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2024-04-20 17:17:27

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Organism: Agrobacterium tumefaciens, MAFF301001

Number of genes found: 215

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Agrobacterium tumefaciens, MAFF301001
NameLocus tagProduct / DescriptionGenomic elementTypeBeginLengthStrandGC-content
NA pTi-SAKURA repeat_unit175938 27 + 0.592593
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NA pTi-SAKURA protein_bind106584 14 + 0.428571
NA pTi-SAKURA protein_bind17759 14 + 0.571429
NA pTi-SAKURA protein_bind124441 14 + 0.285714
NA pTi-SAKURA misc_feature170935 26116 + 0.473886
NA pTi-SAKURA protein_bind17668 14 + 0.5
NA pTi-SAKURA protein_bind152582 14 + 0.142857
NA pTi-SAKURA oriT100345 16 + 0.8125
NA pTi-SAKURA protein_bind137412 14 + 0.285714
NA pTi-SAKURA repeat_unit178602 28 + 0.571429
NA pTi-SAKURA protein_bind150068 14 + 0.357143
NA pTi-SAKURA protein_bind140442 14 + 0.285714
NA pTi-SAKURA protein_bind162259 14 + 0.214286
NA pTi-SAKURA protein_bind158554 14 + 0.357143
LB pTi-SAKURA repeat_unit170935 25 + 0.4
RB pTi-SAKURA repeat_unit197026 25 + 0.44
oriV pTi-SAKURA rep_origin20483 159 + 0.496855
tiorf1 pTi-SAKURA CDS1559 921 - 0.570033
tiorf10 pTi-SAKURA CDS9985 663 - 0.61991
tiorf100 pTi-SAKURA CDS93812 639 + 0.528951
tiorf101 pTi-SAKURA CDS94584 615 - 0.619512
tiorf102 pTi-SAKURA CDS95500 279 - 0.598566
tiorf103 pTi-SAKURA CDS95918 258 - 0.604651
tiorf104 pTi-SAKURA CDS96606 327 + 0.568807
tiorf105 pTi-SAKURA CDS97310 402 - 0.59204
tiorf106 pTi-SAKURA CDS97732 1950 - 0.651795
tiorf107 pTi-SAKURA CDS99668 216 - 0.643519
tiorf108 pTi-SAKURA CDS99888 297 - 0.6633
tiorf109 pTi-SAKURA CDS100441 3585 + 0.638494
tiorf11 pTi-SAKURA CDS10662 1164 - 0.645189
tiorf110 pTi-SAKURA CDS104022 531 + 0.649718
tiorf111 pTi-SAKURA CDS104476 1248 + 0.655449
tiorf112 pTi-SAKURA CDS105737 627 + 0.61563
tiorf113 pTi-SAKURA CDS106888 309 + 0.546926
tiorf114 pTi-SAKURA CDS107355 1725 - 0.59942
tiorf115 pTi-SAKURA CDS109182 330 - 0.521212
tiorf116 pTi-SAKURA CDS109541 705 - 0.587234
tiorf117 pTi-SAKURA CDS110463 1509 - 0.552021
tiorf118 pTi-SAKURA CDS111972 1584 - 0.589015
tiorf119 pTi-SAKURA CDS114166 777 + 0.570142
tiorf12 pTi-SAKURA CDS11852 219 - 0.694064
tiorf120 pTi-SAKURA CDS115000 1566 + 0.547893
tiorf121 pTi-SAKURA CDS116599 966 + 0.584886
tiorf122 pTi-SAKURA CDS117561 1020 + 0.580392
tiorf123 pTi-SAKURA CDS118577 927 + 0.568501
