGGTGACAAACTTAACGAGATGTTGAAGC
AACAGCAGGAGTTACATAAGTTCCGTAACTTCCTGCAGAAAGTTTACGAT
CTAGGTGATACTCGCCAGGATGTAGATATTGCTGCTTTATCTGATGATCA
AGTACATACGTTGGTCCAGAACTTACGTGATGGTCTACCAATTGCGACTC
CAGTATTTGATGGTGCTCCTGAATCATCGATTAAAGAACTGTTGAAGCTT
GGTGACTTACCAGAATCTGGTCAGCTGAAGATGTTTGACGGTCGTACCGG
TGATATGTTTGAGCGTCCTGTAACCGTTGGTTACATGTACATGCTGAAAC
TGAACCACTTGGTTGATGACAAGATGCACGCCCGTTCTACCGGTTCTTAC
AGCCTTGTTACTCAGCAACCGCTGGGCGGTAAAGCTCAGTTCGGTGGTCA
GCGTTTCGGTGAGATGGAAGTGTGGGCACTTGAAGCATACGGTGCTGCAT
TTACTCTTCAAGAAATGCTAACTGTTAAGTCGGATGACGTTAACGGTCGT
ACGAAGATGTACAAAAACATCGTCGACGGAGATCATCGTATGGAACCTGG
TATGCCGGAATCGTTCAACGTATTGTTGAAAGAAATCCGCTCGTTGGGTA
TCAACATCGAGCTGGAAGACAAATAA
>PBPRA3431 putative RNA polymerase, beta prime subunit
TTGTTACTCCGGTATGAATATGAAGGCGCCAGCAGACTGGCGCCTTTATG
GGTCAACTCCTCACAGGAGCCGAATGTGAAAGACTTACTTAAGTTTCTGA
AAGCGCAACATAAGACCGAAGAATTTGATGCTATCAAAATCGGTCTTGCT
TCACCTGACATGATTCGTTCATGGTCTTTTGGTGAAGTAAAAAAGCCAGA
AACCATCAACTACCGTACCTTTAAGCCTGAACGTGACGGTCTTTTCTGTG
CACGTATTTTTGGCCCGGTAAAAGACTACGAATGTCTTTGTGGTAAATAC
AAACGCCTAAAGCACCGTGGTGTTATTTGTGAAAAATGTGGTGTTGAAGT
TACTCAGACTAAAGTGCGCCGTGAGCGTATGGGTCACATTGAGCTTGCTT
CACCCGTTGCACATATCTGGTTCTTAAAATCACTGCCATCTCGTATCGGT
TTGTTAATGGACATGCCTCTACGTGATATTGAACGTGTACTTTACTTCGA
ATCTTACGTAGTAATTGAACCAGGCATGACCAATCTTGAGCGTAGCCAAC
TGCTTTCAGAAGAGCAGTACTTGGATGCACTTGAAGAGTGGGGCGACGAA
TTTGACGCTAAGATGGGCGCAGAAGCGGTTAAAGCACTATTAGGCAACAT
GGACCTAAATGCTGAAATCGATCTTATGCGTGAAGAATTAGAAGAAACTA
ATTCTGAAACTAAGCGTAAAAAACTAACCAAGCGCCTTAAGCTTGTAGAA
GCATTCTTACTTTCAGGAAACAACCCAGAGTGGATGATCCTGTCTGTACT
ACCAGTTCTACCGCCGGATCTACGTCCGTTGGTGCCGCTAGATGGTGGTC
GTTTCGCTACTTCAGATCTGAATGATCTGTACCGTCGCGTAATTAACCGT
AACAACCGTCTTAAGCGTCTACTAGACCTGGCTGCTCCTGATATTATCGT
ACGTAACGAAAAACGTATGCTTCAGGAATCTGTTGATGCATTGCTTGATA
ACGGTCGTCGTGGCCGCGCTATCACTGGTTCTAACAAGCGTCCTTTGAAA
TCTTTGGCTGATATGATCAAAGGTAAGCAGGGTCGTTTCCGTCAGAACCT
TCTTGGTAAGCGTGTTGACTACTCTGGTCGTTCTGTTATCACCGTAGGTC
CATACCTGCGTTTGCATCAGTGTGGTCTTCCTAAGAAGATGGCACTAGAG
CTATTTAAACCATTTATCTACGGTAAGCTAGAAGCTCGTGGTCTTGCGAC
TACAATCAAAGCTGCTAAGAAGATGGTTGAGCGTGAAGAAGCTGTTGTTT
GGGATATCCTAGATGAAGTTATTCGCGAACACCCAGTAATGCTAAACCGT
GCACCAACATTGCACCGTTTGGGTATTCAGGCATTTGAACCAGTACTAAT
CGAAGGTAAAGCGATTCAGCTTCACCCACTAGTGTGTGCGGCATATAACG
CCGACTTCGATGGTGACCAGATGGCGGTACACGTACCTCTAACTCTGGAA
GCACAGCTTGAAGCTCGTGCACTAATGATGTCTACCAATAACATCCTATC
TCCAGCGTCCGGTGATCCAATCATCGTACCTTCTCAGGATGTTGTATTGG
GTCTTTACTACATGACGCGTGAGAAAATCAACGCGAAGGGTGAAGGCATG
TACCTAGCTGGACCTGCAGAAGCAGAGAAAGCTTACCTTACTAAGAATGC
TGTGTTACATGCTCGCGTTAAAGTTCGTATTACTCAGTACGCTTATGATG
AACAAGGTAACTTGTCTTCAGAAACTGGGCTAATTGATACTACTGTTGGC
CGTGCAATTTTATGGCAGATCGTTCCTAAAGGTCTTCCGTACAGCCTTGT
AAACACTGAAGCACTAGGTAAGAAGCAAATCTCTACCCTATTGAACACGT
GTTACCGTAAATTGGGCATGAAAGAGACAGTAGTCTTTGCTGACCAAATT
ATGTACACAGGTTTTGCATACGCAGCACTTTCTGGTGTTTCTGTTGGTAT
CGACGACATGTTGATCCCTAAAGAAAAGTATACCAAGATTGCAGAAGCGG
AAGCAGAAGTTGCAGAAATTCAAGAGCAGTTCCAATCTGGTCTTGTAACT
GCCGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTACGGCGAATGA
GCAAGTTGCTAAAGCGATGATGGATAACTTGTCTGTCGAAACTGTTATTA
ACCGTGACGGTGAAGAAGAGCAGCAGAAATCGTTTAACAGCGTATACATG
ATGGCCGATTCTGGTGCTCGTGGTTCTGCAGCACAGATTCGTCAGCTAGC
GGGTATGCGTGGTTTGATGGCTAAGCCGGATGGCTCAATCATCGAAACAC
CGATCACAGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTACAGTACTTCATC
TCTACTCACGGTGCTCGTAAGGGTCTTGCGGATACGGCACTTAAGACAGC
TAACTCCGGTTACCTAACACGTCGTTTAGTAGATGTTGCACAAGATGTTG
TAATCACTGCTGATGATTGTGGTACGCACGCTGGTATCACCATGACTCCT
CTTATCGAGGGTGGTGATGTTAAAGAGCAGCTTGGTGATCGCGTTCTGGG
TCGTGTTGTTGCTGATGATGTGCTTAAGCCTGGTACTGATGAAGTTCTTG
CTCCACGTAACACGCTTCTTGATGAGAAGTGGTGTGACCTGCTGGAAGAC
AACTCAGTTGACCAAGTTAAAGTACGTTCAGTAGTAACGTGTGAGAATGA
CTTCGGTTGTTGTAAGTTCTGTTACGGTCGCGATCTAGCACGTGGTCACT
TGATTAATACTGGTGAAGCAGTTGGCGTTGTCGCTGCACAGTCAATCGGT
GAACCGGGTACGCAGCTAACGATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCGGC
ATCTCGTGCAGCAGCAGAAAACAATATCCAGGTTAAGAGCACTGGTTCAA
TGCGTCTGCACAATGCGAAGTTCGTTACTAACAGCGAAAGCAAGTTAGTA
ATTACTTCTCGTGCGTCAGTAATGACAGTGATTGATGAGTTCGGTCGTAC
TAAAGAAAGCTACAAGCTTCCTTACGGTTCGATTTTGAGCAAAGGTGACG
GCGATTCAGTAGTACAGGGTGATACTGTAGCTAACTGGGACCCGCACACA
ATGCCAATCATCACTGAAGTGGCTGGTCGTGTTCAGTTCGTTGACTTTAT
CGATGGTGTAACTGTTTCTCGTCAAACTGATGAGCTAACAGGCCTATCTT
CTATCGTTATTCTAGATGCTGCAGAGCGTACTAGTGCCGGTAAAGATATG
CGTCCAACGGTTAAGCTAGTTGACGACAAAGGTAACGATGTAATGATCCC
TGGTACTGATATGCCAGCTCAATACTTCTTACCTGGTAAAGCGATTGTTC
AACTTGAAGATAGTGCTCTAGTTGGCATCGGTGACATCTTATCGCGTATT
CCTCAGGAATCAGGCGGTACTCGAGATATCACGGGTGGTCTACCACGAGT
TGCTGACTTGTTCGAAGCACGTAAGCCTAAAGAGCCTGCAATCCTAGCGG
AAATCACAGGTGCTGTTTCTTTCGGTAAAGAAACTAAAGGTAAGCGTCGT
TTGATTATCACTCCAAGTGAAGGTCAACCATACGAAGAGATGATCCACAA
GTGGCGTCAGCTTAACGTATTCGAAGGCGAAAAAGTTGAATGTGGCGATG
TAATCGCGGATGGTCCAGAAGCTCCGCACGATATCTTGCGTCTACGTGGT
GTCCACGCAGTTGCTGAGTACATCGTAAACGAGGTTCAGGAAGTATACCG