tiorf124 pTi-SAKURA CDS119496 861 + 0.569106
tiorf125 pTi-SAKURA CDS120372 801 + 0.570537
tiorf126 pTi-SAKURA CDS121216 768 + 0.557292
tiorf127 pTi-SAKURA CDS122359 1086 + 0.538674
tiorf128 pTi-SAKURA CDS123199 909 - 0.577558
tiorf129 pTi-SAKURA CDS124584 1176 + 0.534864
tiorf13 pTi-SAKURA CDS12067 804 - 0.60199
tiorf130 pTi-SAKURA CDS125919 1176 + 0.580782
tiorf131 pTi-SAKURA CDS127370 924 + 0.544372
tiorf132 pTi-SAKURA CDS128377 270 - 0.540741
tiorf133 pTi-SAKURA CDS129189 939 + 0.510117
tiorf134 pTi-SAKURA CDS130578 429 + 0.552448
tiorf135 pTi-SAKURA CDS131028 435 + 0.510345
tiorf136 pTi-SAKURA CDS131462 360 + 0.580556
tiorf137 pTi-SAKURA CDS131906 276 - 0.652174
tiorf138 pTi-SAKURA CDS134107 711 - 0.563994
tiorf139 pTi-SAKURA CDS135962 732 - 0.539617
tiorf14 pTi-SAKURA CDS12842 2469 - 0.628595
tiorf140 pTi-SAKURA CDS137530 2502 + 0.523181
tiorf141 pTi-SAKURA CDS140576 738 + 0.563686
tiorf142 pTi-SAKURA CDS141313 366 + 0.579235
tiorf143 pTi-SAKURA CDS141678 327 + 0.568807
tiorf144 pTi-SAKURA CDS142004 2370 + 0.553165
tiorf145 pTi-SAKURA CDS144390 663 + 0.567119
tiorf146 pTi-SAKURA CDS145153 888 + 0.541667
tiorf147 pTi-SAKURA CDS146076 168 + 0.553571
tiorf148 pTi-SAKURA CDS146230 714 + 0.55042
tiorf149 pTi-SAKURA CDS146940 882 + 0.540816
tiorf15 pTi-SAKURA CDS15321 300 - 0.65
tiorf150 pTi-SAKURA CDS147818 1134 + 0.578483
tiorf151 pTi-SAKURA CDS148992 1035 + 0.553623
tiorf152 pTi-SAKURA CDS150245 762 + 0.538058
tiorf153 pTi-SAKURA CDS151148 609 - 0.558292
tiorf154 pTi-SAKURA CDS151759 696 - 0.54023
tiorf155 pTi-SAKURA CDS152725 444 + 0.540541
tiorf156 pTi-SAKURA CDS153202 1344 + 0.582589
tiorf157 pTi-SAKURA CDS154560 2022 + 0.558358
tiorf158 pTi-SAKURA CDS156655 2007 + 0.531141
tiorf159 pTi-SAKURA CDS158773 2526 + 0.552257
tiorf16 pTi-SAKURA CDS15613 402 - 0.629353
tiorf160 pTi-SAKURA CDS161675 327 - 0.547401
tiorf161 pTi-SAKURA CDS162387 252 + 0.559524
tiorf162 pTi-SAKURA CDS162754 192 + 0.458333
tiorf163 pTi-SAKURA CDS162959 1671 + 0.503291
tiorf164 pTi-SAKURA CDS164744 2007 + 0.519183
tiorf165 pTi-SAKURA CDS167260 630 - 0.588889
tiorf166 pTi-SAKURA CDS167918 732 - 0.599727
tiorf167 pTi-SAKURA CDS168646 555 - 0.587387
tiorf168 pTi-SAKURA CDS169190 174 - 0.597701
tiorf169 pTi-SAKURA CDS169404 777 - 0.586873
tiorf17 pTi-SAKURA CDS16004 972 - 0.633745
tiorf170 pTi-SAKURA CDS170173 369 - 0.574526
tiorf171 pTi-SAKURA CDS170755 234 - 0.534188
tiorf172 pTi-SAKURA CDS171321 1116 - 0.49552
tiorf173 pTi-SAKURA CDS173340 684 + 0.480994