TCTACAAGGCGTTAAGATTAATGATAAGCACATTGAGACTATCATTCGTC
AAATGCTACGTAAGGTTACTATCGTTAAGGCTGGTGATTCAGAATTCCTA
CCTGGCGAACAGGTTGAGTTCTCTCGTGTGAATATTGCGAACCGTAAGCT
TGAAGCTGATGGTAAAGATATCGTAACATTCAGCCGTGACCTATTAGGTA
TCACAAAAGCATCGCTTGCAACTGAGTCGTTTATATCTGCAGCGTCGTTC
CAGGAAACAACTCGCGTACTTACAGAAGCAGCTGTTTCTGGTAAGCGTGA
TCCGTTACGTGGTCTGAAAGAAAACGTAATCGTTGGTCGTCTAATTCCAG
CGGGTACAGGTTTCTCTTACCACCAGCGCCGTCAGAACCAACGCAATGCT
GAGCTAGAACCAGTAGCACCTCAGGTTGATGCTGAACAAGCATCTCAAGA
CCTAGCGGCACTACTTAACGCAGGCCTAAGCGACGATTAA
>PBPRA3411 FIS, putative factor-for-inversion stimulation protein
ATGTTCGAACAAAATCTGACTTCCGAAGCGTTAACAGTAACAACTGTAAC
GTCACAAGACCAAATCACACAGAAGCCACTACGTGACTCTGTTAAAGCGT
CGCTAAAAAACTATCTTGCTCAGTTAAATGGTCAGGAAGTCGACGATCTG
TACGAGCTAGTGCTTGCAGAGGTTGAGCAACCGCTATTAGATACAATCAT
GCAGTACACACGTGGTAACCAAACACGTGCAGCAACCATGATGGGTATCA
ACCGTGGTACGCTTCGTAAGAAGCTAAAGAAATACGGCATGAACTAA
>PBPRA3444 PA4279, hypothetical protein
ATGCAATTATTGATTGAAGCCGGCAATACTTACGTTAAAGTTGCCCAATT
GTTTGAATCTGGAAAGTTTGAACTATTAGGTCGTTATCCTAGACGTAAAT
TAGAAATGGTTCTTGAACCACTGCTAGAGAAAGGAATTCATCGAATAGTG
TTTGCTAGCGTTGGGCCTGTTGAGGTTGATAATTCAATTCAACGTATTGC
TCAGCTGGCCAATATTCCTGTAATGCAGGTGAAAACATTACGAAAAGATT
TTGGCGTTAAAAATGCGTATTCTGAATATCAATATCTTGGTGTTGATCGA
TGGTTAACTTTAGTGGCCATTCGGCAAAAATTTAAAAAACCAACAGTGAT
TATTGATATTGGTACGGCTTTAACGTTCGATGTGTTAGCTGAAGATGGCA
AACATTTAGGTGGTTGGATTGCGCCTGGCTACCAACTTATGATGCAGTCA
GTACTAGAAAATACCTGTAAAGTTTTTTCTGATCGTGAGCACGGAGAGTG
TATTACATTTTCTGATAATACCGCTGATGGTTTAAAAAATGGCTGTCGCG
CTGCATTAATTGGTTTATCGAATACGGTNTAA
>PBPRA3597 PAB7155, Hypothetical transcriptional regulator
GTGGAAAACGTAAAATCACGGACAGCGACTAAAATTCGAGAAGCGAGAGA
GCGAAAAGATATTACCCAAGTTGCGATGGCAAAGGCATTAGGCTTGGCTC
GTCAGACGTATCTCGATCTCGAATCGGGGAAAACAGAACCTAGAATATCA
ACATTAGTGAGTATTGCCGATATAACAGGACGACCACTAATTTGGTTTAT
CTATGAAGATGAAGGACTAATATCATCTGAAGATAAAAATGACATTCAAG
TGTTACTCGATCTATTTGCACAAGTGCCTCGTTCGATGCGCTCGAAGTTA
ATTGAGCATAATATGAGTTTTGTTTCTTGCTGGATTGATTATGTTGCCTC
AGTAAAACGAAAATAA
>PBPRA3598 PYRAB062, Hypothetical transcriptional regulator
ATGACAGATTCTAAAGCCAAGATCGCTGCACGTATTAAAGAAGCACGAGA
GTGGAAAGGGTTAACACAAGTCCACATGGCTCAACAATTACAAGTTGCTC
GCCAGACGTACCTTGATCTCGAAACTGGTAAAACAGAACCCAAAGTACGC
CTACTGTCAGAAATTTCTGAAATAACCGAGCGTCCGTTAACGTGGTTTGT
TTACGGGGATGAAGGCATTGAAATTTTAGAAAGTGAATATAAAGAAGAGA
TTGACCGTTTGTTGCAATATTTTAGCCGATTACCTCATTCTGCTCGTAAC
ATTATTTTGCAACAGAGCATTAATTTAGCTGGATTTATGGCGGAATATAC
CAAGGCGCTAACTAACAAACGTAAGTAG
>PBPRA3510 RSP1115, hypothetical transcriptional regulator, AraC/XylS family
TTGATTGATGCCCATTACCAAAGCTTTTCTTTCAAACGCCATTATCACCT
CGATTACCATTTAGGCTTAATCACCCAAGGGCAGCAGCAGTATTTCTTCA
ATGGCGCAAAACATGTCGCAGGGCCTGGCCAAATGGTGATCATGCCCCCC
GATGAAATCCACGATGGGCAACCCAAAGAAAGCGCTGGCTACCGCGTTAA
AGTTTTTAGTATTAGCCCTGATTGGTTAACTCAACAGGCTGAAGCCGTAT
CGGGCAAAGATCTCTTTTGTTTCCCACAACATAAAATTGCCGATCATCAG
TTTTTTCAGCAACTAACCCAATTACATACCCAGTTAGATAATCCTTTGGC
GTCTCAATTAGCCAAAGATAGCTTGCCGATCGAATACTTTTCTTATCTAT
TAACTCACTATGGAAAAGTACAAGAACACACAGTCACGAAACTGGGTACC
AAAGATTTACGTCAGTTACGCGATTACTTCATGGCGCATCTAGATCAAAA
AATCAGCCTTAATGACTTGGCAACACTGTGTGATCTCAGCCCGTCGCAAC
TGTTGCGTCAATTTAAGAAAACCACCGGCATTACACCTTATGCTTGGTTA
GCTCGTTTACGCCTAGAGCATGCTATGGCTTTGCTGCGGGCTGGCTTTAA
CAGTACAGAGGTGGCTTATCATGTCGGCTTTTATGATCAGGCGCACTTTG
CCAATACCTTCAAACAAACGTTCGGTATTGCGCCTTCCCACATAAAATAA
>PBPRA3437 SO0219, putative transcription antiterminator protein
ATGAGCGAAGCTCCAAAAAAACGATGGTATGTAGTGCAAGCCTTCTCTGG
TTTTGAAGGCCGAGTAGCACAATCACTACGCGAGCACATCAAAATGCATA
GTATGGAAGACTATTTTGACGAGGTACTAGTACCAACCGAGGAAGTGGTT
GAAATGCGTGCTGGCCAGCGTAGGAAGAGTGAGCGTAAGTTCTTCCCAGG
CTATGTGCTTGTACAAATGGTGATGAATGATCAAACATGGCACCTAGTAC
GTAGTATTCCTCGTGTAATGGGGTTCATTGGCGGTACATCTGACCGTCCT
GCTCCTATCTCTGATAAAGAGGCGGATGCGATTCTTAATCGTCTTCAGCA
GGCGAGTGAGTCTCCAGTCCATAAAACAGTCTTCGAACCAGGTGAAGTGG
TTCGTGTTACTGATGGTCCATTTGCAGACTTCAACGGTGTTGTTGAGCAT
GTCGATTATGATAAGAGCCGTGTTAAGGTTTCTGTTTCTATTTTCGGTCG
TGCAACACCAGTTGAATTGGAATTTGGTCAAGTAGAAAAGAACTGA
>PBPRA3505 SO4716, conserved hypothetical protein
ATGCGTATACGACAAGCCTCATTGGCAGAAGCCATAATAGTGTTGAATCA
GATCAGTGAGTTTGACCACCCTGAAACAGAAGCCAGTTTGATGCAGCGTC
TTGCTGGGCATGCAAGCTTAATACTCGTTGCAGAGCATGAAGGCAGTTTG
GTTGGAGTGAAAATTGGTTATCGCTTCTCTGATTCTACCTTCTATAGCTG
GTTGGGTGGGGTTGCCCCTGCTGGTCGTCGAATGGGGATTGCTCAAGCCT
TGTTAGATGCACAAGAAACATGGGCGATTGAGCAGGGTTATCAGGAAATT
AAAGTTAAATCGCGAAATTGCTTTCCGTCTATGCTGATGTTACTTCTAAA
AAACGCATATATAATTGAAAATATTGAAAAAAAAGGCAGGGTTGCTGATT
ACCGAATCTATTTTTCAAAGTTGCTAACTAATAAAAAATATTCTAAATGA
>PBPRA3600 SRLR, Putative transcriptional regulator, DeoR family
ATGCTAACGAATCAAAACATAATGTCTAAAAGAAACACTCAGCAACGTCG
TCACACTATTGTGAGCTTAGTTAATGAAAAAGGTGAAGTTAGCGTTGATC
AGCTCGCGACTTTCTTTGCTACTTCAGAAGTAACCATTCGTAAAGACCTT
ACTGCATTAGAAACTAATGGCTTATTGCTACGCCGCTATGGTGGTGCCGT
TGCGATGCCTTCAGAAATAGTTTCCGTCGATGTTGAAGACAATGTTTCGG