tiorf174 pTi-SAKURA CDS174479 1185 - 0.498734
tiorf175 pTi-SAKURA CDS176176 1050 - 0.630476
tiorf176 pTi-SAKURA CDS178097 444 - 0.626126
tiorf177 pTi-SAKURA CDS179821 699 + 0.500715
tiorf178 pTi-SAKURA CDS181225 693 + 0.507937
tiorf179 pTi-SAKURA CDS182396 945 + 0.50582
tiorf18 pTi-SAKURA CDS16972 636 - 0.595912
tiorf180 pTi-SAKURA CDS183802 1107 - 0.459801
tiorf181 pTi-SAKURA CDS185672 666 + 0.45045
tiorf182 pTi-SAKURA CDS186844 1404 - 0.512108
tiorf183 pTi-SAKURA CDS188587 2268 + 0.499559
tiorf184 pTi-SAKURA CDS191551 723 + 0.503458
tiorf185 pTi-SAKURA CDS192789 561 + 0.488414
tiorf186 pTi-SAKURA CDS193832 624 - 0.487179
tiorf187 pTi-SAKURA CDS195445 1242 - 0.485507
tiorf188 pTi-SAKURA CDS197194 1065 - 0.586854
tiorf189 pTi-SAKURA CDS198306 1083 - 0.596491
tiorf19 pTi-SAKURA CDS17971 1218 + 0.538588
tiorf190 pTi-SAKURA CDS199465 975 - 0.607179
tiorf191 pTi-SAKURA CDS200487 1419 - 0.63284
tiorf192 pTi-SAKURA CDS201902 294 - 0.595238
tiorf193 pTi-SAKURA CDS202192 1119 - 0.609473
tiorf194 pTi-SAKURA CDS203919 2037 + 0.613648
tiorf195 pTi-SAKURA CDS205959 1956 + 0.602761
tiorf2 pTi-SAKURA CDS2594 726 - 0.575758
tiorf20 pTi-SAKURA CDS19418 1011 + 0.569733
tiorf21 pTi-SAKURA CDS20643 1320 + 0.585606
tiorf22 pTi-SAKURA CDS21971 942 - 0.618896
tiorf23 pTi-SAKURA CDS23194 1113 + 0.614555
tiorf24 pTi-SAKURA CDS24431 555 + 0.603604
tiorf25 pTi-SAKURA CDS25099 336 + 0.568452
tiorf26 pTi-SAKURA CDS26031 570 + 0.596491
tiorf27 pTi-SAKURA CDS26682 1218 + 0.593596
tiorf28 pTi-SAKURA CDS28007 717 + 0.598326
tiorf29 pTi-SAKURA CDS28732 585 + 0.593162
tiorf3 pTi-SAKURA CDS3321 711 - 0.566807
tiorf30 pTi-SAKURA CDS29484 828 + 0.601449
tiorf31 pTi-SAKURA CDS30571 243 + 0.510288
tiorf32 pTi-SAKURA CDS30842 393 - 0.580153
tiorf33 pTi-SAKURA CDS31238 1164 - 0.561856
tiorf34 pTi-SAKURA CDS32468 1143 - 0.580052
tiorf35 pTi-SAKURA CDS33767 567 - 0.599647
tiorf36 pTi-SAKURA CDS35189 996 + 0.570281
tiorf37 pTi-SAKURA CDS36292 627 - 0.542265
tiorf38 pTi-SAKURA CDS37732 768 + 0.513021
tiorf39 pTi-SAKURA CDS38715 414 - 0.603865
tiorf4 pTi-SAKURA CDS4106 852 - 0.556338
tiorf40 pTi-SAKURA CDS39347 924 + 0.646104
tiorf41 pTi-SAKURA CDS40231 597 - 0.628141
tiorf42 pTi-SAKURA CDS40267 606 + 0.625413
tiorf43 pTi-SAKURA CDS40824 462 - 0.634199
tiorf44 pTi-SAKURA CDS41508 1188 - 0.624579
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tiorf46 pTi-SAKURA CDS42273 402 + 0.599503
tiorf47 pTi-SAKURA CDS42804 5082 + 0.636954