TTCGTAAGTTAGCCATTGCTAAAGCGGCCGCTTTACGTATTCGTGACCAT
AATCGCATCATCATCGACAGTGGTAGTACTACCGCCTCGCTCATTAGTTT
ATTAGGCAGCAAACAAGGCTTAATTGTGATGACGAATTCGTTGAATGTGG
CGAATGCCTTAAATGAGCTCGAAAACGAACCCACATTGCTGATGACGGGG
GGCACGTGGGATCCCCATTCAGAAGCCTTTCAAGGTCAAGTTGCGGAATT
GGTATTACGGTCATACGACTTTGATCAGCTATTTATTGGTGCTGATGGCA
TTGATATTGCTCGTGGTACGACAACGTTTAATGAATTGATTGGCTTGAGC
CGAGTCATGGCTGATGTTTCCCGTGAAGTTGTCGTGATGGTCGAATCAGA
CAAAATTGGTCGAAAAATTCCCAACATGGAACTGCCGTGGAGCAATATCA
GTACGCTGGTGACTGATGATGACTTAAGCGCAGAAGCGAAAGAACAAATA
GAACATCAAGGGGTACAGGTTATCTGTGCCTCAATTGAATAG
>PBPRA3487 STY3849, conserved hypothetical protein
ATGTTTCGACTGATCACACCAAAAACGGACGACGATTTCGCGCGTTATTA
TGATTTTCGCTGGCGTATGTTGCGTGAAGCCTGGCGTATGCCTGTGGGAT
CGGAGCGGGATGCCTATGATGAACTGAGTGCGCACCGTATGATAGTGACA
GATAACGGTGAGACTATTGCCATTGGTCGGCTTTATATGACACCAGATAA
TGATGGTCAGATTCGTTTTATGGCTGTGCATCCTAATTATCGTCATCAAG
GCATGGGAGCCATCGTGCTTATGGCTCTGGAATCGCTGGCTCGCCAAGAT
GGTGCAAAGCGGCTAGTGTGTAATGCCCGAGAGGATGCGATTCCTTTTTA
TTTGAAAAATGACTTTACTAGCCAGGGCGAGTTGAGTGATGAGCGCGGCC
CTGTGCGTCATCAACAAATGCTAAAACACCTCGATCCATTAACGGATGTT
GTTCGTCACCCTGAATGGTGCCAAGAACTGCAAGAATTATGGCAATACCA
GATTCCAATCAGTGACAAAATGGGGATCAAGATCAGTCAATACACGGGGT
ATCGCTTTGAAGTGAGCGCATTAATTAATGCGAACCTTAATCCGAGTGAG
TTTATGTTTGCGGGTAGTATTTTTACTATGGCAACACTCGCGGGCTGGGG
CTTTATTTGGATGCTGATTAAAGAACGTAAGCTAGAAGCTGATATTGTGT
TAGTCGATAGCCATATTCGTTACGTGTCTCCGGTGAAAGAGCGCCCACGT
GCTGTCGTGTCTGTTGAAACCCTCAGTGGTGACTTTGACCGCCTTGCTGC
TGGGCGTAAAGGTCGAGTGATTGTTGAAGTAAATGTTTACAGTGGTGAGA
CGTTAGCCTCTACGTTTACTGGCACTTATATGCTGTTTCCTTCACAAGCT
GAGGCCGATAGCCGCTGCTGA
>PBPRA3418 STY4386, putative transcriptional regulator, MerR family
ATGTATTTGATTGGGCAGCTCGCAAAATTATGCGGGGTAAGTAACGATAC
ACTGCGGTTTTATGAAAAAAATGGCTTAATGAAGCCCGCAGGGCGTAGCA
ATAGCGGTTATCGCTTATACAGTGAAGAAAACTTGTCGCGCATAAATTTT
ATTATTAGAGCGAAAGCAATTGGATTGAGCTTAGATGAAATTCGAGAGTT
ATTGGGTATTCGACTAGAAGCTAGCCAGCATAGCTGCGCAGAGGTAAAAG
CCATCACCCAAACGAAGTTGGATGAAGTTGATGTGAAAATTGCAGAATTA
ACGCGCATTCGAGTCGCATTGAAGAAACTCAATGATGCCTGTTGTGGTCA
TGCTGACGATGATGCCAGCCATTGCTCTATCCTTGAGGCGCTTGATGAGC
GAGATTGTTGCTCTACATTAGAGTAA
>PBPRA3586 T3631, Hypothetical GntR-famly transcriptional regulator
ATGGAACAGCAGAAAAGTGCACTCAATCGTAATTTGTCTTATAAGTTAGC
AGAATCGATTGGTCGAAGTATTTTACAAGGGGAAAACGCCCCAGGTGATA
TTTTACCGGGTGAAATTGAACTTGGTGAAATGTATGGTGTGAGCCGTACT
GCGGTACGTGAGGCGATTAAAATGCTTGCTGCGAAAGGCATGGTACATCC
TCGCCCCCGTATTGGTACGCGTGTATTACCGAAGCGTAATTGGAATTACT
TGGATCAGGACTTACTGGCGTGGTTAAATTTTAGTGAGCATTCAGAGCTG
GTTGCAGAATTTCAGCAGGTTCGTATGACATTAGAGCCAGAAGCGGCGGC
ATTAACGGCATTAAATGCGAGTGATGCTGATCGTGAAGAGTTACAGCATT
TAATGCAAGAAATGCATCTGCTAGGGGATGATTTTAATCAAGATAAATGG
ATTGAAATTGATACTCGTTTTCATCAGTTAATTTATTTTGCATCGGGTAA
TCATTTTATCAGCCCATTTGGTAATTTGTTTAAAGCTGTATTTGAAAACT
ATTTCCGCATTATTACTCGTGAGCGCTTACTTAAGTTAGATATACATCAG
CAAATTGTTGACGGTATCATCGCTCGCGATCCCGATCGCGCACGTCAAGC
AACCGTCGACTTACTTAAGTAA
>PBPRA3535 T3643, putative transcriptional regulator AsnC
ATGACCCAACCTCTTCGAATTGATGACTTAGACCGCGATATTTTAAAAGC
CTTAATGCATGATGCAAGAATACCTTATGCCGAAATGGCAAAGCGTTTTA
ATGTAAGCCCAGCAACTGTACATGTTCGAGTTGAAAAAATGCGAGCATCA
GAAATCATCACTGGAACAGAAGTGGTGGTGAACCCTAAATTATTGGGTTA
TGACGTATGTTGTTTCATTGGGATTAATTTAAATGCTGCCCGCGATTACC
ATTCAGCAATAGAAAAACTCAAAGAATTGGATGAAGTCGTGGAAGCGTAT
TACACCACAGGTGCGTATAATATTTTTGTTAAATTAATGTGCCATTCGAT
TGAAGAGTTGCAATATGTGCTCATTGATAAGCTTCAAGCTATCGATGAAG
TGCAATCGACAGAAACATTAATTTCGCTGCAAAATCCAATTAGTCGTAAT
GTGAAACCTTAA
>PBPRA3447 VP2933, hypothetical protein
ATGACTAAGCTTAGATTTCACCATTTAGAACCTCTTCGTTTTCCACTAGT
AAACCGATTATATAAAAGCTACTACCCCGCAGGAAAAGCAAAAAAAGATG
AAATAATATGGGTTGGAGATAATGAGAAAGGTATAATTTGCGTCGTTAGG
TTTAAACAATTTGAAAACATTCAGTTATTAACAGGAATGCTTGTTCATCC
TGAATTTCGTGAACAAGGGCTTGCTAAAAATTTGTTAGCGGCAACGAAAA
CGCAAATAAATTGCAAGCCTTGTTACTGTTTTGCATTTCGTGAATTAATC
CCACTTTATTCAAACGCTAACTTCCATTTGGTCGACAAAATCGAGTTACC
TGAAGTACTTTCTAACCGATTAATACGTTATATTAGCAGTGGGAAAGACC
TTGTCGCGATGCGTTATGAAGCTTAA
>PBPRA3393 VV2418, putative transcriptional regulator, LysR family
ATGCAGCGATGCAAAAATGGTATGAAGCTAGACGACCTACGCGCTCTGAT
TGCGATAGCCCAGCATGGAAGTTTTAGAGCAGCAGCCAATGCGTTAGACA
TCCCCCCTGCGACCCTGAGCCGTCGATTACAACGACTAGAAGATACCCTT
GGTAGCCAACTGGTTATCCGCGATAGCCGCAATGTGGCATTAACCCCATT
AGGGCAAAATTACTTTGAACGCTGCCAGCCATTGCTTGACGAATTACAAG
CCACGACCAGTGAATTAATGGATACCAGCAGCTCAAACCCGAGAGGGGCA
TTGAGGATCTCTGCCCCTGTAGGTTTGCTGACGTATCAGCTCATGCCATT
ATTCAATCAGTTTTTGGCGCTTTACCCAGAAGTCACACTTTCGCTTAATC
ATTTATCGAATCAACACCATGATTACAGCCAAGAGCAATACGACGTTGTT
TTCCGGGTGGGGCAACAGCCCAATTCGAGCTTTGCCGCCGCCAAAATTGG
CGAATCACAACGTACGCTCGTCGCATCACCAGAATACCTTGCACAATATG
GTATACCGCATCACCCTGATGAATTAAACCACCATTCTCGCTTAGCTACA
GTGCCAGAGTTTGAGTGGGCACTCACTTGTAAAACGGATGTCGCACACCC
GGAAACGATCTGGATCAATTCCCCTGTGCGTATGGCGATTGCCGATCTAA
ATAGTGTAAAACAAGCAGCAATAAGCGGATTGGGTATCGCGTGTTTGCCT
AATTATGTAGTAGCAGATGCCCTAGAAAAATCCACTCTCACCACCATGAT