tiorf48 pTi-SAKURA CDS45048 672 - 0.61756
tiorf49 pTi-SAKURA CDS48070 1914 + 0.631139
tiorf5 pTi-SAKURA CDS5022 774 - 0.577519
tiorf50 pTi-SAKURA CDS48331 933 - 0.620579
tiorf51 pTi-SAKURA CDS50008 459 + 0.642702
tiorf52 pTi-SAKURA CDS50506 1017 + 0.544739
tiorf53 pTi-SAKURA CDS51660 636 - 0.504717
tiorf54 pTi-SAKURA CDS52341 981 - 0.491335
tiorf55 pTi-SAKURA CDS53359 1173 - 0.494459
tiorf56 pTi-SAKURA CDS54524 1035 - 0.518841
tiorf57 pTi-SAKURA CDS55605 612 - 0.511438
tiorf58 pTi-SAKURA CDS56213 573 - 0.481675
tiorf59 pTi-SAKURA CDS56803 846 - 0.526005
tiorf6 pTi-SAKURA CDS6016 936 + 0.547009
tiorf60 pTi-SAKURA CDS58543 600 + 0.661667
tiorf61 pTi-SAKURA CDS58907 1008 + 0.633929
tiorf62 pTi-SAKURA CDS59445 927 + 0.612729
tiorf63 pTi-SAKURA CDS60371 939 + 0.610224
tiorf64 pTi-SAKURA CDS61675 690 - 0.637681
tiorf65 pTi-SAKURA CDS62395 741 - 0.592443
tiorf66 pTi-SAKURA CDS63234 465 - 0.537634
tiorf67 pTi-SAKURA CDS63810 279 - 0.46595
tiorf68 pTi-SAKURA CDS64106 495 - 0.565657
tiorf69 pTi-SAKURA CDS64597 468 - 0.532051
tiorf7 pTi-SAKURA CDS7308 1317 - 0.603645
tiorf70 pTi-SAKURA CDS65273 1461 - 0.581793
tiorf71 pTi-SAKURA CDS66781 378 + 0.550265
tiorf72 pTi-SAKURA CDS67926 282 + 0.507092
tiorf73 pTi-SAKURA CDS68280 915 - 0.575956
tiorf74 pTi-SAKURA CDS69410 477 - 0.545073
tiorf75 pTi-SAKURA CDS69947 597 - 0.629816
tiorf76 pTi-SAKURA CDS71469 318 + 0.638365
tiorf77 pTi-SAKURA CDS71755 447 - 0.61745
tiorf78 pTi-SAKURA CDS72341 345 + 0.571014
tiorf79 pTi-SAKURA CDS72706 1044 + 0.583333
tiorf8 pTi-SAKURA CDS8637 477 - 0.656184
tiorf80 pTi-SAKURA CDS72883 600 - 0.588333
tiorf81 pTi-SAKURA CDS74172 306 - 0.562092
tiorf82 pTi-SAKURA CDS74973 576 + 0.597222
tiorf83 pTi-SAKURA CDS75545 2151 + 0.596002
tiorf84 pTi-SAKURA CDS78527 732 + 0.568306
tiorf85 pTi-SAKURA CDS79251 669 + 0.544096
tiorf86 pTi-SAKURA CDS79979 465 + 0.578495
tiorf87 pTi-SAKURA CDS80695 1077 + 0.545033
tiorf88 pTi-SAKURA CDS81873 492 - 0.563008
tiorf89 pTi-SAKURA CDS82606 921 + 0.57329
tiorf9 pTi-SAKURA CDS9113 855 - 0.625731
tiorf90 pTi-SAKURA CDS83632 507 + 0.564103
tiorf91 pTi-SAKURA CDS84250 849 - 0.60424
tiorf92 pTi-SAKURA CDS85188 969 + 0.589267
tiorf93 pTi-SAKURA CDS86249 885 + 0.581921
tiorf94 pTi-SAKURA CDS87413 756 + 0.60582
tiorf95 pTi-SAKURA CDS88242 1011 - 0.513353
tiorf96 pTi-SAKURA CDS89356 1014 + 0.547337
tiorf97 pTi-SAKURA CDS90475 1083 + 0.542936
tiorf98 pTi-SAKURA CDS91554 786 + 0.577608
tiorf99 pTi-SAKURA CDS92456 1329 + 0.541761