GGATGACTGGTATTCCCCACCACGTCCCATTTATATGCTGTATCAACGCT
TGGGGTATGTACCAAATCATATAACGTGTTTTATCGATTTCATGCGAAAT
GCACTAACAGGAACATAA
>PBPRA3612 XAC3906, Putative ParB family protein
ATGAACATGAGTAAACGGGGTCTAGGAAAAGGCCTTGATGCATTGTTAGC
AACAAGTTCTGTTGCGCAAGCAAAGCAGCAAAGTGCGGAAAAAGCACAAT
CATTATCAGCAGATGGTACGTTAAGAGAACTGCCTATTCATCTGCTCCAG
CCTGGTAAATATCAACCGCGTAAAGATATGTCGGATGAAGCTCTTGCAGA
GTTAAGTGATTCTATTCGTGCGCAAGGTATTATCCAGCCTATTGTTGTGC
GTAGATTAGCATCTCAACAATATGAAATTATCGCAGGTGAGCGACGTTGG
CGAGCAGCTCGTCAAGCTGGGCTTCAGAATATCCCTTGTATTATTAAGGA
TGTTAACGACCGCGCAGTGATTGCGATAGCATTGATTGAGAATATTCAAC
GTGAAGATCTTAATTCGATTGAAGAAGCGCAAGCCTTCGAACGTTTACAG
AGTGAGTTTTCTCTGACCCATCAACAAATCGCGGAAGCGGTAGGTAAGTC
TCGTGCTGCGGTGTCTAACTTGCTACGTTTGAATCAGTTAGAAGCCCCCG
TAAAGCGTATGCTTGAACGGCGTCAGCTTGATATGGGACATGCACGTGCC
CTGCTTAGTTTGGACGCTGATATGCAGTTAGAAGCTGCAGAAACCGTCGT
GACTAAAATGCTGAATGTACGTGACACTGAAAAGTTAGTAAAAAAACTGC
TTAACCCTGTTAGTGAACGTGTTAGACCTGTTGAGAATTTAGAGATTAAA
GCACTAGAAAATAGTTTAAGCGAACGATTGGGTACCCAGGTAGCAATTAA
CCATCAAAAGAATGGTAAAGGAAAAATTGTTATCAGTTTTGATGAAGCGC
ACAAGTTTAAGCAACTTATTGCAATTTTTGGTCAGGAATTGTGA
>PBPRA3395 XAC4180, putative transcriptional regulator, LuxR family
GTGCTAAATAGCACTCTTTTTTTCGATTTTTTCAGCAATACGCGGATTGA
GCATGATTATTACATCTATCGTCAAGCCTTGCCTGATCCAGCTCTTATCT
TGAGTGTTAACGAATTGATCTGGTTTTATAGCAGTGATAGCGTAATTAAA
AATAATAGTGAAAAGGTAGCCATGGACGCTCAATACACGATTGTTATCGC
TGATGATCACCCCTTGTTTCGTAATGCACTTTTTCAATCAGTGCATATGG
CGATCAGCGGTGCCAATCTACTCGAAGCTGAATCGCTTGATACCCTGCTC
AGCTTATTAGAAAAAGAAAATGATGTAGATTTATTGCTGCTCGATCTAAA
AATGCCGGGCGCGAATGGCATGTCAGGTTTAATTCAACTGCGTAACCAAT
ATCCAGACTTACCCATCGTCGTGATATCTGCCAGTGAAGAAATTACGGTT
GTAAAGCAGGTTCGCAGCCACGGTGCATTTGGCTTTATTCCTAAATCAAG
TGATATGCGCGCGCTAATCAGCGCCCTACATCAAGTGCTCGAAGGAGAAC
CCTTTTTTCCTGAAGGGCTCGGGGATGAAGATGATGAAATTAATGACCTT
GCCCAGAAAATAGCCTCATTAACTCCCCAGCAATATAAAGTGTTATGCAT
GCTGTCTGATGGTTTGCTTAATAAGCAAATTGCGTATGAGTTGAATGTAT
CAGAAGCAACAATCAAAGCTCACATGACTGCTATTTTTCGCAAGCTCGGG
GTTAAGAGTCGTACTCAGGCCGTGATTCTATTACAGCAAATGGATTTAAC
CCAATAG
>PBPRA3540 Y0361, putative transcription termination factor
ATGCACATAAATTGCTATTCCGTTCATTTCTTGACCAGCCCCTTGGTCAA
CTCTATCTTAAACCAAAATAGAACCCCGATTTTGACAGACAAGAAACCCA
CCACTATGAATCTTACAGAACTGAAGAGCCAACCAATTCCAAAGTTGGTT
GCACTTAGCGAAAGCTTGGGCCTAGAGAATCTAGCGCGCTTGAGAAAACA
AGACATTATCTTCTCTATTCTCAAACAACACGCGAAAGGTGGTGAGGATA
TTTTTGGCGATGGTGTTCTAGAAATCCTTCAAGATGGCTTCGGCTTCCTT
CGCTCTTCAGATAGTTCTTACCTTGCTGGCCCTGATGATATTTATGTATC
TCCAAGCCAGATTCGTCGTTTCAACCTTCGTACTGGCGATACCGTTGCCG
GAAAAATTCGTCCACCGAAAGATGGCGAACGTTATTTTGCACTACTTAAA
GTAAATGCAGTTAACTATGACAAACCAGACAACGCACGTAATAAGATCTT
ATTTGAAAACCTGACTCCACTGCACGCGAACGATCGTATGCGTATGGAGC
GTGGTAACGGCTCGACTGAAGATATCACTGCACGTGTTCTTGATTTAGCA
TCTCCGATTGGTAAAGGTCAGCGTGGTCTGATTGTTGCTCCGCCTAAAGC
GGGTAAAACCATTTTGCTTCAAAACATTGCACAAAGTATTGCCCACAACC
ACCCTGAGTGTGTGTTGATGGTTTTACTTATCGACGAACGTCCGGAAGAA
GTAACCGAGATGCAACGCCTCGTTAAAGGTGAAGTTATTGCATCAACGTT
TGACGAGCCAGCATCACGTCACGTACAAGTGGCAGAAATGGTTATCGAGA
AAGCAAAACGTCTTGTTGAACACAAGAAAGATGTTGTTATCCTGCTTGAC
TCAATCACACGTCTAGCGCGCGCATACAACACCGTTGTTCCTTCATCTGG
TAAGGTACTTACAGGTGGTGTTGATGCTAACGCCCTTCACCGACCTAAGC
GTTTCTTCGGTGCGGCACGTAATGTTGAAGAAGGTGGTAGCTTAACAATC
ATCGCGACAGCATTGGTTGATACCGGCTCTAAGATGGATGAAGTTATCTA
CGAAGAGTTTAAAGGTACAGGTAACATGGAATTGCACCTATCTCGTAAGA
TTGCTGAGAAACGTGTATTCCCTGCGATTGACTTCAACCGTTCTGGCACT
CGTCGTGAAGAGTTATTGGCTAAGCCTGACGAATTACAGAAAATGTGGAT
CCTGCGCAAGATTGTTCACCCAATGGGCGAAACTGACAGCATGGAATTCC
TGATCGACAAACTGTCGATGACGAAGACGAATAATGAGTTCTTTGACGCA
ATGCGTCGTCAGAAATAA
>PBPRA3467 YIJC, putative transcriptional regulator, TetR family
ATGGGGATTAGGGCTCAACAAAAAGAAAAAACGCGCCGCTCACTTATCGA
TGCTGCGTTTAGCCAGTTAAGTGCAGACCGTAGTTTTTCCAGCCTCAGCC
TACGTGAGGTAGCAAGAGAAGCCGGTATTGCCCCGACGTCTTTTTATCGT
CATTTTAAAGACATGGATGAGCTTGGTTTAACCATGGTTGATGAAGGTGG
TCTTATCCTTCGTCAATTAATGAGACAAGCTAGACAGCGTATTGCTGAAG
AAGGCAGTGTAATTCGCACATCTGTCGAAACATTTATGGAATTTATTGAA
AGTAGTCCAAACGTATTTAGACTACTTTTACGTGAACGCTCGGGAACATC
CACAGCGTTTCGTGCCGCGGTTGCTCGTGAAATTCAACATTTTGTTGCTG
AACTTACCGAGTACCTTGAGGCAAAAACAGGTGTTACGCATGAAGAAGCC
TATATTCAGGCAGAAGCATCGGTCACCTTGGTATTTAGCTCTGGTGCAGA
TGCGCTAGATCTTGATCCTCAGGCTCGTGAAGAGCATGAAGAAAAACTTA
TCATGCAATTAAGAACAATTGCAAAAGGTGCCTATTGGTACCGTAAAGAG
CGTGAGCGTCGTGAGCTCAGGCATAAACTATAA
>PBPRA3430 YPO3737, putative regulator of sigma D
ATGTTAAGTAAATTTGAGCAAGTTCAACAACAGTGGGGCGGTACGAGTGA
TGTTATCGATCACTGGCTGGTGTCCCGGCAGCAATTACTGATCGACTACT
GTAAATTGGCCGGTCTACCCCCCTTCGAAAGCAATACACGCCAATTGCCT
ACCTCTTCACAGTTACAACTCTTTTGCCAACAAGTTGTCGATTACATTTC
AGCAGGTCATTTCAAAATCTATGATATGGTCATGGAAAAGTGGAATACGG
CAGGATATTCACCGACAGAAGACATTTCACTGCTTTACGCGAGCATCACC
CAAACAACCGATCCGATTCTTAATTTCACCGATCGTTATAGCGATATCGC
CGAAGAAAATACGCTGACAGATTTAGACAAAGACCTATCTTCAATTGGTG
AATTGCTAGAATTGCGATTTGGTCTTGAAGATAGCCTGATTGAATTAATT
AGCGAAAGCTTAGCGTGCCCACCAGGCGCTTAA